MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 118531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008380	A	6	6	22144	22149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_008380	ATCA	2	8	22198	22205	50 %	25 %	0 %	25 %	116249791
503	NC_008380	CCGA	2	8	22252	22259	25 %	0 %	25 %	50 %	116249791
504	NC_008380	CGC	2	6	22274	22279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249791
505	NC_008380	GCG	2	6	22324	22329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249791
506	NC_008380	GACCTT	2	12	22362	22373	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116249791
507	NC_008380	TTC	2	6	22395	22400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249791
508	NC_008380	ATC	2	6	22414	22419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249791
509	NC_008380	CGA	3	9	22451	22459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249791
510	NC_008380	GCT	2	6	22526	22531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_008380	GGTGC	2	10	22567	22576	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
512	NC_008380	GCG	2	6	22712	22717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249792
513	NC_008380	CCT	2	6	22769	22774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249792
514	NC_008380	CGG	2	6	22782	22787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249792
515	NC_008380	GAC	2	6	22815	22820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249792
516	NC_008380	GCC	2	6	23014	23019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249792
517	NC_008380	CGC	2	6	23037	23042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249792
518	NC_008380	GCA	2	6	23081	23086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249792
519	NC_008380	GCCT	2	8	23099	23106	0 %	25 %	25 %	50 %	116249792
520	NC_008380	GCG	2	6	23147	23152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249792
521	NC_008380	GAC	2	6	23154	23159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249792
522	NC_008380	CAG	2	6	23160	23165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249792
523	NC_008380	GCC	2	6	23166	23171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249792
524	NC_008380	GCG	2	6	23234	23239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249792
525	NC_008380	CGAT	2	8	23296	23303	25 %	25 %	25 %	25 %	116249792
526	NC_008380	GTC	2	6	23400	23405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249792
527	NC_008380	ATC	2	6	23422	23427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249792
528	NC_008380	GTT	2	6	23442	23447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249792
529	NC_008380	CACG	2	8	23450	23457	25 %	0 %	25 %	50 %	116249792
530	NC_008380	GAC	2	6	23472	23477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249792
531	NC_008380	CGG	2	6	23486	23491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249792
532	NC_008380	CGG	2	6	23613	23618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249792
533	NC_008380	TCG	2	6	23620	23625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249792
534	NC_008380	CCG	2	6	23683	23688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249792
535	NC_008380	CGA	2	6	23690	23695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249792
536	NC_008380	TCG	2	6	23872	23877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249792
537	NC_008380	GCC	3	9	23918	23926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249792
538	NC_008380	CGG	2	6	24038	24043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249792
539	NC_008380	CGC	2	6	24080	24085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249792
540	NC_008380	GTC	2	6	24108	24113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249792
541	NC_008380	GA	3	6	24118	24123	50 %	0 %	50 %	0 %	116249792
542	NC_008380	CGG	2	6	24146	24151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249792
543	NC_008380	CAG	2	6	24198	24203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249792
544	NC_008380	CGC	2	6	24263	24268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249792
545	NC_008380	GCACCA	2	12	24317	24328	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	116249792
546	NC_008380	CGA	2	6	24368	24373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249792
547	NC_008380	CGA	2	6	24386	24391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249792
548	NC_008380	CCG	2	6	24414	24419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249792
549	NC_008380	CG	3	6	24418	24423	0 %	0 %	50 %	50 %	116249792
550	NC_008380	CGGC	2	8	24431	24438	0 %	0 %	50 %	50 %	116249792
551	NC_008380	GC	3	6	24437	24442	0 %	0 %	50 %	50 %	116249792
552	NC_008380	TCC	3	9	24475	24483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249792
553	NC_008380	CAC	2	6	24486	24491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249792
554	NC_008380	ATC	2	6	24505	24510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249792
555	NC_008380	GC	3	6	24575	24580	0 %	0 %	50 %	50 %	116249792
556	NC_008380	CG	4	8	24587	24594	0 %	0 %	50 %	50 %	116249792
557	NC_008380	CGG	2	6	24638	24643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249792
558	NC_008380	GGA	2	6	24672	24677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249792
559	NC_008380	CGC	3	9	24703	24711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249792
560	NC_008380	CTC	2	6	24723	24728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249792
561	NC_008380	GGAA	2	8	24755	24762	50 %	0 %	50 %	0 %	116249792
562	NC_008380	TCG	2	6	24778	24783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249792
563	NC_008380	AAC	2	6	24793	24798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249792
