MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 118531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_008380	CGG	2	6	510712	510717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250243
12002	NC_008380	GGC	2	6	510722	510727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250243
12003	NC_008380	CGA	2	6	510755	510760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250243
12004	NC_008380	CATC	2	8	510785	510792	25 %	25 %	0 %	50 %	116250243
12005	NC_008380	GCT	2	6	510860	510865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250243
12006	NC_008380	TGCGC	2	10	510932	510941	0 %	20 %	40 %	40 %	116250243
12007	NC_008380	GCA	2	6	510959	510964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250243
12008	NC_008380	CGC	2	6	510982	510987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250243
12009	NC_008380	CGA	2	6	511043	511048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250243
12010	NC_008380	TCGATG	2	12	511112	511123	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116250244
12011	NC_008380	TGA	2	6	511204	511209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250244
12012	NC_008380	TGAT	3	12	511349	511360	25 %	50 %	25 %	0 %	116250244
12013	NC_008380	AG	3	6	511362	511367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12014	NC_008380	CGG	2	6	511432	511437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250245
12015	NC_008380	ATCC	2	8	511522	511529	25 %	25 %	0 %	50 %	116250245
12016	NC_008380	GGC	2	6	511637	511642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250245
12017	NC_008380	CCA	2	6	511656	511661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116250245
12018	NC_008380	GCC	2	6	511707	511712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250245
12019	NC_008380	CAG	2	6	511727	511732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250245
12020	NC_008380	GATC	2	8	511768	511775	25 %	25 %	25 %	25 %	116250245
12021	NC_008380	GATC	2	8	511792	511799	25 %	25 %	25 %	25 %	116250245
12022	NC_008380	GCT	2	6	511840	511845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250245
12023	NC_008380	TCG	2	6	511953	511958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250245
12024	NC_008380	GCC	2	6	512030	512035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250245
12025	NC_008380	GCT	2	6	512059	512064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250245
12026	NC_008380	GCA	2	6	512090	512095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250245
12027	NC_008380	CCAG	2	8	512097	512104	25 %	0 %	25 %	50 %	116250245
12028	NC_008380	TGC	2	6	512142	512147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250245
12029	NC_008380	CGC	2	6	512191	512196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250245
12030	NC_008380	CGAA	2	8	512214	512221	50 %	0 %	25 %	25 %	116250245
12031	NC_008380	GCA	2	6	512247	512252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250245
12032	NC_008380	GCT	2	6	512264	512269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250245
12033	NC_008380	TAG	2	6	512302	512307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12034	NC_008380	C	6	6	512399	512404	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12035	NC_008380	CGGT	2	8	512458	512465	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12036	NC_008380	AGGCCG	2	12	512500	512511	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12037	NC_008380	TGC	2	6	512548	512553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12038	NC_008380	GGC	3	9	512561	512569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12039	NC_008380	AGG	2	6	512579	512584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12040	NC_008380	TGC	2	6	512606	512611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12041	NC_008380	AGC	2	6	512667	512672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12042	NC_008380	CTC	3	9	512676	512684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12043	NC_008380	ACA	2	6	512707	512712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12044	NC_008380	CTC	3	9	512713	512721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12045	NC_008380	GTCA	2	8	512728	512735	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12046	NC_008380	CCT	2	6	512755	512760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12047	NC_008380	T	6	6	512773	512778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12048	NC_008380	TTC	2	6	512796	512801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12049	NC_008380	GTTCGA	2	12	512887	512898	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116250246
12050	NC_008380	CCA	2	6	512960	512965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116250246
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12052	NC_008380	CCG	2	6	513063	513068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250246
12053	NC_008380	GCG	2	6	513070	513075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250246
12054	NC_008380	GAT	2	6	513098	513103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250246
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12056	NC_008380	CGAGC	2	10	513140	513149	20 %	0 %	40 %	40 %	116250246
12057	NC_008380	GCATCA	2	12	513154	513165	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116250246
12058	NC_008380	TCA	2	6	513196	513201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116250246
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12060	NC_008380	GC	3	6	513278	513283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12061	NC_008380	TCG	2	6	513339	513344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12062	NC_008380	GCC	2	6	513361	513366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12063	NC_008380	TCT	2	6	513440	513445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116250247
12064	NC_008380	GCG	2	6	513472	513477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250247
12065	NC_008380	CGGT	2	8	513484	513491	0 %	25 %	50 %	25 %	116250247
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12070	NC_008380	CGA	2	6	513566	513571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250247
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12075	NC_008380	GCC	2	6	513790	513795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250247
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12087	NC_008380	GATC	2	8	514280	514287	25 %	25 %	25 %	25 %	116250247
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12099	NC_008380	GCATC	2	10	514788	514797	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12100	NC_008380	TTG	2	6	514798	514803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12101	NC_008380	AT	3	6	514806	514811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12102	NC_008380	ACG	2	6	514819	514824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12103	NC_008380	TCTG	2	8	514830	514837	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12104	NC_008380	ATGGC	2	10	514853	514862	20 %	20 %	40 %	20 %	116250248
