MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 118531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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104002	NC_008380	TCA	2	6	4435115	4435120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253920
104003	NC_008380	TGG	2	6	4435124	4435129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116253920
104004	NC_008380	GTT	2	6	4435138	4435143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116253920
104005	NC_008380	CAA	2	6	4435182	4435187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116253920
104006	NC_008380	GCC	2	6	4435191	4435196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253920
104007	NC_008380	CGG	2	6	4435353	4435358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253920
104008	NC_008380	CCA	2	6	4435379	4435384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116253920
104009	NC_008380	CCA	2	6	4435392	4435397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116253920
104010	NC_008380	CTG	2	6	4435480	4435485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253920
104011	NC_008380	TCT	2	6	4435496	4435501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116253920
104012	NC_008380	CAT	2	6	4435512	4435517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253920
104013	NC_008380	CCG	2	6	4435520	4435525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253920
104014	NC_008380	CGC	2	6	4435535	4435540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253920
104015	NC_008380	TGG	2	6	4435553	4435558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116253920
104016	NC_008380	GTC	3	9	4435564	4435572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253920
104017	NC_008380	TTG	2	6	4435589	4435594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116253920
104018	NC_008380	CGA	2	6	4435631	4435636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253920
104019	NC_008380	CTG	2	6	4435660	4435665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253920
104020	NC_008380	ACG	2	6	4435675	4435680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253920
104021	NC_008380	CGC	2	6	4435728	4435733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253920
104022	NC_008380	CG	3	6	4435773	4435778	0 %	0 %	50 %	50 %	116253920
104023	NC_008380	CGCAAA	2	12	4435786	4435797	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116253920
104024	NC_008380	CGC	2	6	4435803	4435808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253920
104025	NC_008380	AGG	2	6	4435825	4435830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104026	NC_008380	GCG	2	6	4435833	4435838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104027	NC_008380	GC	3	6	4435845	4435850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104028	NC_008380	CGG	2	6	4435939	4435944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104029	NC_008380	CCGG	2	8	4435968	4435975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104030	NC_008380	CATT	2	8	4436039	4436046	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104031	NC_008380	CA	4	8	4436053	4436060	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104032	NC_008380	GCGTCC	2	12	4436086	4436097	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116253921
104033	NC_008380	AAG	2	6	4436172	4436177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116253921
104034	NC_008380	CGG	2	6	4436180	4436185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253921
104035	NC_008380	TGGAA	2	10	4436278	4436287	40 %	20 %	40 %	0 %	116253921
104036	NC_008380	CGG	2	6	4436303	4436308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253921
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104038	NC_008380	GCC	2	6	4436456	4436461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253921
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104040	NC_008380	CGC	2	6	4436489	4436494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253921
104041	NC_008380	GCC	2	6	4436517	4436522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253921
104042	NC_008380	ACC	2	6	4436529	4436534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116253921
104043	NC_008380	CCGA	2	8	4436553	4436560	25 %	0 %	25 %	50 %	116253921
104044	NC_008380	CGA	2	6	4436681	4436686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253921
104045	NC_008380	TGA	2	6	4436692	4436697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116253921
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104047	NC_008380	TGGC	2	8	4436727	4436734	0 %	25 %	50 %	25 %	116253921
104048	NC_008380	TGA	2	6	4436899	4436904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116253921
104049	NC_008380	TTC	2	6	4436919	4436924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116253921
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104052	NC_008380	TGGAA	2	10	4437307	4437316	40 %	20 %	40 %	0 %	116253921
104053	NC_008380	GC	3	6	4437341	4437346	0 %	0 %	50 %	50 %	116253921
104054	NC_008380	AAG	2	6	4437366	4437371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116253921
104055	NC_008380	TCG	2	6	4437397	4437402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253921
104056	NC_008380	TCG	2	6	4437414	4437419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253921
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104058	NC_008380	CTCGC	2	10	4437486	4437495	0 %	20 %	20 %	60 %	116253921
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104063	NC_008380	GC	3	6	4437600	4437605	0 %	0 %	50 %	50 %	116253922
104064	NC_008380	GAAGCT	2	12	4437609	4437620	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116253922
