MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 142158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008435	CGC	3	9	380885	380893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522369
10002	NC_008435	TGA	2	6	380980	380985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522369
10003	NC_008435	AGCTGC	2	12	381022	381033	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	115522369
10004	NC_008435	GC	3	6	381100	381105	0 %	0 %	50 %	50 %	115522369
10005	NC_008435	CG	3	6	381130	381135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10006	NC_008435	GCC	2	6	381166	381171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10007	NC_008435	TCTAG	2	10	381182	381191	20 %	40 %	20 %	20 %	115522370
10008	NC_008435	ACC	2	6	381204	381209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522370
10009	NC_008435	ACC	2	6	381243	381248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522370
10010	NC_008435	GC	3	6	381250	381255	0 %	0 %	50 %	50 %	115522370
10011	NC_008435	GC	4	8	381316	381323	0 %	0 %	50 %	50 %	115522370
10012	NC_008435	CCA	2	6	381343	381348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522370
10013	NC_008435	CGC	2	6	381358	381363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522370
10014	NC_008435	GCA	2	6	381364	381369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522370
10015	NC_008435	GCAGG	2	10	381371	381380	20 %	0 %	60 %	20 %	115522370
10016	NC_008435	CGC	2	6	381433	381438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522370
10017	NC_008435	GGC	2	6	381444	381449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522370
10018	NC_008435	CGT	2	6	381451	381456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522370
10019	NC_008435	GCG	2	6	381461	381466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522370
10020	NC_008435	CTC	2	6	381482	381487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522370
10021	NC_008435	TTG	2	6	381513	381518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522370
10022	NC_008435	GTC	2	6	381567	381572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522370
10023	NC_008435	CGG	2	6	381688	381693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522370
10024	NC_008435	TTC	2	6	381753	381758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522370
10025	NC_008435	GAG	2	6	381794	381799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522370
10026	NC_008435	GTG	2	6	381834	381839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_008435	GCCGAG	2	12	381861	381872	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	115522371
10028	NC_008435	GC	3	6	381899	381904	0 %	0 %	50 %	50 %	115522371
10029	NC_008435	CG	3	6	381908	381913	0 %	0 %	50 %	50 %	115522371
10030	NC_008435	GCC	2	6	381922	381927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522371
10031	NC_008435	GCC	2	6	382032	382037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522371
10032	NC_008435	CGGCG	2	10	382064	382073	0 %	0 %	60 %	40 %	115522371
10033	NC_008435	CG	3	6	382097	382102	0 %	0 %	50 %	50 %	115522371
10034	NC_008435	GCG	2	6	382138	382143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522371
10035	NC_008435	AGC	3	9	382153	382161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522371
10036	NC_008435	CGA	2	6	382205	382210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522371
10037	NC_008435	GTC	2	6	382227	382232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522371
10038	NC_008435	CAC	3	9	382302	382310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522371
10039	NC_008435	TGGT	2	8	382315	382322	0 %	50 %	50 %	0 %	115522371
10040	NC_008435	CGT	2	6	382340	382345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522371
10041	NC_008435	GGT	2	6	382362	382367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522371
10042	NC_008435	GGC	2	6	382422	382427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522371
10043	NC_008435	GGCC	2	8	382511	382518	0 %	0 %	50 %	50 %	115522371
10044	NC_008435	GC	3	6	382565	382570	0 %	0 %	50 %	50 %	115522371
10045	NC_008435	CGA	2	6	382571	382576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522371
10046	NC_008435	GCC	2	6	382629	382634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522371
10047	NC_008435	GGC	2	6	382673	382678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_008435	GCGGCC	2	12	382707	382718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10049	NC_008435	ACGG	2	8	382750	382757	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10050	NC_008435	ATG	2	6	382787	382792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522372
10051	NC_008435	GCG	2	6	382812	382817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522372
