MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 118531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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102002	NC_008380	CAT	2	6	4350369	4350374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253848
102003	NC_008380	CAC	2	6	4350377	4350382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116253848
102004	NC_008380	TCCT	2	8	4350384	4350391	0 %	50 %	0 %	50 %	116253848
102005	NC_008380	GC	4	8	4350395	4350402	0 %	0 %	50 %	50 %	116253848
102006	NC_008380	AGCC	2	8	4350450	4350457	25 %	0 %	25 %	50 %	116253848
102007	NC_008380	CGC	2	6	4350461	4350466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253848
102008	NC_008380	CGC	2	6	4350475	4350480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253848
102009	NC_008380	GGA	2	6	4350497	4350502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116253848
102010	NC_008380	CGC	2	6	4350535	4350540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253848
102011	NC_008380	CAA	2	6	4350662	4350667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116253848
102012	NC_008380	CGA	2	6	4350691	4350696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253848
102013	NC_008380	ACG	2	6	4350705	4350710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253848
102014	NC_008380	GCG	2	6	4350736	4350741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253848
102015	NC_008380	CAT	2	6	4350761	4350766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253848
102016	NC_008380	CCGG	2	8	4350795	4350802	0 %	0 %	50 %	50 %	116253848
102017	NC_008380	CGC	2	6	4350832	4350837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253848
102018	NC_008380	CATG	2	8	4350869	4350876	25 %	25 %	25 %	25 %	116253848
102019	NC_008380	CGACC	2	10	4350923	4350932	20 %	0 %	20 %	60 %	116253848
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102021	NC_008380	TCG	3	9	4350961	4350969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253848
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102025	NC_008380	CGA	2	6	4351093	4351098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102026	NC_008380	CGG	2	6	4351129	4351134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102027	NC_008380	GCGT	2	8	4351144	4351151	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102028	NC_008380	CCT	2	6	4351168	4351173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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102043	NC_008380	CGA	2	6	4351946	4351951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253849
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102046	NC_008380	CAT	2	6	4352106	4352111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253849
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102048	NC_008380	GTTC	2	8	4352159	4352166	0 %	50 %	25 %	25 %	116253849
102049	NC_008380	GCGAC	2	10	4352189	4352198	20 %	0 %	40 %	40 %	116253849
102050	NC_008380	ACT	2	6	4352291	4352296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253849
102051	NC_008380	TGG	2	6	4352321	4352326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116253849
102052	NC_008380	CGA	2	6	4352354	4352359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253849
102053	NC_008380	CTG	2	6	4352371	4352376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253849
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102103	NC_008380	CAG	2	6	4354228	4354233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253851
102104	NC_008380	GC	3	6	4354251	4354256	0 %	0 %	50 %	50 %	116253851
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102110	NC_008380	GGC	2	6	4354461	4354466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253851
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102113	NC_008380	CAA	2	6	4354527	4354532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116253851
102114	NC_008380	CTG	2	6	4354552	4354557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253851
102115	NC_008380	TCGC	2	8	4354588	4354595	0 %	25 %	25 %	50 %	116253851
102116	NC_008380	GCC	2	6	4354612	4354617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253851
102117	NC_008380	CCG	2	6	4354640	4354645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253851
102118	NC_008380	CCGGCA	2	12	4354658	4354669	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116253851
102119	NC_008380	GC	3	6	4354691	4354696	0 %	0 %	50 %	50 %	116253851
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102121	NC_008380	CGA	2	6	4354782	4354787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253851
102122	NC_008380	CAT	2	6	4354827	4354832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253851
102123	NC_008380	CG	3	6	4354841	4354846	0 %	0 %	50 %	50 %	116253851
102124	NC_008380	TCT	2	6	4354883	4354888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116253851
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102126	NC_008380	CAA	2	6	4355043	4355048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116253851
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102128	NC_008380	GAG	2	6	4355283	4355288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116253852
102129	NC_008380	CGG	2	6	4355309	4355314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253852
102130	NC_008380	AGC	2	6	4355332	4355337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253852
102131	NC_008380	CGGCG	2	10	4355406	4355415	0 %	0 %	60 %	40 %	116253852
