MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 118531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
114501	NC_008380	CGCCGA	2	12	4880051	4880062	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116254318
114502	NC_008380	GA	3	6	4880071	4880076	50 %	0 %	50 %	0 %	116254318
114503	NC_008380	CGA	2	6	4880081	4880086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254318
114504	NC_008380	GC	3	6	4880152	4880157	0 %	0 %	50 %	50 %	116254318
114505	NC_008380	GCG	2	6	4880220	4880225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114506	NC_008380	CGC	2	6	4880326	4880331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254319
114507	NC_008380	GTC	3	9	4880358	4880366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254319
114508	NC_008380	CGGT	2	8	4880410	4880417	0 %	25 %	50 %	25 %	116254319
114509	NC_008380	GTC	2	6	4880436	4880441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254319
114510	NC_008380	ATG	2	6	4880456	4880461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254319
114511	NC_008380	CAT	2	6	4880474	4880479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254319
114512	NC_008380	AGCG	2	8	4880542	4880549	25 %	0 %	50 %	25 %	116254319
114513	NC_008380	GC	3	6	4880553	4880558	0 %	0 %	50 %	50 %	116254319
114514	NC_008380	CAT	2	6	4880567	4880572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254319
114515	NC_008380	CGG	2	6	4880577	4880582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254319
114516	NC_008380	GAA	2	6	4880610	4880615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254319
114517	NC_008380	GCC	2	6	4880659	4880664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254319
114518	NC_008380	CTG	2	6	4880677	4880682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254319
114519	NC_008380	GAC	2	6	4880688	4880693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254319
114520	NC_008380	CTG	2	6	4880694	4880699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254319
114521	NC_008380	CCG	2	6	4880704	4880709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254319
114522	NC_008380	GCAG	2	8	4880711	4880718	25 %	0 %	50 %	25 %	116254319
114523	NC_008380	GAC	2	6	4880760	4880765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254319
114524	NC_008380	CGTT	2	8	4880780	4880787	0 %	50 %	25 %	25 %	116254319
114525	NC_008380	TCG	2	6	4880791	4880796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254319
114526	NC_008380	CCGG	2	8	4880813	4880820	0 %	0 %	50 %	50 %	116254319
114527	NC_008380	GCCGGG	2	12	4880883	4880894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254319
114528	NC_008380	CAG	2	6	4880895	4880900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254319
114529	NC_008380	GC	3	6	4880921	4880926	0 %	0 %	50 %	50 %	116254319
114530	NC_008380	GCC	2	6	4880948	4880953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254319
114531	NC_008380	GA	3	6	4880998	4881003	50 %	0 %	50 %	0 %	116254319
114532	NC_008380	CGG	2	6	4881149	4881154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254319
114533	NC_008380	TGC	2	6	4881184	4881189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254319
114534	NC_008380	CGGCG	2	10	4881233	4881242	0 %	0 %	60 %	40 %	116254319
114535	NC_008380	TAA	2	6	4881280	4881285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116254319
114536	NC_008380	CCA	2	6	4881322	4881327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254319
114537	NC_008380	CGA	2	6	4881371	4881376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254319
114538	NC_008380	CCG	2	6	4881377	4881382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254319
114539	NC_008380	GAT	2	6	4881384	4881389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254319
114540	NC_008380	TCA	2	6	4881391	4881396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254319
114541	NC_008380	CCG	2	6	4881419	4881424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254319
114542	NC_008380	GCC	2	6	4881439	4881444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254319
114543	NC_008380	TGG	2	6	4881448	4881453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254319
114544	NC_008380	GCC	2	6	4881462	4881467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254319
114545	NC_008380	CAGC	2	8	4881476	4881483	25 %	0 %	25 %	50 %	116254319
114546	NC_008380	TCG	2	6	4881613	4881618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254319
114547	NC_008380	GAA	2	6	4881627	4881632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254319
114548	NC_008380	GCC	2	6	4881657	4881662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254319
114549	NC_008380	CCGC	3	12	4881719	4881730	0 %	0 %	25 %	75 %	116254319
114550	NC_008380	CGT	2	6	4881753	4881758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254319
114551	NC_008380	CAC	2	6	4881767	4881772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254319
114552	NC_008380	AGA	2	6	4881776	4881781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254319
114553	NC_008380	GTC	2	6	4881810	4881815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254319
114554	NC_008380	CAC	2	6	4881824	4881829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254319
114555	NC_008380	CCA	2	6	4881933	4881938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254319
114556	NC_008380	GCT	2	6	4882001	4882006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254319
114557	NC_008380	CGC	2	6	4882013	4882018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254319
114558	NC_008380	GCA	3	9	4882022	4882030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254319
114559	NC_008380	GGC	2	6	4882070	4882075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254319
114560	NC_008380	CTC	2	6	4882086	4882091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254319
114561	NC_008380	TCGA	2	8	4882117	4882124	25 %	25 %	25 %	25 %	116254319
114562	NC_008380	CGC	2	6	4882135	4882140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254319
114563	NC_008380	GCC	2	6	4882154	4882159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254319
114564	NC_008380	AGC	2	6	4882207	4882212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254319
114565	NC_008380	TTC	2	6	4882225	4882230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254319
114566	NC_008380	CCG	2	6	4882235	4882240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254319
114567	NC_008380	ATC	2	6	4882246	4882251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254319
114568	NC_008380	GCC	2	6	4882256	4882261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254319
114569	NC_008380	GC	4	8	4882263	4882270	0 %	0 %	50 %	50 %	116254319
114570	NC_008380	TCG	2	6	4882324	4882329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254319
114571	NC_008380	GCG	2	6	4882552	4882557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254319
114572	NC_008380	CAT	2	6	4882747	4882752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254320
114573	NC_008380	CGG	2	6	4882767	4882772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254320
