MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 118531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
110001	NC_008380	GCA	2	6	4690452	4690457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254144
110002	NC_008380	GCCCG	2	10	4690482	4690491	0 %	0 %	40 %	60 %	116254144
110003	NC_008380	CG	4	8	4690531	4690538	0 %	0 %	50 %	50 %	116254144
110004	NC_008380	CGA	2	6	4690569	4690574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254144
110005	NC_008380	TCA	2	6	4690587	4690592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254144
110006	NC_008380	TCCAGC	2	12	4690664	4690675	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116254144
110007	NC_008380	GAG	2	6	4690706	4690711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254144
110008	NC_008380	CCT	2	6	4690749	4690754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254144
110009	NC_008380	CGA	2	6	4690785	4690790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254144
110010	NC_008380	GCT	2	6	4690863	4690868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254144
110011	NC_008380	CCA	2	6	4690884	4690889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254144
110012	NC_008380	CAG	2	6	4690975	4690980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254144
110013	NC_008380	GCC	2	6	4691041	4691046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254144
110014	NC_008380	CGC	2	6	4691095	4691100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254144
110015	NC_008380	CGAC	2	8	4691166	4691173	25 %	0 %	25 %	50 %	116254144
110016	NC_008380	ACG	2	6	4691222	4691227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254144
110017	NC_008380	TCC	2	6	4691258	4691263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254144
110018	NC_008380	TCG	2	6	4691288	4691293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254144
110019	NC_008380	GAT	2	6	4691296	4691301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254144
110020	NC_008380	CGAG	2	8	4691335	4691342	25 %	0 %	50 %	25 %	116254144
110021	NC_008380	ACG	2	6	4691351	4691356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254144
110022	NC_008380	GCG	2	6	4691403	4691408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254144
110023	NC_008380	GCA	2	6	4691493	4691498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254144
110024	NC_008380	GCC	2	6	4691636	4691641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254144
110025	NC_008380	GCG	2	6	4691666	4691671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254144
110026	NC_008380	ATCCGG	2	12	4691677	4691688	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116254144
110027	NC_008380	CGG	4	12	4691701	4691712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254144
110028	NC_008380	CGA	2	6	4691754	4691759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254144
110029	NC_008380	TCG	2	6	4691763	4691768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254144
110030	NC_008380	CGC	2	6	4691776	4691781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254144
110031	NC_008380	GC	4	8	4691840	4691847	0 %	0 %	50 %	50 %	116254144
110032	NC_008380	CGC	2	6	4691868	4691873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254144
110033	NC_008380	CGA	2	6	4691874	4691879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254144
110034	NC_008380	CCA	2	6	4691892	4691897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254144
110035	NC_008380	GC	3	6	4691938	4691943	0 %	0 %	50 %	50 %	116254144
110036	NC_008380	GCG	2	6	4691955	4691960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254144
110037	NC_008380	GCG	2	6	4692012	4692017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254144
110038	NC_008380	CTT	2	6	4692049	4692054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254144
110039	NC_008380	CGC	2	6	4692072	4692077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254144
110040	NC_008380	GAC	2	6	4692085	4692090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254144
110041	NC_008380	GCCAT	2	10	4692146	4692155	20 %	20 %	20 %	40 %	116254144
110042	NC_008380	GAATAG	2	12	4692164	4692175	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116254144
110043	NC_008380	GTTCG	2	10	4692212	4692221	0 %	40 %	40 %	20 %	116254144
110044	NC_008380	GC	3	6	4692240	4692245	0 %	0 %	50 %	50 %	116254144
110045	NC_008380	CG	3	6	4692274	4692279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110046	NC_008380	CGA	2	6	4692345	4692350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110047	NC_008380	GGC	2	6	4692477	4692482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254145
110048	NC_008380	TTC	2	6	4692492	4692497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254145
110049	NC_008380	CGC	2	6	4692547	4692552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254145
110050	NC_008380	CCA	3	9	4692556	4692564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254145
110051	NC_008380	CAC	2	6	4692581	4692586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254145
110052	NC_008380	CAG	2	6	4692917	4692922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254145
110053	NC_008380	TCG	2	6	4692927	4692932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254145
110054	NC_008380	TGC	2	6	4693054	4693059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254145
