MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 142158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
125001	NC_008435	GC	3	6	4851843	4851848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125002	NC_008435	CCT	2	6	4851857	4851862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125003	NC_008435	TC	3	6	4851909	4851914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125004	NC_008435	CCAAT	2	10	4852007	4852016	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
125005	NC_008435	ACA	2	6	4852025	4852030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125006	NC_008435	CTTT	2	8	4852375	4852382	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125007	NC_008435	GCT	2	6	4852391	4852396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125008	NC_008435	CCT	2	6	4852407	4852412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125009	NC_008435	GTT	2	6	4852414	4852419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125010	NC_008435	GTT	2	6	4852481	4852486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125011	NC_008435	ACG	2	6	4852496	4852501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125012	NC_008435	CCG	2	6	4852513	4852518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125013	NC_008435	TTGG	2	8	4852555	4852562	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125014	NC_008435	C	6	6	4852606	4852611	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125015	NC_008435	TCC	2	6	4852735	4852740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125016	NC_008435	AGTG	2	8	4852741	4852748	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125017	NC_008435	ATA	2	6	4852890	4852895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125018	NC_008435	ACG	2	6	4852904	4852909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125019	NC_008435	TCG	2	6	4852977	4852982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125020	NC_008435	GAG	2	6	4853031	4853036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125021	NC_008435	C	6	6	4853058	4853063	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125022	NC_008435	CAT	2	6	4853107	4853112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125023	NC_008435	TCGC	2	8	4853204	4853211	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125024	NC_008435	ACT	2	6	4853213	4853218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125025	NC_008435	TCC	2	6	4853243	4853248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125026	NC_008435	AAATCC	2	12	4853332	4853343	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125027	NC_008435	CTT	2	6	4853463	4853468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125028	NC_008435	CA	3	6	4853578	4853583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125029	NC_008435	GCTT	2	8	4853655	4853662	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125030	NC_008435	TGA	2	6	4853679	4853684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125031	NC_008435	CAA	2	6	4853701	4853706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125032	NC_008435	CGC	2	6	4853710	4853715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125033	NC_008435	CCG	2	6	4853788	4853793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125034	NC_008435	GATC	2	8	4853806	4853813	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125035	NC_008435	AGC	2	6	4853915	4853920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125036	NC_008435	ATC	2	6	4853921	4853926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125037	NC_008435	CATC	2	8	4853936	4853943	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125038	NC_008435	TGG	2	6	4853944	4853949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125039	NC_008435	CGA	2	6	4853968	4853973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125040	NC_008435	AGA	2	6	4854025	4854030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125041	NC_008435	TGG	2	6	4854067	4854072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125042	NC_008435	GC	4	8	4854112	4854119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125043	NC_008435	CA	3	6	4854148	4854153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125044	NC_008435	GAA	2	6	4854246	4854251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125045	NC_008435	CGG	2	6	4854265	4854270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125046	NC_008435	ACTC	2	8	4854343	4854350	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125047	NC_008435	AGG	2	6	4854384	4854389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125048	NC_008435	GT	3	6	4854527	4854532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125049	NC_008435	GT	3	6	4854695	4854700	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125050	NC_008435	AGCCC	2	10	4854701	4854710	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
125051	NC_008435	CACGA	2	10	4854846	4854855	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
125052	NC_008435	GAC	2	6	4854859	4854864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125053	NC_008435	GCA	2	6	4854871	4854876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125054	NC_008435	GCC	2	6	4855191	4855196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125055	NC_008435	GCT	2	6	4855401	4855406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125056	NC_008435	TCA	2	6	4855487	4855492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125057	NC_008435	CTG	2	6	4855544	4855549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125058	NC_008435	ATC	2	6	4855594	4855599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125059	NC_008435	TCG	2	6	4855619	4855624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125060	NC_008435	CCA	2	6	4855643	4855648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125061	NC_008435	GTT	2	6	4855734	4855739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125062	NC_008435	GCC	2	6	4855828	4855833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125063	NC_008435	ATG	2	6	4855922	4855927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125064	NC_008435	CCAA	2	8	4855963	4855970	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125065	NC_008435	GCCAA	2	10	4855983	4855992	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
125066	NC_008435	CCG	2	6	4856024	4856029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125067	NC_008435	AAC	2	6	4856074	4856079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125068	NC_008435	CCG	2	6	4856097	4856102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125069	NC_008435	TCTT	2	8	4856113	4856120	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125070	NC_008435	GAC	2	6	4856193	4856198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125071	NC_008435	GCT	2	6	4856222	4856227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125072	NC_008435	AG	3	6	4856242	4856247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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125083	NC_008435	GCG	2	6	4856973	4856978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526328
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125122	NC_008435	GAC	2	6	4858175	4858180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526328
125123	NC_008435	GTC	2	6	4858184	4858189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526328
125124	NC_008435	ACT	2	6	4858191	4858196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526328
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125126	NC_008435	CGG	2	6	4858273	4858278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526328
125127	NC_008435	CCG	2	6	4858279	4858284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526328
125128	NC_008435	GTG	2	6	4858373	4858378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115526328
125129	NC_008435	GGC	2	6	4858397	4858402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526328
125130	NC_008435	CAA	2	6	4858429	4858434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115526328
