MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 15688

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_008384	GAT	2	6	676258	676263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255826
15503	NC_008384	ATC	2	6	676295	676300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255826
15504	NC_008384	GCC	2	6	676346	676351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255826
15505	NC_008384	GAA	2	6	676414	676419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255826
15506	NC_008384	GGA	2	6	676495	676500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255826
15507	NC_008384	TCG	2	6	676518	676523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255826
15508	NC_008384	GGC	2	6	676567	676572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255826
15509	NC_008384	CCA	2	6	676630	676635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255826
15510	NC_008384	GCG	2	6	676652	676657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255826
15511	NC_008384	CGA	2	6	676699	676704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255826
15512	NC_008384	CGA	2	6	676759	676764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255826
15513	NC_008384	GCT	2	6	676795	676800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255826
15514	NC_008384	CGG	2	6	676842	676847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255826
15515	NC_008384	CCGG	2	8	676868	676875	0 %	0 %	50 %	50 %	116255826
15516	NC_008384	GC	3	6	676882	676887	0 %	0 %	50 %	50 %	116255826
15517	NC_008384	GCC	2	6	676920	676925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15519	NC_008384	CGA	2	6	677022	677027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255827
15520	NC_008384	GAT	2	6	677029	677034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255827
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15522	NC_008384	GAC	2	6	677125	677130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255827
15523	NC_008384	GCG	2	6	677160	677165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255827
15524	NC_008384	TCG	2	6	677252	677257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255827
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15526	NC_008384	GA	3	6	677444	677449	50 %	0 %	50 %	0 %	116255827
15527	NC_008384	GGCC	2	8	677478	677485	0 %	0 %	50 %	50 %	116255827
15528	NC_008384	GCA	2	6	677486	677491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255827
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15539	NC_008384	GCC	2	6	677927	677932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255828
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15544	NC_008384	CAT	2	6	678220	678225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255828
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15552	NC_008384	CAG	2	6	678428	678433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255828
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15590	NC_008384	C	7	7	679676	679682	0 %	0 %	0 %	100 %	116255829
15591	NC_008384	GCG	2	6	679693	679698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255829
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15601	NC_008384	CG	3	6	680117	680122	0 %	0 %	50 %	50 %	116255830
15602	NC_008384	CGGC	2	8	680128	680135	0 %	0 %	50 %	50 %	116255830
15603	NC_008384	CGC	2	6	680188	680193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255830
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15606	NC_008384	CCCTG	2	10	680243	680252	0 %	20 %	20 %	60 %	116255830
15607	NC_008384	CTC	2	6	680258	680263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255830
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15609	NC_008384	CGC	2	6	680512	680517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255831
15610	NC_008384	GCCG	3	12	680559	680570	0 %	0 %	50 %	50 %	116255831
15611	NC_008384	CGG	2	6	680582	680587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255831
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15617	NC_008384	GTC	2	6	680954	680959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255831
15618	NC_008384	ATA	2	6	680965	680970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116255831
15619	NC_008384	CAG	2	6	680998	681003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255831
15620	NC_008384	CGA	2	6	681009	681014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255831
15621	NC_008384	TTGCCG	2	12	681020	681031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255831
15622	NC_008384	CCCTG	2	10	681033	681042	0 %	20 %	20 %	60 %	116255831
15623	NC_008384	GC	3	6	681080	681085	0 %	0 %	50 %	50 %	116255831
15624	NC_008384	GAG	2	6	681100	681105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255831
15625	NC_008384	GTC	2	6	681152	681157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255831
15626	NC_008384	GGCCT	2	10	681161	681170	0 %	20 %	40 %	40 %	116255832
15627	NC_008384	GGC	2	6	681186	681191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255832
15628	NC_008384	GCC	2	6	681207	681212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255832
15629	NC_008384	GCCG	2	8	681215	681222	0 %	0 %	50 %	50 %	116255832
15630	NC_008384	CCG	2	6	681278	681283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255832