110055	NC_008380	ATC	2	6	4693086	4693091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254145
110056	NC_008380	CGA	2	6	4693126	4693131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254145
110057	NC_008380	TCG	2	6	4693176	4693181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254145
110058	NC_008380	CG	3	6	4693198	4693203	0 %	0 %	50 %	50 %	116254145
110059	NC_008380	AGA	2	6	4693204	4693209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254145
110060	NC_008380	CCG	2	6	4693212	4693217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254145
110061	NC_008380	GCT	2	6	4693262	4693267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254145
110062	NC_008380	CCT	2	6	4693310	4693315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254146
110063	NC_008380	GCA	2	6	4693326	4693331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254146
110064	NC_008380	CGATCG	2	12	4693359	4693370	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116254146
110065	NC_008380	CGG	2	6	4693417	4693422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254146
110066	NC_008380	CTC	2	6	4693534	4693539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254146
110067	NC_008380	ATG	2	6	4693559	4693564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254146
110068	NC_008380	CGGT	2	8	4693571	4693578	0 %	25 %	50 %	25 %	116254146
110069	NC_008380	GGC	2	6	4693582	4693587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254146
110070	NC_008380	CTG	2	6	4693669	4693674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254146
110071	NC_008380	CGT	2	6	4693693	4693698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254146
110072	NC_008380	TCG	2	6	4693703	4693708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254146
110073	NC_008380	GAT	2	6	4693711	4693716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254146
110074	NC_008380	GCC	2	6	4693768	4693773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254146
110075	NC_008380	GGC	2	6	4693855	4693860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254146
110076	NC_008380	GCC	2	6	4693976	4693981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254146
110077	NC_008380	ATCG	2	8	4694008	4694015	25 %	25 %	25 %	25 %	116254146
110078	NC_008380	CGA	2	6	4694049	4694054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254146
110079	NC_008380	CGG	2	6	4694062	4694067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254146
110080	NC_008380	TCG	2	6	4694168	4694173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254146
110081	NC_008380	CGC	2	6	4694189	4694194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254146
110082	NC_008380	GTA	2	6	4694215	4694220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254146
110083	NC_008380	TCA	2	6	4694286	4694291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254146
110084	NC_008380	AT	3	6	4694343	4694348	50 %	50 %	0 %	0 %	116254147
110085	NC_008380	GAC	2	6	4694393	4694398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254147
110086	NC_008380	CAC	2	6	4694421	4694426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254147
110087	NC_008380	GCC	2	6	4694474	4694479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254147
110088	NC_008380	TCG	2	6	4694482	4694487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254147
110089	NC_008380	TGT	2	6	4694551	4694556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254147
110090	NC_008380	TCG	2	6	4694560	4694565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254147
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110092	NC_008380	GA	3	6	4694669	4694674	50 %	0 %	50 %	0 %	116254147
110093	NC_008380	ACGGA	2	10	4694682	4694691	40 %	0 %	40 %	20 %	116254147
110094	NC_008380	GGC	2	6	4694695	4694700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254147
110095	NC_008380	AGC	2	6	4694718	4694723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254147
110096	NC_008380	AGC	2	6	4694781	4694786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254147
110097	NC_008380	ATG	2	6	4694832	4694837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254147
110098	NC_008380	GGTC	2	8	4694842	4694849	0 %	25 %	50 %	25 %	116254147
110099	NC_008380	GGCGAT	2	12	4694882	4694893	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116254147
110100	NC_008380	CGA	2	6	4694911	4694916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254147
110101	NC_008380	GAA	2	6	4694924	4694929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254147
110102	NC_008380	GGC	2	6	4694948	4694953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254147
110103	NC_008380	CCT	2	6	4694968	4694973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254147
110104	NC_008380	GGC	2	6	4695012	4695017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254147
110105	NC_008380	GAA	2	6	4695062	4695067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254147
110106	NC_008380	GAT	2	6	4695089	4695094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254147
110107	NC_008380	TTG	2	6	4695126	4695131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254147
110108	NC_008380	GCA	2	6	4695136	4695141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254147
