MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 142158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
135001	NC_008435	ATG	2	6	5231666	5231671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526645
135002	NC_008435	GGT	2	6	5231685	5231690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115526645
135003	NC_008435	CGG	3	9	5231721	5231729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526645
135004	NC_008435	GC	3	6	5231750	5231755	0 %	0 %	50 %	50 %	115526645
135005	NC_008435	AGCG	2	8	5231771	5231778	25 %	0 %	50 %	25 %	115526645
135006	NC_008435	CGA	2	6	5231796	5231801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526645
135007	NC_008435	CG	3	6	5231847	5231852	0 %	0 %	50 %	50 %	115526645
135008	NC_008435	GGA	2	6	5231919	5231924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135009	NC_008435	GC	4	8	5232007	5232014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135010	NC_008435	CGT	2	6	5232080	5232085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526646
135011	NC_008435	AGC	2	6	5232124	5232129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526646
135012	NC_008435	GAT	2	6	5232153	5232158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526646
135013	NC_008435	GCGCC	2	10	5232212	5232221	0 %	0 %	40 %	60 %	115526646
135014	NC_008435	GCT	2	6	5232262	5232267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526646
135015	NC_008435	CAG	2	6	5232279	5232284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526646
135016	NC_008435	CGG	2	6	5232285	5232290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526646
135017	NC_008435	CGC	2	6	5232308	5232313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526646
135018	NC_008435	ATGCCG	2	12	5232331	5232342	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	115526646
135019	NC_008435	CAG	3	9	5232354	5232362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526646
135020	NC_008435	CAC	2	6	5232384	5232389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115526646
135021	NC_008435	GGT	2	6	5232396	5232401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115526646
135022	NC_008435	GCG	2	6	5232431	5232436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526646
135023	NC_008435	AGCG	2	8	5232457	5232464	25 %	0 %	50 %	25 %	115526646
135024	NC_008435	CAG	2	6	5232465	5232470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526646
135025	NC_008435	CGC	2	6	5232491	5232496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526646
135026	NC_008435	CG	3	6	5232524	5232529	0 %	0 %	50 %	50 %	115526646
135027	NC_008435	CAG	2	6	5232573	5232578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526646
135028	NC_008435	GAT	2	6	5232597	5232602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526646
135029	NC_008435	GTC	2	6	5232664	5232669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526646
135030	NC_008435	ATGA	2	8	5232670	5232677	50 %	25 %	25 %	0 %	115526646
135031	NC_008435	GT	3	6	5232718	5232723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135032	NC_008435	GAT	2	6	5232739	5232744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135033	NC_008435	CAG	2	6	5232861	5232866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526647
135034	NC_008435	GCC	2	6	5232882	5232887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526647
135035	NC_008435	ATC	2	6	5232889	5232894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526647
135036	NC_008435	GCA	2	6	5232950	5232955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526647
135037	NC_008435	GAT	2	6	5232963	5232968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526647
135038	NC_008435	CCA	2	6	5232971	5232976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115526647
135039	NC_008435	TCA	2	6	5232980	5232985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526647
135040	NC_008435	CAC	2	6	5233010	5233015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115526647
135041	NC_008435	CG	3	6	5233040	5233045	0 %	0 %	50 %	50 %	115526647
135042	NC_008435	CG	3	6	5233050	5233055	0 %	0 %	50 %	50 %	115526647
135043	NC_008435	CGG	2	6	5233061	5233066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526647
135044	NC_008435	GC	3	6	5233071	5233076	0 %	0 %	50 %	50 %	115526647
135045	NC_008435	CAC	2	6	5233116	5233121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115526647
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135050	NC_008435	AGC	2	6	5233285	5233290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526647
135051	NC_008435	GAT	2	6	5233296	5233301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526647
135052	NC_008435	CAC	2	6	5233317	5233322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115526647
135053	NC_008435	GCCGC	2	10	5233331	5233340	0 %	0 %	40 %	60 %	115526647
135054	NC_008435	CGGA	2	8	5233388	5233395	25 %	0 %	50 %	25 %	115526647
135055	NC_008435	CG	3	6	5233416	5233421	0 %	0 %	50 %	50 %	115526647
135056	NC_008435	GCC	2	6	5233440	5233445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526647
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135060	NC_008435	CG	3	6	5233625	5233630	0 %	0 %	50 %	50 %	115526647
135061	NC_008435	GGC	2	6	5233658	5233663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526647
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135065	NC_008435	CG	3	6	5233830	5233835	0 %	0 %	50 %	50 %	115526647
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135068	NC_008435	TGA	2	6	5234063	5234068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526647
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135070	NC_008435	CGGTCG	2	12	5234099	5234110	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	115526647
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135074	NC_008435	GCA	2	6	5234180	5234185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526647
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135089	NC_008435	GCC	2	6	5234739	5234744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526647
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135095	NC_008435	GCA	2	6	5234849	5234854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526647
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135099	NC_008435	TCG	2	6	5235112	5235117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526647
135100	NC_008435	CG	4	8	5235131	5235138	0 %	0 %	50 %	50 %	115526647
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135103	NC_008435	CAT	2	6	5235303	5235308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526647
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135107	NC_008435	CAG	2	6	5235480	5235485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526647
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135109	NC_008435	GCGCC	2	10	5235560	5235569	0 %	0 %	40 %	60 %	115526647
135110	NC_008435	CG	3	6	5235587	5235592	0 %	0 %	50 %	50 %	115526647
135111	NC_008435	GC	3	6	5235594	5235599	0 %	0 %	50 %	50 %	115526647