10052	NC_008435	CAC	2	6	382894	382899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522372
10053	NC_008435	CCTT	2	8	382919	382926	0 %	50 %	0 %	50 %	115522372
10054	NC_008435	CGGC	2	8	382937	382944	0 %	0 %	50 %	50 %	115522372
10055	NC_008435	GC	3	6	382943	382948	0 %	0 %	50 %	50 %	115522372
10056	NC_008435	CG	3	6	383034	383039	0 %	0 %	50 %	50 %	115522372
10057	NC_008435	CGA	2	6	383101	383106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522373
10058	NC_008435	TCG	2	6	383109	383114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522373
10059	NC_008435	CGG	3	9	383125	383133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522373
10060	NC_008435	CGG	2	6	383143	383148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522373
10061	NC_008435	CGG	2	6	383188	383193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522373
10062	NC_008435	GC	4	8	383199	383206	0 %	0 %	50 %	50 %	115522373
10063	NC_008435	CGG	2	6	383233	383238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522373
10064	NC_008435	CTT	2	6	383311	383316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522373
10065	NC_008435	AC	3	6	383324	383329	50 %	0 %	0 %	50 %	115522373
10066	NC_008435	GC	3	6	383364	383369	0 %	0 %	50 %	50 %	115522373
10067	NC_008435	TCG	2	6	383424	383429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522373
10068	NC_008435	AGG	2	6	383431	383436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522373
10069	NC_008435	CCG	2	6	383488	383493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522373
10070	NC_008435	TGA	2	6	383524	383529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522373
10071	NC_008435	CGAG	2	8	383539	383546	25 %	0 %	50 %	25 %	115522373
10072	NC_008435	CGC	2	6	383560	383565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522373
10073	NC_008435	GC	3	6	383564	383569	0 %	0 %	50 %	50 %	115522373
10074	NC_008435	GCCG	2	8	383618	383625	0 %	0 %	50 %	50 %	115522373
10075	NC_008435	GC	5	10	383632	383641	0 %	0 %	50 %	50 %	115522373
10076	NC_008435	GCC	2	6	383651	383656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522373
10077	NC_008435	GTC	2	6	383699	383704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522373
10078	NC_008435	CG	3	6	383709	383714	0 %	0 %	50 %	50 %	115522373
10079	NC_008435	ATC	2	6	383715	383720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522373
10080	NC_008435	CGCGG	2	10	383726	383735	0 %	0 %	60 %	40 %	115522373
10081	NC_008435	CG	3	6	383770	383775	0 %	0 %	50 %	50 %	115522373
10082	NC_008435	CGG	2	6	383863	383868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522374
10083	NC_008435	CGGT	2	8	383880	383887	0 %	25 %	50 %	25 %	115522374
10084	NC_008435	GTC	2	6	383888	383893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522374
10085	NC_008435	GCC	2	6	383973	383978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522374
10086	NC_008435	GC	4	8	383984	383991	0 %	0 %	50 %	50 %	115522374
10087	NC_008435	TTC	2	6	384099	384104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522374
10088	NC_008435	GCG	4	12	384109	384120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522374
10089	NC_008435	CAG	2	6	384143	384148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522374
10090	NC_008435	GC	3	6	384160	384165	0 %	0 %	50 %	50 %	115522374
10091	NC_008435	ATC	2	6	384168	384173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522374
10092	NC_008435	GAGC	2	8	384326	384333	25 %	0 %	50 %	25 %	115522374
10093	NC_008435	CCGA	2	8	384420	384427	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10094	NC_008435	CGG	2	6	384526	384531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522375
10095	NC_008435	GC	3	6	384561	384566	0 %	0 %	50 %	50 %	115522375
10096	NC_008435	ACC	2	6	384647	384652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522375
10097	NC_008435	GC	3	6	384659	384664	0 %	0 %	50 %	50 %	115522375
10098	NC_008435	CAC	2	6	384715	384720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522375
10099	NC_008435	GCA	2	6	384744	384749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522375
10100	NC_008435	TCG	2	6	384977	384982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522375
10101	NC_008435	T	6	6	384997	385002	0 %	100 %	0 %	0 %	115522375
10102	NC_008435	ACGC	2	8	385005	385012	25 %	0 %	25 %	50 %	115522375
10103	NC_008435	G	6	6	385044	385049	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_008435	GCG	2	6	385055	385060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_008435	GAA	2	6	385145	385150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522376
