MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 118531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_008380	TGC	2	6	320917	320922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250053
7502	NC_008380	TGCCGA	2	12	320956	320967	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116250053
7503	NC_008380	CCG	2	6	320968	320973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250053
7504	NC_008380	CGG	2	6	321064	321069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250053
7505	NC_008380	GGCT	2	8	321114	321121	0 %	25 %	50 %	25 %	116250053
7506	NC_008380	CGG	2	6	321155	321160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250053
7507	NC_008380	TCAG	2	8	321190	321197	25 %	25 %	25 %	25 %	116250053
7508	NC_008380	GAT	2	6	321203	321208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250053
7509	NC_008380	ATC	2	6	321296	321301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116250054
7510	NC_008380	GCC	2	6	321328	321333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250054
7511	NC_008380	TCG	2	6	321425	321430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250054
7512	NC_008380	GC	4	8	321508	321515	0 %	0 %	50 %	50 %	116250054
7513	NC_008380	TCG	2	6	321518	321523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250054
7514	NC_008380	CGC	2	6	321552	321557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250054
7515	NC_008380	GCCC	2	8	321582	321589	0 %	0 %	25 %	75 %	116250054
7516	NC_008380	GCG	2	6	321678	321683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250054
7517	NC_008380	TCGG	2	8	321698	321705	0 %	25 %	50 %	25 %	116250054
7518	NC_008380	GCC	2	6	321748	321753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250054
7519	NC_008380	GGC	2	6	321883	321888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250054
7520	NC_008380	CG	3	6	321909	321914	0 %	0 %	50 %	50 %	116250054
7521	NC_008380	TCG	2	6	321965	321970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250054
7522	NC_008380	ACC	2	6	321977	321982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116250054
7523	NC_008380	TCT	2	6	322041	322046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116250054
7524	NC_008380	CAG	2	6	322117	322122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250054
7525	NC_008380	GCC	2	6	322154	322159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250054
7526	NC_008380	AGCC	2	8	322193	322200	25 %	0 %	25 %	50 %	116250054
7527	NC_008380	TCG	2	6	322220	322225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250054
7528	NC_008380	GC	3	6	322240	322245	0 %	0 %	50 %	50 %	116250054
7529	NC_008380	CGT	2	6	322249	322254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250054
7530	NC_008380	TCG	2	6	322259	322264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250054
7531	NC_008380	TGCAGC	2	12	322376	322387	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116250054
7532	NC_008380	GCG	2	6	322524	322529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7533	NC_008380	GC	3	6	322538	322543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7534	NC_008380	GGCA	2	8	322603	322610	25 %	0 %	50 %	25 %	116250055
7535	NC_008380	CGG	2	6	322677	322682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250055
7536	NC_008380	TGTCGC	2	12	322749	322760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250055
7537	NC_008380	CGA	2	6	322812	322817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250055
7538	NC_008380	CCGT	2	8	322847	322854	0 %	25 %	25 %	50 %	116250055
7539	NC_008380	AGG	2	6	322959	322964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116250055
7540	NC_008380	TCCA	2	8	322973	322980	25 %	25 %	0 %	50 %	116250055
7541	NC_008380	TC	3	6	323009	323014	0 %	50 %	0 %	50 %	116250055
7542	NC_008380	TCC	2	6	323042	323047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116250055
7543	NC_008380	GCT	2	6	323065	323070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250055
7544	NC_008380	TCC	2	6	323099	323104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116250055
7545	NC_008380	GCA	2	6	323112	323117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250055
7546	NC_008380	AGC	2	6	323210	323215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250055
7547	NC_008380	GC	3	6	323225	323230	0 %	0 %	50 %	50 %	116250055
7548	NC_008380	GAT	2	6	323247	323252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250055
7549	NC_008380	ACG	2	6	323290	323295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250055
7550	NC_008380	GCG	2	6	323327	323332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250055
7551	NC_008380	AGAT	2	8	323340	323347	50 %	25 %	25 %	0 %	116250055
7552	NC_008380	CAT	2	6	323413	323418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116250056
7553	NC_008380	GC	3	6	323419	323424	0 %	0 %	50 %	50 %	116250056
7554	NC_008380	GGC	2	6	323464	323469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250056
7555	NC_008380	GCC	2	6	323476	323481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250056
7556	NC_008380	GC	3	6	323513	323518	0 %	0 %	50 %	50 %	116250056
7557	NC_008380	GAG	2	6	323552	323557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116250056
7558	NC_008380	GCT	2	6	323590	323595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250056
7559	NC_008380	GTG	2	6	323663	323668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116250056
7560	NC_008380	GCCG	2	8	323678	323685	0 %	0 %	50 %	50 %	116250056
7561	NC_008380	ATCG	2	8	323722	323729	25 %	25 %	25 %	25 %	116250056
7562	NC_008380	AGGCGA	2	12	323763	323774	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	116250056
7563	NC_008380	ATG	2	6	323832	323837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_008380	TCG	2	6	323838	323843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7565	NC_008380	CAT	2	6	323867	323872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7566	NC_008380	GCG	2	6	323896	323901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250057
