MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 118531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008380	GAA	2	6	134149	134154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249871
3002	NC_008380	ATT	2	6	134184	134189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116249871
3003	NC_008380	TCG	2	6	134306	134311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249871
3004	NC_008380	GAA	2	6	134323	134328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249871
3005	NC_008380	GAT	2	6	134337	134342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249871
3006	NC_008380	GGA	2	6	134382	134387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249871
3007	NC_008380	GGC	2	6	134400	134405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249871
3008	NC_008380	TCA	2	6	134438	134443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249871
3009	NC_008380	AGC	2	6	134468	134473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249871
3010	NC_008380	GGC	2	6	134637	134642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249871
3011	NC_008380	CGAA	2	8	134705	134712	50 %	0 %	25 %	25 %	116249871
3012	NC_008380	AGGC	2	8	134714	134721	25 %	0 %	50 %	25 %	116249871
3013	NC_008380	CAC	2	6	134728	134733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249871
3014	NC_008380	CAGCAC	2	12	134734	134745	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	116249871
3015	NC_008380	AGC	2	6	134783	134788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249871
3016	NC_008380	CGG	2	6	134799	134804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249871
3017	NC_008380	GCA	2	6	134839	134844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249871
3018	NC_008380	CG	3	6	134847	134852	0 %	0 %	50 %	50 %	116249871
3019	NC_008380	GAT	2	6	134865	134870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249871
3020	NC_008380	TCA	2	6	134889	134894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249871
3021	NC_008380	GCC	2	6	134908	134913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249871
3022	NC_008380	TCCG	2	8	134989	134996	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3023	NC_008380	T	7	7	135055	135061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_008380	GAA	2	6	135075	135080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_008380	CCG	2	6	135082	135087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_008380	CGG	2	6	135096	135101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_008380	TTC	2	6	135103	135108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_008380	CGC	3	9	135136	135144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249872
3029	NC_008380	CGAAC	2	10	135197	135206	40 %	0 %	20 %	40 %	116249872
3030	NC_008380	CTTC	2	8	135217	135224	0 %	50 %	0 %	50 %	116249872
3031	NC_008380	CTT	2	6	135272	135277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249872
3032	NC_008380	CCGA	2	8	135312	135319	25 %	0 %	25 %	50 %	116249872
3033	NC_008380	GCT	2	6	135334	135339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249872
3034	NC_008380	GTCGCG	2	12	135341	135352	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116249872
3035	NC_008380	GAAG	2	8	135374	135381	50 %	0 %	50 %	0 %	116249872
3036	NC_008380	CCG	2	6	135417	135422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249872
3037	NC_008380	AGC	2	6	135479	135484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249872
3038	NC_008380	GCT	2	6	135511	135516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249872
3039	NC_008380	CGAG	2	8	135523	135530	25 %	0 %	50 %	25 %	116249872
3040	NC_008380	ACG	2	6	135561	135566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249872
3041	NC_008380	GAC	2	6	135572	135577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249872
3042	NC_008380	TTG	2	6	135585	135590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249872
3043	NC_008380	CTC	2	6	135593	135598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249872
3044	NC_008380	GCCG	2	8	135725	135732	0 %	0 %	50 %	50 %	116249872
3045	NC_008380	TGC	2	6	135749	135754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249872
3046	NC_008380	ACG	2	6	135822	135827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249872
3047	NC_008380	TTC	2	6	135873	135878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249872
3048	NC_008380	CGA	2	6	135934	135939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249872
3049	NC_008380	TCT	2	6	135979	135984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249872
3050	NC_008380	GCT	2	6	136033	136038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249872
3051	NC_008380	CGAG	2	8	136045	136052	25 %	0 %	50 %	25 %	116249872
3052	NC_008380	GAT	2	6	136079	136084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249872
3053	NC_008380	CTG	2	6	136097	136102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249872
3054	NC_008380	GCCAT	2	10	136141	136150	20 %	20 %	20 %	40 %	116249872
3055	NC_008380	GCA	2	6	136162	136167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249872
3056	NC_008380	GCC	2	6	136178	136183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249872
3057	NC_008380	AACG	2	8	136190	136197	50 %	0 %	25 %	25 %	116249872
3058	NC_008380	GAC	2	6	136220	136225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249872
3059	NC_008380	CTT	2	6	136243	136248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249872
3060	NC_008380	GCT	2	6	136273	136278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249872
3061	NC_008380	TTC	2	6	136289	136294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249872
3062	NC_008380	GCC	2	6	136460	136465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249872
3063	NC_008380	TTC	2	6	136538	136543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249872
3064	NC_008380	GCG	2	6	136544	136549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249872
3065	NC_008380	CG	3	6	136558	136563	0 %	0 %	50 %	50 %	116249872
3066	NC_008380	ACTTCG	2	12	136608	136619	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116249872
3067	NC_008380	GC	5	10	136647	136656	0 %	0 %	50 %	50 %	116249872
3068	NC_008380	GGTT	2	8	136880	136887	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_008380	CT	3	6	136918	136923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_008380	GAT	2	6	137038	137043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249873
3071	NC_008380	AGC	2	6	137050	137055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249873
3072	NC_008380	CAAG	2	8	137091	137098	50 %	0 %	25 %	25 %	116249873
3073	NC_008380	CAT	2	6	137103	137108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249873
3074	NC_008380	TCG	2	6	137150	137155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249873
3075	NC_008380	CGC	2	6	137156	137161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249873
3076	NC_008380	CCG	2	6	137190	137195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249873
3077	NC_008380	CCG	2	6	137271	137276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249873
