MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL7

Total Repeats: 3066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008382	GGA	2	6	148810	148815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255064
3002	NC_008382	GAA	2	6	148832	148837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255064
3003	NC_008382	CTGGT	2	10	148856	148865	0 %	40 %	40 %	20 %	116255064
3004	NC_008382	TCT	2	6	148960	148965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255064
3005	NC_008382	GTC	2	6	148979	148984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255064
3006	NC_008382	ATG	2	6	149040	149045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255064
3007	NC_008382	GCCG	2	8	149054	149061	0 %	0 %	50 %	50 %	116255064
3008	NC_008382	AG	3	6	149172	149177	50 %	0 %	50 %	0 %	116255064
3009	NC_008382	TAA	2	6	149178	149183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116255064
3010	NC_008382	GTC	2	6	149288	149293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255064
3011	NC_008382	TTG	2	6	149313	149318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255064
3012	NC_008382	GT	3	6	149323	149328	0 %	50 %	50 %	0 %	116255064
3013	NC_008382	CGA	2	6	149362	149367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255064
3014	NC_008382	TCG	2	6	149445	149450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255064
3015	NC_008382	GCC	2	6	149466	149471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255064
3016	NC_008382	TCG	2	6	149537	149542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_008382	AGC	2	6	149552	149557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_008382	ACA	2	6	149622	149627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255065
3019	NC_008382	CTGT	2	8	149717	149724	0 %	50 %	25 %	25 %	116255065
3020	NC_008382	AGAA	2	8	149875	149882	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_008382	GCA	2	6	149885	149890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_008382	GCG	2	6	149972	149977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_008382	GAA	2	6	149982	149987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_008382	GCC	2	6	150000	150005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_008382	TGC	2	6	150007	150012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_008382	CGA	2	6	150026	150031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_008382	GCT	2	6	150041	150046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_008382	ACA	2	6	150100	150105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_008382	GGC	2	6	150156	150161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_008382	GCT	3	9	150198	150206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_008382	TCG	2	6	150212	150217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_008382	CCA	2	6	150219	150224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3033	NC_008382	GCC	2	6	150247	150252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_008382	GCCG	2	8	150270	150277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3035	NC_008382	CGA	2	6	150282	150287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_008382	CGG	2	6	150349	150354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_008382	GCT	2	6	150510	150515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_008382	CGG	2	6	150585	150590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_008382	CCG	2	6	150591	150596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_008382	GCG	2	6	150618	150623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_008382	AGC	2	6	150626	150631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_008382	GCC	2	6	150642	150647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_008382	GAG	2	6	150652	150657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_008382	TCC	2	6	150666	150671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3045	NC_008382	CCT	2	6	150672	150677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3046	NC_008382	GAG	2	6	150722	150727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_008382	ACG	2	6	150729	150734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_008382	CCGG	3	12	150747	150758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3049	NC_008382	CGAT	2	8	150852	150859	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3050	NC_008382	ATC	2	6	150878	150883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_008382	AGC	2	6	150885	150890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_008382	GGC	2	6	150961	150966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_008382	CTC	2	6	150983	150988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3054	NC_008382	ACT	2	6	151035	151040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_008382	ACA	2	6	151041	151046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_008382	CGC	2	6	151069	151074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3057	NC_008382	TTCTG	2	10	151095	151104	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3058	NC_008382	GT	3	6	151143	151148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_008382	CCCT	2	8	151203	151210	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3060	NC_008382	TGAG	2	8	151261	151268	25 %	25 %	50 %	0 %	116255066
3061	NC_008382	CGC	2	6	151278	151283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255066
3062	NC_008382	TAC	2	6	151361	151366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255066
3063	NC_008382	GGA	2	6	151412	151417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_008382	TC	3	6	151427	151432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_008382	CAGT	2	8	151501	151508	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3066	NC_008382	A	6	6	151529	151534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.