564	NC_008380	GAA	2	6	24831	24836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249792
565	NC_008380	GCGA	2	8	24844	24851	25 %	0 %	50 %	25 %	116249792
566	NC_008380	TCG	2	6	24892	24897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249792
567	NC_008380	AGG	2	6	24964	24969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249792
568	NC_008380	CGG	2	6	24971	24976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249792
569	NC_008380	GCTG	2	8	25004	25011	0 %	25 %	50 %	25 %	116249792
570	NC_008380	GCT	2	6	25013	25018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249792
571	NC_008380	CTC	2	6	25026	25031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249792
572	NC_008380	TGC	2	6	25116	25121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249792
573	NC_008380	GC	3	6	25127	25132	0 %	0 %	50 %	50 %	116249792
574	NC_008380	GAA	2	6	25188	25193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249792
575	NC_008380	GC	4	8	25250	25257	0 %	0 %	50 %	50 %	116249792
576	NC_008380	CCCG	2	8	25274	25281	0 %	0 %	25 %	75 %	116249792
577	NC_008380	CCT	2	6	25304	25309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249792
578	NC_008380	GA	3	6	25342	25347	50 %	0 %	50 %	0 %	116249792
579	NC_008380	CGC	2	6	25460	25465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249792
580	NC_008380	CTG	2	6	25467	25472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249792
581	NC_008380	GCC	3	9	25477	25485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249792
582	NC_008380	ACG	2	6	25491	25496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249792
583	NC_008380	CGA	2	6	25514	25519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249792
584	NC_008380	TCG	2	6	25549	25554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249792
585	NC_008380	GC	3	6	25632	25637	0 %	0 %	50 %	50 %	116249792
586	NC_008380	AGC	2	6	25645	25650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249792
587	NC_008380	CCG	2	6	25655	25660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249792
588	NC_008380	CG	3	6	25659	25664	0 %	0 %	50 %	50 %	116249792
589	NC_008380	TCG	2	6	25666	25671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249792
590	NC_008380	GCA	2	6	25718	25723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249792
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592	NC_008380	CGC	2	6	25926	25931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249792
593	NC_008380	AGC	3	9	25981	25989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249792
594	NC_008380	CTG	2	6	26079	26084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249792
595	NC_008380	TCG	2	6	26087	26092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249792
596	NC_008380	CGC	2	6	26151	26156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249793
597	NC_008380	GAT	2	6	26199	26204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249793
598	NC_008380	CGC	2	6	26211	26216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249793
599	NC_008380	GCA	2	6	26274	26279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249793
600	NC_008380	TCGA	2	8	26303	26310	25 %	25 %	25 %	25 %	116249793
601	NC_008380	CGG	2	6	26313	26318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249793
602	NC_008380	GC	3	6	26350	26355	0 %	0 %	50 %	50 %	116249793
603	NC_008380	GTT	2	6	26365	26370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249793
604	NC_008380	GACGCA	2	12	26400	26411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249793
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606	NC_008380	GAT	2	6	26551	26556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249793
607	NC_008380	GCTCCA	2	12	26622	26633	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116249793
608	NC_008380	GCC	2	6	26635	26640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249793
609	NC_008380	ATGCC	2	10	26666	26675	20 %	20 %	20 %	40 %	116249793
610	NC_008380	CG	3	6	26713	26718	0 %	0 %	50 %	50 %	116249793
611	NC_008380	GCC	2	6	26727	26732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249793
612	NC_008380	GCG	2	6	26748	26753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249793
613	NC_008380	CGC	2	6	26797	26802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249793
614	NC_008380	GAT	2	6	26851	26856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249793
615	NC_008380	GCCG	2	8	26967	26974	0 %	0 %	50 %	50 %	116249793
616	NC_008380	GCG	2	6	27012	27017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249793
617	NC_008380	CGAT	2	8	27059	27066	25 %	25 %	25 %	25 %	116249793
618	NC_008380	CCG	2	6	27128	27133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249793
619	NC_008380	CAG	2	6	27139	27144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249793
620	NC_008380	GC	4	8	27192	27199	0 %	0 %	50 %	50 %	116249793
621	NC_008380	CGG	2	6	27268	27273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249793
622	NC_008380	TCA	2	6	27294	27299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249793
623	NC_008380	TTG	2	6	27317	27322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249793
624	NC_008380	CGG	2	6	27456	27461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249793
625	NC_008380	ATG	2	6	27473	27478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249793
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627	NC_008380	GCG	2	6	27542	27547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249793
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754	NC_008380	GCC	2	6	32767	32772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249796
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