MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 15688

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_008384	CATC	2	8	593308	593315	25 %	25 %	0 %	50 %	116255750
13502	NC_008384	CGA	2	6	593338	593343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255750
13503	NC_008384	AT	3	6	593373	593378	50 %	50 %	0 %	0 %	116255750
13504	NC_008384	GTC	2	6	593426	593431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255750
13505	NC_008384	GCC	2	6	593505	593510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255750
13506	NC_008384	GC	3	6	593545	593550	0 %	0 %	50 %	50 %	116255750
13507	NC_008384	TCA	2	6	593551	593556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255750
13508	NC_008384	TAGCG	2	10	593574	593583	20 %	20 %	40 %	20 %	116255750
13509	NC_008384	CTTC	2	8	593587	593594	0 %	50 %	0 %	50 %	116255750
13510	NC_008384	TCG	2	6	593634	593639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255750
13511	NC_008384	CCCG	2	8	593667	593674	0 %	0 %	25 %	75 %	116255750
13512	NC_008384	TCG	2	6	593715	593720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255750
13513	NC_008384	ATC	2	6	593893	593898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255751
13514	NC_008384	TTC	2	6	593919	593924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255751
13515	NC_008384	GCA	2	6	593948	593953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255751
13516	NC_008384	GAC	2	6	593970	593975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255751
13517	NC_008384	GCC	2	6	594000	594005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255751
13518	NC_008384	CGCC	2	8	594029	594036	0 %	0 %	25 %	75 %	116255751
13519	NC_008384	ATC	2	6	594205	594210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255751
13520	NC_008384	GGCT	2	8	594247	594254	0 %	25 %	50 %	25 %	116255751
13521	NC_008384	CGA	2	6	594332	594337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255751
13522	NC_008384	TGC	2	6	594340	594345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255751
13523	NC_008384	CG	3	6	594362	594367	0 %	0 %	50 %	50 %	116255751
13524	NC_008384	CAT	2	6	594420	594425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255751
13525	NC_008384	ATGCCG	2	12	594442	594453	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116255751
13526	NC_008384	TCG	2	6	594526	594531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255751
13527	NC_008384	CATG	2	8	594548	594555	25 %	25 %	25 %	25 %	116255751
13528	NC_008384	GCC	2	6	594564	594569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255751
13529	NC_008384	GCA	2	6	594587	594592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255751
13530	NC_008384	GCG	3	9	594620	594628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255751
13531	NC_008384	GCG	2	6	594648	594653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255751
13532	NC_008384	GCC	2	6	594660	594665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255751
13533	NC_008384	TCA	2	6	594671	594676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255751
13534	NC_008384	GCC	2	6	594693	594698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255751
13535	NC_008384	AAC	2	6	594816	594821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255752
13536	NC_008384	TCC	2	6	594822	594827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255752
13537	NC_008384	GC	3	6	594835	594840	0 %	0 %	50 %	50 %	116255752
13538	NC_008384	TTC	2	6	594848	594853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255752
13539	NC_008384	GGC	2	6	594878	594883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255752
13540	NC_008384	AAT	2	6	594895	594900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116255752
13541	NC_008384	CGT	2	6	594958	594963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255752
13542	NC_008384	CCA	2	6	595060	595065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255752
13543	NC_008384	GA	3	6	595098	595103	50 %	0 %	50 %	0 %	116255752
13544	NC_008384	GCGA	2	8	595131	595138	25 %	0 %	50 %	25 %	116255752
13545	NC_008384	AGC	2	6	595155	595160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255752
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13549	NC_008384	GCT	2	6	595294	595299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255752
13550	NC_008384	GCC	2	6	595345	595350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255752
13551	NC_008384	CGG	2	6	595434	595439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255753
13552	NC_008384	CTT	3	9	595444	595452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255753
13553	NC_008384	TCG	2	6	595460	595465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255753
13554	NC_008384	TGA	2	6	595605	595610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255753
13555	NC_008384	TCG	2	6	595640	595645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255753
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13557	NC_008384	GCA	2	6	595869	595874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255753
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13559	NC_008384	GAT	2	6	595900	595905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255753
13560	NC_008384	CGA	2	6	595926	595931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255753
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13562	NC_008384	CGT	2	6	596035	596040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255753
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13564	NC_008384	GTC	3	9	596137	596145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255753
