MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL9

Total Repeats: 8078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008379	GGC	2	6	88778	88783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249541
2002	NC_008379	CGA	2	6	88827	88832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249541
2003	NC_008379	GCC	2	6	88874	88879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249541
2004	NC_008379	GAC	2	6	88895	88900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249541
2005	NC_008379	GCA	2	6	88912	88917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249541
2006	NC_008379	CGT	2	6	88942	88947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249541
2007	NC_008379	CTG	2	6	88952	88957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249541
2008	NC_008379	GAG	2	6	89060	89065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249541
2009	NC_008379	CCAG	2	8	89235	89242	25 %	0 %	25 %	50 %	116249541
2010	NC_008379	CAG	2	6	89341	89346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2011	NC_008379	AGG	2	6	89414	89419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_008379	CGC	3	9	89530	89538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249542
2013	NC_008379	GGGC	2	8	89564	89571	0 %	0 %	75 %	25 %	116249542
2014	NC_008379	GCC	2	6	89627	89632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249542
2015	NC_008379	CTCGC	2	10	89674	89683	0 %	20 %	20 %	60 %	116249542
2016	NC_008379	TGC	2	6	89697	89702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249542
2017	NC_008379	CGC	3	9	89741	89749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249542
2018	NC_008379	CG	3	6	89766	89771	0 %	0 %	50 %	50 %	116249542
2019	NC_008379	GAC	2	6	89794	89799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249542
2020	NC_008379	GGC	2	6	89830	89835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249542
2021	NC_008379	AGCG	2	8	89861	89868	25 %	0 %	50 %	25 %	116249542
2022	NC_008379	ACA	2	6	89884	89889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2023	NC_008379	CAA	2	6	89893	89898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2024	NC_008379	GCAA	2	8	89907	89914	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2025	NC_008379	ACAA	2	8	89929	89936	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2026	NC_008379	TGC	2	6	89984	89989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249543
2027	NC_008379	GCC	2	6	90033	90038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249543
2028	NC_008379	GTC	2	6	90048	90053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249543
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2030	NC_008379	TCG	2	6	90097	90102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249543
2031	NC_008379	GCC	2	6	90179	90184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249543
2032	NC_008379	CTT	2	6	90234	90239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249543
2033	NC_008379	CTG	2	6	90405	90410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249543
2034	NC_008379	CGC	2	6	90466	90471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249543
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2037	NC_008379	CAT	2	6	90530	90535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249543
2038	NC_008379	TGA	3	9	90556	90564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249543
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2040	NC_008379	CGA	2	6	90608	90613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249543
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2042	NC_008379	GC	3	6	90653	90658	0 %	0 %	50 %	50 %	116249543
2043	NC_008379	CGACG	2	10	90788	90797	20 %	0 %	40 %	40 %	116249543
2044	NC_008379	GCG	2	6	90883	90888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249543
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2049	NC_008379	TGC	2	6	91125	91130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249544
2050	NC_008379	GC	3	6	91129	91134	0 %	0 %	50 %	50 %	116249544
2051	NC_008379	TCT	2	6	91144	91149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249544
2052	NC_008379	CGC	2	6	91152	91157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249544
2053	NC_008379	GC	3	6	91199	91204	0 %	0 %	50 %	50 %	116249544
2054	NC_008379	CGG	2	6	91205	91210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249544
2055	NC_008379	GACGC	2	10	91235	91244	20 %	0 %	40 %	40 %	116249544
2056	NC_008379	TGC	2	6	91245	91250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249544
2057	NC_008379	CGCTGC	2	12	91278	91289	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116249544
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2059	NC_008379	GC	5	10	91424	91433	0 %	0 %	50 %	50 %	116249544
2060	NC_008379	ACG	2	6	91509	91514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249544
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2063	NC_008379	CGG	2	6	91591	91596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249544
2064	NC_008379	GGC	2	6	91612	91617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249544
2065	NC_008379	TGC	2	6	91731	91736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249544
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2090	NC_008379	ACC	2	6	92713	92718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249546
2091	NC_008379	GC	3	6	92766	92771	0 %	0 %	50 %	50 %	116249546
2092	NC_008379	GAA	2	6	92801	92806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249546
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2096	NC_008379	CCGG	2	8	92884	92891	0 %	0 %	50 %	50 %	116249546
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2109	NC_008379	CCT	2	6	93529	93534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2111	NC_008379	ATG	2	6	93687	93692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249547
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2122	NC_008379	ATT	2	6	94263	94268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116249548
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2253	NC_008379	CAC	2	6	99910	99915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249554
2254	NC_008379	GTGC	2	8	99936	99943	0 %	25 %	50 %	25 %	116249554
2255	NC_008379	CGA	2	6	99972	99977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249554
2256	NC_008379	CGG	2	6	100002	100007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249554
2257	NC_008379	GCT	2	6	100025	100030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249554
2258	NC_008379	GTG	2	6	100079	100084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249554
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2261	NC_008379	TGT	2	6	100161	100166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249554
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2263	NC_008379	CTC	2	6	100231	100236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2264	NC_008379	AAG	2	6	100349	100354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2265	NC_008379	TA	3	6	100403	100408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2266	NC_008379	CAG	2	6	100413	100418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2267	NC_008379	T	6	6	100446	100451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2268	NC_008379	GA	3	6	100472	100477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2269	NC_008379	ACGGA	2	10	100483	100492	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2270	NC_008379	TGC	2	6	100496	100501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2271	NC_008379	GGA	2	6	100542	100547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2272	NC_008379	AT	3	6	100578	100583	50 %	50 %	0 %	0 %	116249555
2273	NC_008379	CGT	2	6	100586	100591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249555
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2281	NC_008379	CGC	2	6	101005	101010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249555
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2283	NC_008379	GTC	2	6	101060	101065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249555
2284	NC_008379	GCTG	2	8	101071	101078	0 %	25 %	50 %	25 %	116249555
2285	NC_008379	TCT	2	6	101091	101096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249555
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2291	NC_008379	TTC	2	6	101276	101281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249555
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2308	NC_008379	TCG	2	6	101927	101932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249555
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2315	NC_008379	AAG	3	9	102249	102257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2365	NC_008379	CCT	2	6	104251	104256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249558
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2373	NC_008379	CGG	2	6	104710	104715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249558
2374	NC_008379	TGA	2	6	104730	104735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249558
2375	NC_008379	CGA	2	6	104784	104789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249558
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2378	NC_008379	TCG	2	6	104904	104909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249558
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2493	NC_008379	TGG	2	6	110305	110310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249564
2494	NC_008379	ACG	2	6	110322	110327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249564
2495	NC_008379	GTT	2	6	110360	110365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249564
2496	NC_008379	GATT	2	8	110437	110444	25 %	50 %	25 %	0 %	116249564
2497	NC_008379	GATCGA	2	12	110509	110520	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116249564
2498	NC_008379	CGG	2	6	110531	110536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249564
2499	NC_008379	CGG	2	6	110574	110579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249564
2500	NC_008379	ACC	2	6	110628	110633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249564

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