MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 118531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
113001	NC_008380	TGC	2	6	4820035	4820040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254265
113002	NC_008380	GCC	2	6	4820065	4820070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254265
113003	NC_008380	TCC	2	6	4820079	4820084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254265
113004	NC_008380	TTC	2	6	4820099	4820104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254265
113005	NC_008380	GCC	3	9	4820123	4820131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254265
113006	NC_008380	CTGGCG	2	12	4820267	4820278	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116254266
113007	NC_008380	GC	4	8	4820279	4820286	0 %	0 %	50 %	50 %	116254266
113008	NC_008380	TGGC	2	8	4820294	4820301	0 %	25 %	50 %	25 %	116254266
113009	NC_008380	CT	3	6	4820313	4820318	0 %	50 %	0 %	50 %	116254266
113010	NC_008380	CAG	2	6	4820366	4820371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254266
113011	NC_008380	CAT	2	6	4820386	4820391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254266
113012	NC_008380	GAT	2	6	4820422	4820427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254266
113013	NC_008380	GGC	2	6	4820472	4820477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254266
113014	NC_008380	GCC	2	6	4820522	4820527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254266
113015	NC_008380	TGG	2	6	4820585	4820590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254266
113016	NC_008380	CGA	2	6	4820668	4820673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254266
113017	NC_008380	CG	4	8	4820686	4820693	0 %	0 %	50 %	50 %	116254266
113018	NC_008380	TCG	2	6	4820712	4820717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254266
113019	NC_008380	ATC	2	6	4820735	4820740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254266
113020	NC_008380	GTG	2	6	4820755	4820760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254266
113021	NC_008380	TGC	2	6	4820787	4820792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254266
113022	NC_008380	CGAT	2	8	4820808	4820815	25 %	25 %	25 %	25 %	116254266
113023	NC_008380	TCA	2	6	4820838	4820843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254266
113024	NC_008380	CTT	2	6	4820866	4820871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254266
113025	NC_008380	CAT	2	6	4820881	4820886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254266
113026	NC_008380	GCC	2	6	4820910	4820915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254266
113027	NC_008380	GCC	2	6	4820921	4820926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254266
113028	NC_008380	GCC	2	6	4820939	4820944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254266
113029	NC_008380	GGA	2	6	4820959	4820964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254266
113030	NC_008380	TCTACG	2	12	4820986	4820997	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113031	NC_008380	CGCC	2	8	4821062	4821069	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113032	NC_008380	GCC	2	6	4821081	4821086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113033	NC_008380	CCG	3	9	4821104	4821112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113034	NC_008380	GC	3	6	4821117	4821122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113035	NC_008380	CCG	2	6	4821171	4821176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254267
113036	NC_008380	CG	3	6	4821183	4821188	0 %	0 %	50 %	50 %	116254267
113037	NC_008380	GCT	2	6	4821211	4821216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254267
113038	NC_008380	TCG	2	6	4821222	4821227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254267
113039	NC_008380	CGG	2	6	4821232	4821237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254267
113040	NC_008380	GCC	2	6	4821346	4821351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254267
113041	NC_008380	GACG	2	8	4821482	4821489	25 %	0 %	50 %	25 %	116254267
113042	NC_008380	TCG	2	6	4821498	4821503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254267
113043	NC_008380	CGA	2	6	4821688	4821693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254267
113044	NC_008380	GAAG	2	8	4821703	4821710	50 %	0 %	50 %	0 %	116254267
113045	NC_008380	AAG	2	6	4821777	4821782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113046	NC_008380	GAA	2	6	4821887	4821892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254268
113047	NC_008380	GC	3	6	4821924	4821929	0 %	0 %	50 %	50 %	116254268
113048	NC_008380	AGA	2	6	4821937	4821942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254268
113049	NC_008380	TAA	2	6	4821996	4822001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116254268
113050	NC_008380	TCG	2	6	4822012	4822017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254268
113051	NC_008380	GAG	2	6	4822055	4822060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254268
113052	NC_008380	CAG	3	9	4822088	4822096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254268
113053	NC_008380	GCC	2	6	4822101	4822106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254268
113054	NC_008380	GCG	2	6	4822115	4822120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254268
113055	NC_008380	GAT	2	6	4822160	4822165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254268
113056	NC_008380	TGC	2	6	4822194	4822199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254268
113057	NC_008380	CAT	2	6	4822271	4822276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254268
113058	NC_008380	AT	3	6	4822275	4822280	50 %	50 %	0 %	0 %	116254268
113059	NC_008380	GAT	2	6	4822438	4822443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254269
113060	NC_008380	GAC	2	6	4822507	4822512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254269
113061	NC_008380	AGAA	2	8	4822535	4822542	75 %	0 %	25 %	0 %	116254269
113062	NC_008380	GGC	2	6	4822594	4822599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254269
113063	NC_008380	AGC	2	6	4822616	4822621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254269
113064	NC_008380	GCC	2	6	4822639	4822644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254269
113065	NC_008380	TGA	2	6	4822692	4822697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254269
113066	NC_008380	GAC	3	9	4822738	4822746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254269