102132	NC_008380	ATT	2	6	4355476	4355481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116253852
102133	NC_008380	TCA	2	6	4355533	4355538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253852
102134	NC_008380	GC	3	6	4355548	4355553	0 %	0 %	50 %	50 %	116253852
102135	NC_008380	GTC	2	6	4355601	4355606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253852
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102139	NC_008380	CG	3	6	4355768	4355773	0 %	0 %	50 %	50 %	116253852
102140	NC_008380	CCG	3	9	4355809	4355817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253852
102141	NC_008380	GCC	2	6	4355878	4355883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253852
102142	NC_008380	CGATCT	2	12	4355887	4355898	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116253852
102143	NC_008380	GCC	2	6	4355910	4355915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253852
102144	NC_008380	CCT	2	6	4356046	4356051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116253852
102145	NC_008380	GAC	2	6	4356062	4356067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253852
102146	NC_008380	CCGA	2	8	4356183	4356190	25 %	0 %	25 %	50 %	116253852
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102150	NC_008380	CGAA	2	8	4356430	4356437	50 %	0 %	25 %	25 %	116253852
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102153	NC_008380	GGC	2	6	4356576	4356581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253852
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102155	NC_008380	CGA	2	6	4356782	4356787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253852
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102159	NC_008380	GCG	2	6	4356950	4356955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253852
102160	NC_008380	GCA	2	6	4356985	4356990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253852
102161	NC_008380	CGA	2	6	4357046	4357051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253852
102162	NC_008380	CCA	2	6	4357052	4357057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116253852
102163	NC_008380	TCA	2	6	4357111	4357116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253852
102164	NC_008380	CTAT	2	8	4357129	4357136	25 %	50 %	0 %	25 %	116253852
102165	NC_008380	CGG	2	6	4357211	4357216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253852
102166	NC_008380	GGCG	2	8	4357233	4357240	0 %	0 %	75 %	25 %	116253852
102167	NC_008380	CGG	2	6	4357259	4357264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253852
102168	NC_008380	GCC	2	6	4357289	4357294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253852
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102170	NC_008380	GAG	2	6	4357339	4357344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102171	NC_008380	GGCG	2	8	4357401	4357408	0 %	0 %	75 %	25 %	116253853
102172	NC_008380	ACCG	2	8	4357435	4357442	25 %	0 %	25 %	50 %	116253853
102173	NC_008380	GCCG	2	8	4357452	4357459	0 %	0 %	50 %	50 %	116253853
102174	NC_008380	CGG	2	6	4357467	4357472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253853
102175	NC_008380	CAT	2	6	4357482	4357487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253853
102176	NC_008380	CCG	2	6	4357524	4357529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253853
102177	NC_008380	CTT	2	6	4357593	4357598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116253853
102178	NC_008380	GCCA	2	8	4357636	4357643	25 %	0 %	25 %	50 %	116253853
102179	NC_008380	CAT	2	6	4357704	4357709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253853
102180	NC_008380	TGC	2	6	4357781	4357786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253853
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102182	NC_008380	CATG	2	8	4357866	4357873	25 %	25 %	25 %	25 %	116253853
102183	NC_008380	ATC	2	6	4357891	4357896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253853
102184	NC_008380	TCG	2	6	4357901	4357906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253853
102185	NC_008380	GCCG	2	8	4357911	4357918	0 %	0 %	50 %	50 %	116253853
102186	NC_008380	CCG	2	6	4357921	4357926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253853
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102189	NC_008380	CGC	2	6	4358016	4358021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253853
102190	NC_008380	CAT	2	6	4358055	4358060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253853
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102193	NC_008380	CGC	2	6	4358299	4358304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253853
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102198	NC_008380	GTC	2	6	4358488	4358493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253853
102199	NC_008380	GTC	2	6	4358509	4358514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253853
102200	NC_008380	CGG	2	6	4358548	4358553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253853
102201	NC_008380	GAT	2	6	4358586	4358591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116253853
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102205	NC_008380	CGT	2	6	4358938	4358943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253854
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102208	NC_008380	CGC	2	6	4358976	4358981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253854
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102210	NC_008380	GGC	2	6	4359033	4359038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253854
