MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 15688

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_008384	GGC	2	6	551311	551316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255711
12502	NC_008384	AGGA	2	8	551332	551339	50 %	0 %	50 %	0 %	116255711
12503	NC_008384	CGC	2	6	551371	551376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255711
12504	NC_008384	CGA	2	6	551378	551383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255711
12505	NC_008384	GCCG	2	8	551400	551407	0 %	0 %	50 %	50 %	116255711
12506	NC_008384	CGG	3	9	551459	551467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255711
12507	NC_008384	CTT	2	6	551480	551485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255711
12508	NC_008384	GATC	2	8	551507	551514	25 %	25 %	25 %	25 %	116255711
12509	NC_008384	CG	3	6	551529	551534	0 %	0 %	50 %	50 %	116255711
12510	NC_008384	CGC	2	6	551570	551575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255711
12511	NC_008384	TCAAA	2	10	551686	551695	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12512	NC_008384	AGC	2	6	551739	551744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255712
12513	NC_008384	GAG	2	6	551900	551905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255712
12514	NC_008384	TTTCTG	2	12	551906	551917	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116255712
12515	NC_008384	GCC	2	6	551930	551935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255712
12516	NC_008384	GAC	2	6	552050	552055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255712
12517	NC_008384	GCC	2	6	552164	552169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255712
12518	NC_008384	GGC	2	6	552233	552238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255712
12519	NC_008384	GTC	2	6	552254	552259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255712
12520	NC_008384	ACG	2	6	552279	552284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255712
12521	NC_008384	TCG	2	6	552315	552320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255712
12522	NC_008384	TCG	2	6	552384	552389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255712
12523	NC_008384	GATG	2	8	552397	552404	25 %	25 %	50 %	0 %	116255712
12524	NC_008384	GAT	2	6	552449	552454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255712
12525	NC_008384	TCT	2	6	552463	552468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255712
12526	NC_008384	AAT	2	6	552511	552516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116255712
12527	NC_008384	GCA	2	6	552559	552564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255712
12528	NC_008384	CGA	2	6	552631	552636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255712
12529	NC_008384	GTA	2	6	552659	552664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255712
12530	NC_008384	CCG	2	6	552666	552671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255712
12531	NC_008384	GGGCT	2	10	552676	552685	0 %	20 %	60 %	20 %	116255712
12532	NC_008384	AGC	2	6	552693	552698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255712
12533	NC_008384	ACCG	2	8	552731	552738	25 %	0 %	25 %	50 %	116255712
12534	NC_008384	TCG	3	9	552780	552788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255712
12535	NC_008384	CAG	2	6	552836	552841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255712
12536	NC_008384	CTT	2	6	552842	552847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255712
12537	NC_008384	GGCG	2	8	552871	552878	0 %	0 %	75 %	25 %	116255712
12538	NC_008384	CGA	2	6	552919	552924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255712
12539	NC_008384	GCT	2	6	553022	553027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255712
12540	NC_008384	GATCGT	2	12	553034	553045	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116255712
12541	NC_008384	CGG	2	6	553087	553092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255712
12542	NC_008384	TGC	2	6	553172	553177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255712
12543	NC_008384	TGC	2	6	553187	553192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255712
12544	NC_008384	GCG	2	6	553219	553224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255712
12545	NC_008384	CCGG	2	8	553230	553237	0 %	0 %	50 %	50 %	116255712
12546	NC_008384	CGGC	2	8	553241	553248	0 %	0 %	50 %	50 %	116255712
12547	NC_008384	GAT	2	6	553280	553285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255712
12548	NC_008384	TGC	2	6	553393	553398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255712
12549	NC_008384	TCG	2	6	553423	553428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255712
12550	NC_008384	CCGT	2	8	553431	553438	0 %	25 %	25 %	50 %	116255712
12551	NC_008384	CCGG	2	8	553575	553582	0 %	0 %	50 %	50 %	116255712
12552	NC_008384	CAG	2	6	553681	553686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255712
12553	NC_008384	GAT	2	6	553892	553897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255713
12554	NC_008384	GCATAG	2	12	553899	553910	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116255713
12555	NC_008384	TCG	2	6	553980	553985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255713
12556	NC_008384	GAA	2	6	554000	554005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255713
12557	NC_008384	CGA	2	6	554038	554043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255713
12558	NC_008384	AGC	2	6	554068	554073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255713
12559	NC_008384	CGG	2	6	554075	554080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255713
12560	NC_008384	CTCG	2	8	554105	554112	0 %	25 %	25 %	50 %	116255713
12561	NC_008384	CCAG	2	8	554141	554148	25 %	0 %	25 %	50 %	116255713
12562	NC_008384	CGG	2	6	554165	554170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255713