104065	NC_008380	GCCG	2	8	4437745	4437752	0 %	0 %	50 %	50 %	116253922
104066	NC_008380	TCG	2	6	4437760	4437765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253922
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104069	NC_008380	CAT	2	6	4437885	4437890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253922
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104071	NC_008380	GCT	2	6	4437972	4437977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253922
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104073	NC_008380	CAT	2	6	4438044	4438049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253922
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104083	NC_008380	GC	3	6	4438576	4438581	0 %	0 %	50 %	50 %	116253922
104084	NC_008380	CGC	2	6	4438584	4438589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253922
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104088	NC_008380	AGC	2	6	4438850	4438855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253922
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104094	NC_008380	TTTG	2	8	4439098	4439105	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104095	NC_008380	GGTC	2	8	4439153	4439160	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104096	NC_008380	GTC	2	6	4439203	4439208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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104099	NC_008380	CGAC	2	8	4439295	4439302	25 %	0 %	25 %	50 %	116253923
104100	NC_008380	GCA	2	6	4439379	4439384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253923
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104102	NC_008380	CGC	2	6	4439560	4439565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253923
104103	NC_008380	GCA	2	6	4439581	4439586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253923
104104	NC_008380	GAA	2	6	4439600	4439605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116253923
104105	NC_008380	TCA	2	6	4439626	4439631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253923
104106	NC_008380	CGT	2	6	4439648	4439653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253923
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104109	NC_008380	TGT	2	6	4439866	4439871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116253923
104110	NC_008380	GCC	2	6	4439891	4439896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253923
104111	NC_008380	GCC	2	6	4439939	4439944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253923
104112	NC_008380	AAC	2	6	4440004	4440009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104113	NC_008380	GCA	2	6	4440255	4440260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253924
104114	NC_008380	ACT	2	6	4440285	4440290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253924
104115	NC_008380	ATCG	2	8	4440319	4440326	25 %	25 %	25 %	25 %	116253924
104116	NC_008380	GCA	2	6	4440349	4440354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253924
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104122	NC_008380	GCA	2	6	4440632	4440637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253924
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104273	NC_008380	CGA	2	6	4446821	4446826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253930
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104323	NC_008380	GGA	2	6	4448418	4448423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116253931
104324	NC_008380	CCG	2	6	4448429	4448434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253931
104325	NC_008380	TGA	2	6	4448444	4448449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116253931
104326	NC_008380	CCATT	2	10	4448540	4448549	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
104327	NC_008380	GAT	2	6	4448605	4448610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116253932
104328	NC_008380	T	6	6	4448635	4448640	0 %	100 %	0 %	0 %	116253932
104329	NC_008380	ATC	2	6	4448650	4448655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253932
104330	NC_008380	CTT	2	6	4448661	4448666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116253932
104331	NC_008380	TCCTTG	2	12	4448747	4448758	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	116253932
104332	NC_008380	GGCC	2	8	4448766	4448773	0 %	0 %	50 %	50 %	116253932
104333	NC_008380	CTTGCG	2	12	4448810	4448821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104334	NC_008380	TGT	2	6	4448834	4448839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104335	NC_008380	CCA	2	6	4448911	4448916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116253933
104336	NC_008380	CATC	2	8	4448923	4448930	25 %	25 %	0 %	50 %	116253933
104337	NC_008380	AGG	2	6	4448991	4448996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116253933
104338	NC_008380	CGTCAG	2	12	4449152	4449163	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116253933
104339	NC_008380	GAC	2	6	4449197	4449202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253933
104340	NC_008380	CGA	2	6	4449325	4449330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253933
104341	NC_008380	TGT	2	6	4449337	4449342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116253933
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104345	NC_008380	CTG	2	6	4449563	4449568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104346	NC_008380	TGA	2	6	4449660	4449665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104347	NC_008380	TGA	2	6	4449692	4449697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116253934
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