MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 118531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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101002	NC_008380	GCA	2	6	4308124	4308129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253816
101003	NC_008380	CGG	2	6	4308159	4308164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253816
101004	NC_008380	TCG	3	9	4308165	4308173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253816
101005	NC_008380	GC	3	6	4308184	4308189	0 %	0 %	50 %	50 %	116253816
101006	NC_008380	AGC	2	6	4308207	4308212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253816
101007	NC_008380	ATG	2	6	4308267	4308272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116253816
101008	NC_008380	TCG	2	6	4308273	4308278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253816
101009	NC_008380	GC	3	6	4308311	4308316	0 %	0 %	50 %	50 %	116253816
101010	NC_008380	GCC	2	6	4308346	4308351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253816
101011	NC_008380	GCC	2	6	4308500	4308505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253816
101012	NC_008380	CG	3	6	4308541	4308546	0 %	0 %	50 %	50 %	116253816
101013	NC_008380	GTC	2	6	4308603	4308608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253816
101014	NC_008380	GTTC	2	8	4308637	4308644	0 %	50 %	25 %	25 %	116253816
101015	NC_008380	CGG	3	9	4308664	4308672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253816
101016	NC_008380	CGAG	2	8	4308676	4308683	25 %	0 %	50 %	25 %	116253816
101017	NC_008380	ATG	2	6	4308741	4308746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116253816
101018	NC_008380	CGC	2	6	4308766	4308771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253816
101019	NC_008380	ACG	2	6	4308789	4308794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253816
101020	NC_008380	TCG	2	6	4308795	4308800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253816
101021	NC_008380	CG	4	8	4308799	4308806	0 %	0 %	50 %	50 %	116253816
101022	NC_008380	ATC	2	6	4308807	4308812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253816
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101024	NC_008380	GGCG	2	8	4308854	4308861	0 %	0 %	75 %	25 %	116253816
101025	NC_008380	CGC	2	6	4308881	4308886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253816
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101027	NC_008380	CGC	2	6	4309170	4309175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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101032	NC_008380	CCA	2	6	4309412	4309417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116253817
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101034	NC_008380	CGA	2	6	4309545	4309550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253817
101035	NC_008380	CGA	2	6	4309569	4309574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253817
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101038	NC_008380	TGC	2	6	4309691	4309696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253817
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101088	NC_008380	TTG	2	6	4311859	4311864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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101109	NC_008380	ATG	2	6	4313269	4313274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101110	NC_008380	ACA	2	6	4313279	4313284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101111	NC_008380	ATA	2	6	4313303	4313308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101112	NC_008380	GCAG	2	8	4313345	4313352	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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101114	NC_008380	GGC	2	6	4313420	4313425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253820
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101117	NC_008380	CGA	2	6	4313534	4313539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253820
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101228	NC_008380	CTG	2	6	4317802	4317807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253822
101229	NC_008380	GCG	2	6	4317861	4317866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253822
101230	NC_008380	GCC	2	6	4317877	4317882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253822
101231	NC_008380	GC	4	8	4317911	4317918	0 %	0 %	50 %	50 %	116253822
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101337	NC_008380	CGC	2	6	4322423	4322428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253823
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101340	NC_008380	CGT	2	6	4322573	4322578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253823
101341	NC_008380	GGA	2	6	4322603	4322608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116253823
101342	NC_008380	CGG	2	6	4322641	4322646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253823
101343	NC_008380	ACC	2	6	4322706	4322711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116253823
101344	NC_008380	GCC	2	6	4322745	4322750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253823
101345	NC_008380	TCC	2	6	4322842	4322847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116253824
101346	NC_008380	TCC	2	6	4322908	4322913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116253824
101347	NC_008380	TGC	2	6	4322963	4322968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253824
101348	NC_008380	CGC	3	9	4323000	4323008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253824
101349	NC_008380	CGG	3	9	4323102	4323110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253824
101350	NC_008380	CG	3	6	4323158	4323163	0 %	0 %	50 %	50 %	116253824
101351	NC_008380	CCAG	2	8	4323164	4323171	25 %	0 %	25 %	50 %	116253824
101352	NC_008380	CG	3	6	4323200	4323205	0 %	0 %	50 %	50 %	116253824
101353	NC_008380	GATC	2	8	4323236	4323243	25 %	25 %	25 %	25 %	116253824
101354	NC_008380	CGAA	3	12	4323315	4323326	50 %	0 %	25 %	25 %	116253824
101355	NC_008380	CCG	2	6	4323338	4323343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253824
101356	NC_008380	GCTG	2	8	4323347	4323354	0 %	25 %	50 %	25 %	116253824
101357	NC_008380	TCC	2	6	4323364	4323369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116253824
101358	NC_008380	TCGA	2	8	4323433	4323440	25 %	25 %	25 %	25 %	116253824
101359	NC_008380	GC	4	8	4323448	4323455	0 %	0 %	50 %	50 %	116253824
101360	NC_008380	CAG	2	6	4323462	4323467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253824
101361	NC_008380	CAG	2	6	4323513	4323518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253824
101362	NC_008380	GCTG	2	8	4323554	4323561	0 %	25 %	50 %	25 %	116253824
101363	NC_008380	GCG	2	6	4323592	4323597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253824
101364	NC_008380	CGA	2	6	4323626	4323631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253824
101365	NC_008380	CTG	2	6	4323783	4323788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253825
101366	NC_008380	TGC	2	6	4323814	4323819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253825
101367	NC_008380	ATT	2	6	4323841	4323846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116253825
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101369	NC_008380	CG	3	6	4323907	4323912	0 %	0 %	50 %	50 %	116253825
101370	NC_008380	CTG	2	6	4323930	4323935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253825
101371	NC_008380	CTG	2	6	4323960	4323965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253825
