MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 142158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_008435	GCC	3	9	457393	457401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522442
12002	NC_008435	CCT	2	6	457488	457493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522442
12003	NC_008435	CGGCG	2	10	457533	457542	0 %	0 %	60 %	40 %	115522442
12004	NC_008435	CGA	2	6	457563	457568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522442
12005	NC_008435	CCGG	2	8	457575	457582	0 %	0 %	50 %	50 %	115522442
12006	NC_008435	CGGCG	2	10	457623	457632	0 %	0 %	60 %	40 %	115522442
12007	NC_008435	GGC	2	6	457651	457656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522442
12008	NC_008435	GGT	2	6	457696	457701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522442
12009	NC_008435	CTC	2	6	457702	457707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522442
12010	NC_008435	GCCG	2	8	457749	457756	0 %	0 %	50 %	50 %	115522442
12011	NC_008435	CGG	2	6	457812	457817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522442
12012	NC_008435	A	7	7	457820	457826	100 %	0 %	0 %	0 %	115522442
12013	NC_008435	GAT	2	6	457845	457850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522442
12014	NC_008435	GTG	2	6	457901	457906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522442
12015	NC_008435	A	6	6	457954	457959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12016	NC_008435	CGC	2	6	458009	458014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12017	NC_008435	TG	3	6	458017	458022	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12018	NC_008435	TCG	2	6	458031	458036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12019	NC_008435	CAC	2	6	458039	458044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12020	NC_008435	ATG	2	6	458045	458050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12021	NC_008435	CGT	2	6	458051	458056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12022	NC_008435	GTC	2	6	458063	458068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12023	NC_008435	CG	3	6	458082	458087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12024	NC_008435	ATCA	2	8	458191	458198	50 %	25 %	0 %	25 %	115522443
12025	NC_008435	AGC	2	6	458228	458233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522443
12026	NC_008435	GGC	2	6	458263	458268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522443
12027	NC_008435	TCG	2	6	458282	458287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522443
12028	NC_008435	CG	3	6	458286	458291	0 %	0 %	50 %	50 %	115522443
12029	NC_008435	GC	3	6	458312	458317	0 %	0 %	50 %	50 %	115522443
12030	NC_008435	CGA	2	6	458319	458324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522443
12031	NC_008435	CGC	2	6	458380	458385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522443
12032	NC_008435	GCAAG	2	10	458412	458421	40 %	0 %	40 %	20 %	115522443
12033	NC_008435	CGC	2	6	458451	458456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522443
12034	NC_008435	GGC	2	6	458468	458473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522443
12035	NC_008435	CG	4	8	458526	458533	0 %	0 %	50 %	50 %	115522443
12036	NC_008435	TGC	2	6	458561	458566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522443
12037	NC_008435	GCG	2	6	458593	458598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522443
12038	NC_008435	CTAC	2	8	458603	458610	25 %	25 %	0 %	50 %	115522443
12039	NC_008435	CGC	2	6	458637	458642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522443
12040	NC_008435	GGC	2	6	458643	458648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522443
12041	NC_008435	CG	3	6	458662	458667	0 %	0 %	50 %	50 %	115522443
12042	NC_008435	GCG	2	6	458735	458740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522443
12043	NC_008435	TGA	2	6	458741	458746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522443
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12046	NC_008435	GAAG	2	8	458865	458872	50 %	0 %	50 %	0 %	115522443
12047	NC_008435	GCCG	2	8	458916	458923	0 %	0 %	50 %	50 %	115522443
12048	NC_008435	GCTCG	2	10	458937	458946	0 %	20 %	40 %	40 %	115522443
12049	NC_008435	CGG	2	6	458996	459001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522443
12050	NC_008435	GCTG	2	8	459005	459012	0 %	25 %	50 %	25 %	115522443
12051	NC_008435	CG	3	6	459021	459026	0 %	0 %	50 %	50 %	115522443
12052	NC_008435	TGG	2	6	459218	459223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522443
12053	NC_008435	GTC	2	6	459238	459243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522443
12054	NC_008435	CCA	2	6	459245	459250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522443
12055	NC_008435	CG	3	6	459315	459320	0 %	0 %	50 %	50 %	115522443
