MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 118531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
106001	NC_008380	GAC	2	6	4518501	4518506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106002	NC_008380	CCTCTA	2	12	4518609	4518620	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
106003	NC_008380	GGC	2	6	4518627	4518632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106004	NC_008380	CCCG	2	8	4518762	4518769	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106005	NC_008380	CAT	2	6	4518838	4518843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106006	NC_008380	CGC	2	6	4518874	4518879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106007	NC_008380	ATG	2	6	4518916	4518921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106008	NC_008380	GCC	2	6	4518948	4518953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106009	NC_008380	TGA	2	6	4519006	4519011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106010	NC_008380	CAA	2	6	4519015	4519020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106011	NC_008380	GTT	2	6	4519021	4519026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106012	NC_008380	GCA	2	6	4519035	4519040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106013	NC_008380	TCG	2	6	4519260	4519265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253999
106014	NC_008380	ATC	2	6	4519346	4519351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253999
106015	NC_008380	GCA	2	6	4519377	4519382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253999
106016	NC_008380	GCC	3	9	4519417	4519425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253999
106017	NC_008380	CGG	3	9	4519443	4519451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253999
106018	NC_008380	CGA	2	6	4519491	4519496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253999
106019	NC_008380	CGA	2	6	4519521	4519526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253999
106020	NC_008380	GCT	2	6	4519530	4519535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253999
106021	NC_008380	TCC	2	6	4519538	4519543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116253999
106022	NC_008380	CAT	2	6	4519546	4519551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253999
106023	NC_008380	GCC	2	6	4519592	4519597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253999
106024	NC_008380	TTG	2	6	4519604	4519609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116253999
106025	NC_008380	CAT	2	6	4519621	4519626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253999
106026	NC_008380	GCCG	2	8	4519636	4519643	0 %	0 %	50 %	50 %	116253999
106027	NC_008380	CG	4	8	4519675	4519682	0 %	0 %	50 %	50 %	116253999
106028	NC_008380	TCG	2	6	4519685	4519690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253999
106029	NC_008380	CGG	2	6	4519707	4519712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253999
106030	NC_008380	TGA	2	6	4519722	4519727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116253999
106031	NC_008380	GCA	2	6	4519728	4519733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253999
106032	NC_008380	TCG	2	6	4519751	4519756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253999
106033	NC_008380	TGA	2	6	4519767	4519772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116253999
106034	NC_008380	AGCG	2	8	4519789	4519796	25 %	0 %	50 %	25 %	116253999
106035	NC_008380	GCGG	2	8	4519814	4519821	0 %	0 %	75 %	25 %	116253999
106036	NC_008380	CGG	2	6	4519897	4519902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253999
106037	NC_008380	CCG	2	6	4519977	4519982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253999
106038	NC_008380	ATG	2	6	4520021	4520026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116253999
106039	NC_008380	GCCT	2	8	4520040	4520047	0 %	25 %	25 %	50 %	116253999
106040	NC_008380	CGC	2	6	4520112	4520117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253999
106041	NC_008380	TCA	2	6	4520121	4520126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253999
106042	NC_008380	CGCGC	2	10	4520133	4520142	0 %	0 %	40 %	60 %	116253999
106043	NC_008380	TGA	2	6	4520146	4520151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116253999
106044	NC_008380	AAGCG	2	10	4520152	4520161	40 %	0 %	40 %	20 %	116253999
106045	NC_008380	GCC	2	6	4520168	4520173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253999
106046	NC_008380	GC	3	6	4520190	4520195	0 %	0 %	50 %	50 %	116253999
106047	NC_008380	CAG	2	6	4520209	4520214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253999
106048	NC_008380	AGC	2	6	4520261	4520266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253999
106049	NC_008380	TGC	2	6	4520287	4520292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253999
106050	NC_008380	GAC	3	9	4520293	4520301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253999
106051	NC_008380	CGAT	2	8	4520330	4520337	25 %	25 %	25 %	25 %	116253999
106052	NC_008380	TCC	2	6	4520372	4520377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116253999
106053	NC_008380	GAC	2	6	4520386	4520391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253999
106054	NC_008380	CGGCCG	2	12	4520409	4520420	0 %	0 %	50 %	50 %	116253999
106055	NC_008380	ACG	2	6	4520471	4520476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253999
106056	NC_008380	TCG	2	6	4520525	4520530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253999
106057	NC_008380	GAT	2	6	4520548	4520553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116253999