135112	NC_008435	ACGA	2	8	5235637	5235644	50 %	0 %	25 %	25 %	115526647
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135115	NC_008435	GCG	2	6	5235740	5235745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526647
135116	NC_008435	GA	3	6	5235787	5235792	50 %	0 %	50 %	0 %	115526647
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135231	NC_008435	GAT	2	6	5240070	5240075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526652
135232	NC_008435	TTG	2	6	5240134	5240139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115526652
135233	NC_008435	GGTC	2	8	5240162	5240169	0 %	25 %	50 %	25 %	115526652
135234	NC_008435	GAT	2	6	5240178	5240183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526652
135235	NC_008435	GTC	2	6	5240184	5240189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526652
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135238	NC_008435	TAC	2	6	5240393	5240398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135239	NC_008435	CCG	2	6	5240464	5240469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526653
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135246	NC_008435	GCA	2	6	5240670	5240675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526653
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135333	NC_008435	GC	3	6	5243846	5243851	0 %	0 %	50 %	50 %	115526654
135334	NC_008435	GCC	2	6	5243877	5243882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526654
135335	NC_008435	CCG	2	6	5243894	5243899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526654
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135337	NC_008435	GCCG	2	8	5243984	5243991	0 %	0 %	50 %	50 %	115526654
135338	NC_008435	GCG	3	9	5244078	5244086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526654
135339	NC_008435	CGC	2	6	5244107	5244112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526654
135340	NC_008435	CTG	2	6	5244132	5244137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526654
135341	NC_008435	CG	3	6	5244141	5244146	0 %	0 %	50 %	50 %	115526654
135342	NC_008435	ACA	2	6	5244164	5244169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115526654
135343	NC_008435	GGT	2	6	5244303	5244308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115526654
135344	NC_008435	GCTC	2	8	5244337	5244344	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135345	NC_008435	GCTC	2	8	5244365	5244372	0 %	25 %	25 %	50 %	115526655
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135372	NC_008435	TGA	2	6	5245592	5245597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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135456	NC_008435	TCG	2	6	5248972	5248977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526658
135457	NC_008435	TCG	2	6	5249086	5249091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526659
135458	NC_008435	ATC	2	6	5249127	5249132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526659
135459	NC_008435	CAA	2	6	5249146	5249151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115526659
135460	NC_008435	CGA	2	6	5249191	5249196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526659
135461	NC_008435	A	6	6	5249242	5249247	100 %	0 %	0 %	0 %	115526659
135462	NC_008435	CGC	2	6	5249316	5249321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526659
135463	NC_008435	GC	3	6	5249348	5249353	0 %	0 %	50 %	50 %	115526659
135464	NC_008435	AG	3	6	5249366	5249371	50 %	0 %	50 %	0 %	115526659
135465	NC_008435	GCGCC	2	10	5249378	5249387	0 %	0 %	40 %	60 %	115526659
135466	NC_008435	ATC	2	6	5249409	5249414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526659
135467	NC_008435	CGT	2	6	5249440	5249445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526659
135468	NC_008435	GCA	2	6	5249506	5249511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526659
135469	NC_008435	GTC	2	6	5249513	5249518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526659
135470	NC_008435	GCC	2	6	5249588	5249593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526659
135471	NC_008435	CTT	2	6	5249600	5249605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115526659
135472	NC_008435	CAG	2	6	5249606	5249611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526659
135473	NC_008435	GAA	2	6	5249660	5249665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115526659
135474	NC_008435	GTG	2	6	5249679	5249684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115526659
135475	NC_008435	GTT	2	6	5249726	5249731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115526659
135476	NC_008435	GTC	2	6	5249738	5249743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526659
135477	NC_008435	AGCG	2	8	5249768	5249775	25 %	0 %	50 %	25 %	115526659
135478	NC_008435	CAT	2	6	5249807	5249812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526659
135479	NC_008435	CCA	2	6	5249851	5249856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115526659
135480	NC_008435	ATC	2	6	5249865	5249870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526659
135481	NC_008435	GCC	2	6	5249932	5249937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526660
135482	NC_008435	TCG	2	6	5249971	5249976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526660
135483	NC_008435	GAC	2	6	5249977	5249982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526660
135484	NC_008435	GAT	2	6	5250006	5250011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526660
135485	NC_008435	CCGC	2	8	5250060	5250067	0 %	0 %	25 %	75 %	115526660
135486	NC_008435	CGG	2	6	5250075	5250080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526660
135487	NC_008435	TCG	3	9	5250094	5250102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526660
135488	NC_008435	GAT	3	9	5250177	5250185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526660
135489	NC_008435	CGA	2	6	5250239	5250244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526660
135490	NC_008435	CG	3	6	5250319	5250324	0 %	0 %	50 %	50 %	115526660
135491	NC_008435	TC	3	6	5250332	5250337	0 %	50 %	0 %	50 %	115526660
135492	NC_008435	GATACC	2	12	5250348	5250359	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	115526660
135493	NC_008435	TCT	2	6	5250410	5250415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115526660
135494	NC_008435	CG	3	6	5250461	5250466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135495	NC_008435	CCG	2	6	5250532	5250537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526661
135496	NC_008435	CGC	2	6	5250600	5250605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526661
135497	NC_008435	GC	3	6	5250641	5250646	0 %	0 %	50 %	50 %	115526661
135498	NC_008435	GCG	2	6	5250656	5250661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526661
135499	NC_008435	GCT	2	6	5250668	5250673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526661
135500	NC_008435	TGG	2	6	5250692	5250697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115526661

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