MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 15688

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008384	GGC	2	6	42307	42312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255234
1002	NC_008384	GCC	2	6	42320	42325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255234
1003	NC_008384	TCG	2	6	42332	42337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255234
1004	NC_008384	CCG	2	6	42348	42353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255234
1005	NC_008384	CGCTGG	2	12	42386	42397	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116255234
1006	NC_008384	CCG	2	6	42398	42403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255234
1007	NC_008384	CGC	2	6	42414	42419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255234
1008	NC_008384	CGA	2	6	42426	42431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255234
1009	NC_008384	CCTT	2	8	42506	42513	0 %	50 %	0 %	50 %	116255234
1010	NC_008384	TGT	2	6	42537	42542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255234
1011	NC_008384	TCG	3	9	42549	42557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255234
1012	NC_008384	AGGA	2	8	42563	42570	50 %	0 %	50 %	0 %	116255234
1013	NC_008384	CTG	2	6	42574	42579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255234
1014	NC_008384	ACG	2	6	42581	42586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255234
1015	NC_008384	GCC	2	6	42652	42657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255234
1016	NC_008384	CGT	2	6	42663	42668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255234
1017	NC_008384	TCG	2	6	42693	42698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255234
1018	NC_008384	TCG	2	6	42764	42769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255234
1019	NC_008384	GCA	2	6	42822	42827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255234
1020	NC_008384	CCGT	2	8	42830	42837	0 %	25 %	25 %	50 %	116255234
1021	NC_008384	GTCGAG	2	12	42880	42891	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116255234
1022	NC_008384	GCC	3	9	43039	43047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255234
1023	NC_008384	CGC	2	6	43069	43074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255234
1024	NC_008384	GAA	2	6	43075	43080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255234
1025	NC_008384	GC	3	6	43143	43148	0 %	0 %	50 %	50 %	116255234
1026	NC_008384	GCC	2	6	43157	43162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255234
1027	NC_008384	GC	3	6	43199	43204	0 %	0 %	50 %	50 %	116255234
1028	NC_008384	ACG	2	6	43205	43210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255234
1029	NC_008384	GCC	2	6	43216	43221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255234
1030	NC_008384	TCC	2	6	43229	43234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255234
1031	NC_008384	ATG	2	6	43235	43240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255234
1032	NC_008384	CGA	2	6	43306	43311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255234
1033	NC_008384	CGA	2	6	43320	43325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255234
1034	NC_008384	AGG	2	6	43346	43351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255234
1035	NC_008384	CAG	2	6	43372	43377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255234
1036	NC_008384	GCCGAT	2	12	43387	43398	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116255234
1037	NC_008384	CAG	2	6	43408	43413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255234
1038	NC_008384	ATC	2	6	43415	43420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255234
1039	NC_008384	TCT	2	6	43533	43538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255234
1040	NC_008384	GCA	2	6	43623	43628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255234
1041	NC_008384	AGC	4	12	43640	43651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255234
1042	NC_008384	GCC	2	6	43676	43681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255234
1043	NC_008384	CGC	2	6	43687	43692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255234
1044	NC_008384	CCG	2	6	43694	43699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255234
1045	NC_008384	ATC	2	6	43748	43753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255234
1046	NC_008384	CAT	2	6	43822	43827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255234
1047	NC_008384	TCG	2	6	43902	43907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255234
1048	NC_008384	CG	3	6	43906	43911	0 %	0 %	50 %	50 %	116255234
1049	NC_008384	GCT	2	6	43924	43929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255234
1050	NC_008384	T	6	6	43937	43942	0 %	100 %	0 %	0 %	116255234
1051	NC_008384	TG	3	6	43951	43956	0 %	50 %	50 %	0 %	116255234
1052	NC_008384	GC	3	6	44106	44111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_008384	GCA	2	6	44121	44126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_008384	GA	3	6	44155	44160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_008384	CGAC	2	8	44228	44235	25 %	0 %	25 %	50 %	116255235
