MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 15688

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008384	CGT	2	6	488407	488412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255653
11002	NC_008384	TCA	2	6	488413	488418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255653
11003	NC_008384	ACG	2	6	488440	488445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_008384	GCACT	2	10	488581	488590	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11005	NC_008384	TTC	2	6	488609	488614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_008384	GCC	2	6	488622	488627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11007	NC_008384	TTC	2	6	488636	488641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255654
11008	NC_008384	GGT	2	6	488662	488667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255654
11009	NC_008384	GCA	2	6	488781	488786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255654
11010	NC_008384	CG	3	6	488805	488810	0 %	0 %	50 %	50 %	116255654
11011	NC_008384	GAC	2	6	488914	488919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255654
11012	NC_008384	TC	3	6	488974	488979	0 %	50 %	0 %	50 %	116255654
11013	NC_008384	GGCC	2	8	488997	489004	0 %	0 %	50 %	50 %	116255654
11014	NC_008384	GGT	2	6	489061	489066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255654
11015	NC_008384	TCT	2	6	489132	489137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255654
11016	NC_008384	GGT	2	6	489142	489147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255654
11017	NC_008384	CGT	2	6	489204	489209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255654
11018	NC_008384	CCGTT	2	10	489235	489244	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11019	NC_008384	GTG	2	6	489293	489298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_008384	TG	3	6	489320	489325	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_008384	CCG	2	6	489344	489349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11022	NC_008384	GATC	2	8	489380	489387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11023	NC_008384	TCG	2	6	489488	489493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255655
11024	NC_008384	TCA	2	6	489533	489538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255655
11025	NC_008384	CGA	2	6	489545	489550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255655
11026	NC_008384	GCC	2	6	489558	489563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255655
11027	NC_008384	GTC	2	6	489579	489584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255655
11028	NC_008384	TCG	2	6	489596	489601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255655
11029	NC_008384	GCA	2	6	489612	489617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255655
11030	NC_008384	CGC	2	6	489662	489667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255655
11031	NC_008384	GTC	2	6	489775	489780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255655
11032	NC_008384	CG	3	6	489812	489817	0 %	0 %	50 %	50 %	116255655
11033	NC_008384	AGC	2	6	489887	489892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255655
11034	NC_008384	GCT	2	6	489912	489917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255655
11035	NC_008384	CAA	2	6	489924	489929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255655
11036	NC_008384	ATC	3	9	489940	489948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255655
11037	NC_008384	GGC	2	6	490090	490095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255655
11038	NC_008384	CCA	2	6	490101	490106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255655
11039	NC_008384	GTGCCG	2	12	490129	490140	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116255655
11040	NC_008384	GCC	2	6	490162	490167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255655
11041	NC_008384	ATC	2	6	490249	490254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255655
11042	NC_008384	GTCTTC	2	12	490276	490287	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	116255655
11043	NC_008384	CAA	2	6	490305	490310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255655
11044	NC_008384	GCA	2	6	490379	490384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255655
11045	NC_008384	GGC	2	6	490485	490490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255655
11046	NC_008384	GCC	2	6	490495	490500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255655
11047	NC_008384	AAG	2	6	490501	490506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255655
11048	NC_008384	GCC	2	6	490544	490549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255655
11049	NC_008384	GCC	2	6	490582	490587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255655
11050	NC_008384	GCTC	2	8	490727	490734	0 %	25 %	25 %	50 %	116255655
11051	NC_008384	TGG	2	6	490753	490758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255655
11052	NC_008384	GCC	2	6	490777	490782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255655
11053	NC_008384	GAA	2	6	490812	490817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255655
11054	NC_008384	AAG	2	6	490969	490974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255655
