MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 15688

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008384	GGCAG	2	10	270300	270309	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6002	NC_008384	CTG	2	6	270385	270390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_008384	TGG	2	6	270395	270400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_008384	TCG	2	6	270488	270493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_008384	TCG	3	9	270509	270517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_008384	ATG	3	9	270533	270541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_008384	GCG	2	6	270566	270571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_008384	CGG	2	6	270756	270761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_008384	CGGT	2	8	270812	270819	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6010	NC_008384	GCC	2	6	270873	270878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_008384	CAA	2	6	270923	270928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_008384	GGGAGG	2	12	271027	271038	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_008384	CAC	2	6	271062	271067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_008384	TCG	2	6	271157	271162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_008384	GCA	2	6	271217	271222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_008384	CAG	2	6	271266	271271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_008384	GGC	2	6	271316	271321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255450
6018	NC_008384	GGC	2	6	271334	271339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255450
6019	NC_008384	GT	3	6	271348	271353	0 %	50 %	50 %	0 %	116255450
6020	NC_008384	TCG	2	6	271413	271418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255450
6021	NC_008384	GTA	2	6	271481	271486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255450
6022	NC_008384	CCG	2	6	271536	271541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255450
6023	NC_008384	GAT	2	6	271757	271762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255451
6024	NC_008384	GTC	2	6	271897	271902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255451
6025	NC_008384	GCG	2	6	271916	271921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255451
6026	NC_008384	TCG	2	6	272021	272026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255451
6027	NC_008384	CTT	2	6	272035	272040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255451
6028	NC_008384	CCT	2	6	272042	272047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255451
6029	NC_008384	CCT	2	6	272210	272215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6030	NC_008384	CCG	2	6	272305	272310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255452
6031	NC_008384	GC	3	6	272342	272347	0 %	0 %	50 %	50 %	116255452
6032	NC_008384	CGA	2	6	272371	272376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255452
6033	NC_008384	CCT	2	6	272386	272391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255452
6034	NC_008384	GTC	2	6	272429	272434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255452
6035	NC_008384	CTG	2	6	272477	272482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255452
6036	NC_008384	CAT	2	6	272605	272610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255452
6037	NC_008384	TTG	2	6	272637	272642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255452
6038	NC_008384	GCT	2	6	272653	272658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255452
6039	NC_008384	AGA	2	6	272703	272708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255452
6040	NC_008384	CCG	2	6	272720	272725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255452
6041	NC_008384	GAG	2	6	272726	272731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255452
6042	NC_008384	CGAT	2	8	272733	272740	25 %	25 %	25 %	25 %	116255452
6043	NC_008384	GAA	2	6	272804	272809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255452
6044	NC_008384	GAA	2	6	273023	273028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255452
6045	NC_008384	GAAA	2	8	273102	273109	75 %	0 %	25 %	0 %	116255452
6046	NC_008384	G	6	6	273165	273170	0 %	0 %	100 %	0 %	116255452
6047	NC_008384	CCAG	2	8	273264	273271	25 %	0 %	25 %	50 %	116255452
6048	NC_008384	TGA	2	6	273325	273330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255452
6049	NC_008384	CGG	2	6	273332	273337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255452
6050	NC_008384	AGG	2	6	273369	273374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255452
6051	NC_008384	ACC	2	6	273381	273386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255452
6052	NC_008384	TA	3	6	273474	273479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_008384	ATG	2	6	273494	273499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255453
6054	NC_008384	CAA	2	6	273509	273514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255453
6055	NC_008384	GTA	2	6	273530	273535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255453
6056	NC_008384	CTC	2	6	273573	273578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255453
6057	NC_008384	TTC	2	6	273591	273596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255453
6058	NC_008384	GAC	2	6	273612	273617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255453
6059	NC_008384	AGG	2	6	273618	273623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255453
6060	NC_008384	AAG	2	6	273626	273631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255453
6061	NC_008384	CTTC	2	8	273646	273653	0 %	50 %	0 %	50 %	116255453
6062	NC_008384	TGGA	2	8	273765	273772	25 %	25 %	50 %	0 %	116255453
6063	NC_008384	GCC	2	6	273805	273810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255453
6064	NC_008384	TCG	2	6	273924	273929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255453
6065	NC_008384	CGG	2	6	273942	273947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255453
6066	NC_008384	ACC	2	6	273949	273954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255453
6067	NC_008384	CCG	2	6	274081	274086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255453
6068	NC_008384	ACG	2	6	274239	274244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255453
6069	NC_008384	GAG	2	6	274283	274288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255454
6070	NC_008384	CAC	2	6	274302	274307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255454
6071	NC_008384	CCA	2	6	274340	274345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255454
6072	NC_008384	CG	3	6	274365	274370	0 %	0 %	50 %	50 %	116255454
6073	NC_008384	GCG	2	6	274391	274396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255454
6074	NC_008384	GTCGCC	2	12	274457	274468	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116255454
6075	NC_008384	TCC	2	6	274519	274524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255454
6076	NC_008384	CG	3	6	274525	274530	0 %	0 %	50 %	50 %	116255454
6077	NC_008384	GAT	2	6	274536	274541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255454
6078	NC_008384	CAG	2	6	274566	274571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255454
6079	NC_008384	AGC	2	6	274721	274726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255454