10106	NC_008435	GAA	2	6	385166	385171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522376
10107	NC_008435	CCTCGG	2	12	385174	385185	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	115522376
10108	NC_008435	CGA	2	6	385199	385204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522376
10109	NC_008435	TGT	2	6	385233	385238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522376
10110	NC_008435	GCG	2	6	385255	385260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522376
10111	NC_008435	GTAC	2	8	385276	385283	25 %	25 %	25 %	25 %	115522376
10112	NC_008435	GCG	2	6	385340	385345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522376
10113	NC_008435	CACCTT	2	12	385367	385378	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	115522376
10114	NC_008435	GCC	2	6	385385	385390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522376
10115	NC_008435	TCGA	2	8	385392	385399	25 %	25 %	25 %	25 %	115522376
10116	NC_008435	CGC	2	6	385414	385419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522376
10117	NC_008435	TGCAA	2	10	385453	385462	40 %	20 %	20 %	20 %	115522376
10118	NC_008435	GAA	2	6	385481	385486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522376
10119	NC_008435	TGGC	2	8	385491	385498	0 %	25 %	50 %	25 %	115522376
10120	NC_008435	CGC	2	6	385534	385539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522376
10121	NC_008435	GGCGA	2	10	385562	385571	20 %	0 %	60 %	20 %	115522376
10122	NC_008435	AGCG	2	8	385614	385621	25 %	0 %	50 %	25 %	115522376
10123	NC_008435	ATC	2	6	385671	385676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522376
10124	NC_008435	GAA	2	6	385718	385723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522376
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10133	NC_008435	GCT	2	6	386129	386134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522376
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10139	NC_008435	GAC	2	6	386381	386386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10144	NC_008435	CTG	2	6	386492	386497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522377
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10151	NC_008435	CTG	2	6	386816	386821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522377
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10154	NC_008435	CGG	2	6	386962	386967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522377
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10189	NC_008435	AGG	2	6	388402	388407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10193	NC_008435	GTC	2	6	388524	388529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10196	NC_008435	GCAT	2	8	388579	388586	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10197	NC_008435	GCG	2	6	388695	388700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10205	NC_008435	CGA	2	6	389061	389066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522378
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10233	NC_008435	CGG	2	6	390220	390225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522379
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10235	NC_008435	CTT	2	6	390299	390304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522379
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10237	NC_008435	CGGC	2	8	390403	390410	0 %	0 %	50 %	50 %	115522379
10238	NC_008435	GC	4	8	390421	390428	0 %	0 %	50 %	50 %	115522379
10239	NC_008435	CG	3	6	390502	390507	0 %	0 %	50 %	50 %	115522379
10240	NC_008435	TC	3	6	390558	390563	0 %	50 %	0 %	50 %	115522379
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10242	NC_008435	ATG	2	6	390621	390626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522379
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10363	NC_008435	GGCT	2	8	394761	394768	0 %	25 %	50 %	25 %	115522384
10364	NC_008435	GCC	2	6	394769	394774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522384
10365	NC_008435	TGC	2	6	394810	394815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522384
10366	NC_008435	GGAT	2	8	394859	394866	25 %	25 %	50 %	0 %	115522384
10367	NC_008435	CGGA	2	8	395014	395021	25 %	0 %	50 %	25 %	115522384
10368	NC_008435	GCA	2	6	395028	395033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522384
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10383	NC_008435	AAC	2	6	395523	395528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522384
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10398	NC_008435	AGCCG	2	10	396016	396025	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10399	NC_008435	GC	3	6	396031	396036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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