MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 118531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008380	GC	3	6	216762	216767	0 %	0 %	50 %	50 %	116249948
5002	NC_008380	TCG	2	6	216783	216788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249948
5003	NC_008380	CCA	2	6	216832	216837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249948
5004	NC_008380	AGGC	2	8	216843	216850	25 %	0 %	50 %	25 %	116249948
5005	NC_008380	GAT	2	6	216896	216901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249948
5006	NC_008380	GCT	2	6	216929	216934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249948
5007	NC_008380	CCG	2	6	216955	216960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249948
5008	NC_008380	CGC	2	6	217058	217063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_008380	GCG	2	6	217118	217123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249949
5010	NC_008380	GCG	2	6	217127	217132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249949
5011	NC_008380	GC	3	6	217166	217171	0 %	0 %	50 %	50 %	116249949
5012	NC_008380	AGG	2	6	217174	217179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249949
5013	NC_008380	CAC	2	6	217211	217216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249949
5014	NC_008380	AGC	2	6	217236	217241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249949
5015	NC_008380	GCG	2	6	217249	217254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249949
5016	NC_008380	CTT	2	6	217286	217291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249949
5017	NC_008380	GAT	2	6	217301	217306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249949
5018	NC_008380	GCC	2	6	217319	217324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249949
5019	NC_008380	CGC	2	6	217336	217341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249949
5020	NC_008380	CGCC	2	8	217369	217376	0 %	0 %	25 %	75 %	116249949
5021	NC_008380	GTGC	2	8	217441	217448	0 %	25 %	50 %	25 %	116249949
5022	NC_008380	CGG	2	6	217459	217464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249949
5023	NC_008380	TCG	2	6	217474	217479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249949
5024	NC_008380	TGC	2	6	217606	217611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249949
5025	NC_008380	GCC	2	6	217631	217636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249949
5026	NC_008380	CGCCGA	2	12	217681	217692	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116249949
5027	NC_008380	ACG	2	6	217713	217718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249949
5028	NC_008380	GCG	2	6	217779	217784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249949
5029	NC_008380	GCGCCT	2	12	217792	217803	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116249949
5030	NC_008380	GAC	2	6	217814	217819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249949
5031	NC_008380	TCC	2	6	217827	217832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249949
5032	NC_008380	ATC	2	6	217848	217853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249949
5033	NC_008380	CAC	2	6	217865	217870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249949
5034	NC_008380	TCG	3	9	217896	217904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249949
5035	NC_008380	CGGCGA	2	12	217915	217926	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116249949
5036	NC_008380	CGG	2	6	217948	217953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249949
5037	NC_008380	TCG	2	6	217983	217988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249949
5038	NC_008380	TCG	2	6	217990	217995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249949
5039	NC_008380	CCG	2	6	218002	218007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249949
5040	NC_008380	GCC	2	6	218075	218080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249949
5041	NC_008380	AGCGG	2	10	218109	218118	20 %	0 %	60 %	20 %	116249949
5042	NC_008380	TGT	2	6	218122	218127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249949
5043	NC_008380	GAA	2	6	218175	218180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249950
5044	NC_008380	CGA	2	6	218286	218291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249950
5045	NC_008380	AGA	2	6	218292	218297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249950
5046	NC_008380	GC	3	6	218328	218333	0 %	0 %	50 %	50 %	116249950
5047	NC_008380	CTG	2	6	218338	218343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249950
5048	NC_008380	CGC	2	6	218346	218351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249950
5049	NC_008380	GAC	2	6	218374	218379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249950
5050	NC_008380	CCCG	2	8	218406	218413	0 %	0 %	25 %	75 %	116249950
5051	NC_008380	CGA	2	6	218430	218435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249950
5052	NC_008380	GA	3	6	218447	218452	50 %	0 %	50 %	0 %	116249950
5053	NC_008380	CGC	2	6	218476	218481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249950
5054	NC_008380	GTC	2	6	218485	218490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249950
5055	NC_008380	CTT	2	6	218491	218496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249950
5056	NC_008380	GCC	2	6	218527	218532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249950
5057	NC_008380	GGC	2	6	218711	218716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249951
5058	NC_008380	GC	3	6	218719	218724	0 %	0 %	50 %	50 %	116249951
5059	NC_008380	GCG	2	6	218727	218732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249951
5060	NC_008380	CCA	2	6	218739	218744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249951
5061	NC_008380	GGC	2	6	218750	218755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249951
5062	NC_008380	CGG	2	6	218788	218793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249951
5063	NC_008380	CAT	2	6	218819	218824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249951
5064	NC_008380	CGG	2	6	218831	218836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249951
