MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 15688

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008384	CTT	2	6	178169	178174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255365
4002	NC_008384	CGG	2	6	178187	178192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255365
4003	NC_008384	CGGG	2	8	178226	178233	0 %	0 %	75 %	25 %	116255365
4004	NC_008384	GCC	2	6	178302	178307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255365
4005	NC_008384	CAA	2	6	178325	178330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255365
4006	NC_008384	TGA	2	6	178403	178408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255365
4007	NC_008384	GCG	2	6	178409	178414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255365
4008	NC_008384	CG	3	6	178413	178418	0 %	0 %	50 %	50 %	116255365
4009	NC_008384	CGT	2	6	178472	178477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255365
4010	NC_008384	GCG	2	6	178512	178517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255365
4011	NC_008384	CTGT	2	8	178536	178543	0 %	50 %	25 %	25 %	116255365
4012	NC_008384	AGA	2	6	178549	178554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255365
4013	NC_008384	GCC	2	6	178598	178603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255365
4014	NC_008384	CGG	2	6	178631	178636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255365
4015	NC_008384	CGT	2	6	178656	178661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255365
4016	NC_008384	GGA	2	6	178694	178699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255365
4017	NC_008384	TG	3	6	178704	178709	0 %	50 %	50 %	0 %	116255365
4018	NC_008384	GAT	2	6	178803	178808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255365
4019	NC_008384	CTG	2	6	178866	178871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255366
4020	NC_008384	CCG	2	6	178877	178882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255366
4021	NC_008384	CCCG	2	8	178912	178919	0 %	0 %	25 %	75 %	116255366
4022	NC_008384	CAAAGC	2	12	178928	178939	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116255366
4023	NC_008384	GAC	2	6	178962	178967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255366
4024	NC_008384	GAT	2	6	179053	179058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255366
4025	NC_008384	TGC	2	6	179107	179112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255366
4026	NC_008384	CTC	2	6	179302	179307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255366
4027	NC_008384	GTT	2	6	179350	179355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255366
4028	NC_008384	TTG	2	6	179393	179398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255366
4029	NC_008384	GGA	2	6	179445	179450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255366
4030	NC_008384	GAT	2	6	179470	179475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255366
4031	NC_008384	CGG	2	6	179514	179519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255366
4032	NC_008384	CGC	2	6	179568	179573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255366
4033	NC_008384	GAA	2	6	179661	179666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_008384	CCGT	2	8	179671	179678	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_008384	GTCAG	2	10	179705	179714	20 %	20 %	40 %	20 %	116255367
4036	NC_008384	CCG	2	6	179715	179720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255367
4037	NC_008384	ACCG	2	8	179744	179751	25 %	0 %	25 %	50 %	116255367
4038	NC_008384	CGG	2	6	179761	179766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255367
4039	NC_008384	AGG	2	6	179850	179855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255367
4040	NC_008384	GC	3	6	179857	179862	0 %	0 %	50 %	50 %	116255367
4041	NC_008384	CGC	2	6	179890	179895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255367
4042	NC_008384	CGG	2	6	179959	179964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255367
4043	NC_008384	CTG	2	6	180010	180015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255367
4044	NC_008384	CGC	2	6	180016	180021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255367
4045	NC_008384	AGA	2	6	180025	180030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255367
4046	NC_008384	GCT	2	6	180078	180083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255367
4047	NC_008384	GCC	2	6	180092	180097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255367
4048	NC_008384	CCA	2	6	180118	180123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255367
4049	NC_008384	GTG	2	6	180153	180158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255367
4050	NC_008384	AGA	2	6	180222	180227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255367
4051	NC_008384	GCC	2	6	180236	180241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255367
4052	NC_008384	AGG	2	6	180259	180264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255367
4053	NC_008384	TTG	2	6	180279	180284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255367
4054	NC_008384	CAG	2	6	180320	180325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255367
4055	NC_008384	CGC	2	6	180331	180336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255367
4056	NC_008384	TTG	2	6	180388	180393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255367
4057	NC_008384	AGCG	2	8	180420	180427	25 %	0 %	50 %	25 %	116255367
4058	NC_008384	CGAT	2	8	180514	180521	25 %	25 %	25 %	25 %	116255367
4059	NC_008384	AG	3	6	180641	180646	50 %	0 %	50 %	0 %	116255367
4060	NC_008384	TGA	2	6	180661	180666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255367
4061	NC_008384	ACG	2	6	180669	180674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255367
4062	NC_008384	ATG	2	6	180690	180695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255367
4063	NC_008384	TGAC	2	8	180752	180759	25 %	25 %	25 %	25 %	116255367
4064	NC_008384	CAG	3	9	180797	180805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255367
4065	NC_008384	CT	3	6	180824	180829	0 %	50 %	0 %	50 %	116255367
4066	NC_008384	TGG	2	6	180853	180858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255367
4067	NC_008384	TC	3	6	180934	180939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4068	NC_008384	AGC	2	6	180983	180988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255368
4069	NC_008384	CCG	2	6	180993	180998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255368
