MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 15688

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008384	CGA	2	6	448183	448188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255614
10002	NC_008384	CAG	2	6	448214	448219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255614
10003	NC_008384	GTC	2	6	448253	448258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255614
10004	NC_008384	GCT	2	6	448303	448308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255614
10005	NC_008384	TGGT	2	8	448335	448342	0 %	50 %	50 %	0 %	116255614
10006	NC_008384	GGT	2	6	448346	448351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255614
10007	NC_008384	GCC	2	6	448382	448387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255614
10008	NC_008384	GAC	2	6	448440	448445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255614
10009	NC_008384	CTT	2	6	448523	448528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255614
10010	NC_008384	TGA	2	6	448603	448608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255614
10011	NC_008384	CGG	2	6	448624	448629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255614
10012	NC_008384	TCG	4	12	448630	448641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255614
10013	NC_008384	CGC	2	6	448663	448668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255614
10014	NC_008384	GGC	2	6	448679	448684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255614
10015	NC_008384	TTG	2	6	448698	448703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255614
10016	NC_008384	GCA	2	6	448704	448709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255614
10017	NC_008384	GAA	2	6	448712	448717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255614
10018	NC_008384	GAC	2	6	448736	448741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255614
10019	NC_008384	GCTG	2	8	448766	448773	0 %	25 %	50 %	25 %	116255614
10020	NC_008384	CAT	2	6	448781	448786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255614
10021	NC_008384	TCC	2	6	448842	448847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255614
10022	NC_008384	TTGA	2	8	448851	448858	25 %	50 %	25 %	0 %	116255614
10023	NC_008384	CGAC	2	8	448888	448895	25 %	0 %	25 %	50 %	116255615
10024	NC_008384	TCC	2	6	448902	448907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255615
10025	NC_008384	ATC	2	6	448962	448967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255615
10026	NC_008384	TGA	2	6	448999	449004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255615
10027	NC_008384	AC	3	6	449011	449016	50 %	0 %	0 %	50 %	116255615
10028	NC_008384	GAC	2	6	449075	449080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255615
10029	NC_008384	TCG	2	6	449085	449090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255615
10030	NC_008384	GAT	2	6	449120	449125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255615
10031	NC_008384	ATG	2	6	449142	449147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255615
10032	NC_008384	GC	3	6	449167	449172	0 %	0 %	50 %	50 %	116255615
10033	NC_008384	GAA	2	6	449177	449182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255615
10034	NC_008384	GCG	2	6	449183	449188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255615
10035	NC_008384	CGC	2	6	449257	449262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255615
10036	NC_008384	TTC	2	6	449280	449285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255615
10037	NC_008384	TCA	2	6	449326	449331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255615
10038	NC_008384	GCC	2	6	449346	449351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255615
10039	NC_008384	GGT	2	6	449372	449377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255615
10040	NC_008384	GCC	2	6	449381	449386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255615
10041	NC_008384	TGA	3	9	449389	449397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255615
10042	NC_008384	GCG	2	6	449509	449514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255615
10043	NC_008384	GCC	2	6	449531	449536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255615
10044	NC_008384	CGG	2	6	449544	449549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255615
10045	NC_008384	TCG	2	6	449590	449595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255615
10046	NC_008384	ACG	2	6	449637	449642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255615
10047	NC_008384	ATG	2	6	449667	449672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255615
10048	NC_008384	GCGTTC	2	12	449678	449689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255615
10049	NC_008384	CTC	2	6	449700	449705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10050	NC_008384	TCAA	2	8	449740	449747	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10051	NC_008384	AAT	2	6	449780	449785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_008384	TGA	2	6	449821	449826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_008384	GAT	3	9	449866	449874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_008384	GGA	2	6	449883	449888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_008384	GGC	2	6	449895	449900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255616
10056	NC_008384	GAT	2	6	449929	449934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255616
10057	NC_008384	GCT	2	6	449967	449972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255616
10058	NC_008384	GGC	3	9	450019	450027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255616
10059	NC_008384	CGG	2	6	450066	450071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255616
10060	NC_008384	GCG	2	6	450104	450109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255616
10061	NC_008384	CGAGGA	2	12	450192	450203	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	116255616
10062	NC_008384	TCGA	2	8	450259	450266	25 %	25 %	25 %	25 %	116255616
10063	NC_008384	CGC	2	6	450269	450274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255616
10064	NC_008384	ATC	2	6	450325	450330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255616
10065	NC_008384	CGC	2	6	450336	450341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255616
10066	NC_008384	GAA	2	6	450345	450350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255616
10067	NC_008384	GCA	2	6	450366	450371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255616
10068	NC_008384	GGCT	2	8	450391	450398	0 %	25 %	50 %	25 %	116255616
10069	NC_008384	CGT	2	6	450474	450479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255616
