MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 142158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_008435	GCG	2	6	513886	513891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522493
13502	NC_008435	GCA	2	6	513905	513910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522493
13503	NC_008435	GGT	2	6	513945	513950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522493
13504	NC_008435	TGGCC	2	10	513998	514007	0 %	20 %	40 %	40 %	115522493
13505	NC_008435	CG	3	6	514014	514019	0 %	0 %	50 %	50 %	115522493
13506	NC_008435	TGC	2	6	514034	514039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522493
13507	NC_008435	GCC	2	6	514041	514046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522493
13508	NC_008435	GCA	2	6	514061	514066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522493
13509	NC_008435	CAG	2	6	514086	514091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522493
13510	NC_008435	GGC	2	6	514129	514134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522493
13511	NC_008435	GCA	2	6	514187	514192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522493
13512	NC_008435	GGCG	2	8	514194	514201	0 %	0 %	75 %	25 %	115522493
13513	NC_008435	CGC	2	6	514220	514225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522493
13514	NC_008435	CGG	2	6	514247	514252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522493
13515	NC_008435	CG	3	6	514290	514295	0 %	0 %	50 %	50 %	115522493
13516	NC_008435	TCGGCC	2	12	514303	514314	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	115522493
13517	NC_008435	GC	3	6	514360	514365	0 %	0 %	50 %	50 %	115522493
13518	NC_008435	CAG	2	6	514380	514385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522493
13519	NC_008435	TGG	2	6	514388	514393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522493
13520	NC_008435	CGG	2	6	514418	514423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522493
13521	NC_008435	CAG	2	6	514524	514529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522493
13522	NC_008435	GCCAA	2	10	514537	514546	40 %	0 %	20 %	40 %	115522493
13523	NC_008435	CAG	2	6	514578	514583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522493
13524	NC_008435	CGCC	2	8	514607	514614	0 %	0 %	25 %	75 %	115522493
13525	NC_008435	GCG	2	6	514737	514742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13526	NC_008435	CG	3	6	514804	514809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13527	NC_008435	CTC	2	6	514828	514833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13528	NC_008435	GGC	2	6	514871	514876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13529	NC_008435	CGC	3	9	514887	514895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13530	NC_008435	GCC	2	6	514957	514962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522494
13531	NC_008435	CGG	2	6	514978	514983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522494
13532	NC_008435	GC	5	10	515007	515016	0 %	0 %	50 %	50 %	115522494
13533	NC_008435	CGC	2	6	515049	515054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522494
13534	NC_008435	ACG	2	6	515093	515098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522494
13535	NC_008435	CGC	2	6	515106	515111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522494
13536	NC_008435	GCC	2	6	515165	515170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522494
13537	NC_008435	GCG	2	6	515268	515273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522494
13538	NC_008435	GCC	2	6	515288	515293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522494
13539	NC_008435	CGG	2	6	515307	515312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522494
13540	NC_008435	TTGT	2	8	515391	515398	0 %	75 %	25 %	0 %	115522495
13541	NC_008435	CG	3	6	515419	515424	0 %	0 %	50 %	50 %	115522495
13542	NC_008435	CGT	2	6	515441	515446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522495
13543	NC_008435	CAG	2	6	515499	515504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522495
13544	NC_008435	CGC	2	6	515522	515527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522495
13545	NC_008435	CGC	2	6	515534	515539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522495
13546	NC_008435	CGT	2	6	515552	515557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522495
13547	NC_008435	CGA	2	6	515561	515566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522495
13548	NC_008435	CG	3	6	515584	515589	0 %	0 %	50 %	50 %	115522495
13549	NC_008435	CG	3	6	515599	515604	0 %	0 %	50 %	50 %	115522495
13550	NC_008435	CGG	2	6	515627	515632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522495
13551	NC_008435	GCG	2	6	515648	515653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522495
13552	NC_008435	GC	3	6	515665	515670	0 %	0 %	50 %	50 %	115522495
13553	NC_008435	CGG	2	6	515726	515731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522495
13554	NC_008435	CTT	2	6	515736	515741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522495
13555	NC_008435	CGCC	2	8	515753	515760	0 %	0 %	25 %	75 %	115522495
13556	NC_008435	CGG	2	6	515786	515791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522495
13557	NC_008435	CGGC	2	8	515807	515814	0 %	0 %	50 %	50 %	115522495
13558	NC_008435	CGC	2	6	515817	515822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522495
13559	NC_008435	CCG	2	6	515828	515833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522495
13560	NC_008435	CGG	2	6	515877	515882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522495
13561	NC_008435	GCC	3	9	515932	515940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522495
13562	NC_008435	GCG	3	9	515941	515949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522495
13563	NC_008435	TGGG	2	8	516013	516020	0 %	25 %	75 %	0 %	115522495
13564	NC_008435	CGG	2	6	516023	516028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522495
13565	NC_008435	GCG	2	6	516065	516070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522495
13566	NC_008435	CGG	2	6	516086	516091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522495
13567	NC_008435	ATC	2	6	516172	516177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522495
13568	NC_008435	GCG	2	6	516210	516215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522495
13569	NC_008435	GGC	2	6	516219	516224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522495
13570	NC_008435	CAG	2	6	516258	516263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522495
13571	NC_008435	TGG	2	6	516275	516280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522495
13572	NC_008435	GTC	2	6	516303	516308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522495
13573	NC_008435	CGG	2	6	516341	516346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522495
13574	NC_008435	CCA	2	6	516356	516361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522495
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13576	NC_008435	GC	3	6	516439	516444	0 %	0 %	50 %	50 %	115522495
13577	NC_008435	GCG	2	6	516470	516475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522495
13578	NC_008435	TGC	2	6	516484	516489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522495
13579	NC_008435	GCG	2	6	516490	516495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522495
13580	NC_008435	GCC	2	6	516536	516541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522495
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13584	NC_008435	GCC	2	6	516666	516671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522495