101372	NC_008380	CTA	2	6	4323987	4323992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253825
101373	NC_008380	TCCTCT	2	12	4324051	4324062	0 %	50 %	0 %	50 %	116253825
101374	NC_008380	TGC	2	6	4324066	4324071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253825
101375	NC_008380	GTC	2	6	4324085	4324090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253825
101376	NC_008380	GGCG	2	8	4324109	4324116	0 %	0 %	75 %	25 %	116253825
101377	NC_008380	GCC	2	6	4324128	4324133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253825
101378	NC_008380	CTCGGC	2	12	4324139	4324150	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116253825
101379	NC_008380	CGC	2	6	4324177	4324182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253825
101380	NC_008380	TCG	2	6	4324186	4324191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253825
101381	NC_008380	CTG	2	6	4324194	4324199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253825
101382	NC_008380	CGG	2	6	4324208	4324213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253825
101383	NC_008380	GGC	2	6	4324218	4324223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253825
101384	NC_008380	CTG	2	6	4324251	4324256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253825
101385	NC_008380	GCT	2	6	4324259	4324264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253825
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101388	NC_008380	GTC	2	6	4324368	4324373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253825
101389	NC_008380	GTC	2	6	4324395	4324400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253825
101390	NC_008380	CGT	2	6	4324439	4324444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253825
101391	NC_008380	TCG	2	6	4324447	4324452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253825
101392	NC_008380	CTG	2	6	4324464	4324469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253825
101393	NC_008380	CAA	2	6	4324517	4324522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116253825
101394	NC_008380	ATCACC	2	12	4324533	4324544	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	116253825
101395	NC_008380	GAA	2	6	4324556	4324561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116253825
101396	NC_008380	GCG	2	6	4324573	4324578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253825
101397	NC_008380	CCA	2	6	4324646	4324651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116253825
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101399	NC_008380	CGC	2	6	4324707	4324712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253825
101400	NC_008380	CGA	2	6	4324730	4324735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253825
101401	NC_008380	GCC	2	6	4324737	4324742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253825
101402	NC_008380	CGTT	2	8	4324803	4324810	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101403	NC_008380	TGA	2	6	4324838	4324843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116253826
101404	NC_008380	GCA	2	6	4324943	4324948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253826
101405	NC_008380	TTC	2	6	4324954	4324959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116253826
101406	NC_008380	GCG	2	6	4324966	4324971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253826
101407	NC_008380	GCG	2	6	4325001	4325006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253826
101408	NC_008380	GC	3	6	4325014	4325019	0 %	0 %	50 %	50 %	116253826
101409	NC_008380	CGC	2	6	4325045	4325050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253826
101410	NC_008380	TCGA	2	8	4325107	4325114	25 %	25 %	25 %	25 %	116253826
101411	NC_008380	TCG	2	6	4325125	4325130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253826
101412	NC_008380	GA	3	6	4325279	4325284	50 %	0 %	50 %	0 %	116253826
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101415	NC_008380	GGC	2	6	4325358	4325363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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101426	NC_008380	CCG	2	6	4325993	4325998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253827
101427	NC_008380	TCG	2	6	4326001	4326006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253827
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101429	NC_008380	CTG	2	6	4326075	4326080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116253827
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101434	NC_008380	CTCGGC	2	12	4326234	4326245	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116253827
101435	NC_008380	GAT	2	6	4326335	4326340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116253827
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101437	NC_008380	TCACC	2	10	4326418	4326427	20 %	20 %	0 %	60 %	116253827
101438	NC_008380	ATC	2	6	4326430	4326435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253827
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101441	NC_008380	CGC	3	9	4326596	4326604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253827
101442	NC_008380	GAA	2	6	4326645	4326650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116253827
101443	NC_008380	CGC	2	6	4326662	4326667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253827
101444	NC_008380	CGG	2	6	4326775	4326780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253828
101445	NC_008380	GAT	2	6	4326782	4326787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116253828
101446	NC_008380	GCC	2	6	4326791	4326796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253828
101447	NC_008380	CCG	2	6	4326810	4326815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253828
101448	NC_008380	GGT	2	6	4326821	4326826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116253828
101449	NC_008380	GAT	2	6	4326827	4326832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116253828
101450	NC_008380	GCC	2	6	4326833	4326838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253828
101451	NC_008380	ATG	2	6	4326858	4326863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116253828
101452	NC_008380	CCG	2	6	4326864	4326869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116253828
101453	NC_008380	CAT	2	6	4326871	4326876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116253828
101454	NC_008380	CGA	3	9	4326895	4326903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253828
101455	NC_008380	CGG	2	6	4326916	4326921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253828
101456	NC_008380	AGC	2	6	4326924	4326929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116253828
101457	NC_008380	GCATAG	2	12	4326930	4326941	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116253828
101458	NC_008380	GCG	2	6	4327021	4327026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116253828
101459	NC_008380	GGT	2	6	4327028	4327033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116253828
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101474	NC_008380	AT	3	6	4327610	4327615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101475	NC_008380	TGCAA	2	10	4327629	4327638	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101476	NC_008380	TAG	2	6	4327639	4327644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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101480	NC_008380	T	8	8	4327724	4327731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101481	NC_008380	AG	3	6	4327767	4327772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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