MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 15688

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008384	GGCA	2	8	573600	573607	25 %	0 %	50 %	25 %	116255731
13002	NC_008384	GGAT	2	8	573679	573686	25 %	25 %	50 %	0 %	116255731
13003	NC_008384	TTG	2	6	573706	573711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255731
13004	NC_008384	CGA	2	6	573911	573916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255731
13005	NC_008384	CGGC	2	8	573922	573929	0 %	0 %	50 %	50 %	116255731
13006	NC_008384	ACC	2	6	573930	573935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255731
13007	NC_008384	AAGG	2	8	573966	573973	50 %	0 %	50 %	0 %	116255731
13008	NC_008384	CGTCAG	2	12	573999	574010	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116255731
13009	NC_008384	GCG	2	6	574022	574027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255731
13010	NC_008384	CGC	2	6	574031	574036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255731
13011	NC_008384	CGC	2	6	574079	574084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255731
13012	NC_008384	CCA	2	6	574100	574105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255731
13013	NC_008384	CGC	2	6	574114	574119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255731
13014	NC_008384	CACG	2	8	574139	574146	25 %	0 %	25 %	50 %	116255731
13015	NC_008384	TTCC	2	8	574192	574199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13016	NC_008384	GTC	2	6	574218	574223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255732
13017	NC_008384	GCG	2	6	574262	574267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255732
13018	NC_008384	ATCC	2	8	574270	574277	25 %	25 %	0 %	50 %	116255732
13019	NC_008384	GAG	2	6	574332	574337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255732
13020	NC_008384	GAAA	2	8	574359	574366	75 %	0 %	25 %	0 %	116255732
13021	NC_008384	GAT	2	6	574396	574401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255732
13022	NC_008384	CAT	2	6	574406	574411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255732
13023	NC_008384	GAG	2	6	574489	574494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255732
13024	NC_008384	A	6	6	574512	574517	100 %	0 %	0 %	0 %	116255732
13025	NC_008384	GAG	3	9	574533	574541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255732
13026	NC_008384	GAC	2	6	574557	574562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255732
13027	NC_008384	GAG	2	6	574568	574573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255732
13028	NC_008384	GAG	2	6	574605	574610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255732
13029	NC_008384	AAT	2	6	574629	574634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116255732
13030	NC_008384	T	6	6	574643	574648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_008384	CTT	2	6	574665	574670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_008384	AAAGC	2	10	574740	574749	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13033	NC_008384	GGA	2	6	574759	574764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_008384	GTC	2	6	574868	574873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255733
13035	NC_008384	ATG	2	6	574956	574961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255733
13036	NC_008384	TTCG	2	8	575008	575015	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13037	NC_008384	TA	3	6	575029	575034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_008384	ATT	2	6	575049	575054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_008384	GCG	2	6	575082	575087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13040	NC_008384	GCA	2	6	575110	575115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_008384	CGG	2	6	575178	575183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255734
13042	NC_008384	TCG	2	6	575230	575235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255734
13043	NC_008384	CCA	2	6	575262	575267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255734
13044	NC_008384	GGC	2	6	575276	575281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255734
13045	NC_008384	TCCG	2	8	575289	575296	0 %	25 %	25 %	50 %	116255734
13046	NC_008384	GCTG	2	8	575375	575382	0 %	25 %	50 %	25 %	116255734
13047	NC_008384	GCT	2	6	575420	575425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255734
13048	NC_008384	TCGA	2	8	575427	575434	25 %	25 %	25 %	25 %	116255734
13049	NC_008384	CAG	2	6	575442	575447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255734
13050	NC_008384	GTC	2	6	575457	575462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255734
13051	NC_008384	CGA	2	6	575501	575506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255734
13052	NC_008384	CATCG	2	10	575706	575715	20 %	20 %	20 %	40 %	116255734
13053	NC_008384	CGGG	2	8	575741	575748	0 %	0 %	75 %	25 %	116255734
13054	NC_008384	GTT	2	6	575762	575767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255734
13055	NC_008384	GCC	2	6	575772	575777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255734
13056	NC_008384	CGA	2	6	575786	575791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255734
13057	NC_008384	TCG	2	6	575812	575817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255734
13058	NC_008384	GAT	2	6	575844	575849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255734
13059	NC_008384	TCG	2	6	575851	575856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255734
13060	NC_008384	GGT	2	6	575861	575866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255734
13061	NC_008384	GGT	2	6	575874	575879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255734
13062	NC_008384	CTGA	2	8	575923	575930	25 %	25 %	25 %	25 %	116255734
13063	NC_008384	GGC	2	6	575943	575948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255734
13064	NC_008384	CT	3	6	575977	575982	0 %	50 %	0 %	50 %	116255734
13065	NC_008384	GAC	2	6	576015	576020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255734
13066	NC_008384	GCC	2	6	576032	576037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255734
13067	NC_008384	CGC	2	6	576166	576171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13068	NC_008384	GGC	2	6	576233	576238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255735
13069	NC_008384	CGC	2	6	576318	576323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255735
13070	NC_008384	GAGGCC	2	12	576355	576366	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116255735
13071	NC_008384	CGTC	2	8	576374	576381	0 %	25 %	25 %	50 %	116255735
13072	NC_008384	GAA	2	6	576394	576399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255735
13073	NC_008384	TCG	2	6	576446	576451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255735
13074	NC_008384	CGG	2	6	576474	576479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255735
13075	NC_008384	GAT	2	6	576487	576492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255735
13076	NC_008384	GCC	2	6	576502	576507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255735
