MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 142158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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130002	NC_008435	CGGC	2	8	5043387	5043394	0 %	0 %	50 %	50 %	115526494
130003	NC_008435	CCG	2	6	5043420	5043425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526494
130004	NC_008435	AGC	2	6	5043439	5043444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526494
130005	NC_008435	CGC	2	6	5043540	5043545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526494
130006	NC_008435	GCTG	2	8	5043604	5043611	0 %	25 %	50 %	25 %	115526494
130007	NC_008435	GCC	2	6	5043639	5043644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526494
130008	NC_008435	GCC	2	6	5043688	5043693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526494
130009	NC_008435	TCC	2	6	5043709	5043714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115526494
130010	NC_008435	CGT	2	6	5043918	5043923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130011	NC_008435	CCG	2	6	5044002	5044007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526495
130012	NC_008435	CCGA	2	8	5044013	5044020	25 %	0 %	25 %	50 %	115526495
130013	NC_008435	ACGCA	2	10	5044025	5044034	40 %	0 %	20 %	40 %	115526495
130014	NC_008435	ACG	2	6	5044068	5044073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526495
130015	NC_008435	GAT	2	6	5044108	5044113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526495
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130017	NC_008435	GCA	2	6	5044187	5044192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526495
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130020	NC_008435	GAT	2	6	5044387	5044392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526495
130021	NC_008435	GTGC	2	8	5044405	5044412	0 %	25 %	50 %	25 %	115526495
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130025	NC_008435	GCTG	2	8	5044503	5044510	0 %	25 %	50 %	25 %	115526495
130026	NC_008435	GCTG	2	8	5044515	5044522	0 %	25 %	50 %	25 %	115526495
130027	NC_008435	CG	3	6	5044542	5044547	0 %	0 %	50 %	50 %	115526495
130028	NC_008435	CTG	2	6	5044565	5044570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526495
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130033	NC_008435	GCT	2	6	5044704	5044709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526496
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130114	NC_008435	TCAG	2	8	5047811	5047818	25 %	25 %	25 %	25 %	115526499
130115	NC_008435	CGGT	2	8	5047830	5047837	0 %	25 %	50 %	25 %	115526499
130116	NC_008435	CGGC	2	8	5047848	5047855	0 %	0 %	50 %	50 %	115526499
130117	NC_008435	CGG	2	6	5047968	5047973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526499
130118	NC_008435	CAC	2	6	5048010	5048015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115526499
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130120	NC_008435	CAT	2	6	5048070	5048075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526499
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130122	NC_008435	TCA	2	6	5048114	5048119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526499
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130126	NC_008435	CGAG	2	8	5048262	5048269	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130127	NC_008435	ACA	2	6	5048285	5048290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130128	NC_008435	CG	3	6	5048306	5048311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130129	NC_008435	AGCG	2	8	5048318	5048325	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130130	NC_008435	CG	3	6	5048391	5048396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130131	NC_008435	TACG	2	8	5048399	5048406	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130132	NC_008435	T	6	6	5048448	5048453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130133	NC_008435	TG	3	6	5048468	5048473	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130134	NC_008435	CG	4	8	5048476	5048483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130135	NC_008435	GATT	2	8	5048488	5048495	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130136	NC_008435	CCG	2	6	5048544	5048549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130137	NC_008435	CGG	2	6	5048628	5048633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526500
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130140	NC_008435	TGC	2	6	5048777	5048782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526500
130141	NC_008435	GCC	2	6	5048848	5048853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526500
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130143	NC_008435	CGT	2	6	5048889	5048894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526500
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130146	NC_008435	TCG	2	6	5048997	5049002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526500
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130149	NC_008435	TGG	2	6	5049098	5049103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115526500
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130152	NC_008435	CGC	2	6	5049173	5049178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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130183	NC_008435	TCGA	2	8	5050708	5050715	25 %	25 %	25 %	25 %	115526503
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130185	NC_008435	ACA	2	6	5050896	5050901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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130215	NC_008435	GC	3	6	5052122	5052127	0 %	0 %	50 %	50 %	115526505
130216	NC_008435	CAC	2	6	5052160	5052165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115526505
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130220	NC_008435	ATG	2	6	5052323	5052328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526505
130221	NC_008435	GTC	2	6	5052394	5052399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526505
130222	NC_008435	GCT	2	6	5052414	5052419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526505
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130226	NC_008435	TTC	2	6	5052628	5052633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115526505
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130228	NC_008435	CGA	2	6	5052794	5052799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526506