12056	NC_008435	CG	3	6	459365	459370	0 %	0 %	50 %	50 %	115522443
12057	NC_008435	GTG	2	6	459433	459438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522443
12058	NC_008435	TCCGCC	2	12	459463	459474	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	115522443
12059	NC_008435	GAA	2	6	459484	459489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522443
12060	NC_008435	GCGCG	2	10	459513	459522	0 %	0 %	60 %	40 %	115522443
12061	NC_008435	CG	3	6	459531	459536	0 %	0 %	50 %	50 %	115522443
12062	NC_008435	GATC	2	8	459570	459577	25 %	25 %	25 %	25 %	115522443
12063	NC_008435	CGCT	2	8	459634	459641	0 %	25 %	25 %	50 %	115522443
12064	NC_008435	GGT	2	6	459648	459653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522443
12065	NC_008435	ATCG	2	8	459747	459754	25 %	25 %	25 %	25 %	115522443
12066	NC_008435	GCA	2	6	459756	459761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522443
12067	NC_008435	CG	4	8	459788	459795	0 %	0 %	50 %	50 %	115522443
12068	NC_008435	GAA	2	6	459801	459806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522443
12069	NC_008435	GGT	2	6	459915	459920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522443
12070	NC_008435	GCG	2	6	459921	459926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522443
12071	NC_008435	TCG	2	6	460007	460012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522443
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12073	NC_008435	TCG	2	6	460193	460198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522443
12074	NC_008435	TCA	2	6	460253	460258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522443
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12076	NC_008435	GGT	2	6	460272	460277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522443
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12078	NC_008435	CGA	3	9	460356	460364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522443
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12080	NC_008435	GGC	3	9	460462	460470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522443
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12083	NC_008435	CG	4	8	460694	460701	0 %	0 %	50 %	50 %	115522444
12084	NC_008435	CCG	2	6	460708	460713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522444
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12088	NC_008435	ATCGAC	2	12	460782	460793	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	115522444
12089	NC_008435	CGC	2	6	460811	460816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522444
12090	NC_008435	CG	3	6	460824	460829	0 %	0 %	50 %	50 %	115522444
12091	NC_008435	GCT	2	6	460865	460870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522444
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12094	NC_008435	CGG	2	6	460979	460984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522444
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12096	NC_008435	GC	3	6	461154	461159	0 %	0 %	50 %	50 %	115522444
12097	NC_008435	ATT	2	6	461205	461210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115522444
12098	NC_008435	CTT	2	6	461329	461334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12099	NC_008435	GTT	2	6	461351	461356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12100	NC_008435	CAG	2	6	461459	461464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12101	NC_008435	GAA	2	6	461501	461506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522445
12102	NC_008435	GACT	2	8	461528	461535	25 %	25 %	25 %	25 %	115522445
12103	NC_008435	CG	3	6	461541	461546	0 %	0 %	50 %	50 %	115522445
12104	NC_008435	GGCG	2	8	461564	461571	0 %	0 %	75 %	25 %	115522445
12105	NC_008435	CAT	2	6	461582	461587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522445
12106	NC_008435	CGCAT	2	10	461601	461610	20 %	20 %	20 %	40 %	115522445
12107	NC_008435	CGG	2	6	461617	461622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522445
12108	NC_008435	GACG	2	8	461630	461637	25 %	0 %	50 %	25 %	115522445
12109	NC_008435	GCT	2	6	461645	461650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522445
12110	NC_008435	CGC	3	9	461669	461677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522445
12111	NC_008435	GAT	2	6	461795	461800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522445
12112	NC_008435	CGC	2	6	461903	461908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522445
12113	NC_008435	CGGC	2	8	461916	461923	0 %	0 %	50 %	50 %	115522445
12114	NC_008435	TCGC	2	8	461930	461937	0 %	25 %	25 %	50 %	115522445
12115	NC_008435	ACCGC	2	10	461965	461974	20 %	0 %	20 %	60 %	115522445
12116	NC_008435	GC	3	6	461973	461978	0 %	0 %	50 %	50 %	115522445
12117	NC_008435	GC	3	6	461982	461987	0 %	0 %	50 %	50 %	115522445