1056	NC_008384	GAT	2	6	44238	44243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255235
1057	NC_008384	CGT	2	6	44277	44282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255235
1058	NC_008384	CGA	2	6	44334	44339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255235
1059	NC_008384	CCG	2	6	44384	44389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255235
1060	NC_008384	CTG	2	6	44395	44400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255235
1061	NC_008384	GAG	2	6	44476	44481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255235
1062	NC_008384	CGA	2	6	44484	44489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255235
1063	NC_008384	CGT	2	6	44532	44537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255235
1064	NC_008384	CCA	2	6	44556	44561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255235
1065	NC_008384	ACG	2	6	44591	44596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255235
1066	NC_008384	CCA	2	6	44654	44659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255235
1067	NC_008384	TCG	2	6	44663	44668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255235
1068	NC_008384	GGCC	2	8	44736	44743	0 %	0 %	50 %	50 %	116255235
1069	NC_008384	GGC	2	6	44773	44778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255235
1070	NC_008384	CCGAC	2	10	44790	44799	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1071	NC_008384	CAA	2	6	44898	44903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_008384	TCA	2	6	45052	45057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_008384	TCGA	2	8	45090	45097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_008384	T	6	6	45148	45153	0 %	100 %	0 %	0 %	116255236
1075	NC_008384	GCG	3	9	45168	45176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255236
1076	NC_008384	CGG	2	6	45184	45189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255236
1077	NC_008384	TCG	2	6	45205	45210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255236
1078	NC_008384	ATG	2	6	45228	45233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255236
1079	NC_008384	TGA	2	6	45247	45252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255236
1080	NC_008384	GC	4	8	45260	45267	0 %	0 %	50 %	50 %	116255236
1081	NC_008384	CTC	2	6	45335	45340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255236
1082	NC_008384	TC	3	6	45368	45373	0 %	50 %	0 %	50 %	116255236
1083	NC_008384	TCGG	2	8	45378	45385	0 %	25 %	50 %	25 %	116255236
1084	NC_008384	ACG	2	6	45391	45396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255236
1085	NC_008384	GCA	2	6	45415	45420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255236
1086	NC_008384	GCC	2	6	45423	45428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255236
1087	NC_008384	CGC	2	6	45434	45439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255236
1088	NC_008384	GCCG	2	8	45443	45450	0 %	0 %	50 %	50 %	116255236
1089	NC_008384	CGC	2	6	45530	45535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255236
1090	NC_008384	GC	3	6	45534	45539	0 %	0 %	50 %	50 %	116255236
1091	NC_008384	CGG	2	6	45692	45697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255236
1092	NC_008384	TCG	2	6	45730	45735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255236
1093	NC_008384	CG	3	6	45734	45739	0 %	0 %	50 %	50 %	116255236
1094	NC_008384	TGC	2	6	45751	45756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255236
1095	NC_008384	CGT	2	6	45773	45778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255236
1096	NC_008384	GCT	2	6	45785	45790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255236
1097	NC_008384	CCG	2	6	45874	45879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255236
1098	NC_008384	CCG	2	6	45892	45897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255236
1099	NC_008384	TGA	2	6	45988	45993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255236
1100	NC_008384	CGCT	2	8	46014	46021	0 %	25 %	25 %	50 %	116255236
1101	NC_008384	TGC	2	6	46156	46161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255236
1102	NC_008384	CGGG	2	8	46170	46177	0 %	0 %	75 %	25 %	116255236
1103	NC_008384	CCG	2	6	46178	46183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255236
1104	NC_008384	TTC	2	6	46200	46205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255236
1105	NC_008384	GCCG	2	8	46208	46215	0 %	0 %	50 %	50 %	116255236
1106	NC_008384	CAT	2	6	46250	46255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255236
1107	NC_008384	CCG	2	6	46312	46317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255236
1108	NC_008384	GC	3	6	46362	46367	0 %	0 %	50 %	50 %	116255236
1109	NC_008384	AGCG	2	8	46503	46510	25 %	0 %	50 %	25 %	116255236
1110	NC_008384	CTG	2	6	46569	46574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_008384	GAG	2	6	46643	46648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255237
1112	NC_008384	CTAT	2	8	46689	46696	25 %	50 %	0 %	25 %	116255237
1113	NC_008384	GCG	2	6	46734	46739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255237
1114	NC_008384	CCGCG	2	10	46813	46822	0 %	0 %	40 %	60 %	116255237