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130230	NC_008435	CGACGC	2	12	5052815	5052826	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115526506
130231	NC_008435	CGG	2	6	5052908	5052913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526506
130232	NC_008435	AGC	2	6	5052944	5052949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526506
130233	NC_008435	GCT	2	6	5052977	5052982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526506
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130249	NC_008435	CG	3	6	5053795	5053800	0 %	0 %	50 %	50 %	115526507
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130276	NC_008435	CGACA	2	10	5054862	5054871	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
130277	NC_008435	CG	3	6	5054885	5054890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130278	NC_008435	GCG	2	6	5055044	5055049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526508
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130330	NC_008435	CGACAG	2	12	5057089	5057100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526510
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130332	NC_008435	GC	3	6	5057172	5057177	0 %	0 %	50 %	50 %	115526510
130333	NC_008435	ACC	2	6	5057255	5057260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115526510
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130335	NC_008435	ATG	2	6	5057327	5057332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526510
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130340	NC_008435	CG	5	10	5057535	5057544	0 %	0 %	50 %	50 %	115526510
130341	NC_008435	CGG	3	9	5057553	5057561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526510
130342	NC_008435	CGA	2	6	5057584	5057589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526510
130343	NC_008435	TGC	2	6	5057603	5057608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526510
130344	NC_008435	GCA	2	6	5057619	5057624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526510
130345	NC_008435	CGC	2	6	5057626	5057631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526510
130346	NC_008435	GGT	2	6	5057653	5057658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115526510
130347	NC_008435	GCG	2	6	5057685	5057690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526510
130348	NC_008435	CAC	2	6	5057712	5057717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115526511
130349	NC_008435	AGAT	2	8	5057815	5057822	50 %	25 %	25 %	0 %	115526511
130350	NC_008435	CGC	2	6	5057855	5057860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526511
130351	NC_008435	GCG	2	6	5057948	5057953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526511
130352	NC_008435	TGC	2	6	5057960	5057965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526511
130353	NC_008435	CGG	2	6	5058000	5058005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526511
130354	NC_008435	GC	3	6	5058031	5058036	0 %	0 %	50 %	50 %	115526511
130355	NC_008435	GGC	2	6	5058039	5058044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526511
130356	NC_008435	CGG	2	6	5058051	5058056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526511
130357	NC_008435	GGC	2	6	5058091	5058096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526511
130358	NC_008435	CGC	2	6	5058134	5058139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526511
130359	NC_008435	GCC	3	9	5058204	5058212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526511
130360	NC_008435	GAT	2	6	5058251	5058256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526511
130361	NC_008435	TCCGC	2	10	5058269	5058278	0 %	20 %	20 %	60 %	115526511
130362	NC_008435	CGC	2	6	5058327	5058332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526511
130363	NC_008435	CTC	2	6	5058333	5058338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115526511
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130365	NC_008435	TCA	2	6	5058383	5058388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526511
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130368	NC_008435	TCG	2	6	5058463	5058468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526511
130369	NC_008435	GAT	2	6	5058480	5058485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526511
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130372	NC_008435	GATC	2	8	5058572	5058579	25 %	25 %	25 %	25 %	115526511
130373	NC_008435	GCA	2	6	5058581	5058586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526511
130374	NC_008435	GC	3	6	5058614	5058619	0 %	0 %	50 %	50 %	115526511
130375	NC_008435	TTC	2	6	5058661	5058666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115526511
130376	NC_008435	TGC	2	6	5058703	5058708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526511
130377	NC_008435	CAG	2	6	5058740	5058745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526512
130378	NC_008435	CGG	2	6	5058771	5058776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526512
130379	NC_008435	CGA	2	6	5058819	5058824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526512
130380	NC_008435	CAG	2	6	5058844	5058849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526512
130381	NC_008435	CGC	2	6	5058882	5058887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526512
130382	NC_008435	TCG	3	9	5058905	5058913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526512
130383	NC_008435	CG	3	6	5058912	5058917	0 %	0 %	50 %	50 %	115526512
130384	NC_008435	GCC	2	6	5058958	5058963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526512
130385	NC_008435	CCGC	2	8	5058986	5058993	0 %	0 %	25 %	75 %	115526512
130386	NC_008435	CGG	2	6	5059026	5059031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526512
130387	NC_008435	CTC	2	6	5059068	5059073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130388	NC_008435	GATC	2	8	5059115	5059122	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130389	NC_008435	GCGCC	2	10	5059242	5059251	0 %	0 %	40 %	60 %	115526513
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130391	NC_008435	TCG	2	6	5059273	5059278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526513
130392	NC_008435	CGT	2	6	5059340	5059345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526513
