MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB1

Total Repeats: 2058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008386	ACC	2	6	104019	104024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345635
2002	NC_008386	GTCGG	2	10	104061	104070	0 %	20 %	60 %	20 %	115345635
2003	NC_008386	TTG	2	6	104080	104085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345635
2004	NC_008386	CCG	2	6	104086	104091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345635
2005	NC_008386	GCA	2	6	104176	104181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345635
2006	NC_008386	CCG	2	6	104197	104202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345635
2007	NC_008386	GTG	2	6	104212	104217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345635
2008	NC_008386	CTGG	2	8	104222	104229	0 %	25 %	50 %	25 %	115345635
2009	NC_008386	GCC	2	6	104241	104246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345635
2010	NC_008386	GAA	2	6	104315	104320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345635
2011	NC_008386	TGG	2	6	104329	104334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345635
2012	NC_008386	CAA	2	6	104384	104389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345635
2013	NC_008386	GCA	2	6	104436	104441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345635
2014	NC_008386	GTCT	2	8	104508	104515	0 %	50 %	25 %	25 %	115345635
2015	NC_008386	CGG	2	6	104658	104663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345635
2016	NC_008386	GC	3	6	104676	104681	0 %	0 %	50 %	50 %	115345635
2017	NC_008386	AG	3	6	104745	104750	50 %	0 %	50 %	0 %	115345635
2018	NC_008386	GTG	2	6	104766	104771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345635
2019	NC_008386	CGA	2	6	104794	104799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345635
2020	NC_008386	GCC	2	6	104802	104807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345635
2021	NC_008386	GCA	2	6	104825	104830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345635
2022	NC_008386	GGC	2	6	104861	104866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345635
2023	NC_008386	CGAC	2	8	104914	104921	25 %	0 %	25 %	50 %	115345635
2024	NC_008386	GGC	2	6	104961	104966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345635
2025	NC_008386	CGG	2	6	104986	104991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345635
2026	NC_008386	ATTT	2	8	105054	105061	25 %	75 %	0 %	0 %	115345635
2027	NC_008386	TGT	2	6	105062	105067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345635
2028	NC_008386	GTC	2	6	105092	105097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345635
2029	NC_008386	CCTC	2	8	105199	105206	0 %	25 %	0 %	75 %	115345635
2030	NC_008386	CAC	2	6	105236	105241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345635
2031	NC_008386	CGG	2	6	105254	105259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345635
2032	NC_008386	TGA	2	6	105265	105270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345635
2033	NC_008386	GCC	2	6	105340	105345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345635
2034	NC_008386	CGG	2	6	105364	105369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345635
2035	NC_008386	CG	4	8	105394	105401	0 %	0 %	50 %	50 %	115345635
2036	NC_008386	GC	3	6	105423	105428	0 %	0 %	50 %	50 %	115345635
2037	NC_008386	GAA	2	6	105480	105485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345635
2038	NC_008386	TTG	2	6	105538	105543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345635
2039	NC_008386	TAC	2	6	105588	105593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345635
2040	NC_008386	CGA	2	6	105668	105673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345635
2041	NC_008386	GGC	2	6	105701	105706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345635
2042	NC_008386	GAC	2	6	105726	105731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345635
2043	NC_008386	ACCCG	2	10	105761	105770	20 %	0 %	20 %	60 %	115345635
2044	NC_008386	GCCA	2	8	105788	105795	25 %	0 %	25 %	50 %	115345635
2045	NC_008386	ACC	2	6	105809	105814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345635
2046	NC_008386	CACCGG	2	12	105898	105909	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115345635
2047	NC_008386	GC	3	6	105959	105964	0 %	0 %	50 %	50 %	115345635
2048	NC_008386	AGC	2	6	105980	105985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345635
2049	NC_008386	AAG	2	6	105995	106000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345635
2050	NC_008386	CGA	2	6	106004	106009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345635
2051	NC_008386	GCC	3	9	106032	106040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345635
2052	NC_008386	ACC	2	6	106057	106062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345635
2053	NC_008386	AGCG	2	8	106084	106091	25 %	0 %	50 %	25 %	115345635
2054	NC_008386	GC	3	6	106101	106106	0 %	0 %	50 %	50 %	115345635
2055	NC_008386	TCTG	2	8	106227	106234	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2056	NC_008386	CGG	2	6	106266	106271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2057	NC_008386	CAT	2	6	106402	106407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2058	NC_008386	ACC	2	6	106460	106465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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