106058	NC_008380	CCG	2	6	4520562	4520567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253999
106059	NC_008380	ATG	2	6	4520591	4520596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116253999
106060	NC_008380	CGGC	2	8	4520619	4520626	0 %	0 %	50 %	50 %	116253999
106061	NC_008380	AGC	2	6	4520654	4520659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253999
106062	NC_008380	CG	3	6	4520700	4520705	0 %	0 %	50 %	50 %	116253999
106063	NC_008380	CAG	2	6	4520728	4520733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253999
106064	NC_008380	CAGGAA	2	12	4520743	4520754	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116253999
106065	NC_008380	CAC	2	6	4520755	4520760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116253999
106066	NC_008380	TGA	3	9	4520784	4520792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116253999
106067	NC_008380	CGG	2	6	4520802	4520807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253999
106068	NC_008380	TCA	2	6	4520814	4520819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253999
106069	NC_008380	TCGA	2	8	4520825	4520832	25 %	25 %	25 %	25 %	116253999
106070	NC_008380	GA	3	6	4520846	4520851	50 %	0 %	50 %	0 %	116253999
106071	NC_008380	GC	3	6	4520864	4520869	0 %	0 %	50 %	50 %	116253999
106072	NC_008380	CG	3	6	4520870	4520875	0 %	0 %	50 %	50 %	116253999
106073	NC_008380	CGA	2	6	4520901	4520906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253999
106074	NC_008380	GGC	2	6	4520953	4520958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253999
106075	NC_008380	GCA	2	6	4520966	4520971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253999
106076	NC_008380	CCA	2	6	4521007	4521012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116253999
106077	NC_008380	TCT	2	6	4521060	4521065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116253999
106078	NC_008380	TCATGG	2	12	4521074	4521085	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116253999
106079	NC_008380	TGATCG	2	12	4521092	4521103	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116253999
106080	NC_008380	TTCGTG	2	12	4521130	4521141	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116253999
106081	NC_008380	CGGC	2	8	4521146	4521153	0 %	0 %	50 %	50 %	116253999
106082	NC_008380	GCT	2	6	4521271	4521276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253999
106083	NC_008380	CCG	2	6	4521351	4521356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253999
106084	NC_008380	GGC	2	6	4521376	4521381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253999
106085	NC_008380	GCC	2	6	4521391	4521396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253999
106086	NC_008380	CTCG	2	8	4521412	4521419	0 %	25 %	25 %	50 %	116253999
106087	NC_008380	TC	3	6	4521457	4521462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106088	NC_008380	A	7	7	4521504	4521510	100 %	0 %	0 %	0 %	116254000
106089	NC_008380	CCG	2	6	4521631	4521636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254000
106090	NC_008380	GCC	2	6	4521643	4521648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254000
106091	NC_008380	TCG	2	6	4521772	4521777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254000
106092	NC_008380	TGG	2	6	4521832	4521837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254000
106093	NC_008380	TGCT	2	8	4521883	4521890	0 %	50 %	25 %	25 %	116254000
106094	NC_008380	TGCA	2	8	4521903	4521910	25 %	25 %	25 %	25 %	116254000
106095	NC_008380	CAC	2	6	4521915	4521920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254000
106096	NC_008380	CAGA	2	8	4521968	4521975	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106097	NC_008380	ATC	2	6	4522014	4522019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254001
106098	NC_008380	GGC	3	9	4522020	4522028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254001
106099	NC_008380	CGG	2	6	4522030	4522035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254001
106100	NC_008380	GCT	2	6	4522052	4522057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254001
106101	NC_008380	TGA	2	6	4522235	4522240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254001
106102	NC_008380	GGC	2	6	4522253	4522258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254001
106103	NC_008380	TCG	2	6	4522279	4522284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254001
106104	NC_008380	CCGG	2	8	4522291	4522298	0 %	0 %	50 %	50 %	116254001
106105	NC_008380	TGA	2	6	4522312	4522317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254001
106106	NC_008380	TGC	2	6	4522330	4522335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254001
106107	NC_008380	GC	3	6	4522334	4522339	0 %	0 %	50 %	50 %	116254001
106108	NC_008380	GCT	2	6	4522373	4522378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254001
106109	NC_008380	GACG	2	8	4522434	4522441	25 %	0 %	50 %	25 %	116254001
106110	NC_008380	CGG	2	6	4522478	4522483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254001
106111	NC_008380	GCC	2	6	4522512	4522517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254001
106112	NC_008380	TGGC	2	8	4522527	4522534	0 %	25 %	50 %	25 %	116254001
106113	NC_008380	GA	3	6	4522536	4522541	50 %	0 %	50 %	0 %	116254001
106114	NC_008380	TCG	3	9	4522582	4522590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254001
106115	NC_008380	AGCG	2	8	4522608	4522615	25 %	0 %	50 %	25 %	116254001
106116	NC_008380	TCA	2	6	4522684	4522689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254001
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106119	NC_008380	CGGC	2	8	4523020	4523027	0 %	0 %	50 %	50 %	116254001
