MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 142158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_008435	GCC	2	6	342799	342804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522330
9002	NC_008435	TCCAG	2	10	343007	343016	20 %	20 %	20 %	40 %	115522330
9003	NC_008435	AC	3	6	343072	343077	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9004	NC_008435	GAA	2	6	343307	343312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522331
9005	NC_008435	GGC	2	6	343370	343375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522331
9006	NC_008435	CGG	2	6	343394	343399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522331
9007	NC_008435	GC	3	6	343433	343438	0 %	0 %	50 %	50 %	115522331
9008	NC_008435	TCT	2	6	343444	343449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522331
9009	NC_008435	GATC	2	8	343486	343493	25 %	25 %	25 %	25 %	115522331
9010	NC_008435	GCCC	2	8	343573	343580	0 %	0 %	25 %	75 %	115522331
9011	NC_008435	GAG	2	6	343581	343586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522331
9012	NC_008435	CGG	2	6	343693	343698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522331
9013	NC_008435	CCA	2	6	343717	343722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522331
9014	NC_008435	GC	3	6	343747	343752	0 %	0 %	50 %	50 %	115522331
9015	NC_008435	CCG	3	9	343789	343797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522331
9016	NC_008435	CGCC	2	8	343826	343833	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9017	NC_008435	TCA	2	6	343882	343887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522332
9018	NC_008435	CGG	2	6	343900	343905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522332
9019	NC_008435	GCTCG	2	10	343949	343958	0 %	20 %	40 %	40 %	115522332
9020	NC_008435	GGCGA	2	10	344010	344019	20 %	0 %	60 %	20 %	115522332
9021	NC_008435	TCGGGC	2	12	344037	344048	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	115522332
9022	NC_008435	CTG	2	6	344058	344063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522332
9023	NC_008435	GGT	3	9	344102	344110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522332
9024	NC_008435	GCC	2	6	344164	344169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522332
9025	NC_008435	CGC	2	6	344264	344269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522332
9026	NC_008435	CGCGC	2	10	344274	344283	0 %	0 %	40 %	60 %	115522332
9027	NC_008435	TCGG	2	8	344295	344302	0 %	25 %	50 %	25 %	115522332
9028	NC_008435	CAT	2	6	344319	344324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522332
9029	NC_008435	GGC	2	6	344343	344348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522332
9030	NC_008435	CAG	2	6	344352	344357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522332
9031	NC_008435	TGGCGC	2	12	344362	344373	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	115522332
9032	NC_008435	GC	5	10	344370	344379	0 %	0 %	50 %	50 %	115522332
9033	NC_008435	CGA	2	6	344429	344434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522332
9034	NC_008435	TCG	2	6	344452	344457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522332
9035	NC_008435	CTGGTG	2	12	344496	344507	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	115522332
9036	NC_008435	GTG	2	6	344544	344549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522332
9037	NC_008435	CGC	2	6	344576	344581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522332
9038	NC_008435	ATCGA	2	10	344646	344655	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9039	NC_008435	GCGA	2	8	344674	344681	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9040	NC_008435	GCG	2	6	344696	344701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9041	NC_008435	CG	4	8	344703	344710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9042	NC_008435	TCG	2	6	344727	344732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522333
9043	NC_008435	CTC	2	6	344738	344743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522333
9044	NC_008435	AGCG	2	8	344770	344777	25 %	0 %	50 %	25 %	115522333
9045	NC_008435	GCG	2	6	344861	344866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522333
9046	NC_008435	CGC	2	6	344940	344945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522333
9047	NC_008435	GC	3	6	344965	344970	0 %	0 %	50 %	50 %	115522333
9048	NC_008435	CG	3	6	344977	344982	0 %	0 %	50 %	50 %	115522333
9049	NC_008435	CGG	2	6	344988	344993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522333
9050	NC_008435	CG	3	6	345056	345061	0 %	0 %	50 %	50 %	115522333
9051	NC_008435	CGG	2	6	345074	345079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522333
9052	NC_008435	GC	3	6	345097	345102	0 %	0 %	50 %	50 %	115522333
9053	NC_008435	CCG	2	6	345104	345109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522333
9054	NC_008435	CGA	2	6	345144	345149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522333
9055	NC_008435	GCC	3	9	345235	345243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522333
9056	NC_008435	CGC	2	6	345246	345251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522333
9057	NC_008435	CGGT	2	8	345359	345366	0 %	25 %	50 %	25 %	115522333
9058	NC_008435	GC	3	6	345402	345407	0 %	0 %	50 %	50 %	115522333
9059	NC_008435	TTG	2	6	345415	345420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522333
9060	NC_008435	GTG	2	6	345454	345459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522333
9061	NC_008435	CCG	2	6	345473	345478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522333
9062	NC_008435	CGCGC	2	10	345514	345523	0 %	0 %	40 %	60 %	115522333
9063	NC_008435	CGC	2	6	345566	345571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522333
9064	NC_008435	CGC	2	6	345624	345629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522333
9065	NC_008435	CGG	2	6	345639	345644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522333
9066	NC_008435	CGC	2	6	345699	345704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522333
9067	NC_008435	ATCT	2	8	345745	345752	25 %	50 %	0 %	25 %	115522333
9068	NC_008435	GTGCTG	2	12	345760	345771	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	115522333
9069	NC_008435	TCG	2	6	345827	345832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522333
9070	NC_008435	TGC	2	6	345848	345853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522333
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9072	NC_008435	CCT	2	6	345912	345917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522333
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9076	NC_008435	TCTGG	2	10	346029	346038	0 %	40 %	40 %	20 %	115522333
9077	NC_008435	GGC	2	6	346041	346046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522333
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9081	NC_008435	TGC	2	6	346208	346213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522333
9082	NC_008435	CAA	2	6	346224	346229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522333
9083	NC_008435	CCGGC	2	10	346236	346245	0 %	0 %	40 %	60 %	115522333
9084	NC_008435	GC	3	6	346244	346249	0 %	0 %	50 %	50 %	115522333
9085	NC_008435	GGT	2	6	346260	346265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522333
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9087	NC_008435	GTCACC	2	12	346297	346308	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	115522333