113067	NC_008380	GAT	2	6	4822810	4822815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254269
113068	NC_008380	CGA	2	6	4822842	4822847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254269
113069	NC_008380	CCA	2	6	4822887	4822892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254269
113070	NC_008380	GAA	2	6	4822915	4822920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254269
113071	NC_008380	ATC	2	6	4822925	4822930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254269
113072	NC_008380	CAG	2	6	4822957	4822962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254269
113073	NC_008380	GAT	2	6	4822965	4822970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254269
113074	NC_008380	GCA	2	6	4822979	4822984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254269
113075	NC_008380	TTC	2	6	4823017	4823022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113076	NC_008380	CGG	2	6	4823070	4823075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113077	NC_008380	CAT	2	6	4823087	4823092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254270
113078	NC_008380	CGCCGA	2	12	4823160	4823171	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116254270
113079	NC_008380	GCC	2	6	4823218	4823223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254270
113080	NC_008380	GC	3	6	4823224	4823229	0 %	0 %	50 %	50 %	116254270
113081	NC_008380	CGT	2	6	4823314	4823319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254270
113082	NC_008380	GCA	2	6	4823334	4823339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254270
113083	NC_008380	GCG	2	6	4823346	4823351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254270
113084	NC_008380	TCT	2	6	4823385	4823390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254270
113085	NC_008380	GGC	2	6	4823424	4823429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254270
113086	NC_008380	CGG	2	6	4823430	4823435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254270
113087	NC_008380	CGA	2	6	4823439	4823444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254270
113088	NC_008380	T	6	6	4823458	4823463	0 %	100 %	0 %	0 %	116254270
113089	NC_008380	CAT	2	6	4823484	4823489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254270
113090	NC_008380	GCT	2	6	4823565	4823570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254270
113091	NC_008380	CGC	3	9	4823575	4823583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254270
113092	NC_008380	CAGC	2	8	4823601	4823608	25 %	0 %	25 %	50 %	116254270
113093	NC_008380	TCG	2	6	4823655	4823660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254270
113094	NC_008380	CGA	3	9	4823685	4823693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254270
113095	NC_008380	AAGC	2	8	4823823	4823830	50 %	0 %	25 %	25 %	116254270
113096	NC_008380	CAG	2	6	4823878	4823883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254270
113097	NC_008380	GTGC	2	8	4823966	4823973	0 %	25 %	50 %	25 %	116254270
113098	NC_008380	AAC	2	6	4824019	4824024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254270
113099	NC_008380	CGA	2	6	4824036	4824041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254270
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113101	NC_008380	C	6	6	4824110	4824115	0 %	0 %	0 %	100 %	116254270
113102	NC_008380	CTGCC	2	10	4824117	4824126	0 %	20 %	20 %	60 %	116254270
113103	NC_008380	GGA	2	6	4824160	4824165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254270
113104	NC_008380	CAT	2	6	4824180	4824185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254270
113105	NC_008380	CGA	2	6	4824237	4824242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254270
113106	NC_008380	GCC	2	6	4824293	4824298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254270
113107	NC_008380	GGT	2	6	4824329	4824334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254270
113108	NC_008380	GCCTCC	2	12	4824371	4824382	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	116254270
113109	NC_008380	GCT	2	6	4824383	4824388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254270
113110	NC_008380	CGG	3	9	4824441	4824449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254270
113111	NC_008380	CAT	2	6	4824468	4824473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254270
113112	NC_008380	GCT	2	6	4824485	4824490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254270
113113	NC_008380	CGC	3	9	4824492	4824500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254270
113114	NC_008380	CGT	2	6	4824501	4824506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254270
113115	NC_008380	GCCG	2	8	4824526	4824533	0 %	0 %	50 %	50 %	116254270
113116	NC_008380	TCG	2	6	4824560	4824565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254270
113117	NC_008380	TCG	2	6	4824581	4824586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254270
113118	NC_008380	CG	3	6	4824585	4824590	0 %	0 %	50 %	50 %	116254270
113119	NC_008380	TTC	2	6	4824631	4824636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254270
113120	NC_008380	TGA	2	6	4824666	4824671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254270
113121	NC_008380	GCT	2	6	4824708	4824713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254271
113122	NC_008380	GTT	2	6	4824836	4824841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254271
113123	NC_008380	AGC	2	6	4824849	4824854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254271
113124	NC_008380	ATC	2	6	4824870	4824875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254271
113125	NC_008380	GCA	2	6	4824895	4824900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254271
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113127	NC_008380	GCG	2	6	4824924	4824929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254271
113128	NC_008380	GCGG	2	8	4824965	4824972	0 %	0 %	75 %	25 %	116254271
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113132	NC_008380	ACGCA	2	10	4825145	4825154	40 %	0 %	20 %	40 %	116254271
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113137	NC_008380	GGC	2	6	4825309	4825314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254271
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113143	NC_008380	CGA	2	6	4825438	4825443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254271
113144	NC_008380	CGA	2	6	4825459	4825464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254271
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113146	NC_008380	CG	3	6	4825559	4825564	0 %	0 %	50 %	50 %	116254271
