MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 15688

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_008384	CTGG	2	8	613923	613930	0 %	25 %	50 %	25 %	116255769
14002	NC_008384	CGA	2	6	613956	613961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255769
14003	NC_008384	CGG	2	6	613997	614002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255769
14004	NC_008384	CG	3	6	614024	614029	0 %	0 %	50 %	50 %	116255769
14005	NC_008384	AGG	2	6	614040	614045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255769
14006	NC_008384	AC	4	8	614069	614076	50 %	0 %	0 %	50 %	116255769
14007	NC_008384	TCC	2	6	614092	614097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14008	NC_008384	GCT	2	6	614107	614112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_008384	TCGA	2	8	614147	614154	25 %	25 %	25 %	25 %	116255770
14010	NC_008384	CGC	2	6	614164	614169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255770
14011	NC_008384	CTG	2	6	614180	614185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255770
14012	NC_008384	CCA	2	6	614220	614225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255770
14013	NC_008384	CGC	2	6	614257	614262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255770
14014	NC_008384	GACGC	2	10	614343	614352	20 %	0 %	40 %	40 %	116255770
14015	NC_008384	GCT	2	6	614358	614363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255770
14016	NC_008384	GGC	3	9	614384	614392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255770
14017	NC_008384	GAC	2	6	614417	614422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255770
14018	NC_008384	CGA	2	6	614539	614544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255770
14019	NC_008384	CGA	2	6	614590	614595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255770
14020	NC_008384	CAA	2	6	614617	614622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255770
14021	NC_008384	CGA	2	6	614680	614685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255770
14022	NC_008384	CGC	3	9	614801	614809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255771
14023	NC_008384	GC	3	6	614887	614892	0 %	0 %	50 %	50 %	116255771
14024	NC_008384	GC	4	8	614897	614904	0 %	0 %	50 %	50 %	116255771
14025	NC_008384	CG	3	6	614905	614910	0 %	0 %	50 %	50 %	116255771
14026	NC_008384	TCA	2	6	614917	614922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255771
14027	NC_008384	GCA	2	6	614962	614967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255771
14028	NC_008384	CGA	2	6	614981	614986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255771
14029	NC_008384	GCC	2	6	615003	615008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255771
14030	NC_008384	CGGC	2	8	615015	615022	0 %	0 %	50 %	50 %	116255771
14031	NC_008384	GAA	2	6	615045	615050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255771
14032	NC_008384	CCG	2	6	615055	615060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255771
14033	NC_008384	GCC	2	6	615066	615071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255771
14034	NC_008384	CGA	2	6	615107	615112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255771
14035	NC_008384	GTG	3	9	615120	615128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255771
14036	NC_008384	TTC	2	6	615132	615137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255771
14037	NC_008384	GACGGC	2	12	615138	615149	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116255771
14038	NC_008384	GGC	2	6	615152	615157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255771
14039	NC_008384	CCG	2	6	615170	615175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255771
14040	NC_008384	CCG	2	6	615233	615238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255771
14041	NC_008384	CCG	2	6	615241	615246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255771
14042	NC_008384	TGA	2	6	615268	615273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255771
14043	NC_008384	CCG	2	6	615354	615359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255771
14044	NC_008384	GC	3	6	615464	615469	0 %	0 %	50 %	50 %	116255771
14045	NC_008384	CGC	2	6	615505	615510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255771
14046	NC_008384	GCG	2	6	615520	615525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255771
14047	NC_008384	CGGC	2	8	615542	615549	0 %	0 %	50 %	50 %	116255771
14048	NC_008384	GCA	2	6	615583	615588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255771
14049	NC_008384	AAC	2	6	615644	615649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255771
14050	NC_008384	TCG	2	6	615681	615686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255772
14051	NC_008384	TCA	2	6	615690	615695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255772
14052	NC_008384	TGC	2	6	615831	615836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255772
14053	NC_008384	CGC	2	6	615874	615879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255772
14054	NC_008384	AGGAC	2	10	615903	615912	40 %	0 %	40 %	20 %	116255772
14055	NC_008384	GCGA	2	8	615917	615924	25 %	0 %	50 %	25 %	116255772
14056	NC_008384	CCGG	2	8	615929	615936	0 %	0 %	50 %	50 %	116255772
14057	NC_008384	TGC	2	6	615942	615947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255772
14058	NC_008384	CGA	2	6	615961	615966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255772
14059	NC_008384	CGG	2	6	615973	615978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255772
14060	NC_008384	GAC	2	6	615985	615990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255772
14061	NC_008384	GAT	2	6	615991	615996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255772
14062	NC_008384	TCG	2	6	616056	616061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255772
14063	NC_008384	CGA	2	6	616096	616101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255772
14064	NC_008384	GCCG	2	8	616120	616127	0 %	0 %	50 %	50 %	116255772
14065	NC_008384	CCG	2	6	616161	616166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255772
14066	NC_008384	CCAGC	2	10	616208	616217	20 %	0 %	20 %	60 %	116255772
14067	NC_008384	GAA	2	6	616243	616248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255772
14068	NC_008384	CGA	2	6	616273	616278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255772