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9090	NC_008435	GACC	2	8	346398	346405	25 %	0 %	25 %	50 %	115522333
9091	NC_008435	CGG	2	6	346436	346441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522333
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9093	NC_008435	CG	4	8	346485	346492	0 %	0 %	50 %	50 %	115522333
9094	NC_008435	GAG	2	6	346504	346509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522333
9095	NC_008435	TGC	2	6	346538	346543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522333
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9107	NC_008435	CCG	2	6	346859	346864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522333
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9109	NC_008435	GGT	2	6	346956	346961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522333
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9118	NC_008435	GC	3	6	347267	347272	0 %	0 %	50 %	50 %	115522333
9119	NC_008435	TGG	2	6	347273	347278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522333
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9121	NC_008435	ACG	2	6	347363	347368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9122	NC_008435	GCAA	2	8	347371	347378	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9123	NC_008435	CG	3	6	347461	347466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9124	NC_008435	AT	3	6	347498	347503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9125	NC_008435	CGA	2	6	347544	347549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9126	NC_008435	GCG	2	6	347700	347705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522334
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9128	NC_008435	GC	3	6	347741	347746	0 %	0 %	50 %	50 %	115522334
9129	NC_008435	TGC	2	6	347752	347757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522334
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9151	NC_008435	TTTTG	2	10	348529	348538	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9152	NC_008435	CCAT	2	8	348592	348599	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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9247	NC_008435	CTT	2	6	352703	352708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522338
9248	NC_008435	CGC	2	6	352724	352729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522338
9249	NC_008435	CCG	2	6	352747	352752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522338
9250	NC_008435	CGGCC	2	10	352781	352790	0 %	0 %	40 %	60 %	115522338
9251	NC_008435	CAGCGT	2	12	352817	352828	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	115522338
9252	NC_008435	AGC	2	6	352853	352858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522338
9253	NC_008435	CG	3	6	352906	352911	0 %	0 %	50 %	50 %	115522338
9254	NC_008435	GCGCG	3	15	352907	352921	0 %	0 %	60 %	40 %	115522338
9255	NC_008435	TGG	2	6	353008	353013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522338
9256	NC_008435	GA	3	6	353028	353033	50 %	0 %	50 %	0 %	115522338
9257	NC_008435	CGA	2	6	353059	353064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522338
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9260	NC_008435	GCA	3	9	353176	353184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522338
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9277	NC_008435	GTC	2	6	353774	353779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522338
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9282	NC_008435	GCC	2	6	353891	353896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522338
9283	NC_008435	GA	3	6	353930	353935	50 %	0 %	50 %	0 %	115522338
9284	NC_008435	TG	3	6	354030	354035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9285	NC_008435	TGG	2	6	354175	354180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522339
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9290	NC_008435	CTG	2	6	354318	354323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522339
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9302	NC_008435	CACCCC	2	12	354817	354828	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
9303	NC_008435	CGA	2	6	354841	354846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9304	NC_008435	GAGG	2	8	354890	354897	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9305	NC_008435	GGT	2	6	354974	354979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9306	NC_008435	GCGAA	2	10	354988	354997	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9307	NC_008435	G	6	6	355032	355037	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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9320	NC_008435	GAT	2	6	355479	355484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522340
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9322	NC_008435	CGG	2	6	355515	355520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522340
9323	NC_008435	GTGCTG	2	12	355534	355545	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	115522340
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9328	NC_008435	GCCGCG	2	12	355678	355689	0 %	0 %	50 %	50 %	115522340
9329	NC_008435	CGG	2	6	355783	355788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9330	NC_008435	GAC	2	6	355811	355816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522341
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9332	NC_008435	ACCCG	2	10	355846	355855	20 %	0 %	20 %	60 %	115522341
9333	NC_008435	GCT	2	6	355877	355882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522341
9334	NC_008435	CTGG	2	8	355886	355893	0 %	25 %	50 %	25 %	115522341
9335	NC_008435	GCT	3	9	355907	355915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522341
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9343	NC_008435	CG	3	6	356192	356197	0 %	0 %	50 %	50 %	115522341
9344	NC_008435	GC	3	6	356252	356257	0 %	0 %	50 %	50 %	115522341
9345	NC_008435	GCCGC	2	10	356272	356281	0 %	0 %	40 %	60 %	115522341
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9351	NC_008435	GCT	2	6	356453	356458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522341
9352	NC_008435	TCA	2	6	356461	356466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522341
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9356	NC_008435	CCT	2	6	356580	356585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522342
9357	NC_008435	TCA	2	6	356586	356591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522342
9358	NC_008435	TGG	3	9	356616	356624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522342
9359	NC_008435	TGC	2	6	356643	356648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522342
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9362	NC_008435	TGC	3	9	356792	356800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522343
9363	NC_008435	GGT	2	6	356817	356822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522343
9364	NC_008435	CGG	2	6	356847	356852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522343
9365	NC_008435	CGACC	2	10	356853	356862	20 %	0 %	20 %	60 %	115522343
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9491	NC_008435	GC	3	6	361588	361593	0 %	0 %	50 %	50 %	115522348
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