6080	NC_008384	CCG	2	6	274727	274732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255454
6081	NC_008384	TC	3	6	274751	274756	0 %	50 %	0 %	50 %	116255454
6082	NC_008384	AGAAC	2	10	274771	274780	60 %	0 %	20 %	20 %	116255454
6083	NC_008384	GAA	2	6	274803	274808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255454
6084	NC_008384	CGC	2	6	274824	274829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255454
6085	NC_008384	CG	3	6	274834	274839	0 %	0 %	50 %	50 %	116255454
6086	NC_008384	C	6	6	274877	274882	0 %	0 %	0 %	100 %	116255454
6087	NC_008384	GCC	2	6	274897	274902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255454
6088	NC_008384	CAGC	2	8	274923	274930	25 %	0 %	25 %	50 %	116255454
6089	NC_008384	G	6	6	274937	274942	0 %	0 %	100 %	0 %	116255454
6090	NC_008384	TCG	2	6	275035	275040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255454
6091	NC_008384	ACC	2	6	275138	275143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255454
6092	NC_008384	GGC	2	6	275172	275177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255454
6093	NC_008384	GTGA	2	8	275184	275191	25 %	25 %	50 %	0 %	116255454
6094	NC_008384	CGG	2	6	275352	275357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255454
6095	NC_008384	GTT	2	6	275387	275392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255454
6096	NC_008384	TCT	2	6	275517	275522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255455
6097	NC_008384	GCCA	2	8	275584	275591	25 %	0 %	25 %	50 %	116255455
6098	NC_008384	CAG	2	6	275651	275656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255455
6099	NC_008384	GCA	2	6	275672	275677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255455
6100	NC_008384	GCAT	2	8	275683	275690	25 %	25 %	25 %	25 %	116255455
6101	NC_008384	TCG	2	6	275713	275718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255455
6102	NC_008384	TGC	2	6	275728	275733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255455
6103	NC_008384	AGC	2	6	275737	275742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255455
6104	NC_008384	ACG	2	6	275780	275785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255455
6105	NC_008384	TCA	2	6	275786	275791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255455
6106	NC_008384	TGC	2	6	275832	275837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255455
6107	NC_008384	CGA	2	6	275911	275916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255455
6108	NC_008384	TAA	2	6	275929	275934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116255455
6109	NC_008384	TGC	2	6	275948	275953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255455
6110	NC_008384	CAT	2	6	276017	276022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255455
6111	NC_008384	CAG	3	9	276024	276032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255455
6112	NC_008384	CAT	2	6	276071	276076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255455
6113	NC_008384	GAA	2	6	276084	276089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255455
6114	NC_008384	TGG	2	6	276182	276187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255455
6115	NC_008384	GTCTC	2	10	276212	276221	0 %	40 %	20 %	40 %	116255455
6116	NC_008384	CG	4	8	276259	276266	0 %	0 %	50 %	50 %	116255455
6117	NC_008384	ACC	2	6	276299	276304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255455
6118	NC_008384	CGA	2	6	276342	276347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255455
6119	NC_008384	TTC	2	6	276352	276357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255455
6120	NC_008384	CGC	2	6	276385	276390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255455
6121	NC_008384	GC	4	8	276389	276396	0 %	0 %	50 %	50 %	116255455
6122	NC_008384	ACG	2	6	276427	276432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255455
6123	NC_008384	GAA	2	6	276551	276556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255455
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6126	NC_008384	GCT	2	6	276720	276725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255455
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6150	NC_008384	CT	3	6	277782	277787	0 %	50 %	0 %	50 %	116255455
6151	NC_008384	CATT	2	8	277813	277820	25 %	50 %	0 %	25 %	116255455
6152	NC_008384	GAC	2	6	277825	277830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255455
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6154	NC_008384	TTCGG	2	10	277975	277984	0 %	40 %	40 %	20 %	116255455
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6164	NC_008384	GCG	2	6	278480	278485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6165	NC_008384	GTT	2	6	278504	278509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6248	NC_008384	AGA	2	6	282368	282373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255460
6249	NC_008384	TGC	2	6	282401	282406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6371	NC_008384	CAA	3	9	288119	288127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255464
6372	NC_008384	CGG	2	6	288130	288135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255464
6373	NC_008384	CGA	2	6	288166	288171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255464
6374	NC_008384	CGG	2	6	288185	288190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255464
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6379	NC_008384	CAG	2	6	288556	288561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255464
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6402	NC_008384	CGG	2	6	289485	289490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255465
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6473	NC_008384	CCG	2	6	293198	293203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6474	NC_008384	AGCA	2	8	293250	293257	50 %	0 %	25 %	25 %	116255470
6475	NC_008384	CAATC	2	10	293259	293268	40 %	20 %	0 %	40 %	116255470
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6485	NC_008384	GAC	2	6	293673	293678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255470
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6487	NC_008384	GGA	2	6	293760	293765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255470
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6489	NC_008384	ATGCC	2	10	293805	293814	20 %	20 %	20 %	40 %	116255470
6490	NC_008384	GCC	2	6	293835	293840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255470
6491	NC_008384	GAG	2	6	293946	293951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255470
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6493	NC_008384	TCT	2	6	294082	294087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255470
6494	NC_008384	CGG	2	6	294088	294093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255470
6495	NC_008384	GC	3	6	294107	294112	0 %	0 %	50 %	50 %	116255470
6496	NC_008384	GAG	3	9	294150	294158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255470
6497	NC_008384	GCG	2	6	294159	294164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255470
6498	NC_008384	AGC	2	6	294245	294250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255471
6499	NC_008384	TCT	2	6	294288	294293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255471
6500	NC_008384	CCG	2	6	294341	294346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255471

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