14069	NC_008384	CGT	2	6	616345	616350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255772
14070	NC_008384	CGGCG	2	10	616390	616399	0 %	0 %	60 %	40 %	116255772
14071	NC_008384	ACG	2	6	616400	616405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255772
14072	NC_008384	ACA	2	6	616440	616445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255772
14073	NC_008384	TGC	2	6	616527	616532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255772
14074	NC_008384	CCG	2	6	616592	616597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14075	NC_008384	TCG	2	6	616685	616690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255773
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14079	NC_008384	TGC	2	6	616772	616777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255773
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14082	NC_008384	CGA	2	6	616833	616838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255773
14083	NC_008384	CGGC	2	8	616874	616881	0 %	0 %	50 %	50 %	116255773
14084	NC_008384	TCG	2	6	616916	616921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255773
14085	NC_008384	GCC	2	6	616933	616938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255773
14086	NC_008384	CTG	2	6	617005	617010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255773
14087	NC_008384	CCG	2	6	617042	617047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255773
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14089	NC_008384	AGG	2	6	617105	617110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255773
14090	NC_008384	TCA	2	6	617147	617152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255773
14091	NC_008384	TGGC	2	8	617170	617177	0 %	25 %	50 %	25 %	116255773
14092	NC_008384	GCG	2	6	617199	617204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255773
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14095	NC_008384	CGC	2	6	617254	617259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255773
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14098	NC_008384	CTG	2	6	617548	617553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255773
14099	NC_008384	CTTCGC	2	12	617565	617576	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	116255773
14100	NC_008384	TGA	2	6	617591	617596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255773
14101	NC_008384	CG	3	6	617681	617686	0 %	0 %	50 %	50 %	116255773
14102	NC_008384	CCG	2	6	617701	617706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255773
14103	NC_008384	CGG	2	6	617745	617750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255773
14104	NC_008384	CCG	2	6	617783	617788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255773
14105	NC_008384	GC	3	6	617789	617794	0 %	0 %	50 %	50 %	116255773
14106	NC_008384	GC	3	6	617808	617813	0 %	0 %	50 %	50 %	116255773
14107	NC_008384	GTTC	2	8	617830	617837	0 %	50 %	25 %	25 %	116255773
14108	NC_008384	TCG	2	6	617849	617854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255773
14109	NC_008384	GGC	2	6	617860	617865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255773
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14111	NC_008384	CGT	2	6	617928	617933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255773
14112	NC_008384	GTC	2	6	617977	617982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255773
14113	NC_008384	CAT	2	6	618075	618080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255773
14114	NC_008384	TGC	2	6	618116	618121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255773
14115	NC_008384	GAC	2	6	618153	618158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255773
14116	NC_008384	CGC	2	6	618173	618178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255773
14117	NC_008384	ATG	2	6	618184	618189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255773
14118	NC_008384	TGC	2	6	618209	618214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255773
14119	NC_008384	CAG	2	6	618250	618255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255773
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14150	NC_008384	TGA	2	6	619354	619359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255774
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14208	NC_008384	CGG	2	6	620994	620999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255776
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14211	NC_008384	TCG	2	6	621095	621100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255776
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14214	NC_008384	CAG	2	6	621178	621183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255776
14215	NC_008384	CG	3	6	621219	621224	0 %	0 %	50 %	50 %	116255776
14216	NC_008384	GCGCC	2	10	621237	621246	0 %	0 %	40 %	60 %	116255776
14217	NC_008384	GCC	2	6	621255	621260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255776
14218	NC_008384	CGCC	3	12	621257	621268	0 %	0 %	25 %	75 %	116255776
14219	NC_008384	AGCA	2	8	621286	621293	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14220	NC_008384	GCG	2	6	621319	621324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14221	NC_008384	CG	4	8	621323	621330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14222	NC_008384	GCT	2	6	621340	621345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14223	NC_008384	GCT	2	6	621351	621356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255777
14224	NC_008384	AGCG	2	8	621451	621458	25 %	0 %	50 %	25 %	116255777
14225	NC_008384	TGC	2	6	621539	621544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255777
14226	NC_008384	GCT	2	6	621604	621609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255777
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14228	NC_008384	GTT	2	6	621637	621642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255777
14229	NC_008384	CCGCC	2	10	621682	621691	0 %	0 %	20 %	80 %	116255777
14230	NC_008384	GAA	2	6	621709	621714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255777
14231	NC_008384	TGC	2	6	621799	621804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255777
14232	NC_008384	CG	3	6	621958	621963	0 %	0 %	50 %	50 %	116255777
14233	NC_008384	CGG	2	6	621975	621980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255777
14234	NC_008384	AC	3	6	622014	622019	50 %	0 %	0 %	50 %	116255777
