MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 118531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_008380	GCC	2	6	299588	299593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250031
7002	NC_008380	GAC	2	6	299597	299602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250031
7003	NC_008380	CAT	2	6	299653	299658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116250031
7004	NC_008380	CGG	2	6	299668	299673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250031
7005	NC_008380	CCG	3	9	299727	299735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250031
7006	NC_008380	TCG	2	6	299736	299741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250031
7007	NC_008380	TCT	2	6	299742	299747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116250031
7008	NC_008380	GC	3	6	299803	299808	0 %	0 %	50 %	50 %	116250031
7009	NC_008380	GGT	2	6	299818	299823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116250031
7010	NC_008380	CGG	3	9	299827	299835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250031
7011	NC_008380	GCA	2	6	299921	299926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_008380	CCG	2	6	300007	300012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7013	NC_008380	GC	3	6	300048	300053	0 %	0 %	50 %	50 %	116250032
7014	NC_008380	CGGC	2	8	300092	300099	0 %	0 %	50 %	50 %	116250032
7015	NC_008380	CGG	2	6	300159	300164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250032
7016	NC_008380	CGG	2	6	300192	300197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250032
7017	NC_008380	ACG	2	6	300242	300247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250032
7018	NC_008380	TCA	2	6	300249	300254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116250032
7019	NC_008380	GCG	2	6	300292	300297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250032
7020	NC_008380	CGG	2	6	300327	300332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250032
7021	NC_008380	CTG	2	6	300563	300568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250032
7022	NC_008380	GGC	2	6	300580	300585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250032
7023	NC_008380	CAT	2	6	300607	300612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116250032
7024	NC_008380	TTAT	2	8	300665	300672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_008380	CTT	2	6	300716	300721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7026	NC_008380	GGA	2	6	300723	300728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_008380	TGA	2	6	300829	300834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250033
7028	NC_008380	GAT	2	6	300838	300843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250033
7029	NC_008380	CAC	2	6	300922	300927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116250033
7030	NC_008380	TCG	2	6	300929	300934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250033
7031	NC_008380	CGCATG	2	12	300961	300972	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116250033
7032	NC_008380	GAT	2	6	301027	301032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250033
7033	NC_008380	GGGC	2	8	301197	301204	0 %	0 %	75 %	25 %	116250033
7034	NC_008380	GCC	2	6	301234	301239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250033
7035	NC_008380	GCC	2	6	301279	301284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250033
7036	NC_008380	CGA	2	6	301288	301293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250033
7037	NC_008380	CGA	2	6	301296	301301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250033
7038	NC_008380	CCT	2	6	301344	301349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116250033
7039	NC_008380	CCAG	2	8	301350	301357	25 %	0 %	25 %	50 %	116250033
7040	NC_008380	GCC	2	6	301384	301389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250033
7041	NC_008380	CCG	2	6	301440	301445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250033
7042	NC_008380	CGC	2	6	301567	301572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250033
7043	NC_008380	TGT	2	6	301642	301647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_008380	GAT	2	6	301705	301710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_008380	TGC	2	6	301769	301774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250034
7046	NC_008380	GAG	2	6	301793	301798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116250034
7047	NC_008380	GGAC	2	8	301843	301850	25 %	0 %	50 %	25 %	116250034
7048	NC_008380	GA	3	6	301905	301910	50 %	0 %	50 %	0 %	116250034
7049	NC_008380	CGT	2	6	301918	301923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250034
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7051	NC_008380	TCG	2	6	301971	301976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250034
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7053	NC_008380	GC	3	6	302063	302068	0 %	0 %	50 %	50 %	116250034
7054	NC_008380	AGA	2	6	302076	302081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116250034
7055	NC_008380	TCG	2	6	302082	302087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250034
7056	NC_008380	CTT	2	6	302161	302166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116250034
7057	NC_008380	CGA	2	6	302167	302172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250034
7058	NC_008380	CAAGGT	2	12	302179	302190	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116250034
7059	NC_008380	CCA	2	6	302221	302226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116250034
7060	NC_008380	GCA	2	6	302248	302253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250034
7061	NC_008380	GCC	2	6	302310	302315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250034
7062	NC_008380	GAT	3	9	302317	302325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250034
7063	NC_008380	GGC	2	6	302381	302386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_008380	TCC	2	6	302428	302433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7065	NC_008380	GC	3	6	302471	302476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7066	NC_008380	TCG	2	6	302532	302537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7067	NC_008380	CAA	3	9	302552	302560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_008380	TTG	2	6	302574	302579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_008380	T	6	6	302614	302619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_008380	GC	3	6	302626	302631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7071	NC_008380	GGA	2	6	302634	302639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_008380	AAG	2	6	302686	302691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116250035