10070	NC_008384	ATC	2	6	450547	450552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255616
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10072	NC_008384	CGC	2	6	450640	450645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255616
10073	NC_008384	CGC	2	6	450651	450656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255616
10074	NC_008384	CGA	2	6	450717	450722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255616
10075	NC_008384	GC	3	6	450773	450778	0 %	0 %	50 %	50 %	116255616
10076	NC_008384	CCGC	2	8	450819	450826	0 %	0 %	25 %	75 %	116255616
10077	NC_008384	TCG	2	6	450830	450835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255616
10078	NC_008384	TCG	2	6	450869	450874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255616
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10081	NC_008384	GCG	2	6	451079	451084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255616
10082	NC_008384	GCT	2	6	451146	451151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255616
10083	NC_008384	GCCGAA	2	12	451176	451187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255616
10084	NC_008384	GCCG	2	8	451195	451202	0 %	0 %	50 %	50 %	116255616
10085	NC_008384	CGG	2	6	451218	451223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255616
10086	NC_008384	CGG	2	6	451227	451232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255616
10087	NC_008384	TCG	2	6	451259	451264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255616
10088	NC_008384	GTG	2	6	451279	451284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255616
10089	NC_008384	GCA	2	6	451303	451308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255616
10090	NC_008384	AAG	2	6	451336	451341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255616
10091	NC_008384	CCT	2	6	451403	451408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255616
10092	NC_008384	CGG	2	6	451431	451436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255616
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10094	NC_008384	CCG	2	6	451575	451580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255616
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10098	NC_008384	GCG	2	6	451778	451783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255616
10099	NC_008384	AGC	2	6	451793	451798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255616
10100	NC_008384	GC	3	6	451797	451802	0 %	0 %	50 %	50 %	116255616
10101	NC_008384	CAT	2	6	451944	451949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255616
10102	NC_008384	GGA	2	6	452000	452005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_008384	GAT	2	6	452022	452027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_008384	AT	3	6	452057	452062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_008384	GAT	2	6	452118	452123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_008384	AAG	2	6	452127	452132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_008384	GGA	2	6	452218	452223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_008384	TTC	2	6	452375	452380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255617
10109	NC_008384	CCT	2	6	452391	452396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255617
10110	NC_008384	CGG	2	6	452410	452415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255617
10111	NC_008384	CG	3	6	452451	452456	0 %	0 %	50 %	50 %	116255617
10112	NC_008384	CGA	2	6	452473	452478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255617
10113	NC_008384	TCA	2	6	452487	452492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255617
10114	NC_008384	CTCGGC	2	12	452582	452593	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116255617
10115	NC_008384	CGATG	2	10	452596	452605	20 %	20 %	40 %	20 %	116255617
10116	NC_008384	GCTC	2	8	452658	452665	0 %	25 %	25 %	50 %	116255617
10117	NC_008384	GCG	2	6	452678	452683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255617
10118	NC_008384	CGA	2	6	452860	452865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255617
10119	NC_008384	TCG	2	6	452982	452987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255617
10120	NC_008384	CCA	2	6	452995	453000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255617
10121	NC_008384	GAT	2	6	453022	453027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255617
10122	NC_008384	CGAT	2	8	453114	453121	25 %	25 %	25 %	25 %	116255617
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10130	NC_008384	CGC	2	6	453404	453409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255617
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10228	NC_008384	CG	5	10	457242	457251	0 %	0 %	50 %	50 %	116255621
10229	NC_008384	GC	4	8	457252	457259	0 %	0 %	50 %	50 %	116255621
10230	NC_008384	CTG	3	9	457305	457313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255621
10231	NC_008384	AAT	2	6	457453	457458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10232	NC_008384	GCG	2	6	457476	457481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10233	NC_008384	CCG	2	6	457528	457533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10234	NC_008384	AAC	2	6	457544	457549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10235	NC_008384	AGG	2	6	457583	457588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10236	NC_008384	TCCCA	2	10	457619	457628	20 %	20 %	0 %	60 %	116255622
10237	NC_008384	AGC	2	6	457631	457636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255622
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10239	NC_008384	CGG	2	6	457737	457742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255622
10240	NC_008384	AGGG	2	8	457783	457790	25 %	0 %	75 %	0 %	116255622
10241	NC_008384	CGA	2	6	457815	457820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255622
10242	NC_008384	GCAG	2	8	457913	457920	25 %	0 %	50 %	25 %	116255622
10243	NC_008384	TCG	2	6	457922	457927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255622
10244	NC_008384	CGG	2	6	457931	457936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255622
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10259	NC_008384	CCG	2	6	458487	458492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10260	NC_008384	CGT	2	6	458512	458517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10261	NC_008384	GCC	2	6	458567	458572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10263	NC_008384	GGC	2	6	458629	458634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10264	NC_008384	TTC	2	6	458635	458640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255623