4070	NC_008384	GAT	2	6	181073	181078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255368
4071	NC_008384	AGC	2	6	181095	181100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255368
4072	NC_008384	ATG	2	6	181122	181127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255368
4073	NC_008384	ACTG	2	8	181128	181135	25 %	25 %	25 %	25 %	116255368
4074	NC_008384	GCCG	2	8	181196	181203	0 %	0 %	50 %	50 %	116255368
4075	NC_008384	GCC	2	6	181274	181279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255368
4076	NC_008384	TCGC	2	8	181355	181362	0 %	25 %	25 %	50 %	116255368
4077	NC_008384	TTC	2	6	181364	181369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255368
4078	NC_008384	GCT	2	6	181500	181505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255368
4079	NC_008384	TCCA	2	8	181529	181536	25 %	25 %	0 %	50 %	116255368
4080	NC_008384	GTCA	2	8	181853	181860	25 %	25 %	25 %	25 %	116255368
4081	NC_008384	AAG	2	6	181878	181883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255368
4082	NC_008384	GCC	2	6	181924	181929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255368
4083	NC_008384	AGG	2	6	181969	181974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255368
4084	NC_008384	ATG	2	6	182025	182030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255368
4085	NC_008384	GA	3	6	182055	182060	50 %	0 %	50 %	0 %	116255368
4086	NC_008384	CACC	2	8	182062	182069	25 %	0 %	0 %	75 %	116255368
4087	NC_008384	CGG	2	6	182124	182129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255368
4088	NC_008384	GA	3	6	182139	182144	50 %	0 %	50 %	0 %	116255368
4089	NC_008384	GAT	2	6	182285	182290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255368
4090	NC_008384	AAC	2	6	182441	182446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255368
4091	NC_008384	TCA	2	6	182497	182502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255368
4092	NC_008384	CAC	2	6	182515	182520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255369
4093	NC_008384	CGT	2	6	182696	182701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255369
4094	NC_008384	CCG	2	6	182719	182724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255369
4095	NC_008384	GTC	2	6	182787	182792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255369
4096	NC_008384	TCG	2	6	182876	182881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255369
4097	NC_008384	GCT	2	6	182882	182887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255369
4098	NC_008384	AC	3	6	183017	183022	50 %	0 %	0 %	50 %	116255369
4099	NC_008384	CAA	2	6	183041	183046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255369
4100	NC_008384	CAA	2	6	183179	183184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255369
4101	NC_008384	CGA	2	6	183194	183199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255369
4102	NC_008384	GGA	2	6	183212	183217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255369
4103	NC_008384	TCG	2	6	183250	183255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255369
4104	NC_008384	CG	3	6	183284	183289	0 %	0 %	50 %	50 %	116255369
4105	NC_008384	GAC	2	6	183297	183302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255369
4106	NC_008384	CCT	2	6	183329	183334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255369
4107	NC_008384	AGGTC	2	10	183395	183404	20 %	20 %	40 %	20 %	116255369
4108	NC_008384	GAC	2	6	183454	183459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255369
4109	NC_008384	GT	3	6	183489	183494	0 %	50 %	50 %	0 %	116255369
4110	NC_008384	CCTC	2	8	183527	183534	0 %	25 %	0 %	75 %	116255369
4111	NC_008384	CTC	2	6	183545	183550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_008384	CCT	2	6	183687	183692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4113	NC_008384	GGT	2	6	183743	183748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_008384	AGACT	2	10	183820	183829	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4115	NC_008384	AGC	2	6	183932	183937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_008384	GC	3	6	183951	183956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4117	NC_008384	GGGC	2	8	183969	183976	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4118	NC_008384	GGA	2	6	183997	184002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_008384	TGA	2	6	184080	184085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255370
4120	NC_008384	ACC	2	6	184133	184138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255370
4121	NC_008384	TCG	2	6	184199	184204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255370
4122	NC_008384	GGTT	2	8	184209	184216	0 %	50 %	50 %	0 %	116255370
4123	NC_008384	CCG	2	6	184217	184222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255370
4124	NC_008384	ACA	2	6	184325	184330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255370
4125	NC_008384	CGG	2	6	184344	184349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255370
4126	NC_008384	GC	3	6	184361	184366	0 %	0 %	50 %	50 %	116255370
4127	NC_008384	ATC	2	6	184399	184404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255370
4128	NC_008384	AGC	2	6	184415	184420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255370
4129	NC_008384	AGC	2	6	184437	184442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255370
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4131	NC_008384	GACGA	2	10	184501	184510	40 %	0 %	40 %	20 %	116255370
4132	NC_008384	GAA	2	6	184600	184605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255370
4133	NC_008384	GAT	2	6	184660	184665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255370
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4135	NC_008384	CAG	2	6	184750	184755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255370
4136	NC_008384	TCA	2	6	184835	184840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255370
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4138	NC_008384	CAA	2	6	184875	184880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255370
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4142	NC_008384	AGC	2	6	184994	184999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255370
4143	NC_008384	CGTGTT	2	12	185016	185027	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116255370