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130400	NC_008435	TCG	2	6	5059765	5059770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526513
130401	NC_008435	TGC	2	6	5059792	5059797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526513
130402	NC_008435	GCA	2	6	5059862	5059867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526513
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130405	NC_008435	TCA	2	6	5060068	5060073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526514
130406	NC_008435	TCG	2	6	5060074	5060079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526514
130407	NC_008435	AAC	2	6	5060090	5060095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115526514
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130409	NC_008435	AGGT	2	8	5060203	5060210	25 %	25 %	50 %	0 %	115526514
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130411	NC_008435	CGT	2	6	5060275	5060280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130412	NC_008435	CG	3	6	5060283	5060288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130413	NC_008435	CGC	2	6	5060301	5060306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130414	NC_008435	GC	3	6	5060344	5060349	0 %	0 %	50 %	50 %	115526515
130415	NC_008435	CGT	2	6	5060370	5060375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526515
130416	NC_008435	GT	3	6	5060374	5060379	0 %	50 %	50 %	0 %	115526515
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130418	NC_008435	TCC	2	6	5060423	5060428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115526515
130419	NC_008435	TGC	2	6	5060541	5060546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526516
130420	NC_008435	ATC	2	6	5060566	5060571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526516
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130422	NC_008435	CGA	2	6	5060585	5060590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526516
130423	NC_008435	CTC	2	6	5060601	5060606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115526516
130424	NC_008435	CGAAGC	2	12	5060627	5060638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526516
130425	NC_008435	GCT	2	6	5060654	5060659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526516
130426	NC_008435	GAC	2	6	5060664	5060669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526516
130427	NC_008435	ATC	2	6	5060692	5060697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526516
130428	NC_008435	TCA	2	6	5060723	5060728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526516
130429	NC_008435	TCGA	2	8	5060758	5060765	25 %	25 %	25 %	25 %	115526516
130430	NC_008435	AC	3	6	5060769	5060774	50 %	0 %	0 %	50 %	115526516
130431	NC_008435	CGA	2	6	5060825	5060830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526516
130432	NC_008435	GC	3	6	5060844	5060849	0 %	0 %	50 %	50 %	115526516
130433	NC_008435	GAT	2	6	5060859	5060864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526516
130434	NC_008435	GC	3	6	5060923	5060928	0 %	0 %	50 %	50 %	115526516
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130436	NC_008435	CTC	2	6	5061034	5061039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115526517
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130439	NC_008435	CG	4	8	5061168	5061175	0 %	0 %	50 %	50 %	115526517
130440	NC_008435	GCC	2	6	5061184	5061189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526517
130441	NC_008435	TCG	2	6	5061275	5061280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526517
130442	NC_008435	CAC	2	6	5061289	5061294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115526517
130443	NC_008435	GCC	2	6	5061502	5061507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526518
130444	NC_008435	AGATC	2	10	5061562	5061571	40 %	20 %	20 %	20 %	115526518
130445	NC_008435	CCGA	2	8	5061588	5061595	25 %	0 %	25 %	50 %	115526518
130446	NC_008435	GCG	2	6	5061606	5061611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526518
130447	NC_008435	CGG	2	6	5061667	5061672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526518
130448	NC_008435	GGC	2	6	5061676	5061681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526518
130449	NC_008435	TCG	2	6	5061756	5061761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526518
130450	NC_008435	GTG	3	9	5061792	5061800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115526518
130451	NC_008435	CCG	2	6	5061802	5061807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526518
130452	NC_008435	AGC	2	6	5061852	5061857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526518
130453	NC_008435	GCC	2	6	5061890	5061895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526518
130454	NC_008435	GCTG	2	8	5061931	5061938	0 %	25 %	50 %	25 %	115526518
130455	NC_008435	GGC	2	6	5061943	5061948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526518
130456	NC_008435	GGC	2	6	5061967	5061972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526518
130457	NC_008435	TCG	2	6	5062002	5062007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526518
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130459	NC_008435	CGG	3	9	5062075	5062083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526518
130460	NC_008435	CTG	2	6	5062139	5062144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526518
130461	NC_008435	CGC	2	6	5062153	5062158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526518
130462	NC_008435	GTG	2	6	5062164	5062169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115526518
130463	NC_008435	TCC	2	6	5062179	5062184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115526518
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130484	NC_008435	GC	3	6	5062970	5062975	0 %	0 %	50 %	50 %	115526519
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130488	NC_008435	GCC	3	9	5063074	5063082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526519
130489	NC_008435	CGG	2	6	5063084	5063089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526519
130490	NC_008435	CGG	3	9	5063133	5063141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526519
130491	NC_008435	GCC	2	6	5063295	5063300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526519
130492	NC_008435	ATG	2	6	5063308	5063313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526519
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