7073	NC_008380	GCTGCC	2	12	302725	302736	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116250035
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7075	NC_008380	AAG	2	6	302940	302945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116250036
7076	NC_008380	GCC	2	6	302974	302979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250036
7077	NC_008380	GCT	2	6	303006	303011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250036
7078	NC_008380	CAA	2	6	303053	303058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116250036
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7080	NC_008380	TC	3	6	303179	303184	0 %	50 %	0 %	50 %	116250036
7081	NC_008380	GC	3	6	303217	303222	0 %	0 %	50 %	50 %	116250036
7082	NC_008380	AAG	2	6	303237	303242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116250036
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7084	NC_008380	GCCG	2	8	303393	303400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7085	NC_008380	GCC	2	6	303403	303408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7086	NC_008380	CGCC	2	8	303420	303427	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7087	NC_008380	AAG	2	6	303442	303447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7088	NC_008380	GCT	2	6	303482	303487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250037
7089	NC_008380	GCC	2	6	303501	303506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250037
7090	NC_008380	AAG	2	6	303552	303557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116250037
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7094	NC_008380	CCGC	2	8	303667	303674	0 %	0 %	25 %	75 %	116250037
7095	NC_008380	GAC	2	6	303677	303682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250037
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7098	NC_008380	ATCC	2	8	303774	303781	25 %	25 %	0 %	50 %	116250037
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7106	NC_008380	GAA	2	6	304155	304160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116250037
7107	NC_008380	CTT	2	6	304172	304177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116250037
7108	NC_008380	CTT	2	6	304214	304219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116250037
7109	NC_008380	CCT	2	6	304234	304239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116250037
7110	NC_008380	TGGA	2	8	304302	304309	25 %	25 %	50 %	0 %	116250037
7111	NC_008380	TGC	2	6	304342	304347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250037
7112	NC_008380	CGG	2	6	304352	304357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250037
7113	NC_008380	ATCGC	2	10	304405	304414	20 %	20 %	20 %	40 %	116250037
7114	NC_008380	CTT	2	6	304448	304453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116250037
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7116	NC_008380	CGG	2	6	304517	304522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250037
7117	NC_008380	CGA	2	6	304656	304661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250038
7118	NC_008380	GGC	2	6	304665	304670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250038
7119	NC_008380	GTC	2	6	304696	304701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250038
7120	NC_008380	GTC	2	6	304777	304782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250038
7121	NC_008380	GCG	2	6	304784	304789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250038
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7123	NC_008380	TCG	2	6	304811	304816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250038
7124	NC_008380	ATG	2	6	304903	304908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250038
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7132	NC_008380	CTCGAT	2	12	305170	305181	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116250038
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7242	NC_008380	GCC	2	6	309540	309545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7243	NC_008380	TGC	2	6	309595	309600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250042
7244	NC_008380	GTG	2	6	309602	309607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116250042
7245	NC_008380	CGA	2	6	309669	309674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250042
7246	NC_008380	CCT	2	6	309675	309680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116250042
7247	NC_008380	TCC	2	6	309797	309802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116250042
7248	NC_008380	CTG	2	6	309886	309891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250042
7249	NC_008380	CTT	2	6	309940	309945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116250042
7250	NC_008380	GCG	2	6	309962	309967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250042
7251	NC_008380	CG	3	6	309966	309971	0 %	0 %	50 %	50 %	116250042
7252	NC_008380	GC	3	6	309986	309991	0 %	0 %	50 %	50 %	116250042
7253	NC_008380	AGA	2	6	310035	310040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116250042
7254	NC_008380	GCG	2	6	310103	310108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7255	NC_008380	AAG	2	6	310116	310121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7256	NC_008380	AGA	2	6	310122	310127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7257	NC_008380	CGAT	2	8	310144	310151	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7258	NC_008380	GAT	2	6	310181	310186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7259	NC_008380	GGA	2	6	310244	310249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116250043
7260	NC_008380	CTT	2	6	310277	310282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116250043
7261	NC_008380	AACTG	2	10	310480	310489	40 %	20 %	20 %	20 %	116250043
7262	NC_008380	CCG	2	6	310507	310512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250043
7263	NC_008380	TGC	2	6	310556	310561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250043
7264	NC_008380	TGCCG	2	10	310571	310580	0 %	20 %	40 %	40 %	116250043
7265	NC_008380	TGG	2	6	310629	310634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116250043
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7268	NC_008380	CG	3	6	310883	310888	0 %	0 %	50 %	50 %	116250044
7269	NC_008380	GTTCT	2	10	310889	310898	0 %	60 %	20 %	20 %	116250044
7270	NC_008380	GCTC	2	8	310899	310906	0 %	25 %	25 %	50 %	116250044