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13078	NC_008384	GC	3	6	576542	576547	0 %	0 %	50 %	50 %	116255735
13079	NC_008384	CATCGA	2	12	576585	576596	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116255735
13080	NC_008384	CGG	2	6	576612	576617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255735
13081	NC_008384	GCG	2	6	576627	576632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255735
13082	NC_008384	GAT	2	6	576640	576645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255735
13083	NC_008384	GGTC	2	8	576765	576772	0 %	25 %	50 %	25 %	116255735
13084	NC_008384	GCG	2	6	576842	576847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255735
13085	NC_008384	TCG	2	6	576881	576886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255735
13086	NC_008384	GC	3	6	576897	576902	0 %	0 %	50 %	50 %	116255735
13087	NC_008384	GCG	2	6	576921	576926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255735
13088	NC_008384	GCCG	2	8	576957	576964	0 %	0 %	50 %	50 %	116255735
13089	NC_008384	ATCG	2	8	576979	576986	25 %	25 %	25 %	25 %	116255735
13090	NC_008384	GATC	2	8	577008	577015	25 %	25 %	25 %	25 %	116255735
13091	NC_008384	ACG	2	6	577034	577039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255735
13092	NC_008384	GCG	2	6	577041	577046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255735
13093	NC_008384	CGA	2	6	577077	577082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255735
13094	NC_008384	GGA	2	6	577135	577140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255735
13095	NC_008384	TCA	2	6	577200	577205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255735
13096	NC_008384	CTTGG	2	10	577246	577255	0 %	40 %	40 %	20 %	116255735
13097	NC_008384	GT	3	6	577269	577274	0 %	50 %	50 %	0 %	116255735
13098	NC_008384	TTC	2	6	577291	577296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255735
13099	NC_008384	ATC	2	6	577505	577510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255735
13100	NC_008384	AAG	2	6	577540	577545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255735
13101	NC_008384	ATG	2	6	577592	577597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255735
13102	NC_008384	TGA	2	6	577634	577639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255736
13103	NC_008384	GCCT	2	8	577644	577651	0 %	25 %	25 %	50 %	116255736
13104	NC_008384	TGC	2	6	577656	577661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255736
13105	NC_008384	AT	3	6	577682	577687	50 %	50 %	0 %	0 %	116255736
13106	NC_008384	TCG	3	9	577714	577722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255736
13107	NC_008384	CGGC	2	8	577765	577772	0 %	0 %	50 %	50 %	116255736
13108	NC_008384	GAT	2	6	577839	577844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255736
13109	NC_008384	CGAA	2	8	577862	577869	50 %	0 %	25 %	25 %	116255736
13110	NC_008384	GCCG	2	8	577871	577878	0 %	0 %	50 %	50 %	116255736
13111	NC_008384	GCG	2	6	577911	577916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255736
13112	NC_008384	TCG	2	6	577945	577950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255736
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13115	NC_008384	GAT	2	6	578037	578042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255736
13116	NC_008384	CTT	2	6	578058	578063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255736
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13118	NC_008384	CGT	2	6	578126	578131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255736
13119	NC_008384	CAAG	2	8	578317	578324	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13120	NC_008384	CG	3	6	578340	578345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13121	NC_008384	GCC	2	6	578360	578365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13122	NC_008384	GGT	2	6	578395	578400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_008384	TGAT	2	8	578433	578440	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13352	NC_008384	ATC	3	9	587296	587304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13363	NC_008384	CA	3	6	587703	587708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13364	NC_008384	CGCAAT	2	12	587748	587759	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13365	NC_008384	CG	3	6	587774	587779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13366	NC_008384	A	6	6	587817	587822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13367	NC_008384	GCGAA	2	10	587894	587903	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13368	NC_008384	A	6	6	587902	587907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13369	NC_008384	CG	3	6	587995	588000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13370	NC_008384	GC	3	6	588008	588013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13371	NC_008384	GAT	2	6	588029	588034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13372	NC_008384	ATG	2	6	588087	588092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13373	NC_008384	CAT	2	6	588121	588126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13387	NC_008384	GTC	2	6	588559	588564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13389	NC_008384	CGAT	2	8	588655	588662	25 %	25 %	25 %	25 %	116255745
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13438	NC_008384	GCT	2	6	590655	590660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13484	NC_008384	TGC	2	6	592532	592537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255749
13485	NC_008384	TCG	2	6	592558	592563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255749
13486	NC_008384	GGC	2	6	592653	592658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255749
13487	NC_008384	GC	3	6	592669	592674	0 %	0 %	50 %	50 %	116255749
13488	NC_008384	GATA	2	8	592783	592790	50 %	25 %	25 %	0 %	116255750
13489	NC_008384	CGT	2	6	592810	592815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255750
13490	NC_008384	TCG	2	6	592837	592842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255750
13491	NC_008384	GGC	2	6	592884	592889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255750
13492	NC_008384	CG	3	6	592903	592908	0 %	0 %	50 %	50 %	116255750
13493	NC_008384	GCG	2	6	592913	592918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255750
13494	NC_008384	TCA	2	6	592954	592959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255750
13495	NC_008384	AGC	2	6	592963	592968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255750
13496	NC_008384	GTG	2	6	593067	593072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255750
13497	NC_008384	ATCGTC	2	12	593127	593138	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116255750
13498	NC_008384	CTG	2	6	593165	593170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255750
13499	NC_008384	TGG	2	6	593214	593219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255750
13500	NC_008384	CGT	2	6	593291	593296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255750

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