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106219	NC_008380	CAA	2	6	4526733	4526738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106220	NC_008380	GGA	2	6	4526782	4526787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254005
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106222	NC_008380	ATC	2	6	4526874	4526879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254005
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106225	NC_008380	CTG	2	6	4526908	4526913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254005
106226	NC_008380	CTC	2	6	4526920	4526925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254005
106227	NC_008380	CGG	2	6	4526989	4526994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254005
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106338	NC_008380	GCG	2	6	4531617	4531622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106339	NC_008380	CTGT	2	8	4531656	4531663	0 %	50 %	25 %	25 %	116254011
106340	NC_008380	GCTG	2	8	4531689	4531696	0 %	25 %	50 %	25 %	116254011
106341	NC_008380	CTC	4	12	4531726	4531737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254011
106342	NC_008380	GC	3	6	4531830	4531835	0 %	0 %	50 %	50 %	116254011
106343	NC_008380	ATCG	2	8	4531853	4531860	25 %	25 %	25 %	25 %	116254011
106344	NC_008380	TGA	2	6	4531882	4531887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254011
106345	NC_008380	CTCGC	2	10	4531956	4531965	0 %	20 %	20 %	60 %	116254011
106346	NC_008380	GC	3	6	4531984	4531989	0 %	0 %	50 %	50 %	116254011
106347	NC_008380	CAC	2	6	4532033	4532038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254011
106348	NC_008380	CCG	2	6	4532044	4532049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254011
106349	NC_008380	CGA	2	6	4532072	4532077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254011
106350	NC_008380	CATC	2	8	4532086	4532093	25 %	25 %	0 %	50 %	116254011
106351	NC_008380	ATCTCG	2	12	4532110	4532121	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116254011
106352	NC_008380	CGA	2	6	4532122	4532127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254011
106353	NC_008380	TCG	2	6	4532185	4532190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254011
106354	NC_008380	CCA	2	6	4532221	4532226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254011
106355	NC_008380	TGA	2	6	4532293	4532298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254011
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106358	NC_008380	CA	3	6	4532395	4532400	50 %	0 %	0 %	50 %	116254011
106359	NC_008380	CGC	2	6	4532422	4532427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254011
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106361	NC_008380	TGC	2	6	4532491	4532496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254011
106362	NC_008380	CTG	2	6	4532547	4532552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254011
106363	NC_008380	CGA	2	6	4532558	4532563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254011
106364	NC_008380	GAAC	2	8	4532572	4532579	50 %	0 %	25 %	25 %	116254011
106365	NC_008380	GAC	2	6	4532613	4532618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254011
106366	NC_008380	GTC	2	6	4532619	4532624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254011
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106368	NC_008380	GCA	2	6	4532737	4532742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254011
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106371	NC_008380	CGC	2	6	4532829	4532834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106372	NC_008380	TTTTG	2	10	4532898	4532907	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
106373	NC_008380	CGGA	2	8	4532917	4532924	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106374	NC_008380	CAG	2	6	4532962	4532967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106375	NC_008380	CTT	2	6	4532980	4532985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254012
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106380	NC_008380	CGA	2	6	4533210	4533215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254012
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106391	NC_008380	CGGC	2	8	4533685	4533692	0 %	0 %	50 %	50 %	116254012
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106402	NC_008380	TCG	2	6	4534215	4534220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254012
106403	NC_008380	CGCC	2	8	4534228	4534235	0 %	0 %	25 %	75 %	116254012
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106443	NC_008380	CTG	2	6	4536056	4536061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254012
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106446	NC_008380	ATC	2	6	4536377	4536382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254013
106447	NC_008380	CG	3	6	4536390	4536395	0 %	0 %	50 %	50 %	116254013
106448	NC_008380	CAT	2	6	4536409	4536414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254013
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106451	NC_008380	CCG	2	6	4536455	4536460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254013
106452	NC_008380	CTGG	2	8	4536461	4536468	0 %	25 %	50 %	25 %	116254013
106453	NC_008380	TCC	2	6	4536484	4536489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254013
106454	NC_008380	CTG	2	6	4536505	4536510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254013
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106457	NC_008380	GCGTT	2	10	4536626	4536635	0 %	40 %	40 %	20 %	116254013
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