4144	NC_008384	CGC	2	6	185129	185134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4145	NC_008384	CGC	2	6	185138	185143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4146	NC_008384	ACC	2	6	185201	185206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4147	NC_008384	CCA	2	6	185535	185540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255371
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4149	NC_008384	CAT	2	6	185632	185637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255371
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4151	NC_008384	GCTG	2	8	185743	185750	0 %	25 %	50 %	25 %	116255371
4152	NC_008384	GGC	2	6	185792	185797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255371
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4154	NC_008384	TGG	2	6	185832	185837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255371
4155	NC_008384	GTG	2	6	185894	185899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255371
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4157	NC_008384	TTGA	2	8	185942	185949	25 %	50 %	25 %	0 %	116255371
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4160	NC_008384	TGAT	2	8	186052	186059	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4161	NC_008384	CTT	2	6	186096	186101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255372
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4163	NC_008384	GAAG	2	8	186112	186119	50 %	0 %	50 %	0 %	116255372
4164	NC_008384	GAG	2	6	186153	186158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255372
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4184	NC_008384	GAA	2	6	187430	187435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255372
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4202	NC_008384	GAT	2	6	188491	188496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255374
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4209	NC_008384	CG	3	6	188901	188906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4210	NC_008384	ATG	2	6	188927	188932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255375
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4216	NC_008384	CG	3	6	189127	189132	0 %	0 %	50 %	50 %	116255375
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4233	NC_008384	GC	3	6	189912	189917	0 %	0 %	50 %	50 %	116255375
4234	NC_008384	GGC	2	6	189961	189966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255375
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4239	NC_008384	GGC	2	6	190524	190529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4240	NC_008384	GTT	2	6	190546	190551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255376
4241	NC_008384	TGT	2	6	190560	190565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255376
4242	NC_008384	TCG	2	6	190622	190627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255376
4243	NC_008384	GCG	2	6	190656	190661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255376
4244	NC_008384	CAC	2	6	190723	190728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255376
4245	NC_008384	TCG	2	6	190730	190735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255376
4246	NC_008384	GGC	2	6	190750	190755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255376
4247	NC_008384	CG	4	8	190770	190777	0 %	0 %	50 %	50 %	116255376
4248	NC_008384	CCG	2	6	190800	190805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255376
4249	NC_008384	ATC	2	6	190873	190878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255376
4250	NC_008384	ATC	2	6	190913	190918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255376
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4264	NC_008384	CAC	2	6	191730	191735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4266	NC_008384	AGTGAC	2	12	191867	191878	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116255377
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4283	NC_008384	GCC	2	6	192816	192821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4284	NC_008384	GGA	2	6	192824	192829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4292	NC_008384	GCTGGC	2	12	193827	193838	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116255379
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4322	NC_008384	GAG	2	6	196051	196056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4343	NC_008384	CGACAG	2	12	197220	197231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255382
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4352	NC_008384	TGT	2	6	197623	197628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4353	NC_008384	GGA	2	6	197689	197694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4364	NC_008384	TGC	2	6	198237	198242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255384
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4366	NC_008384	GTT	2	6	198271	198276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255384
4367	NC_008384	TCGC	2	8	198284	198291	0 %	25 %	25 %	50 %	116255384
4368	NC_008384	TGG	2	6	198296	198301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255384
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4371	NC_008384	CTG	2	6	198629	198634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255384
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4488	NC_008384	GGC	2	6	204879	204884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255392
4489	NC_008384	GGC	2	6	204891	204896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255392
4490	NC_008384	ATG	2	6	204909	204914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255392
4491	NC_008384	GCG	2	6	204918	204923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255392
4492	NC_008384	GC	3	6	204928	204933	0 %	0 %	50 %	50 %	116255392
4493	NC_008384	CGT	3	9	205004	205012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255392
4494	NC_008384	CGG	2	6	205076	205081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255392
4495	NC_008384	CGT	2	6	205104	205109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255392
4496	NC_008384	CAT	2	6	205114	205119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255392
4497	NC_008384	GTC	2	6	205122	205127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255392
4498	NC_008384	GAC	2	6	205157	205162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255392
4499	NC_008384	GCT	2	6	205255	205260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4500	NC_008384	CGG	2	6	205287	205292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255393

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