MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 118531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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106502	NC_008380	GAC	2	6	4538492	4538497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254014
106503	NC_008380	CCG	2	6	4538547	4538552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254014
106504	NC_008380	GAGC	2	8	4538614	4538621	25 %	0 %	50 %	25 %	116254014
106505	NC_008380	GC	3	6	4538675	4538680	0 %	0 %	50 %	50 %	116254014
106506	NC_008380	TGC	2	6	4538708	4538713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254014
106507	NC_008380	TCG	2	6	4538740	4538745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254014
106508	NC_008380	TCG	2	6	4538766	4538771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254014
106509	NC_008380	CAC	2	6	4538774	4538779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254014
106510	NC_008380	CTG	2	6	4538822	4538827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254014
106511	NC_008380	T	6	6	4538831	4538836	0 %	100 %	0 %	0 %	116254014
106512	NC_008380	CG	3	6	4538841	4538846	0 %	0 %	50 %	50 %	116254014
106513	NC_008380	GC	3	6	4538910	4538915	0 %	0 %	50 %	50 %	116254014
106514	NC_008380	TCG	2	6	4538932	4538937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254014
106515	NC_008380	TCG	2	6	4538994	4538999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254014
106516	NC_008380	GCA	2	6	4539027	4539032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254014
106517	NC_008380	CGG	2	6	4539043	4539048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254014
106518	NC_008380	GCG	2	6	4539129	4539134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254014
106519	NC_008380	TTGT	2	8	4539140	4539147	0 %	75 %	25 %	0 %	116254014
106520	NC_008380	GCT	2	6	4539169	4539174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254014
106521	NC_008380	CGT	2	6	4539233	4539238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254014
106522	NC_008380	GGC	2	6	4539278	4539283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254014
106523	NC_008380	TTG	2	6	4539318	4539323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254014
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106527	NC_008380	GAT	2	6	4539479	4539484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254014
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106529	NC_008380	GTC	2	6	4539525	4539530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254014
106530	NC_008380	CTG	2	6	4539605	4539610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254014
106531	NC_008380	TCA	2	6	4539619	4539624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254014
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106533	NC_008380	GTA	2	6	4539722	4539727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254014
106534	NC_008380	CAC	2	6	4539838	4539843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106535	NC_008380	T	6	6	4539864	4539869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106536	NC_008380	AGGC	2	8	4539955	4539962	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106537	NC_008380	TTG	2	6	4539986	4539991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106538	NC_008380	CTC	2	6	4540014	4540019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106539	NC_008380	CTT	2	6	4540023	4540028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106540	NC_008380	TGT	2	6	4540105	4540110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106541	NC_008380	CTT	2	6	4540137	4540142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106542	NC_008380	GGGC	2	8	4540204	4540211	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106543	NC_008380	GCT	2	6	4540284	4540289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106544	NC_008380	TTGC	2	8	4540377	4540384	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106545	NC_008380	ACC	2	6	4540620	4540625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106546	NC_008380	T	7	7	4540683	4540689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106547	NC_008380	GTC	2	6	4540947	4540952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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106550	NC_008380	ACG	2	6	4541162	4541167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106551	NC_008380	AAC	2	6	4541266	4541271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106552	NC_008380	TCA	2	6	4541296	4541301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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106554	NC_008380	CGA	2	6	4541437	4541442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106555	NC_008380	CG	3	6	4541472	4541477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106556	NC_008380	CCA	2	6	4541520	4541525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106557	NC_008380	CCCGGA	2	12	4541534	4541545	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106558	NC_008380	GGT	2	6	4541580	4541585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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106567	NC_008380	CCGCT	2	10	4542161	4542170	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
106568	NC_008380	ATCCA	2	10	4542175	4542184	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
106569	NC_008380	AAC	2	6	4542194	4542199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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106571	NC_008380	TC	3	6	4542341	4542346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106572	NC_008380	TCA	2	6	4542417	4542422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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106588	NC_008380	TCAC	2	8	4543505	4543512	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106589	NC_008380	GC	3	6	4543545	4543550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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106592	NC_008380	ATG	2	6	4543922	4543927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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106605	NC_008380	TGG	2	6	4544525	4544530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106606	NC_008380	TC	3	6	4544603	4544608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106607	NC_008380	CAAG	2	8	4544626	4544633	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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106617	NC_008380	GT	3	6	4545252	4545257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106618	NC_008380	AGCCC	2	10	4545258	4545267	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