3078	NC_008380	GAC	2	6	137287	137292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249873
3079	NC_008380	TCG	2	6	137334	137339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249873
3080	NC_008380	CCA	2	6	137358	137363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249873
3081	NC_008380	CCG	2	6	137376	137381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249873
3082	NC_008380	GGC	2	6	137401	137406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249873
3083	NC_008380	ATCCA	2	10	137440	137449	40 %	20 %	0 %	40 %	116249873
3084	NC_008380	CT	3	6	137461	137466	0 %	50 %	0 %	50 %	116249873
3085	NC_008380	TCG	3	9	137489	137497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249873
3086	NC_008380	AGC	2	6	137516	137521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249873
3087	NC_008380	GAT	2	6	137559	137564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249873
3088	NC_008380	GCG	2	6	137587	137592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249873
3089	NC_008380	GCCG	2	8	137608	137615	0 %	0 %	50 %	50 %	116249873
3090	NC_008380	CCG	3	9	137613	137621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249873
3091	NC_008380	CGATGG	2	12	137628	137639	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116249873
3092	NC_008380	GCA	2	6	137674	137679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_008380	CAT	2	6	137729	137734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249874
3094	NC_008380	CCA	2	6	137739	137744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249874
3095	NC_008380	TCA	2	6	137769	137774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249874
3096	NC_008380	ATC	2	6	137804	137809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249874
3097	NC_008380	CGT	2	6	137814	137819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249874
3098	NC_008380	GCGAT	2	10	137870	137879	20 %	20 %	40 %	20 %	116249874
3099	NC_008380	GGCC	2	8	137936	137943	0 %	0 %	50 %	50 %	116249874
3100	NC_008380	TCG	2	6	137969	137974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249874
3101	NC_008380	CGG	2	6	138009	138014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249874
3102	NC_008380	TCC	2	6	138044	138049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249874
3103	NC_008380	GGC	2	6	138085	138090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249874
3104	NC_008380	AGGAT	2	10	138098	138107	40 %	20 %	40 %	0 %	116249874
3105	NC_008380	TCG	2	6	138110	138115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249874
3106	NC_008380	ATC	2	6	138116	138121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249874
3107	NC_008380	GC	3	6	138126	138131	0 %	0 %	50 %	50 %	116249874
3108	NC_008380	CGC	2	6	138195	138200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249874
3109	NC_008380	CAC	2	6	138217	138222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249874
3110	NC_008380	CGGGT	2	10	138269	138278	0 %	20 %	60 %	20 %	116249874
3111	NC_008380	TCA	2	6	138279	138284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249874
3112	NC_008380	GGA	2	6	138349	138354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249874
3113	NC_008380	CGTC	2	8	138432	138439	0 %	25 %	25 %	50 %	116249874
3114	NC_008380	GCG	2	6	138452	138457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249874
3115	NC_008380	GCA	2	6	138468	138473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249874
3116	NC_008380	CG	3	6	138489	138494	0 %	0 %	50 %	50 %	116249874
3117	NC_008380	TCA	2	6	138495	138500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249874
3118	NC_008380	GTG	2	6	138515	138520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249874
3119	NC_008380	CGA	2	6	138759	138764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249874
3120	NC_008380	GCG	2	6	138810	138815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249874
3121	NC_008380	AGC	2	6	138827	138832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249874
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3123	NC_008380	CTT	2	6	138870	138875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249874
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3245	NC_008380	GGC	2	6	144667	144672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249882
3246	NC_008380	AAGAC	2	10	144696	144705	60 %	0 %	20 %	20 %	116249882
3247	NC_008380	ACA	2	6	144739	144744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3248	NC_008380	GTGTC	2	10	144786	144795	0 %	40 %	40 %	20 %	116249883
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3263	NC_008380	CGG	2	6	145462	145467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249883
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3351	NC_008380	AAG	2	6	149954	149959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249886
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3356	NC_008380	TG	4	8	150106	150113	0 %	50 %	50 %	0 %	116249886
3357	NC_008380	GCGCA	2	10	150169	150178	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3358	NC_008380	CAAT	2	8	150189	150196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3359	NC_008380	GGTT	2	8	150332	150339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3360	NC_008380	CGT	2	6	150419	150424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3362	NC_008380	CCG	2	6	150459	150464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3363	NC_008380	GCG	2	6	150475	150480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249887
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3367	NC_008380	CAG	2	6	150571	150576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249887
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3486	NC_008380	CGA	2	6	155467	155472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249891
3487	NC_008380	GCG	2	6	155481	155486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249891
3488	NC_008380	GTGC	2	8	155501	155508	0 %	25 %	50 %	25 %	116249891
3489	NC_008380	CTGCGG	2	12	155526	155537	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116249891
3490	NC_008380	CTT	2	6	155598	155603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249891
3491	NC_008380	CGG	2	6	155634	155639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249891
3492	NC_008380	CGGCG	2	10	155658	155667	0 %	0 %	60 %	40 %	116249891
3493	NC_008380	GC	3	6	155706	155711	0 %	0 %	50 %	50 %	116249891
3494	NC_008380	GGC	2	6	155712	155717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249891
3495	NC_008380	CAC	2	6	155752	155757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249891
3496	NC_008380	CGGGCG	2	12	155758	155769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249891
3497	NC_008380	GCG	2	6	155781	155786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249891
3498	NC_008380	TGG	2	6	155789	155794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249891
3499	NC_008380	CTG	2	6	155797	155802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249891
3500	NC_008380	CGG	2	6	155803	155808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249891

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