5065	NC_008380	CGG	2	6	218840	218845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249951
5066	NC_008380	CGG	2	6	218870	218875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249951
5067	NC_008380	GCGA	2	8	218904	218911	25 %	0 %	50 %	25 %	116249951
5068	NC_008380	GCG	2	6	218947	218952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249951
5069	NC_008380	CAG	2	6	218959	218964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249951
5070	NC_008380	CGG	2	6	218969	218974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249951
5071	NC_008380	CGC	2	6	219046	219051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249951
5072	NC_008380	TCT	3	9	219067	219075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249951
5073	NC_008380	CGC	2	6	219119	219124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249951
5074	NC_008380	CG	5	10	219138	219147	0 %	0 %	50 %	50 %	116249951
5075	NC_008380	GCA	2	6	219193	219198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249951
5076	NC_008380	GCG	2	6	219239	219244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249951
5077	NC_008380	CGC	2	6	219319	219324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249951
5078	NC_008380	TCGG	2	8	219471	219478	0 %	25 %	50 %	25 %	116249951
5079	NC_008380	GCCA	2	8	219491	219498	25 %	0 %	25 %	50 %	116249951
5080	NC_008380	GCC	2	6	219557	219562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249951
5081	NC_008380	TCT	2	6	219595	219600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249951
5082	NC_008380	TGGC	2	8	219778	219785	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5083	NC_008380	GCG	2	6	219794	219799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_008380	CGC	2	6	219809	219814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5085	NC_008380	GGC	2	6	219838	219843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_008380	CG	3	6	219887	219892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5087	NC_008380	CT	3	6	219909	219914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5088	NC_008380	AAT	2	6	219955	219960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_008380	GGC	2	6	219978	219983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249952
5090	NC_008380	GTTT	2	8	220001	220008	0 %	75 %	25 %	0 %	116249952
5091	NC_008380	TCA	2	6	220082	220087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249952
5092	NC_008380	GCG	2	6	220175	220180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249952
5093	NC_008380	GCT	2	6	220200	220205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249952
5094	NC_008380	GCA	2	6	220219	220224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249952
5095	NC_008380	TGA	2	6	220253	220258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249952
5096	NC_008380	CGA	3	9	220266	220274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249952
5097	NC_008380	GCT	2	6	220275	220280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249952
5098	NC_008380	TCACCT	2	12	220496	220507	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	116249952
5099	NC_008380	CGA	2	6	220509	220514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249952
5100	NC_008380	GAA	2	6	220515	220520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249952
5101	NC_008380	TGG	3	9	220553	220561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249952
5102	NC_008380	TGG	2	6	220573	220578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249952
5103	NC_008380	GAC	2	6	220620	220625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249952
5104	NC_008380	CTTC	2	8	220664	220671	0 %	50 %	0 %	50 %	116249952
5105	NC_008380	GAC	2	6	220705	220710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249952
5106	NC_008380	ACT	2	6	220826	220831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249952
5107	NC_008380	GAAG	2	8	220884	220891	50 %	0 %	50 %	0 %	116249952
5108	NC_008380	AAGA	2	8	220900	220907	75 %	0 %	25 %	0 %	116249952
5109	NC_008380	GC	3	6	220926	220931	0 %	0 %	50 %	50 %	116249952
5110	NC_008380	CAT	2	6	220938	220943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249952
5111	NC_008380	GAG	2	6	221026	221031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249952
5112	NC_008380	CCT	2	6	221099	221104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249952
5113	NC_008380	CAC	2	6	221175	221180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249952
5114	NC_008380	AGA	2	6	221213	221218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249952
5115	NC_008380	AAG	2	6	221255	221260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249952
5116	NC_008380	TTG	2	6	221329	221334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249952
5117	NC_008380	TATGA	2	10	221458	221467	40 %	40 %	20 %	0 %	116249952
5118	NC_008380	TG	3	6	221475	221480	0 %	50 %	50 %	0 %	116249952
5119	NC_008380	CGA	2	6	221625	221630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249952
5120	NC_008380	GCA	2	6	221638	221643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249952
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5122	NC_008380	TGG	2	6	221785	221790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249952
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5242	NC_008380	AGA	2	6	225830	225835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_008380	CTC	2	6	225848	225853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249956
5244	NC_008380	TCG	2	6	225860	225865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249956
5245	NC_008380	GCA	2	6	225926	225931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249956
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5248	NC_008380	TCT	2	6	226043	226048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249956
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5250	NC_008380	TCG	2	6	226115	226120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249956
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5261	NC_008380	CGG	2	6	226593	226598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249956