106619	NC_008380	CACGA	2	10	4545403	4545412	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
106620	NC_008380	GAC	2	6	4545416	4545421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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106622	NC_008380	GCC	2	6	4545746	4545751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106623	NC_008380	TCC	2	6	4545766	4545771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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106625	NC_008380	AAC	2	6	4545926	4545931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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106627	NC_008380	CTT	2	6	4545981	4545986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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106738	NC_008380	TCA	2	6	4549850	4549855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254016
106739	NC_008380	AT	3	6	4549910	4549915	50 %	50 %	0 %	0 %	116254016
106740	NC_008380	TCG	3	9	4549946	4549954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254016
106741	NC_008380	GAAC	2	8	4550020	4550027	50 %	0 %	25 %	25 %	116254016
106742	NC_008380	CG	4	8	4550060	4550067	0 %	0 %	50 %	50 %	116254016
106743	NC_008380	GC	3	6	4550075	4550080	0 %	0 %	50 %	50 %	116254016
106744	NC_008380	AGC	2	6	4550144	4550149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254016
106745	NC_008380	TGT	2	6	4550217	4550222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254016
106746	NC_008380	ACC	2	6	4550231	4550236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254016
106747	NC_008380	CGC	2	6	4550250	4550255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254016
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106749	NC_008380	GCT	2	6	4550286	4550291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254016
106750	NC_008380	TGCGC	2	10	4550349	4550358	0 %	20 %	40 %	40 %	116254016
106751	NC_008380	TCG	2	6	4550381	4550386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254016
106752	NC_008380	GCT	2	6	4550388	4550393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254016
106753	NC_008380	CGG	2	6	4550403	4550408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254016
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106756	NC_008380	ATG	2	6	4550564	4550569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254016
106757	NC_008380	CGG	2	6	4550570	4550575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254016
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106761	NC_008380	CCA	2	6	4550709	4550714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254016
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106766	NC_008380	AGG	2	6	4550927	4550932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254016
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106768	NC_008380	TCG	2	6	4550987	4550992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254016
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106773	NC_008380	CTT	2	6	4551115	4551120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254016
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106791	NC_008380	CGC	2	6	4551685	4551690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254016
106792	NC_008380	TCG	3	9	4551701	4551709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254016
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106794	NC_008380	GCCCT	2	10	4551844	4551853	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
106795	NC_008380	GAT	2	6	4551869	4551874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106796	NC_008380	AGGC	2	8	4551894	4551901	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106797	NC_008380	ACT	2	6	4551957	4551962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106798	NC_008380	CAGC	2	8	4552095	4552102	25 %	0 %	25 %	50 %	116254017
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106800	NC_008380	TGC	2	6	4552191	4552196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254017
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106803	NC_008380	GCC	2	6	4552225	4552230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254017
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106820	NC_008380	CAATAA	2	12	4553147	4553158	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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106834	NC_008380	TTG	2	6	4554048	4554053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254018
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106841	NC_008380	GAC	2	6	4554360	4554365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254019
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106847	NC_008380	TCG	2	6	4554626	4554631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254019
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106850	NC_008380	CCG	2	6	4554701	4554706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254019
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106968	NC_008380	CCG	2	6	4560091	4560096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254023
106969	NC_008380	CCT	2	6	4560103	4560108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254023
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106997	NC_008380	GA	3	6	4561507	4561512	50 %	0 %	50 %	0 %	116254026
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