113147	NC_008380	GCG	2	6	4825594	4825599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254271
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113166	NC_008380	CGT	2	6	4826245	4826250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254272
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113173	NC_008380	CGTCC	2	10	4826536	4826545	0 %	20 %	20 %	60 %	116254272
113174	NC_008380	CGG	2	6	4826610	4826615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254272
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113181	NC_008380	GCA	2	6	4826981	4826986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113182	NC_008380	GCA	2	6	4827027	4827032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254273
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113200	NC_008380	GC	3	6	4827781	4827786	0 %	0 %	50 %	50 %	116254274
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113219	NC_008380	CGA	2	6	4828313	4828318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254274
113220	NC_008380	AAG	2	6	4828347	4828352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254274
113221	NC_008380	CTG	2	6	4828374	4828379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254274
113222	NC_008380	CGA	2	6	4828430	4828435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254274
113223	NC_008380	CGG	2	6	4828487	4828492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254274
113224	NC_008380	GCC	2	6	4828494	4828499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254274
113225	NC_008380	GC	3	6	4828508	4828513	0 %	0 %	50 %	50 %	116254274
113226	NC_008380	TCGGCG	2	12	4828540	4828551	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116254274
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113228	NC_008380	GAGC	2	8	4828559	4828566	25 %	0 %	50 %	25 %	116254274
113229	NC_008380	GGA	2	6	4828568	4828573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254274
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113322	NC_008380	GGCCT	2	10	4831596	4831605	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
113323	NC_008380	CAAA	2	8	4831653	4831660	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113324	NC_008380	AGA	2	6	4831745	4831750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113325	NC_008380	CAT	2	6	4831772	4831777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254279
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113327	NC_008380	GCC	2	6	4831800	4831805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254279
113328	NC_008380	CG	3	6	4831891	4831896	0 %	0 %	50 %	50 %	116254279
113329	NC_008380	CGG	3	9	4831931	4831939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254279
113330	NC_008380	GAT	2	6	4832015	4832020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254279
113331	NC_008380	CGT	2	6	4832033	4832038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254279
113332	NC_008380	CGC	2	6	4832040	4832045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254279
113333	NC_008380	ACG	2	6	4832143	4832148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254279
113334	NC_008380	GC	3	6	4832153	4832158	0 %	0 %	50 %	50 %	116254279
113335	NC_008380	GCA	2	6	4832202	4832207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254279
113336	NC_008380	CGC	2	6	4832219	4832224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254279
113337	NC_008380	GCA	3	9	4832232	4832240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254279
113338	NC_008380	GCC	2	6	4832259	4832264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254279
113339	NC_008380	AGC	2	6	4832270	4832275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254279
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113341	NC_008380	GCA	2	6	4832295	4832300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254279
113342	NC_008380	GGC	2	6	4832340	4832345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113343	NC_008380	T	6	6	4832365	4832370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113344	NC_008380	CGG	2	6	4832386	4832391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113345	NC_008380	TGT	2	6	4832453	4832458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254280
113346	NC_008380	TCG	2	6	4832460	4832465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254280
113347	NC_008380	CGC	2	6	4832484	4832489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254280
113348	NC_008380	CGC	2	6	4832508	4832513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254280
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113351	NC_008380	CGT	4	12	4832550	4832561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254280
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113436	NC_008380	ATCG	2	8	4836156	4836163	25 %	25 %	25 %	25 %	116254283
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113445	NC_008380	TC	3	6	4836484	4836489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113446	NC_008380	GGC	2	6	4836494	4836499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113447	NC_008380	TGGC	2	8	4836507	4836514	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113448	NC_008380	ATG	2	6	4836516	4836521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113449	NC_008380	CGT	2	6	4836603	4836608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254284
113450	NC_008380	GC	3	6	4836652	4836657	0 %	0 %	50 %	50 %	116254284
113451	NC_008380	GAC	2	6	4836679	4836684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254284
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113453	NC_008380	CTT	2	6	4836823	4836828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254284
113454	NC_008380	CCT	2	6	4836834	4836839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254284
113455	NC_008380	GCC	2	6	4836842	4836847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254284
113456	NC_008380	CTG	2	6	4836850	4836855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254284
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113458	NC_008380	ACG	2	6	4836893	4836898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254284
113459	NC_008380	GAT	2	6	4836910	4836915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254284
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113463	NC_008380	GCG	2	6	4837284	4837289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254284
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