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102212	NC_008380	GCCTGC	2	12	4359146	4359157	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116253854
102213	NC_008380	CAC	2	6	4359171	4359176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116253854
102214	NC_008380	GGC	2	6	4359217	4359222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253854
102215	NC_008380	CAC	2	6	4359243	4359248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116253854
102216	NC_008380	CGA	2	6	4359327	4359332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253854
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102220	NC_008380	GAG	2	6	4359433	4359438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116253854
102221	NC_008380	TTC	2	6	4359460	4359465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116253854
102222	NC_008380	GAC	2	6	4359478	4359483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253854
102223	NC_008380	TCT	2	6	4359491	4359496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116253854
102224	NC_008380	TCA	2	6	4359500	4359505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253854
102225	NC_008380	TCG	2	6	4359536	4359541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253854
102226	NC_008380	TCG	2	6	4359560	4359565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253854
102227	NC_008380	TCG	2	6	4359581	4359586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253854
102228	NC_008380	GCC	2	6	4359604	4359609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253854
102229	NC_008380	GC	3	6	4359617	4359622	0 %	0 %	50 %	50 %	116253854
102230	NC_008380	GCC	2	6	4359638	4359643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253854
102231	NC_008380	TGCGA	2	10	4359709	4359718	20 %	20 %	40 %	20 %	116253854
102232	NC_008380	TCA	2	6	4359719	4359724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253854
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102235	NC_008380	CCG	2	6	4359915	4359920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253854
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102238	NC_008380	CCA	2	6	4360079	4360084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116253855
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102252	NC_008380	GGC	2	6	4360453	4360458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253855
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102254	NC_008380	CGG	2	6	4360575	4360580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253855
102255	NC_008380	CGG	2	6	4360797	4360802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253855
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102272	NC_008380	CGA	2	6	4361418	4361423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253855
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102275	NC_008380	CG	3	6	4361498	4361503	0 %	0 %	50 %	50 %	116253855
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102278	NC_008380	G	6	6	4361698	4361703	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
102279	NC_008380	CAT	2	6	4361779	4361784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253856
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102284	NC_008380	CTG	2	6	4361974	4361979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253856
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102322	NC_008380	CCTCC	2	10	4363687	4363696	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
102323	NC_008380	CGG	2	6	4363749	4363754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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102325	NC_008380	CGAC	2	8	4363883	4363890	25 %	0 %	25 %	50 %	116253857
102326	NC_008380	GC	3	6	4363920	4363925	0 %	0 %	50 %	50 %	116253857
102327	NC_008380	GGC	2	6	4363926	4363931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253857
102328	NC_008380	CGG	2	6	4363944	4363949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253857
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102331	NC_008380	CTGC	2	8	4364004	4364011	0 %	25 %	25 %	50 %	116253857
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102333	NC_008380	TGA	2	6	4364147	4364152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116253857
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102337	NC_008380	CGA	2	6	4364250	4364255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253857
102338	NC_008380	CGC	2	6	4364335	4364340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253858
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102457	NC_008380	CG	3	6	4368511	4368516	0 %	0 %	50 %	50 %	116253861
102458	NC_008380	GCA	2	6	4368587	4368592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253861
102459	NC_008380	CAT	2	6	4368753	4368758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253862
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102461	NC_008380	ATC	2	6	4368841	4368846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253862
102462	NC_008380	AGC	2	6	4368853	4368858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253862
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102484	NC_008380	CGT	2	6	4369705	4369710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253863
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102491	NC_008380	CAT	2	6	4369901	4369906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253863
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