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13586	NC_008435	TGC	2	6	516719	516724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522495
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13588	NC_008435	GC	3	6	516753	516758	0 %	0 %	50 %	50 %	115522495
13589	NC_008435	CG	3	6	516759	516764	0 %	0 %	50 %	50 %	115522495
13590	NC_008435	CGT	2	6	516788	516793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522495
13591	NC_008435	CGGT	2	8	516821	516828	0 %	25 %	50 %	25 %	115522495
13592	NC_008435	CCG	2	6	516901	516906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13593	NC_008435	CAAT	2	8	516939	516946	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13594	NC_008435	GGT	2	6	516967	516972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13595	NC_008435	CGT	2	6	517028	517033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13596	NC_008435	CATC	2	8	517119	517126	25 %	25 %	0 %	50 %	115522496
13597	NC_008435	TGA	2	6	517152	517157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522496
13598	NC_008435	AAGA	2	8	517186	517193	75 %	0 %	25 %	0 %	115522496
13599	NC_008435	ATC	2	6	517330	517335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522496
13600	NC_008435	CG	3	6	517392	517397	0 %	0 %	50 %	50 %	115522496
13601	NC_008435	AGC	2	6	517415	517420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522496
13602	NC_008435	ACAA	2	8	517451	517458	75 %	0 %	0 %	25 %	115522496
13603	NC_008435	TGG	2	6	517520	517525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522496
13604	NC_008435	CGC	2	6	517794	517799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522496
13605	NC_008435	TGA	2	6	517806	517811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522496
13606	NC_008435	CAA	2	6	517865	517870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522496
13607	NC_008435	TA	3	6	517994	517999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13608	NC_008435	AG	4	8	518088	518095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13609	NC_008435	GAT	2	6	518177	518182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522497
13610	NC_008435	GCG	2	6	518213	518218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522497
13611	NC_008435	CAC	2	6	518420	518425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522497
13612	NC_008435	GC	3	6	518468	518473	0 %	0 %	50 %	50 %	115522497
13613	NC_008435	TCT	2	6	518497	518502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522497
13614	NC_008435	CAA	2	6	518504	518509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522497
13615	NC_008435	CCGG	2	8	518518	518525	0 %	0 %	50 %	50 %	115522497
13616	NC_008435	AGC	3	9	518556	518564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522497
13617	NC_008435	CAG	2	6	518567	518572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522497
13618	NC_008435	CGG	2	6	518593	518598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522497
13619	NC_008435	ATG	2	6	518657	518662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522497
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13621	NC_008435	TGA	2	6	518719	518724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522497
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13742	NC_008435	TCGCG	2	10	523899	523908	0 %	20 %	40 %	40 %	115522502
13743	NC_008435	CAA	2	6	523933	523938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522502
13744	NC_008435	GCC	2	6	523946	523951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522502
13745	NC_008435	GC	3	6	523956	523961	0 %	0 %	50 %	50 %	115522502
13746	NC_008435	CGA	2	6	523966	523971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522502
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13748	NC_008435	GC	3	6	524056	524061	0 %	0 %	50 %	50 %	115522502
13749	NC_008435	CGC	3	9	524059	524067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522502
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13751	NC_008435	CGA	2	6	524183	524188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522502
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13756	NC_008435	CGA	2	6	524326	524331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522502
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13758	NC_008435	CTCGC	2	10	524357	524366	0 %	20 %	20 %	60 %	115522502
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13762	NC_008435	GGTTGC	2	12	524630	524641	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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13764	NC_008435	CGC	2	6	524675	524680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13765	NC_008435	CGT	2	6	524712	524717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522503
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13768	NC_008435	CTG	2	6	524971	524976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522503
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13770	NC_008435	CGGC	2	8	525030	525037	0 %	0 %	50 %	50 %	115522503
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13790	NC_008435	GGT	2	6	525615	525620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522503
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13792	NC_008435	GTC	2	6	525664	525669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13794	NC_008435	TCA	2	6	525812	525817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13797	NC_008435	GTC	2	6	525867	525872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13822	NC_008435	GAGC	2	8	526590	526597	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13823	NC_008435	CCG	2	6	526604	526609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13824	NC_008435	CTT	2	6	526615	526620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13825	NC_008435	GAT	2	6	526649	526654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13826	NC_008435	CCG	2	6	526680	526685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13827	NC_008435	ACG	2	6	526703	526708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13847	NC_008435	GC	3	6	527340	527345	0 %	0 %	50 %	50 %	115522505
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13986	NC_008435	CGA	2	6	533082	533087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522512
13987	NC_008435	GGT	2	6	533088	533093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522512
13988	NC_008435	CGC	2	6	533107	533112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522512
13989	NC_008435	TCAAGG	2	12	533150	533161	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	115522512
13990	NC_008435	CGGC	2	8	533207	533214	0 %	0 %	50 %	50 %	115522512
13991	NC_008435	GTG	3	9	533260	533268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522512
13992	NC_008435	GGAT	2	8	533291	533298	25 %	25 %	50 %	0 %	115522512
13993	NC_008435	CGC	3	9	533331	533339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522512
13994	NC_008435	AAG	2	6	533356	533361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522512
13995	NC_008435	CAT	2	6	533364	533369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522512
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13998	NC_008435	AAG	2	6	533551	533556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522512
13999	NC_008435	GGA	2	6	533607	533612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522512
14000	NC_008435	GAT	3	9	533637	533645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522512

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