MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 118531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_008380	CAC	2	6	278102	278107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116250006
6502	NC_008380	CGG	2	6	278123	278128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250006
6503	NC_008380	CGT	3	9	278155	278163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250006
6504	NC_008380	ATC	2	6	278181	278186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116250006
6505	NC_008380	TCGA	2	8	278214	278221	25 %	25 %	25 %	25 %	116250006
6506	NC_008380	GATGTC	2	12	278240	278251	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116250006
6507	NC_008380	CGT	2	6	278272	278277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250006
6508	NC_008380	GGC	2	6	278285	278290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250006
6509	NC_008380	GCC	2	6	278318	278323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250006
6510	NC_008380	GC	3	6	278324	278329	0 %	0 %	50 %	50 %	116250006
6511	NC_008380	GAT	2	6	278342	278347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250006
6512	NC_008380	GAT	2	6	278408	278413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250006
6513	NC_008380	CCAT	2	8	278422	278429	25 %	25 %	0 %	50 %	116250006
6514	NC_008380	TTG	2	6	278483	278488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116250006
6515	NC_008380	TGG	2	6	278563	278568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116250006
6516	NC_008380	CTGTT	2	10	278625	278634	0 %	60 %	20 %	20 %	116250007
6517	NC_008380	CCGC	2	8	278644	278651	0 %	0 %	25 %	75 %	116250007
6518	NC_008380	AGC	2	6	278663	278668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250007
6519	NC_008380	CG	3	6	278728	278733	0 %	0 %	50 %	50 %	116250007
6520	NC_008380	AGA	3	9	278802	278810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116250007
6521	NC_008380	CG	4	8	278811	278818	0 %	0 %	50 %	50 %	116250007
6522	NC_008380	CTG	2	6	278842	278847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250007
6523	NC_008380	GGT	2	6	278860	278865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116250007
6524	NC_008380	CGA	2	6	279000	279005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250007
6525	NC_008380	GCC	2	6	279041	279046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250007
6526	NC_008380	TCG	2	6	279080	279085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250007
6527	NC_008380	GCG	2	6	279155	279160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250007
6528	NC_008380	GCC	2	6	279178	279183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250007
6529	NC_008380	CGT	2	6	279190	279195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250007
6530	NC_008380	CGGCG	2	10	279246	279255	0 %	0 %	60 %	40 %	116250007
6531	NC_008380	CAG	2	6	279328	279333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250007
6532	NC_008380	GAT	2	6	279373	279378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250007
6533	NC_008380	CTCG	2	8	279412	279419	0 %	25 %	25 %	50 %	116250007
6534	NC_008380	GCA	2	6	279441	279446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250007
6535	NC_008380	CGA	2	6	279450	279455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250007
6536	NC_008380	TCG	2	6	279527	279532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250007
6537	NC_008380	CGCCGA	2	12	279537	279548	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116250007
6538	NC_008380	AGA	2	6	279735	279740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116250007
6539	NC_008380	TTGAA	2	10	279768	279777	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_008380	CCA	2	6	279797	279802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6541	NC_008380	ATG	3	9	279834	279842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_008380	CCG	2	6	280006	280011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6543	NC_008380	ACC	2	6	280056	280061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116250008
6544	NC_008380	GAT	2	6	280065	280070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250008
6545	NC_008380	CAA	2	6	280088	280093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116250008
6546	NC_008380	ATC	2	6	280212	280217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116250008
6547	NC_008380	CCG	2	6	280225	280230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250008
6548	NC_008380	CCA	2	6	280261	280266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116250008
6549	NC_008380	GAT	2	6	280310	280315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250008
6550	NC_008380	GGCAAG	2	12	280344	280355	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	116250008
6551	NC_008380	CCG	2	6	280456	280461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250008
6552	NC_008380	GGTCAT	2	12	280505	280516	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116250008
6553	NC_008380	TGA	2	6	280550	280555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250008
6554	NC_008380	CGC	2	6	280570	280575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250008
6555	NC_008380	GACG	2	8	280580	280587	25 %	0 %	50 %	25 %	116250008
6556	NC_008380	TCG	2	6	280597	280602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250008
6557	NC_008380	CAT	2	6	280739	280744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116250008
6558	NC_008380	TC	3	6	280760	280765	0 %	50 %	0 %	50 %	116250008
6559	NC_008380	GGC	2	6	280776	280781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250008
6560	NC_008380	TG	3	6	280791	280796	0 %	50 %	50 %	0 %	116250008
6561	NC_008380	ATCAA	2	10	280822	280831	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6562	NC_008380	TCG	2	6	280838	280843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6563	NC_008380	ACG	2	6	280910	280915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250009
6564	NC_008380	ACTGA	2	10	280918	280927	40 %	20 %	20 %	20 %	116250009
6565	NC_008380	CCG	2	6	280976	280981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250009
6566	NC_008380	T	7	7	280985	280991	0 %	100 %	0 %	0 %	116250009
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6569	NC_008380	GAT	2	6	281029	281034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250009
6570	NC_008380	CAT	2	6	281040	281045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116250009
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6572	NC_008380	GGA	2	6	281133	281138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116250009
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6581	NC_008380	GGC	3	9	281550	281558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6583	NC_008380	TTGAA	2	10	281639	281648	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_008380	ACG	2	6	281670	281675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6593	NC_008380	CGT	2	6	282252	282257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250010
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6609	NC_008380	TGA	2	6	282986	282991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116250011
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6612	NC_008380	GC	3	6	283252	283257	0 %	0 %	50 %	50 %	116250011
6613	NC_008380	CGGCT	2	10	283278	283287	0 %	20 %	40 %	40 %	116250011
6614	NC_008380	ATGC	2	8	283293	283300	25 %	25 %	25 %	25 %	116250011
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6617	NC_008380	CCG	2	6	283457	283462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6618	NC_008380	GGAA	2	8	283465	283472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_008380	CGGCA	2	10	283496	283505	20 %	0 %	40 %	40 %	116250012
6620	NC_008380	CTG	2	6	283536	283541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250012
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6851	NC_008380	GCG	2	6	293632	293637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6852	NC_008380	CAT	2	6	293680	293685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6859	NC_008380	CTGCG	2	10	293909	293918	0 %	20 %	40 %	40 %	116250024
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6988	NC_008380	GGC	2	6	298694	298699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250030
6989	NC_008380	GCG	2	6	298743	298748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6990	NC_008380	GC	3	6	298774	298779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6991	NC_008380	GTC	2	6	298784	298789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6992	NC_008380	CAGC	2	8	298812	298819	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6993	NC_008380	TTTAGA	2	12	298854	298865	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6994	NC_008380	ATT	2	6	298866	298871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6995	NC_008380	GATGC	2	10	299207	299216	20 %	20 %	40 %	20 %	116250031
6996	NC_008380	GGA	2	6	299236	299241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116250031
6997	NC_008380	GGC	2	6	299266	299271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116250031
6998	NC_008380	ACG	2	6	299391	299396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250031
6999	NC_008380	CGC	3	9	299494	299502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250031
7000	NC_008380	TCG	2	6	299535	299540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116250031

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