7271	NC_008380	GCCC	2	8	310970	310977	0 %	0 %	25 %	75 %	116250044
7272	NC_008380	CG	3	6	310989	310994	0 %	0 %	50 %	50 %	116250044
7273	NC_008380	CGA	2	6	311004	311009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250044
7274	NC_008380	CAT	2	6	311080	311085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116250044
7275	NC_008380	CGT	2	6	311181	311186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250044
7276	NC_008380	GGC	2	6	311200	311205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250044
7277	NC_008380	GGGC	2	8	311237	311244	0 %	0 %	75 %	25 %	116250044
7278	NC_008380	TCTT	2	8	311272	311279	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7279	NC_008380	AGC	2	6	311299	311304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250045
7280	NC_008380	CAT	2	6	311312	311317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116250045
7281	NC_008380	CTT	2	6	311400	311405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116250045
7282	NC_008380	GCA	2	6	311408	311413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250045
7283	NC_008380	GCGA	2	8	311419	311426	25 %	0 %	50 %	25 %	116250045
7284	NC_008380	CCG	2	6	311432	311437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250045
7285	NC_008380	GTC	2	6	311496	311501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250045
7286	NC_008380	TGC	2	6	311552	311557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250045
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7288	NC_008380	TGA	2	6	311600	311605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250045
7289	NC_008380	GAAG	2	8	311727	311734	50 %	0 %	50 %	0 %	116250045
7290	NC_008380	CAT	2	6	311750	311755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116250045
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7293	NC_008380	GCG	2	6	311828	311833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250045
7294	NC_008380	GA	3	6	311854	311859	50 %	0 %	50 %	0 %	116250045
7295	NC_008380	CTTGG	2	10	311997	312006	0 %	40 %	40 %	20 %	116250045
7296	NC_008380	GAT	2	6	312021	312026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250045
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7300	NC_008380	GAA	2	6	312108	312113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116250045
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7313	NC_008380	CGC	2	6	312729	312734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250046
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7316	NC_008380	CGG	4	12	312909	312920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250046
7317	NC_008380	GAGCT	2	10	313066	313075	20 %	20 %	40 %	20 %	116250046
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7321	NC_008380	CG	3	6	313501	313506	0 %	0 %	50 %	50 %	116250047
7322	NC_008380	GAA	2	6	313528	313533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116250047
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7334	NC_008380	AGC	2	6	314047	314052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250048
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7341	NC_008380	ATC	2	6	314443	314448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116250048
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7347	NC_008380	GCCGTC	2	12	314598	314609	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116250048
7348	NC_008380	GAT	2	6	314613	314618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250048
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7352	NC_008380	TTG	2	6	314740	314745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116250048
7353	NC_008380	GCA	2	6	314761	314766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250048
7354	NC_008380	TCG	2	6	314807	314812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250048
7355	NC_008380	TAA	2	6	314927	314932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7356	NC_008380	CGG	3	9	314991	314999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7357	NC_008380	TCC	2	6	315066	315071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116250049
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7359	NC_008380	CTG	2	6	315126	315131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250049
7360	NC_008380	GCC	3	9	315174	315182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250049
7361	NC_008380	TCA	2	6	315187	315192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116250049
7362	NC_008380	ATG	3	9	315232	315240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250049
7363	NC_008380	TCG	2	6	315250	315255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250049
7364	NC_008380	CGG	2	6	315320	315325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250049
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7366	NC_008380	TTC	2	6	315381	315386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116250049
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7482	NC_008380	CGGCG	2	10	320066	320075	0 %	0 %	60 %	40 %	116250052
7483	NC_008380	GGA	2	6	320100	320105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116250052
7484	NC_008380	TCAT	2	8	320286	320293	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7485	NC_008380	AAG	2	6	320311	320316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7486	NC_008380	GCA	2	6	320419	320424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250053
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7488	NC_008380	TGC	2	6	320479	320484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250053
7489	NC_008380	GC	3	6	320483	320488	0 %	0 %	50 %	50 %	116250053
7490	NC_008380	GCCG	2	8	320492	320499	0 %	0 %	50 %	50 %	116250053
7491	NC_008380	TGC	2	6	320503	320508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250053
7492	NC_008380	TGG	2	6	320544	320549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116250053
7493	NC_008380	GC	3	6	320569	320574	0 %	0 %	50 %	50 %	116250053
7494	NC_008380	TTC	2	6	320586	320591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116250053
7495	NC_008380	GGC	2	6	320628	320633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250053
7496	NC_008380	CTGG	2	8	320724	320731	0 %	25 %	50 %	25 %	116250053
7497	NC_008380	CTG	2	6	320757	320762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250053
7498	NC_008380	CGC	2	6	320853	320858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250053
7499	NC_008380	GCC	2	6	320864	320869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250053
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