15631	NC_008384	CGA	2	6	681287	681292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255832
15632	NC_008384	CGC	2	6	681315	681320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255832
15633	NC_008384	CGGT	2	8	681368	681375	0 %	25 %	50 %	25 %	116255832
15634	NC_008384	GCC	2	6	681399	681404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255832
15635	NC_008384	GGC	3	9	681429	681437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255832
15636	NC_008384	CG	3	6	681458	681463	0 %	0 %	50 %	50 %	116255832
15637	NC_008384	AGA	2	6	681563	681568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255832
15638	NC_008384	CG	3	6	681593	681598	0 %	0 %	50 %	50 %	116255832
15639	NC_008384	CGG	2	6	681614	681619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255832
15640	NC_008384	GCC	2	6	681637	681642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255832
15641	NC_008384	ATCGC	2	10	681751	681760	20 %	20 %	20 %	40 %	116255832
15642	NC_008384	ATTCCT	2	12	681787	681798	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	116255832
15643	NC_008384	AGGC	2	8	681840	681847	25 %	0 %	50 %	25 %	116255833
15644	NC_008384	TTG	2	6	681870	681875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255833
15645	NC_008384	CT	3	6	681897	681902	0 %	50 %	0 %	50 %	116255833
15646	NC_008384	GCA	2	6	681951	681956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255833
15647	NC_008384	CCG	2	6	681985	681990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255833
15648	NC_008384	GGTCAG	2	12	681995	682006	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116255833
15649	NC_008384	GCCG	2	8	682008	682015	0 %	0 %	50 %	50 %	116255833
15650	NC_008384	CG	3	6	682014	682019	0 %	0 %	50 %	50 %	116255833
15651	NC_008384	GC	3	6	682100	682105	0 %	0 %	50 %	50 %	116255833
15652	NC_008384	AGCCGC	2	12	682132	682143	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116255833
15653	NC_008384	CGGCGC	2	12	682144	682155	0 %	0 %	50 %	50 %	116255833
15654	NC_008384	GGC	2	6	682157	682162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255833
15655	NC_008384	GCG	2	6	682191	682196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255833
15656	NC_008384	GCG	2	6	682212	682217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255833
15657	NC_008384	CTG	2	6	682240	682245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255833
15658	NC_008384	GAA	2	6	682259	682264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255833
15659	NC_008384	CGC	2	6	682424	682429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255833
15660	NC_008384	CCAT	2	8	682452	682459	25 %	25 %	0 %	50 %	116255833
15661	NC_008384	CTGCC	2	10	682509	682518	0 %	20 %	20 %	60 %	116255833
15662	NC_008384	CGA	2	6	682648	682653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255833
15663	NC_008384	CGG	2	6	682663	682668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255833
15664	NC_008384	GAT	2	6	682703	682708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255833
15665	NC_008384	TGC	2	6	682759	682764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255833
15666	NC_008384	GCG	2	6	682822	682827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255833
15667	NC_008384	CGG	2	6	682864	682869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255833
15668	NC_008384	CCGG	2	8	683019	683026	0 %	0 %	50 %	50 %	116255833
15669	NC_008384	GCGCC	2	10	683085	683094	0 %	0 %	40 %	60 %	116255833
15670	NC_008384	CCG	2	6	683107	683112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255833
15671	NC_008384	CGCCT	2	10	683129	683138	0 %	20 %	20 %	60 %	116255833
15672	NC_008384	TCGC	2	8	683145	683152	0 %	25 %	25 %	50 %	116255833
15673	NC_008384	GGCCG	2	10	683207	683216	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15674	NC_008384	GCCGT	2	10	683296	683305	0 %	20 %	40 %	40 %	116255834
15675	NC_008384	AGA	2	6	683403	683408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255834
15676	NC_008384	TCG	2	6	683423	683428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255834
15677	NC_008384	CGA	2	6	683532	683537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255834
15678	NC_008384	TGGC	2	8	683555	683562	0 %	25 %	50 %	25 %	116255834
15679	NC_008384	GAT	2	6	683641	683646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255834
15680	NC_008384	CTC	2	6	683704	683709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255834
15681	NC_008384	GCCG	3	12	683830	683841	0 %	0 %	50 %	50 %	116255834
15682	NC_008384	CCG	2	6	683866	683871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255834
15683	NC_008384	TGCCGA	2	12	683979	683990	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116255834
15684	NC_008384	TGATAT	2	12	683991	684002	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116255834
15685	NC_008384	CGG	2	6	684032	684037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15686	NC_008384	CGC	2	6	684058	684063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15687	NC_008384	TGT	2	6	684121	684126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15688	NC_008384	TGC	2	6	684127	684132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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