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13567	NC_008384	GCCGGA	2	12	596197	596208	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116255753
13568	NC_008384	TCG	2	6	596258	596263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255753
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13570	NC_008384	CTT	2	6	596386	596391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255753
13571	NC_008384	ATG	2	6	596408	596413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255753
13572	NC_008384	TTC	2	6	596440	596445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255753
13573	NC_008384	ATTT	2	8	596591	596598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_008384	GCCC	2	8	596631	596638	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13575	NC_008384	GAAT	2	8	596686	596693	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13584	NC_008384	TGG	2	6	597046	597051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255754
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13588	NC_008384	TGG	2	6	597205	597210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255754
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13592	NC_008384	ATCG	2	8	597276	597283	25 %	25 %	25 %	25 %	116255754
13593	NC_008384	CAG	2	6	597348	597353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255754
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13601	NC_008384	CTTT	2	8	597625	597632	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13602	NC_008384	AG	3	6	597647	597652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_008384	CATTC	2	10	597765	597774	20 %	40 %	0 %	40 %	116255755
13604	NC_008384	GCTTGA	2	12	597780	597791	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116255755
13605	NC_008384	GGC	2	6	597796	597801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255755
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13607	NC_008384	CAT	2	6	597843	597848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255755
13608	NC_008384	GC	3	6	597851	597856	0 %	0 %	50 %	50 %	116255755
13609	NC_008384	GGCGC	2	10	597882	597891	0 %	0 %	60 %	40 %	116255755
13610	NC_008384	GCCG	2	8	597936	597943	0 %	0 %	50 %	50 %	116255755
13611	NC_008384	GGCC	2	8	597972	597979	0 %	0 %	50 %	50 %	116255755
13612	NC_008384	GAT	3	9	597982	597990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255755
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13615	NC_008384	GTT	2	6	598078	598083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255755
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13617	NC_008384	ATG	2	6	598205	598210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255755
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13741	NC_008384	GCC	2	6	603631	603636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255760
13742	NC_008384	CGG	2	6	603687	603692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255760
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13975	NC_008384	GTC	2	6	612685	612690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255769
13976	NC_008384	GAC	2	6	612717	612722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255769
13977	NC_008384	GCC	2	6	612810	612815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255769
13978	NC_008384	GCC	2	6	612819	612824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255769
13979	NC_008384	AGA	2	6	612848	612853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255769
13980	NC_008384	CAT	2	6	612870	612875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255769
13981	NC_008384	CCA	2	6	612920	612925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255769
13982	NC_008384	CAT	2	6	612996	613001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255769
13983	NC_008384	ATGA	2	8	613009	613016	50 %	25 %	25 %	0 %	116255769
13984	NC_008384	TCG	2	6	613031	613036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255769
13985	NC_008384	CGT	2	6	613101	613106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255769
13986	NC_008384	CCG	2	6	613114	613119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255769
13987	NC_008384	GCG	2	6	613262	613267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255769
13988	NC_008384	GGC	2	6	613315	613320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255769
13989	NC_008384	CGA	2	6	613368	613373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255769
13990	NC_008384	CGGCC	2	10	613410	613419	0 %	0 %	40 %	60 %	116255769
13991	NC_008384	ATC	2	6	613447	613452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255769
13992	NC_008384	TGG	2	6	613474	613479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255769
13993	NC_008384	CTG	2	6	613486	613491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255769
13994	NC_008384	CTT	2	6	613503	613508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255769
13995	NC_008384	TTC	2	6	613522	613527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255769
13996	NC_008384	CGG	2	6	613661	613666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255769
13997	NC_008384	TGG	2	6	613761	613766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255769
13998	NC_008384	CGA	2	6	613776	613781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255769
13999	NC_008384	CG	3	6	613805	613810	0 %	0 %	50 %	50 %	116255769
14000	NC_008384	CG	3	6	613814	613819	0 %	0 %	50 %	50 %	116255769

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