1115	NC_008384	GC	5	10	46832	46841	0 %	0 %	50 %	50 %	116255237
1116	NC_008384	CGG	3	9	46848	46856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255237
1117	NC_008384	ATC	2	6	46925	46930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255237
1118	NC_008384	GATCC	2	10	46931	46940	20 %	20 %	20 %	40 %	116255237
1119	NC_008384	GTC	2	6	46941	46946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255237
1120	NC_008384	AGC	2	6	47002	47007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255237
1121	NC_008384	CCG	2	6	47041	47046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255237
1122	NC_008384	CAG	2	6	47104	47109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255237
1123	NC_008384	GC	3	6	47411	47416	0 %	0 %	50 %	50 %	116255237
1124	NC_008384	AGA	2	6	47436	47441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255237
1125	NC_008384	CGG	2	6	47464	47469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255237
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1247	NC_008384	AGCC	2	8	51816	51823	25 %	0 %	25 %	50 %	116255241
1248	NC_008384	ATG	3	9	51858	51866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255241
1249	NC_008384	CGG	2	6	51874	51879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255241
1250	NC_008384	GTT	2	6	51899	51904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255241
1251	NC_008384	GGAAGG	2	12	51907	51918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255241
1252	NC_008384	CG	4	8	51925	51932	0 %	0 %	50 %	50 %	116255241
1253	NC_008384	CAC	2	6	51947	51952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255241
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1259	NC_008384	ATG	2	6	52125	52130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255241
1260	NC_008384	ATG	2	6	52149	52154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255241
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1262	NC_008384	TGA	2	6	52222	52227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255241
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1265	NC_008384	AAC	2	6	52360	52365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1266	NC_008384	TTG	4	12	52404	52415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255242
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1298	NC_008384	GCA	2	6	53665	53670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1300	NC_008384	TGA	2	6	53721	53726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1301	NC_008384	AAG	2	6	53731	53736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1302	NC_008384	AT	3	6	53767	53772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1303	NC_008384	GGCC	2	8	53780	53787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1304	NC_008384	T	6	6	53830	53835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1305	NC_008384	TGA	3	9	53860	53868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1306	NC_008384	GAGG	2	8	53950	53957	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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1342	NC_008384	GCA	2	6	55254	55259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255243
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1346	NC_008384	ATT	2	6	55382	55387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1351	NC_008384	TCGATG	2	12	55667	55678	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116255244
1352	NC_008384	CGT	2	6	55732	55737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255244
1353	NC_008384	GGC	2	6	55746	55751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255244
1354	NC_008384	AGG	2	6	55796	55801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255244
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1359	NC_008384	CAA	2	6	56175	56180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255245
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1367	NC_008384	GGCGA	2	10	56475	56484	20 %	0 %	60 %	20 %	116255246
1368	NC_008384	GAT	2	6	56486	56491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255246
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1371	NC_008384	GGC	2	6	56519	56524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255246
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1493	NC_008384	CCT	2	6	61475	61480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255249
1494	NC_008384	CGG	2	6	61738	61743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255249
1495	NC_008384	TCA	2	6	61790	61795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255249
1496	NC_008384	CTC	2	6	61854	61859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255249
1497	NC_008384	GAC	2	6	61881	61886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255249
1498	NC_008384	CTT	2	6	61920	61925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255249
1499	NC_008384	GTCG	2	8	61926	61933	0 %	25 %	50 %	25 %	116255249
1500	NC_008384	AGC	2	6	61984	61989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255249

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