110109	NC_008380	GATC	2	8	4695190	4695197	25 %	25 %	25 %	25 %	116254148
110110	NC_008380	GAT	2	6	4695206	4695211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254148
110111	NC_008380	CGG	2	6	4695229	4695234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254148
110112	NC_008380	GAT	2	6	4695242	4695247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254148
110113	NC_008380	CGA	2	6	4695343	4695348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254148
110114	NC_008380	GCC	2	6	4695356	4695361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254148
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110126	NC_008380	GAT	2	6	4695695	4695700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254148
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110131	NC_008380	GAT	2	6	4695800	4695805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254148
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110228	NC_008380	CGA	2	6	4699589	4699594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254150
110229	NC_008380	CCA	2	6	4699627	4699632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254150
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110231	NC_008380	CGT	2	6	4699772	4699777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254150
110232	NC_008380	CGA	2	6	4699787	4699792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254150
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110258	NC_008380	CGG	2	6	4700971	4700976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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110295	NC_008380	TCC	2	6	4702186	4702191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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110297	NC_008380	CGC	2	6	4702264	4702269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254153
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110339	NC_008380	TGCC	2	8	4703988	4703995	0 %	25 %	25 %	50 %	116254154
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110341	NC_008380	GGC	2	6	4704023	4704028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254154
110342	NC_008380	CGA	2	6	4704118	4704123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254154
110343	NC_008380	ACA	2	6	4704202	4704207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254154
110344	NC_008380	TGC	2	6	4704211	4704216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254154
110345	NC_008380	GCC	2	6	4704228	4704233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254154
110346	NC_008380	TCG	2	6	4704256	4704261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254154
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110353	NC_008380	GCC	2	6	4704654	4704659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254154
110354	NC_008380	GCT	2	6	4704674	4704679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254154
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110362	NC_008380	CGT	3	9	4705078	4705086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254155
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110364	NC_008380	TGC	2	6	4705254	4705259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254155
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110400	NC_008380	GCC	2	6	4706915	4706920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254157
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110403	NC_008380	GCA	2	6	4707049	4707054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254157
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110405	NC_008380	GAAC	2	8	4707362	4707369	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110406	NC_008380	CGC	2	6	4707407	4707412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254158
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110416	NC_008380	GCG	2	6	4707816	4707821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254158
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110431	NC_008380	TGC	2	6	4708567	4708572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254159
110432	NC_008380	GCC	2	6	4708578	4708583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254159
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110437	NC_008380	ACGCC	2	10	4708711	4708720	20 %	0 %	20 %	60 %	116254159
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110440	NC_008380	CG	3	6	4708804	4708809	0 %	0 %	50 %	50 %	116254159
110441	NC_008380	GCC	2	6	4708820	4708825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254159
110442	NC_008380	CGC	2	6	4708847	4708852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254159
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110447	NC_008380	AGC	2	6	4709008	4709013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254159
110448	NC_008380	GAT	2	6	4709054	4709059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254159
110449	NC_008380	GC	3	6	4709110	4709115	0 %	0 %	50 %	50 %	116254159
110450	NC_008380	AGA	2	6	4709128	4709133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254159
110451	NC_008380	GTC	2	6	4709280	4709285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254159
110452	NC_008380	GACC	2	8	4709294	4709301	25 %	0 %	25 %	50 %	116254159
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