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5270	NC_008380	TTC	2	6	226842	226847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5281	NC_008380	GCC	2	6	227306	227311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5283	NC_008380	GCCG	2	8	227350	227357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5284	NC_008380	GCA	2	6	227384	227389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5320	NC_008380	GAT	2	6	229060	229065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5323	NC_008380	CTGG	2	8	229187	229194	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5324	NC_008380	CCG	3	9	229198	229206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5347	NC_008380	ATC	2	6	230422	230427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5359	NC_008380	T	6	6	231135	231140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5362	NC_008380	T	6	6	231226	231231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5363	NC_008380	CTT	2	6	231234	231239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5364	NC_008380	CGGC	2	8	231319	231326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5365	NC_008380	GGA	2	6	231353	231358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5366	NC_008380	GCG	2	6	231402	231407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249962
5367	NC_008380	TCGAT	2	10	231427	231436	20 %	40 %	20 %	20 %	116249962
5368	NC_008380	GCG	2	6	231447	231452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249962
5369	NC_008380	TCC	2	6	231453	231458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249962
5370	NC_008380	GTG	2	6	231459	231464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249962
5371	NC_008380	TCC	2	6	231525	231530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249962
5372	NC_008380	TAT	2	6	231537	231542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116249962
5373	NC_008380	GCT	2	6	231620	231625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249962
5374	NC_008380	GAT	2	6	231632	231637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249962
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5377	NC_008380	CGG	2	6	231705	231710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5378	NC_008380	CCG	2	6	231739	231744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5379	NC_008380	GC	3	6	231896	231901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5380	NC_008380	G	6	6	231914	231919	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5381	NC_008380	GGT	2	6	231925	231930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5382	NC_008380	GGA	2	6	231960	231965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5383	NC_008380	CAA	2	6	231980	231985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5384	NC_008380	A	6	6	232001	232006	100 %	0 %	0 %	0 %	116249963
5385	NC_008380	CT	3	6	232017	232022	0 %	50 %	0 %	50 %	116249963
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5406	NC_008380	AAG	2	6	233118	233123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249964
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5430	NC_008380	TCG	2	6	233938	233943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249964
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5433	NC_008380	CCA	2	6	234107	234112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249964
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5464	NC_008380	GCT	2	6	235321	235326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249965
5465	NC_008380	TACG	2	8	235345	235352	25 %	25 %	25 %	25 %	116249965
5466	NC_008380	TGA	2	6	235358	235363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249965
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5471	NC_008380	TCG	2	6	235448	235453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249965
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5473	NC_008380	TCG	2	6	235466	235471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249965
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5477	NC_008380	GCG	2	6	235553	235558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249965
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5480	NC_008380	AT	3	6	235647	235652	50 %	50 %	0 %	0 %	116249965
5481	NC_008380	CCGG	2	8	235656	235663	0 %	0 %	50 %	50 %	116249965
5482	NC_008380	CAG	2	6	235681	235686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249965
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5484	NC_008380	TCA	2	6	235731	235736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249966
5485	NC_008380	CCA	2	6	235749	235754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249966
5486	NC_008380	GCC	3	9	235862	235870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249966
5487	NC_008380	CTT	2	6	236008	236013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249966
5488	NC_008380	GGGC	2	8	236059	236066	0 %	0 %	75 %	25 %	116249966
5489	NC_008380	CGC	2	6	236070	236075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249966
5490	NC_008380	ATC	2	6	236105	236110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249966
5491	NC_008380	ATC	2	6	236144	236149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249966
5492	NC_008380	CAA	2	6	236179	236184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249966
5493	NC_008380	ACCT	2	8	236192	236199	25 %	25 %	0 %	50 %	116249966
5494	NC_008380	TGG	2	6	236225	236230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249966
5495	NC_008380	TG	3	6	236340	236345	0 %	50 %	50 %	0 %	116249966
5496	NC_008380	CCG	2	6	236394	236399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249966
5497	NC_008380	TCA	2	6	236403	236408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249966
5498	NC_008380	CGGC	2	8	236418	236425	0 %	0 %	50 %	50 %	116249966
5499	NC_008380	CGC	2	6	236443	236448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249966
5500	NC_008380	TGCC	2	8	236488	236495	0 %	25 %	25 %	50 %	116249966

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