11055	NC_008384	CCG	2	6	490998	491003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11056	NC_008384	TCT	2	6	491017	491022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11057	NC_008384	T	6	6	491022	491027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_008384	GCA	2	6	491028	491033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11059	NC_008384	TCC	2	6	491071	491076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255656
11060	NC_008384	TCG	2	6	491095	491100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255656
11061	NC_008384	TCG	2	6	491110	491115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255656
11062	NC_008384	GCC	2	6	491160	491165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255656
11063	NC_008384	CGC	2	6	491188	491193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255656
11064	NC_008384	TAT	2	6	491256	491261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116255656
11065	NC_008384	CTT	2	6	491351	491356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255656
11066	NC_008384	TCGC	2	8	491370	491377	0 %	25 %	25 %	50 %	116255656
11067	NC_008384	CAT	2	6	491387	491392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255656
11068	NC_008384	GGC	2	6	491447	491452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255656
11069	NC_008384	ACG	2	6	491454	491459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255656
11070	NC_008384	GCC	2	6	491472	491477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255656
11071	NC_008384	CCTGAT	2	12	491501	491512	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116255656
11072	NC_008384	TTC	2	6	491517	491522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255656
11073	NC_008384	CTGC	2	8	491604	491611	0 %	25 %	25 %	50 %	116255656
11074	NC_008384	CG	3	6	491658	491663	0 %	0 %	50 %	50 %	116255656
11075	NC_008384	CGA	2	6	491684	491689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255656
11076	NC_008384	GC	4	8	491703	491710	0 %	0 %	50 %	50 %	116255656
11077	NC_008384	GAA	2	6	491753	491758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255656
11078	NC_008384	CGT	2	6	491819	491824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255656
11079	NC_008384	TCG	2	6	491863	491868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255656
11080	NC_008384	CGG	2	6	491872	491877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255656
11081	NC_008384	TGC	2	6	491878	491883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255656
11082	NC_008384	GCT	2	6	491912	491917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255656
11083	NC_008384	CGC	2	6	491924	491929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255656
11084	NC_008384	TCT	2	6	491969	491974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255656
11085	NC_008384	GATC	2	8	491975	491982	25 %	25 %	25 %	25 %	116255656
11086	NC_008384	AATCA	2	10	492013	492022	60 %	20 %	0 %	20 %	116255657
11087	NC_008384	GCA	2	6	492036	492041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255657
11088	NC_008384	CTG	2	6	492056	492061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255657
11089	NC_008384	CTG	2	6	492086	492091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255657
11090	NC_008384	TGT	2	6	492130	492135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255657
11091	NC_008384	GCC	2	6	492181	492186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255657
11092	NC_008384	TTC	2	6	492200	492205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255657
11093	NC_008384	GCCG	2	8	492251	492258	0 %	0 %	50 %	50 %	116255657
11094	NC_008384	GCT	2	6	492265	492270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255657
11095	NC_008384	CTT	2	6	492334	492339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255657
11096	NC_008384	GATT	2	8	492366	492373	25 %	50 %	25 %	0 %	116255657
11097	NC_008384	GAT	2	6	492379	492384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255657
11098	NC_008384	CTG	2	6	492401	492406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255657
11099	NC_008384	TGC	2	6	492421	492426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255657
11100	NC_008384	GAC	2	6	492442	492447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255657
11101	NC_008384	GGC	2	6	492541	492546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255657
11102	NC_008384	CAT	2	6	492574	492579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255657
11103	NC_008384	TGC	2	6	492591	492596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255657
11104	NC_008384	CTG	2	6	492602	492607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255657
11105	NC_008384	CCTT	2	8	492630	492637	0 %	50 %	0 %	50 %	116255657
11106	NC_008384	GAT	2	6	492718	492723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255657
11107	NC_008384	GCC	2	6	492725	492730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255657
11108	NC_008384	CAT	2	6	492784	492789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255657
11109	NC_008384	CCG	2	6	492870	492875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11110	NC_008384	CCG	3	9	492950	492958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255658
11111	NC_008384	GCC	2	6	492991	492996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255658
11112	NC_008384	CCG	6	18	493012	493029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255658
11113	NC_008384	CACG	2	8	493044	493051	25 %	0 %	25 %	50 %	116255658
11114	NC_008384	CG	3	6	493091	493096	0 %	0 %	50 %	50 %	116255658