14235	NC_008384	CCT	2	6	622107	622112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255777
14236	NC_008384	TCT	2	6	622140	622145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255777
14237	NC_008384	CGTTTG	2	12	622190	622201	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116255777
14238	NC_008384	GCCC	2	8	622208	622215	0 %	0 %	25 %	75 %	116255777
14239	NC_008384	CCG	3	9	622238	622246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255777
14240	NC_008384	TGG	2	6	622331	622336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255777
14241	NC_008384	CTGTG	2	10	622357	622366	0 %	40 %	40 %	20 %	116255777
14242	NC_008384	GC	3	6	622425	622430	0 %	0 %	50 %	50 %	116255777
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14245	NC_008384	TGA	2	6	622524	622529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255777
14246	NC_008384	TCAG	2	8	622535	622542	25 %	25 %	25 %	25 %	116255777
14247	NC_008384	TCG	2	6	622568	622573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255777
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14265	NC_008384	AGC	2	6	623243	623248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14267	NC_008384	CGC	2	6	623329	623334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14268	NC_008384	CCGC	2	8	623450	623457	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14269	NC_008384	ACG	2	6	623592	623597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14293	NC_008384	GTC	2	6	624561	624566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14303	NC_008384	CGC	3	9	624839	624847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14310	NC_008384	GCCTGC	2	12	625182	625193	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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14330	NC_008384	GGGC	2	8	626409	626416	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14331	NC_008384	CTG	2	6	626429	626434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14332	NC_008384	CCGC	2	8	626450	626457	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14333	NC_008384	GAG	2	6	626544	626549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14334	NC_008384	CATT	2	8	626651	626658	25 %	50 %	0 %	25 %	116255781
14335	NC_008384	GATG	2	8	626683	626690	25 %	25 %	50 %	0 %	116255781
14336	NC_008384	TGCGAT	2	12	626773	626784	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116255781
14337	NC_008384	GAT	2	6	626792	626797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255781
14338	NC_008384	GAT	3	9	626810	626818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255781
14339	NC_008384	TTG	2	6	626869	626874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255781
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14341	NC_008384	GGCC	2	8	626971	626978	0 %	0 %	50 %	50 %	116255781
14342	NC_008384	GTC	2	6	627033	627038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255782
14343	NC_008384	C	6	6	627076	627081	0 %	0 %	0 %	100 %	116255782
14344	NC_008384	CGC	2	6	627091	627096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255782
14345	NC_008384	GCAC	2	8	627107	627114	25 %	0 %	25 %	50 %	116255782
14346	NC_008384	CAG	2	6	627153	627158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255782
14347	NC_008384	GCA	2	6	627276	627281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255782
14348	NC_008384	CAA	2	6	627352	627357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255782
14349	NC_008384	TGCG	2	8	627500	627507	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14350	NC_008384	GTT	2	6	627556	627561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14351	NC_008384	CTCGC	2	10	627757	627766	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14352	NC_008384	ATG	2	6	627798	627803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14353	NC_008384	GAT	2	6	627876	627881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255784
14354	NC_008384	GTG	2	6	627923	627928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255784
14355	NC_008384	TTC	2	6	627942	627947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255784
14356	NC_008384	CGG	3	9	627960	627968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255784
14357	NC_008384	GCAA	2	8	628021	628028	50 %	0 %	25 %	25 %	116255784
14358	NC_008384	CGG	2	6	628081	628086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255784
14359	NC_008384	TGCC	2	8	628120	628127	0 %	25 %	25 %	50 %	116255784
14360	NC_008384	GGC	2	6	628258	628263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255784
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14363	NC_008384	CTT	2	6	628295	628300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255784
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14373	NC_008384	GCCC	2	8	628853	628860	0 %	0 %	25 %	75 %	116255784
14374	NC_008384	CGT	2	6	628925	628930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255784
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14399	NC_008384	GTCAT	2	10	629822	629831	20 %	40 %	20 %	20 %	116255785
14400	NC_008384	GTCATC	2	12	629864	629875	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116255785
14401	NC_008384	CAT	2	6	629926	629931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14473	NC_008384	CGG	2	6	633073	633078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255788
14474	NC_008384	CGA	2	6	633096	633101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255788
14475	NC_008384	CGA	2	6	633192	633197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255788
14476	NC_008384	GATCA	2	10	633286	633295	40 %	20 %	20 %	20 %	116255788
14477	NC_008384	CATT	2	8	633319	633326	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14478	NC_008384	TCAT	2	8	633327	633334	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14479	NC_008384	CAG	3	9	633389	633397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255789
14480	NC_008384	ACG	2	6	633444	633449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255789
14481	NC_008384	TGC	2	6	633469	633474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255789
14482	NC_008384	GCC	3	9	633498	633506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255789
14483	NC_008384	ATC	2	6	633531	633536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255789
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