MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 142158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_008435	CGG	2	6	553897	553902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522534
14502	NC_008435	GCC	2	6	553905	553910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522534
14503	NC_008435	CGG	3	9	553949	553957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522534
14504	NC_008435	GGC	2	6	553980	553985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522534
14505	NC_008435	CG	3	6	554000	554005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14506	NC_008435	GCC	2	6	554041	554046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14507	NC_008435	CAT	2	6	554066	554071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14508	NC_008435	CA	3	6	554083	554088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14509	NC_008435	GCGG	2	8	554114	554121	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14510	NC_008435	GTT	2	6	554135	554140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14511	NC_008435	TGT	2	6	554157	554162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14512	NC_008435	CTG	2	6	554174	554179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14513	NC_008435	G	6	6	554194	554199	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14514	NC_008435	CG	3	6	554207	554212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14515	NC_008435	GCT	2	6	554231	554236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14516	NC_008435	GCC	2	6	554273	554278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14517	NC_008435	CGC	2	6	554297	554302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14518	NC_008435	CG	3	6	554304	554309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14519	NC_008435	ATTG	2	8	554313	554320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14520	NC_008435	GA	3	6	554321	554326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14521	NC_008435	CTGGCT	2	12	554348	554359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522535
14522	NC_008435	CCG	2	6	554390	554395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522535
14523	NC_008435	GCCC	2	8	554402	554409	0 %	0 %	25 %	75 %	115522535
14524	NC_008435	TGG	2	6	554425	554430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522535
14525	NC_008435	GTG	2	6	554453	554458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522535
14526	NC_008435	CCG	2	6	554463	554468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522535
14527	NC_008435	GTC	2	6	554486	554491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522535
14528	NC_008435	CG	3	6	554501	554506	0 %	0 %	50 %	50 %	115522535
14529	NC_008435	GTCGGC	2	12	554519	554530	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	115522535
14530	NC_008435	GCAA	2	8	554538	554545	50 %	0 %	25 %	25 %	115522535
14531	NC_008435	GCC	2	6	554596	554601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522535
14532	NC_008435	CGG	2	6	554647	554652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522535
14533	NC_008435	GGC	2	6	554677	554682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522535
14534	NC_008435	GGCG	2	8	554692	554699	0 %	0 %	75 %	25 %	115522535
14535	NC_008435	CGT	2	6	554730	554735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522535
14536	NC_008435	CGG	2	6	554740	554745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522535
14537	NC_008435	TGCG	2	8	554762	554769	0 %	25 %	50 %	25 %	115522535
14538	NC_008435	ACG	2	6	554778	554783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522535
14539	NC_008435	TCGG	2	8	554810	554817	0 %	25 %	50 %	25 %	115522535
14540	NC_008435	GTG	2	6	554825	554830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522535
14541	NC_008435	CG	3	6	554836	554841	0 %	0 %	50 %	50 %	115522535
14542	NC_008435	TGC	2	6	555096	555101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522536
14543	NC_008435	CAAT	2	8	555121	555128	50 %	25 %	0 %	25 %	115522536
14544	NC_008435	GGC	2	6	555211	555216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522536
14545	NC_008435	TGC	2	6	555219	555224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522536
14546	NC_008435	GCG	2	6	555254	555259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522536
14547	NC_008435	TCGA	2	8	555263	555270	25 %	25 %	25 %	25 %	115522536
14548	NC_008435	GC	3	6	555298	555303	0 %	0 %	50 %	50 %	115522536
14549	NC_008435	TCG	2	6	555321	555326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522536
14550	NC_008435	GCG	2	6	555335	555340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522536
14551	NC_008435	CG	3	6	555347	555352	0 %	0 %	50 %	50 %	115522536
14552	NC_008435	CGA	2	6	555393	555398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522536
14553	NC_008435	GCTG	3	12	555405	555416	0 %	25 %	50 %	25 %	115522536
14554	NC_008435	GCT	2	6	555511	555516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522536
14555	NC_008435	CG	3	6	555572	555577	0 %	0 %	50 %	50 %	115522536
14556	NC_008435	CAGC	2	8	555588	555595	25 %	0 %	25 %	50 %	115522536
14557	NC_008435	GCC	2	6	555596	555601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522536
14558	NC_008435	AGCAGA	2	12	555633	555644	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	115522536
14559	NC_008435	CGC	2	6	555661	555666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522536
14560	NC_008435	GC	3	6	555675	555680	0 %	0 %	50 %	50 %	115522536
14561	NC_008435	AGCG	2	8	555684	555691	25 %	0 %	50 %	25 %	115522536
14562	NC_008435	AGC	2	6	555697	555702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522536
14563	NC_008435	CGC	2	6	555784	555789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522536
14564	NC_008435	GCA	2	6	555796	555801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522536
14565	NC_008435	CAG	2	6	555815	555820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522536
14566	NC_008435	CAA	2	6	555880	555885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522536
14567	NC_008435	GAT	2	6	555886	555891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522536
14568	NC_008435	GC	3	6	555893	555898	0 %	0 %	50 %	50 %	115522536
14569	NC_008435	TGG	2	6	555963	555968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522536
14570	NC_008435	CGG	2	6	556057	556062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522536
14571	NC_008435	CAA	2	6	556063	556068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522536
14572	NC_008435	CGT	2	6	556072	556077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522536
14573	NC_008435	CGA	2	6	556099	556104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522536
14574	NC_008435	CGC	2	6	556123	556128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522536
14575	NC_008435	CAG	2	6	556184	556189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522536
14576	NC_008435	CGC	4	12	556195	556206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522536
14577	NC_008435	GAT	2	6	556222	556227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522536
14578	NC_008435	CGG	2	6	556258	556263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522536
14579	NC_008435	CGG	3	9	556305	556313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522536