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12106	NC_008380	GTC	2	6	514888	514893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250248
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12110	NC_008380	GGCT	2	8	515065	515072	0 %	25 %	50 %	25 %	116250248
12111	NC_008380	GCC	2	6	515113	515118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250248
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12113	NC_008380	GCCG	2	8	515152	515159	0 %	0 %	50 %	50 %	116250248
12114	NC_008380	AG	3	6	515173	515178	50 %	0 %	50 %	0 %	116250248
12115	NC_008380	CG	3	6	515209	515214	0 %	0 %	50 %	50 %	116250248
12116	NC_008380	TGA	2	6	515261	515266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250248
12117	NC_008380	GGA	2	6	515268	515273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116250248
12118	NC_008380	GCC	2	6	515311	515316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250248
12119	NC_008380	ATG	2	6	515335	515340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250248
12120	NC_008380	TGC	2	6	515429	515434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250248
12121	NC_008380	ACA	2	6	515441	515446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116250248
12122	NC_008380	TGG	2	6	515471	515476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116250248
12123	NC_008380	CGC	2	6	515490	515495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250248
12124	NC_008380	CCG	2	6	515561	515566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250248
12125	NC_008380	GCC	2	6	515617	515622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250248
12126	NC_008380	CGG	2	6	515771	515776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250248
12127	NC_008380	CGG	2	6	515790	515795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250248
12128	NC_008380	CCG	2	6	515835	515840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250248
12129	NC_008380	GC	4	8	515868	515875	0 %	0 %	50 %	50 %	116250248
12130	NC_008380	GAG	2	6	515893	515898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116250248
12131	NC_008380	ACG	2	6	515899	515904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250248
12132	NC_008380	ATGG	2	8	515907	515914	25 %	25 %	50 %	0 %	116250248
12133	NC_008380	TCG	2	6	515959	515964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250248
12134	NC_008380	CGGCCA	2	12	515991	516002	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116250248
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12136	NC_008380	ACC	2	6	516127	516132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116250249
12137	NC_008380	CGG	3	9	516153	516161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250249
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12139	NC_008380	CTG	2	6	516211	516216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250249
12140	NC_008380	GGC	2	6	516252	516257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250249
12141	NC_008380	CG	3	6	516278	516283	0 %	0 %	50 %	50 %	116250249
12142	NC_008380	CGT	2	6	516357	516362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250249
12143	NC_008380	CCG	2	6	516379	516384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250249
12144	NC_008380	ATG	2	6	516436	516441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250249
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12149	NC_008380	GGC	2	6	516805	516810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250249
12150	NC_008380	CGG	2	6	516912	516917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250250
12151	NC_008380	GCC	2	6	516946	516951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250250
12152	NC_008380	CG	3	6	517016	517021	0 %	0 %	50 %	50 %	116250250
12153	NC_008380	GC	3	6	517022	517027	0 %	0 %	50 %	50 %	116250250
12154	NC_008380	CTG	3	9	517045	517053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250250
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12159	NC_008380	CCG	2	6	517211	517216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250250
12160	NC_008380	CCT	2	6	517286	517291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116250250
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12165	NC_008380	GCC	2	6	517423	517428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250250
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12169	NC_008380	CAAGGT	2	12	517653	517664	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116250250
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12172	NC_008380	GGCC	2	8	517737	517744	0 %	0 %	50 %	50 %	116250250
12173	NC_008380	CCA	2	6	517760	517765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116250250
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12176	NC_008380	GAG	2	6	517886	517891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12177	NC_008380	GGC	2	6	518062	518067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12178	NC_008380	CTGC	2	8	518176	518183	0 %	25 %	25 %	50 %	116250251
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12181	NC_008380	CCGA	2	8	518447	518454	25 %	0 %	25 %	50 %	116250251
12182	NC_008380	CAGCG	2	10	518503	518512	20 %	0 %	40 %	40 %	116250251
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12185	NC_008380	GCT	2	6	518753	518758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250251
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12188	NC_008380	AGA	2	6	518912	518917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12189	NC_008380	CTGG	2	8	518929	518936	0 %	25 %	50 %	25 %	116250252
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12192	NC_008380	GTC	2	6	519058	519063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250252
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12200	NC_008380	TCGG	2	8	519340	519347	0 %	25 %	50 %	25 %	116250252
12201	NC_008380	TCG	2	6	519359	519364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250252
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12203	NC_008380	CGAC	2	8	519479	519486	25 %	0 %	25 %	50 %	116250252
12204	NC_008380	GCC	2	6	519574	519579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250252
12205	NC_008380	CTG	2	6	519602	519607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250252
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12207	NC_008380	GGTC	2	8	519710	519717	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12208	NC_008380	CTT	2	6	519719	519724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12209	NC_008380	TCC	2	6	519753	519758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12210	NC_008380	GAG	2	6	519769	519774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12211	NC_008380	G	6	6	519777	519782	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12212	NC_008380	GCT	2	6	519861	519866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12213	NC_008380	CTC	2	6	519921	519926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12214	NC_008380	CT	3	6	519936	519941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12215	NC_008380	CGC	3	9	519946	519954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12217	NC_008380	GAC	3	9	520030	520038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12218	NC_008380	CTT	2	6	520049	520054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12219	NC_008380	CGA	2	6	520123	520128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250253