12118	NC_008435	GCTG	2	8	462010	462017	0 %	25 %	50 %	25 %	115522445
12119	NC_008435	GCT	2	6	462062	462067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522445
12120	NC_008435	CGA	2	6	462125	462130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522445
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12122	NC_008435	ATT	2	6	462142	462147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115522445
12123	NC_008435	GC	3	6	462172	462177	0 %	0 %	50 %	50 %	115522445
12124	NC_008435	TCG	2	6	462196	462201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522445
12125	NC_008435	GCG	2	6	462280	462285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522445
12126	NC_008435	TCG	2	6	462289	462294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522445
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12222	NC_008435	CGG	4	12	465998	466009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522448
12223	NC_008435	CGC	2	6	466021	466026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522448
12224	NC_008435	TG	3	6	466062	466067	0 %	50 %	50 %	0 %	115522448
12225	NC_008435	GACC	2	8	466073	466080	25 %	0 %	25 %	50 %	115522448
12226	NC_008435	TGG	3	9	466147	466155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522448
12227	NC_008435	GCTGA	2	10	466178	466187	20 %	20 %	40 %	20 %	115522448
12228	NC_008435	GC	3	6	466258	466263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12229	NC_008435	TGC	2	6	466267	466272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522449
12230	NC_008435	CAT	2	6	466307	466312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522449
12231	NC_008435	CGA	2	6	466316	466321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522449
12232	NC_008435	CG	3	6	466345	466350	0 %	0 %	50 %	50 %	115522449
12233	NC_008435	ATC	2	6	466362	466367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522449
12234	NC_008435	CG	4	8	466391	466398	0 %	0 %	50 %	50 %	115522449
12235	NC_008435	CTG	2	6	466533	466538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522449
12236	NC_008435	CGC	2	6	466565	466570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522449
12237	NC_008435	TCG	2	6	466576	466581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522449
12238	NC_008435	TGC	2	6	466588	466593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522449
12239	NC_008435	CGC	2	6	466626	466631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12240	NC_008435	TCG	2	6	466642	466647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12241	NC_008435	CGC	2	6	466803	466808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522450
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12363	NC_008435	AGC	2	6	471786	471791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12480	NC_008435	CTC	2	6	475949	475954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522458
12481	NC_008435	AAGCA	2	10	475974	475983	60 %	0 %	20 %	20 %	115522458
12482	NC_008435	CGT	2	6	476005	476010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522458
12483	NC_008435	CATGA	2	10	476102	476111	40 %	20 %	20 %	20 %	115522459
12484	NC_008435	GC	3	6	476159	476164	0 %	0 %	50 %	50 %	115522459
12485	NC_008435	CGA	2	6	476179	476184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522459
12486	NC_008435	TGC	2	6	476187	476192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522459
12487	NC_008435	GC	3	6	476265	476270	0 %	0 %	50 %	50 %	115522459
12488	NC_008435	CGC	2	6	476311	476316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522459
12489	NC_008435	GCT	2	6	476344	476349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522459
12490	NC_008435	CGC	2	6	476434	476439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522459
12491	NC_008435	CGC	2	6	476443	476448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522459
12492	NC_008435	CGACGC	2	12	476473	476484	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115522459
12493	NC_008435	GCA	2	6	476491	476496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522459
12494	NC_008435	CGA	2	6	476497	476502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522459
12495	NC_008435	ATC	2	6	476516	476521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522459
12496	NC_008435	CCA	2	6	476529	476534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522459
12497	NC_008435	GAA	2	6	476542	476547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522459
12498	NC_008435	GCG	2	6	476586	476591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522459
12499	NC_008435	GGT	2	6	476596	476601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522459
12500	NC_008435	GCA	2	6	476616	476621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522459

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