114574	NC_008380	TGC	2	6	4882783	4882788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254320
114575	NC_008380	CGG	2	6	4882878	4882883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254320
114576	NC_008380	GCG	2	6	4882886	4882891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254320
114577	NC_008380	GCC	2	6	4882925	4882930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254320
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114579	NC_008380	GCC	2	6	4883091	4883096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254320
114580	NC_008380	CG	3	6	4883104	4883109	0 %	0 %	50 %	50 %	116254320
114581	NC_008380	CGG	2	6	4883170	4883175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254320
114582	NC_008380	AAT	2	6	4883253	4883258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116254320
114583	NC_008380	CGT	2	6	4883299	4883304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254320
114584	NC_008380	CG	3	6	4883334	4883339	0 %	0 %	50 %	50 %	116254320
114585	NC_008380	CG	3	6	4883387	4883392	0 %	0 %	50 %	50 %	116254320
114586	NC_008380	GAA	2	6	4883488	4883493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254320
114587	NC_008380	GC	3	6	4883615	4883620	0 %	0 %	50 %	50 %	116254320
114588	NC_008380	GGCC	2	8	4883733	4883740	0 %	0 %	50 %	50 %	116254321
114589	NC_008380	TGA	2	6	4883761	4883766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254321
114590	NC_008380	CAG	2	6	4883928	4883933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254321
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114592	NC_008380	GAA	2	6	4883991	4883996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254321
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114594	NC_008380	CGC	2	6	4884053	4884058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254321
114595	NC_008380	ATCC	2	8	4884060	4884067	25 %	25 %	0 %	50 %	116254321
114596	NC_008380	GCT	2	6	4884134	4884139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254321
114597	NC_008380	GCC	2	6	4884198	4884203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254321
114598	NC_008380	TCG	2	6	4884233	4884238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254321
114599	NC_008380	GCAG	2	8	4884252	4884259	25 %	0 %	50 %	25 %	116254321
114600	NC_008380	GTCG	2	8	4884276	4884283	0 %	25 %	50 %	25 %	116254321
114601	NC_008380	CCT	2	6	4884284	4884289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254321
114602	NC_008380	GCA	2	6	4884326	4884331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254321
114603	NC_008380	GAA	2	6	4884417	4884422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254321
114604	NC_008380	GCC	2	6	4884471	4884476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254321
114605	NC_008380	CAG	2	6	4884564	4884569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254321
114606	NC_008380	AAG	2	6	4884653	4884658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254322
114607	NC_008380	ATG	2	6	4884768	4884773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254322
114608	NC_008380	GCATG	2	10	4884784	4884793	20 %	20 %	40 %	20 %	116254322
114609	NC_008380	ATC	2	6	4884810	4884815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254322
114610	NC_008380	GTT	2	6	4884836	4884841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254322
114611	NC_008380	GAC	2	6	4884864	4884869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254322
114612	NC_008380	GCA	2	6	4884940	4884945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254322
114613	NC_008380	CGG	2	6	4884977	4884982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254322
114614	NC_008380	GCAC	2	8	4885011	4885018	25 %	0 %	25 %	50 %	116254322
114615	NC_008380	GC	3	6	4885029	4885034	0 %	0 %	50 %	50 %	116254322
114616	NC_008380	CGC	2	6	4885066	4885071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254322
114617	NC_008380	GAG	2	6	4885086	4885091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254322
114618	NC_008380	GGA	2	6	4885268	4885273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254322
114619	NC_008380	GCC	2	6	4885275	4885280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254322
114620	NC_008380	GGC	2	6	4885357	4885362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254322
114621	NC_008380	TCGACC	2	12	4885374	4885385	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116254322
114622	NC_008380	GGT	2	6	4885427	4885432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254322
114623	NC_008380	CAG	2	6	4885445	4885450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254322
114624	NC_008380	CGG	3	9	4885456	4885464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254322
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114626	NC_008380	GCG	2	6	4885560	4885565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254322
114627	NC_008380	AGC	2	6	4885653	4885658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254322
114628	NC_008380	CATCG	2	10	4885670	4885679	20 %	20 %	20 %	40 %	116254322
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114630	NC_008380	TCA	2	6	4885798	4885803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254322
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114632	NC_008380	TCGA	2	8	4885994	4886001	25 %	25 %	25 %	25 %	116254323
114633	NC_008380	CGT	2	6	4886204	4886209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114634	NC_008380	ACC	2	6	4886215	4886220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114635	NC_008380	AC	3	6	4886256	4886261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114636	NC_008380	TGGCG	2	10	4886271	4886280	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
114637	NC_008380	CGGC	2	8	4886322	4886329	0 %	0 %	50 %	50 %	116254324
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114640	NC_008380	CGA	2	6	4886490	4886495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254324
114641	NC_008380	CTC	2	6	4886506	4886511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254324
114642	NC_008380	GAT	2	6	4886553	4886558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254324
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114644	NC_008380	TCA	2	6	4886598	4886603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254324
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114708	NC_008380	TGA	2	6	4889409	4889414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254327
114709	NC_008380	CCG	2	6	4889427	4889432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254327
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114711	NC_008380	GCC	2	6	4889532	4889537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254327
114712	NC_008380	GGC	2	6	4889538	4889543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254327
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114721	NC_008380	GCA	2	6	4889885	4889890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254327
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114726	NC_008380	CGC	2	6	4890026	4890031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254328
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