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10267	NC_008384	TCC	2	6	458860	458865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255623
10268	NC_008384	GTG	2	6	458932	458937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10269	NC_008384	GTAA	2	8	458944	458951	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10270	NC_008384	A	7	7	459002	459008	100 %	0 %	0 %	0 %	116255624
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10305	NC_008384	A	6	6	460873	460878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10306	NC_008384	AG	3	6	460941	460946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10308	NC_008384	GTCG	2	8	460995	461002	0 %	25 %	50 %	25 %	116255628
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10342	NC_008384	CGA	2	6	462149	462154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255628
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10345	NC_008384	CTG	2	6	462253	462258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255628
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10347	NC_008384	CGA	2	6	462279	462284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255628
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10351	NC_008384	CCG	2	6	462356	462361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10352	NC_008384	GAG	2	6	462386	462391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10353	NC_008384	GGA	2	6	462395	462400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10354	NC_008384	TCG	2	6	462440	462445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255629
10355	NC_008384	GCT	2	6	462460	462465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255629
10356	NC_008384	TCCCGA	2	12	462487	462498	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116255629
10357	NC_008384	CGG	2	6	462558	462563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255629
10358	NC_008384	GC	3	6	462572	462577	0 %	0 %	50 %	50 %	116255629
10359	NC_008384	TTCC	2	8	462601	462608	0 %	50 %	0 %	50 %	116255629
10360	NC_008384	TA	3	6	462632	462637	50 %	50 %	0 %	0 %	116255629
10361	NC_008384	GTG	2	6	462648	462653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255629
10362	NC_008384	GGC	2	6	462658	462663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255629
10363	NC_008384	GCT	2	6	462685	462690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255629
10364	NC_008384	ATGG	2	8	462742	462749	25 %	25 %	50 %	0 %	116255629
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10372	NC_008384	CTG	2	6	462920	462925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255629
10373	NC_008384	GCT	2	6	462949	462954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255629
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10378	NC_008384	CTG	2	6	463205	463210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255629
10379	NC_008384	GC	3	6	463250	463255	0 %	0 %	50 %	50 %	116255629
10380	NC_008384	GC	3	6	463308	463313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10381	NC_008384	GAC	2	6	463322	463327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10383	NC_008384	AGA	2	6	463351	463356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10384	NC_008384	ATC	2	6	463388	463393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10449	NC_008384	GAG	2	6	466365	466370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10450	NC_008384	GGC	2	6	466428	466433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255633
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10466	NC_008384	GC	3	6	467233	467238	0 %	0 %	50 %	50 %	116255634
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10470	NC_008384	GATG	2	8	467486	467493	25 %	25 %	50 %	0 %	116255634
10471	NC_008384	TCG	2	6	467506	467511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255634
10472	NC_008384	CG	3	6	467543	467548	0 %	0 %	50 %	50 %	116255634
10473	NC_008384	CGA	2	6	467555	467560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255634
10474	NC_008384	GCG	2	6	467617	467622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255634
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10476	NC_008384	CTTGG	2	10	467662	467671	0 %	40 %	40 %	20 %	116255634
10477	NC_008384	GATCC	2	10	467682	467691	20 %	20 %	20 %	40 %	116255634
10478	NC_008384	CTT	2	6	467711	467716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255634
10479	NC_008384	GGC	2	6	467729	467734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255634
10480	NC_008384	TCA	2	6	467738	467743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255634
10481	NC_008384	GCT	2	6	467783	467788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255634
10482	NC_008384	GCA	2	6	467846	467851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255634
10483	NC_008384	GAC	2	6	467899	467904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10484	NC_008384	ATC	2	6	467927	467932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255635
10485	NC_008384	GAT	2	6	467959	467964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255635
10486	NC_008384	CGG	3	9	467987	467995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255635
10487	NC_008384	TCC	2	6	467999	468004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255635
10488	NC_008384	GTC	2	6	468034	468039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255635
10489	NC_008384	AGC	3	9	468071	468079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255635
10490	NC_008384	CGA	2	6	468132	468137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255635
10491	NC_008384	TCG	2	6	468296	468301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255635
10492	NC_008384	CGA	2	6	468303	468308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255635
10493	NC_008384	GCGA	2	8	468334	468341	25 %	0 %	50 %	25 %	116255635
10494	NC_008384	GCC	2	6	468361	468366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255635
10495	NC_008384	CGA	2	6	468393	468398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255635
10496	NC_008384	GCA	2	6	468423	468428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255635
10497	NC_008384	GCC	2	6	468489	468494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255635
10498	NC_008384	GAT	2	6	468498	468503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255635
10499	NC_008384	ATC	2	6	468551	468556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255635
10500	NC_008384	GCG	2	6	468565	468570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255635

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