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125132	NC_008435	TCG	2	6	4858524	4858529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526328
125133	NC_008435	GC	3	6	4858551	4858556	0 %	0 %	50 %	50 %	115526328
125134	NC_008435	TCG	2	6	4858590	4858595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526328
125135	NC_008435	CG	3	6	4858617	4858622	0 %	0 %	50 %	50 %	115526328
125136	NC_008435	CGCT	2	8	4858625	4858632	0 %	25 %	25 %	50 %	115526328
125137	NC_008435	ATG	2	6	4858685	4858690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526328
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125139	NC_008435	GCA	2	6	4858746	4858751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526328
125140	NC_008435	CG	3	6	4858857	4858862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125141	NC_008435	ACG	2	6	4858884	4858889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125142	NC_008435	CG	3	6	4858898	4858903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125143	NC_008435	AGT	2	6	4858914	4858919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125144	NC_008435	CAA	2	6	4858971	4858976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125145	NC_008435	GGA	2	6	4858989	4858994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125146	NC_008435	GAG	2	6	4859003	4859008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115526329
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125148	NC_008435	CGA	2	6	4859249	4859254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526329
125149	NC_008435	CTCG	2	8	4859372	4859379	0 %	25 %	25 %	50 %	115526329
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125153	NC_008435	CGA	2	6	4859519	4859524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526329
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125157	NC_008435	CTCG	2	8	4859738	4859745	0 %	25 %	25 %	50 %	115526329
125158	NC_008435	CGAT	2	8	4859755	4859762	25 %	25 %	25 %	25 %	115526329
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125163	NC_008435	CGG	2	6	4859894	4859899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526329
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125182	NC_008435	GCCA	2	8	4860911	4860918	25 %	0 %	25 %	50 %	115526330
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125226	NC_008435	CTT	2	6	4862611	4862616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115526330
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125231	NC_008435	TCG	2	6	4862765	4862770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526330
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125233	NC_008435	TTC	2	6	4862831	4862836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115526330
125234	NC_008435	CAT	2	6	4862841	4862846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526330
125235	NC_008435	CCG	2	6	4862856	4862861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526330
125236	NC_008435	GCG	2	6	4862919	4862924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526330
125237	NC_008435	AGC	2	6	4862942	4862947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526330
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125239	NC_008435	AGC	2	6	4862984	4862989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526330
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125255	NC_008435	GCC	2	6	4863537	4863542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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125327	NC_008435	GCCG	2	8	4866637	4866644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125328	NC_008435	GC	3	6	4866705	4866710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125329	NC_008435	GGCTC	2	10	4866715	4866724	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
125330	NC_008435	GCC	2	6	4866727	4866732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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125332	NC_008435	CCGG	2	8	4866789	4866796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125333	NC_008435	CG	3	6	4866805	4866810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125334	NC_008435	CGGC	2	8	4866814	4866821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125335	NC_008435	CTCG	2	8	4866877	4866884	0 %	25 %	25 %	50 %	115526334
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125339	NC_008435	TCGGC	2	10	4866993	4867002	0 %	20 %	40 %	40 %	115526334
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125345	NC_008435	CCG	4	12	4867230	4867241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526334
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125350	NC_008435	CG	3	6	4867489	4867494	0 %	0 %	50 %	50 %	115526334
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125352	NC_008435	CGGCG	2	10	4867546	4867555	0 %	0 %	60 %	40 %	115526334
125353	NC_008435	CTG	2	6	4867556	4867561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526334
125354	NC_008435	CGG	3	9	4867576	4867584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526334
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125357	NC_008435	GC	3	6	4867686	4867691	0 %	0 %	50 %	50 %	115526334
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125359	NC_008435	CGC	2	6	4867857	4867862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526335
125360	NC_008435	GCG	2	6	4867886	4867891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526335
125361	NC_008435	ATC	2	6	4867893	4867898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526335
125362	NC_008435	TGC	2	6	4867929	4867934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526335
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125382	NC_008435	CGG	2	6	4868673	4868678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526335
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125433	NC_008435	GC	3	6	4870675	4870680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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125456	NC_008435	GCCG	2	8	4871611	4871618	0 %	0 %	50 %	50 %	115526338
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125463	NC_008435	GCA	2	6	4871979	4871984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526339
125464	NC_008435	CCCG	2	8	4871989	4871996	0 %	0 %	25 %	75 %	115526339
125465	NC_008435	CGC	2	6	4872027	4872032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526339
125466	NC_008435	GCC	2	6	4872038	4872043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526339
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125468	NC_008435	GGAT	2	8	4872112	4872119	25 %	25 %	50 %	0 %	115526339
125469	NC_008435	TCA	2	6	4872156	4872161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526339
125470	NC_008435	TCC	2	6	4872170	4872175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125471	NC_008435	CCG	2	6	4872195	4872200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125472	NC_008435	CGC	2	6	4872201	4872206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125473	NC_008435	CGC	2	6	4872214	4872219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125474	NC_008435	GGC	2	6	4872221	4872226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125475	NC_008435	T	6	6	4872250	4872255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125476	NC_008435	GGCG	2	8	4872271	4872278	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125477	NC_008435	TTC	2	6	4872351	4872356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125478	NC_008435	CTT	2	6	4872466	4872471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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125496	NC_008435	CG	3	6	4873231	4873236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125497	NC_008435	GGA	2	6	4873282	4873287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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125500	NC_008435	CG	3	6	4873329	4873334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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