14580	NC_008435	GGC	2	6	556405	556410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522536
14581	NC_008435	GCC	2	6	556449	556454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522536
14582	NC_008435	CG	3	6	556513	556518	0 %	0 %	50 %	50 %	115522536
14583	NC_008435	GGC	2	6	556537	556542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522536
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14587	NC_008435	GTG	2	6	556661	556666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522536
14588	NC_008435	GCGA	2	8	556667	556674	25 %	0 %	50 %	25 %	115522536
14589	NC_008435	GC	3	6	556722	556727	0 %	0 %	50 %	50 %	115522536
14590	NC_008435	CCA	2	6	556788	556793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522536
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14592	NC_008435	GAG	2	6	556838	556843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522536
14593	NC_008435	GCC	2	6	556886	556891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522536
14594	NC_008435	CCG	2	6	556899	556904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522536
14595	NC_008435	GCGCCA	2	12	556938	556949	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115522536
14596	NC_008435	CAG	2	6	557014	557019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522536
14597	NC_008435	GCGG	2	8	557047	557054	0 %	0 %	75 %	25 %	115522536
14598	NC_008435	CCG	2	6	557151	557156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14599	NC_008435	AGC	2	6	557200	557205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14600	NC_008435	GTA	2	6	557208	557213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_008435	ACG	2	6	557293	557298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522537
14602	NC_008435	TGG	2	6	557348	557353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522537
14603	NC_008435	TGC	2	6	557374	557379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522537
14604	NC_008435	GC	3	6	557417	557422	0 %	0 %	50 %	50 %	115522537
14605	NC_008435	GGT	2	6	557460	557465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522537
14606	NC_008435	CCG	3	9	557534	557542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522537
14607	NC_008435	GATC	2	8	557543	557550	25 %	25 %	25 %	25 %	115522537
14608	NC_008435	GAT	2	6	557613	557618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522537
14609	NC_008435	CGA	2	6	557624	557629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522537
14610	NC_008435	GCCG	2	8	557685	557692	0 %	0 %	50 %	50 %	115522537
14611	NC_008435	CCA	2	6	557693	557698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522537
14612	NC_008435	CGG	2	6	557702	557707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522537
14613	NC_008435	CAT	2	6	557724	557729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522537
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14615	NC_008435	CGC	2	6	557817	557822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522537
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14617	NC_008435	GAG	2	6	557944	557949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522537
14618	NC_008435	GC	3	6	557970	557975	0 %	0 %	50 %	50 %	115522537
14619	NC_008435	CCG	2	6	557999	558004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522537
14620	NC_008435	CCA	2	6	558014	558019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522537
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14622	NC_008435	CCG	2	6	558178	558183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522537
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14735	NC_008435	AAGCTG	2	12	562436	562447	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	115522542
14736	NC_008435	TCG	2	6	562481	562486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14737	NC_008435	GATCG	2	10	562532	562541	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14738	NC_008435	GCC	4	12	562545	562556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14739	NC_008435	CGAT	2	8	562610	562617	25 %	25 %	25 %	25 %	115522543
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14741	NC_008435	TGA	2	6	562662	562667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522543
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14864	NC_008435	TGC	2	6	566934	566939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522547
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14867	NC_008435	GCT	2	6	566989	566994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522547
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14943	NC_008435	TCG	2	6	569885	569890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522549
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14951	NC_008435	GCA	2	6	570252	570257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522549
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14954	NC_008435	GATC	2	8	570442	570449	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14955	NC_008435	GGGC	2	8	570452	570459	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14956	NC_008435	TC	3	6	570478	570483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14957	NC_008435	GCG	3	9	570495	570503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14958	NC_008435	GC	3	6	570519	570524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14959	NC_008435	GC	3	6	570533	570538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14960	NC_008435	TGC	2	6	570646	570651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522550
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14962	NC_008435	GC	3	6	570675	570680	0 %	0 %	50 %	50 %	115522550
14963	NC_008435	GCT	2	6	570692	570697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522550
14964	NC_008435	GGCC	2	8	570704	570711	0 %	0 %	50 %	50 %	115522550
14965	NC_008435	CGC	2	6	570736	570741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522550
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14970	NC_008435	CTG	2	6	570888	570893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522550
14971	NC_008435	GCCTC	2	10	570908	570917	0 %	20 %	20 %	60 %	115522550
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14973	NC_008435	GGCGT	2	10	570930	570939	0 %	20 %	60 %	20 %	115522550
14974	NC_008435	GC	3	6	570988	570993	0 %	0 %	50 %	50 %	115522550
14975	NC_008435	GCC	2	6	571019	571024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522550
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14977	NC_008435	CG	3	6	571052	571057	0 %	0 %	50 %	50 %	115522550
14978	NC_008435	CGTG	2	8	571072	571079	0 %	25 %	50 %	25 %	115522550
14979	NC_008435	GGC	2	6	571085	571090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522550
14980	NC_008435	CGC	2	6	571145	571150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522550
14981	NC_008435	CAC	2	6	571174	571179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522550
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14983	NC_008435	CTG	2	6	571257	571262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522550
14984	NC_008435	CGC	2	6	571278	571283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522550
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