7567	NC_008380	GGC	2	6	323994	323999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250057
7568	NC_008380	GCC	2	6	324048	324053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250057
7569	NC_008380	TCGGCA	2	12	324076	324087	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116250057
7570	NC_008380	TCA	2	6	324092	324097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116250057
7571	NC_008380	CTT	2	6	324132	324137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116250057
7572	NC_008380	ACG	3	9	324163	324171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250057
7573	NC_008380	GCG	2	6	324221	324226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250057
7574	NC_008380	GCC	2	6	324244	324249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250057
7575	NC_008380	GCCT	2	8	324309	324316	0 %	25 %	25 %	50 %	116250057
7576	NC_008380	AAG	2	6	324321	324326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116250057
7577	NC_008380	CG	4	8	324333	324340	0 %	0 %	50 %	50 %	116250057
7578	NC_008380	TCT	2	6	324355	324360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7579	NC_008380	GCC	2	6	324378	324383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7580	NC_008380	ATC	2	6	324468	324473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116250058
7581	NC_008380	GGT	2	6	324551	324556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116250058
7582	NC_008380	GGCC	2	8	324583	324590	0 %	0 %	50 %	50 %	116250058
7583	NC_008380	TCG	2	6	324591	324596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250058
7584	NC_008380	TTC	2	6	324668	324673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116250058
7585	NC_008380	CTT	2	6	324689	324694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116250058
7586	NC_008380	CGAT	2	8	324740	324747	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7587	NC_008380	TGA	2	6	324755	324760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7588	NC_008380	CGA	2	6	324825	324830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7589	NC_008380	AGGC	2	8	324834	324841	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7590	NC_008380	TCG	2	6	324901	324906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250059
7591	NC_008380	TCA	2	6	324917	324922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116250059
7592	NC_008380	CGC	2	6	324926	324931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250059
7593	NC_008380	GCC	2	6	324932	324937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250059
7594	NC_008380	GCG	2	6	324980	324985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250059
7595	NC_008380	TGC	2	6	324998	325003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250059
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7597	NC_008380	TCG	2	6	325031	325036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250059
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7601	NC_008380	CGC	2	6	325158	325163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250059
7602	NC_008380	CCT	2	6	325346	325351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116250059
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7604	NC_008380	GCC	2	6	325417	325422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250059
7605	NC_008380	TCG	2	6	325438	325443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250059
7606	NC_008380	TCG	2	6	325468	325473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250059
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7609	NC_008380	GCA	3	9	325766	325774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250059
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7613	NC_008380	GCAAGC	2	12	325987	325998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7614	NC_008380	CAT	2	6	326011	326016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7615	NC_008380	AGC	2	6	326028	326033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250060
7616	NC_008380	CGAT	2	8	326040	326047	25 %	25 %	25 %	25 %	116250060
7617	NC_008380	GT	3	6	326116	326121	0 %	50 %	50 %	0 %	116250060
7618	NC_008380	AGC	2	6	326250	326255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250060
7619	NC_008380	GCCTT	2	10	326292	326301	0 %	40 %	20 %	40 %	116250060
7620	NC_008380	GC	3	6	326344	326349	0 %	0 %	50 %	50 %	116250060
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7622	NC_008380	TTC	2	6	326402	326407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116250060
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7988	NC_008380	GCA	2	6	342326	342331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250076
7989	NC_008380	CGA	2	6	342362	342367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250076
7990	NC_008380	GATC	2	8	342446	342453	25 %	25 %	25 %	25 %	116250076
7991	NC_008380	CAA	2	6	342492	342497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116250076
7992	NC_008380	GTT	2	6	342538	342543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116250076
7993	NC_008380	TTC	2	6	342561	342566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116250076
7994	NC_008380	T	6	6	342617	342622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7995	NC_008380	GCC	2	6	342630	342635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7996	NC_008380	GTCG	2	8	342705	342712	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7997	NC_008380	GGAA	2	8	342802	342809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7998	NC_008380	AC	3	6	342833	342838	50 %	0 %	0 %	50 %	116250077
7999	NC_008380	TGC	2	6	342863	342868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250077
8000	NC_008380	GGT	2	6	342918	342923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116250077

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