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12221	NC_008380	GCA	2	6	520425	520430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250253
12222	NC_008380	TTG	2	6	520524	520529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116250253
12223	NC_008380	TC	3	6	520553	520558	0 %	50 %	0 %	50 %	116250253
12224	NC_008380	AGG	2	6	520588	520593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116250253
12225	NC_008380	AGA	2	6	520615	520620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116250253
12226	NC_008380	GCG	2	6	520629	520634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250253
12227	NC_008380	T	7	7	520689	520695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12228	NC_008380	TTA	2	6	520707	520712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12229	NC_008380	TAA	2	6	520757	520762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12230	NC_008380	AAAT	2	8	520772	520779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12231	NC_008380	CA	3	6	520800	520805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12232	NC_008380	GGC	2	6	520875	520880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250254
12233	NC_008380	CG	3	6	520882	520887	0 %	0 %	50 %	50 %	116250254
12234	NC_008380	GCC	2	6	520896	520901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250254
12235	NC_008380	GGC	3	9	521042	521050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250254
12236	NC_008380	GGT	2	6	521069	521074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116250254
12237	NC_008380	CAA	2	6	521105	521110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116250254
12238	NC_008380	GCG	2	6	521112	521117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250254
12239	NC_008380	CGA	2	6	521141	521146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250254
12240	NC_008380	CG	3	6	521215	521220	0 %	0 %	50 %	50 %	116250254
12241	NC_008380	CAG	2	6	521221	521226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250254
12242	NC_008380	GGC	2	6	521244	521249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250254
12243	NC_008380	ATC	2	6	521253	521258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116250254
12244	NC_008380	TCGGC	2	10	521263	521272	0 %	20 %	40 %	40 %	116250254
12245	NC_008380	GCG	2	6	521325	521330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250254
12246	NC_008380	TCG	2	6	521332	521337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250254
12247	NC_008380	CCGA	2	8	521412	521419	25 %	0 %	25 %	50 %	116250254
12248	NC_008380	GGC	2	6	521423	521428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250254
12249	NC_008380	CCG	2	6	521480	521485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250254
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12251	NC_008380	GGC	2	6	521541	521546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250254
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12253	NC_008380	TGGCC	2	10	521579	521588	0 %	20 %	40 %	40 %	116250254
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12255	NC_008380	TCG	2	6	521730	521735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250255
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12257	NC_008380	TGG	2	6	521764	521769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116250255
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12260	NC_008380	GAGC	2	8	521817	521824	25 %	0 %	50 %	25 %	116250255
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12262	NC_008380	ACTG	2	8	521873	521880	25 %	25 %	25 %	25 %	116250255
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12264	NC_008380	CAT	2	6	521957	521962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116250255
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12326	NC_008380	CG	3	6	525396	525401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12327	NC_008380	GCA	2	6	525414	525419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12330	NC_008380	CGA	2	6	525536	525541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12331	NC_008380	ATT	2	6	525568	525573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12332	NC_008380	TAG	2	6	525575	525580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250258
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12356	NC_008380	GCA	2	6	526414	526419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250259
12357	NC_008380	TGCCG	2	10	526508	526517	0 %	20 %	40 %	40 %	116250259
12358	NC_008380	GCC	3	9	526553	526561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250259
12359	NC_008380	GAA	2	6	526577	526582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116250259
12360	NC_008380	GCG	2	6	526779	526784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250259
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12362	NC_008380	GTC	2	6	526817	526822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250259
12363	NC_008380	ATGCGG	2	12	526911	526922	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116250259
12364	NC_008380	CGA	2	6	526924	526929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250259
12365	NC_008380	CG	3	6	527050	527055	0 %	0 %	50 %	50 %	116250259
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12371	NC_008380	CGTT	2	8	527181	527188	0 %	50 %	25 %	25 %	116250259
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12379	NC_008380	CGT	2	6	527398	527403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12413	NC_008380	GACG	2	8	528581	528588	25 %	0 %	50 %	25 %	116250261
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12469	NC_008380	GCTT	2	8	530757	530764	0 %	50 %	25 %	25 %	116250263
12470	NC_008380	CG	3	6	530819	530824	0 %	0 %	50 %	50 %	116250263
12471	NC_008380	CG	3	6	530871	530876	0 %	0 %	50 %	50 %	116250263
12472	NC_008380	GCCC	2	8	530894	530901	0 %	0 %	25 %	75 %	116250263
12473	NC_008380	TCA	3	9	530922	530930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116250263
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12478	NC_008380	GCG	2	6	531183	531188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12479	NC_008380	CCG	2	6	531268	531273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250264
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12483	NC_008380	GTC	2	6	531386	531391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250264
12484	NC_008380	TGA	2	6	531465	531470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250264
12485	NC_008380	CGA	2	6	531499	531504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250264
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