11115	NC_008384	CATG	2	8	493110	493117	25 %	25 %	25 %	25 %	116255658
11116	NC_008384	GAG	2	6	493147	493152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255658
11117	NC_008384	CG	3	6	493164	493169	0 %	0 %	50 %	50 %	116255658
11118	NC_008384	TC	3	6	493218	493223	0 %	50 %	0 %	50 %	116255658
11119	NC_008384	GGT	2	6	493236	493241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255658
11120	NC_008384	GCT	2	6	493245	493250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255658
11121	NC_008384	ATC	2	6	493283	493288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255658
11122	NC_008384	TCA	2	6	493295	493300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255658
11123	NC_008384	GCT	2	6	493304	493309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255658
11124	NC_008384	GCCG	2	8	493335	493342	0 %	0 %	50 %	50 %	116255658
11125	NC_008384	TCG	2	6	493412	493417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255658
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11127	NC_008384	TCA	2	6	493540	493545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255659
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11129	NC_008384	TCG	2	6	493630	493635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255659
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11135	NC_008384	CTG	2	6	493767	493772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255659
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11157	NC_008384	GCA	2	6	494653	494658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255659
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11159	NC_008384	CCG	2	6	494698	494703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11238	NC_008384	GCA	2	6	497441	497446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255661
11239	NC_008384	CGA	2	6	497498	497503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255661
11240	NC_008384	GCA	2	6	497546	497551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255661
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11357	NC_008384	GCT	2	6	503632	503637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11358	NC_008384	GCT	2	6	503670	503675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11359	NC_008384	GACTG	2	10	503697	503706	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11360	NC_008384	CGC	2	6	503721	503726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11361	NC_008384	GCC	2	6	503737	503742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11362	NC_008384	CGC	2	6	503756	503761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11363	NC_008384	TCG	2	6	503805	503810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11364	NC_008384	ATT	2	6	503811	503816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11365	NC_008384	CG	3	6	503990	503995	0 %	0 %	50 %	50 %	116255670
11366	NC_008384	CTGGT	2	10	504009	504018	0 %	40 %	40 %	20 %	116255670
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11469	NC_008384	TCCC	2	8	508717	508724	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11470	NC_008384	GCA	2	6	508732	508737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11471	NC_008384	T	6	6	508740	508745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11472	NC_008384	CA	3	6	508795	508800	50 %	0 %	0 %	50 %	116255676
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11479	NC_008384	CTG	2	6	509330	509335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255676
11480	NC_008384	TCA	2	6	509342	509347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255676
11481	NC_008384	CGC	2	6	509349	509354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255676
11482	NC_008384	GGC	2	6	509457	509462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255676
11483	NC_008384	GCC	2	6	509466	509471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255676
11484	NC_008384	GCA	2	6	509593	509598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255676
11485	NC_008384	TCG	2	6	509651	509656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255676
11486	NC_008384	GGC	2	6	509694	509699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255676
11487	NC_008384	CGT	2	6	509705	509710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255676
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11490	NC_008384	CCG	2	6	509828	509833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255676
11491	NC_008384	CGC	2	6	509889	509894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255676
11492	NC_008384	CGG	2	6	509918	509923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255676
11493	NC_008384	GCG	2	6	510027	510032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255676
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11495	NC_008384	CTC	2	6	510087	510092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255676
11496	NC_008384	TCG	2	6	510161	510166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255676
11497	NC_008384	GCC	2	6	510220	510225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255676
11498	NC_008384	CTGC	2	8	510256	510263	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11499	NC_008384	GGC	2	6	510294	510299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11500	NC_008384	CTT	2	6	510393	510398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255677

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