12563	NC_008384	CCG	2	6	554177	554182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255713
12564	NC_008384	CG	3	6	554197	554202	0 %	0 %	50 %	50 %	116255713
12565	NC_008384	TTCG	2	8	554206	554213	0 %	50 %	25 %	25 %	116255713
12566	NC_008384	GACT	2	8	554217	554224	25 %	25 %	25 %	25 %	116255713
12567	NC_008384	GAGC	2	8	554350	554357	25 %	0 %	50 %	25 %	116255714
12568	NC_008384	CG	3	6	554384	554389	0 %	0 %	50 %	50 %	116255714
12569	NC_008384	CCG	2	6	554393	554398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255714
12570	NC_008384	CTG	2	6	554411	554416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255714
12571	NC_008384	AGC	2	6	554435	554440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255714
12572	NC_008384	CCA	2	6	554667	554672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255714
12573	NC_008384	GCC	2	6	554725	554730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255714
12574	NC_008384	CAG	2	6	554788	554793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255714
12575	NC_008384	GAT	2	6	554862	554867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255714
12576	NC_008384	CGA	2	6	554893	554898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255714
12577	NC_008384	TCGCC	2	10	554952	554961	0 %	20 %	20 %	60 %	116255714
12578	NC_008384	GCGG	2	8	554962	554969	0 %	0 %	75 %	25 %	116255714
12579	NC_008384	GCC	2	6	554998	555003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255714
12580	NC_008384	GC	3	6	555019	555024	0 %	0 %	50 %	50 %	116255714
12581	NC_008384	ATG	2	6	555026	555031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255714
12582	NC_008384	GTC	2	6	555041	555046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255714
12583	NC_008384	AC	3	6	555105	555110	50 %	0 %	0 %	50 %	116255714
12584	NC_008384	ACA	2	6	555176	555181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255714
12585	NC_008384	GCG	2	6	555278	555283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255715
12586	NC_008384	CGA	2	6	555314	555319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255715
12587	NC_008384	TGA	2	6	555383	555388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255715
12588	NC_008384	CGA	2	6	555422	555427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255715
12589	NC_008384	CGT	2	6	555468	555473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255715
12590	NC_008384	ATG	3	9	555484	555492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255715
12591	NC_008384	CGATG	2	10	555572	555581	20 %	20 %	40 %	20 %	116255715
12592	NC_008384	CGA	2	6	555593	555598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255715
12593	NC_008384	CGC	2	6	555614	555619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255715
12594	NC_008384	TGC	2	6	555806	555811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255715
12595	NC_008384	CGC	2	6	555812	555817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255715
12596	NC_008384	CGC	2	6	555908	555913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255715
12597	NC_008384	CCT	2	6	555932	555937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255715
12598	NC_008384	CGA	2	6	555962	555967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255715
12599	NC_008384	AGA	2	6	555997	556002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255715
12600	NC_008384	GCCGG	2	10	556071	556080	0 %	0 %	60 %	40 %	116255716
12601	NC_008384	TCG	2	6	556104	556109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255716
12602	NC_008384	AGGCCG	2	12	556131	556142	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116255716
12603	NC_008384	CCA	2	6	556178	556183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255716
12604	NC_008384	GAA	2	6	556203	556208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255716
12605	NC_008384	CGT	2	6	556277	556282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255716
12606	NC_008384	GAT	2	6	556301	556306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255716
12607	NC_008384	CGA	2	6	556312	556317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255716
12608	NC_008384	CGT	2	6	556334	556339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255716
12609	NC_008384	GAT	2	6	556364	556369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255716
12610	NC_008384	ATC	2	6	556389	556394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255716
12611	NC_008384	AGG	2	6	556468	556473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255716
12612	NC_008384	GAT	2	6	556481	556486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255716
12613	NC_008384	ATG	2	6	556491	556496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255716
12614	NC_008384	AGG	2	6	556522	556527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255716
12615	NC_008384	TCG	2	6	556573	556578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255716
12616	NC_008384	GCC	2	6	556604	556609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255716
12617	NC_008384	GAGC	2	8	556682	556689	25 %	0 %	50 %	25 %	116255716
12618	NC_008384	GTG	2	6	556737	556742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255716
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12979	NC_008384	AGC	2	6	572909	572914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255730
12980	NC_008384	TGA	2	6	572925	572930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255730
12981	NC_008384	GGC	2	6	572958	572963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255730
12982	NC_008384	GCC	2	6	572966	572971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255730
12983	NC_008384	GAA	2	6	572980	572985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255730
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