MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL9

Total Repeats: 8078

< Previous12...567891011121314151617Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_008379	TGC	2	6	349230	349235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249763
8002	NC_008379	GAC	2	6	349252	349257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249763
8003	NC_008379	GAC	2	6	349267	349272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249763
8004	NC_008379	TCG	2	6	349347	349352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249763
8005	NC_008379	CTG	2	6	349367	349372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249763
8006	NC_008379	GAC	2	6	349409	349414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249763
8007	NC_008379	GC	3	6	349419	349424	0 %	0 %	50 %	50 %	116249763
8008	NC_008379	ATA	2	6	349434	349439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116249763
8009	NC_008379	CA	3	6	349450	349455	50 %	0 %	0 %	50 %	116249763
8010	NC_008379	CGG	2	6	349459	349464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249763
8011	NC_008379	CAC	2	6	349486	349491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249763
8012	NC_008379	CTG	2	6	349523	349528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249763
8013	NC_008379	CGG	2	6	349531	349536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249763
8014	NC_008379	CGC	2	6	349561	349566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249763
8015	NC_008379	CGA	2	6	349786	349791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249763
8016	NC_008379	AGG	2	6	349878	349883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249763
8017	NC_008379	CAG	2	6	349946	349951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249763
8018	NC_008379	C	6	6	349959	349964	0 %	0 %	0 %	100 %	116249763
8019	NC_008379	CGA	2	6	349982	349987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249763
8020	NC_008379	TACG	2	8	350010	350017	25 %	25 %	25 %	25 %	116249763
8021	NC_008379	GAA	2	6	350062	350067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249763
8022	NC_008379	GCT	2	6	350071	350076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249763
8023	NC_008379	GC	3	6	350195	350200	0 %	0 %	50 %	50 %	116249763
8024	NC_008379	TGA	2	6	350217	350222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249763
8025	NC_008379	TC	3	6	350306	350311	0 %	50 %	0 %	50 %	116249763
8026	NC_008379	CCA	2	6	350316	350321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249763
8027	NC_008379	CCA	2	6	350348	350353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8028	NC_008379	TCA	2	6	350358	350363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_008379	CTGC	2	8	350377	350384	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8030	NC_008379	A	6	6	350450	350455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_008379	ACG	2	6	350731	350736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249764
8032	NC_008379	CGG	2	6	350748	350753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249764
8033	NC_008379	ACG	2	6	350818	350823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249764
8034	NC_008379	GCC	2	6	350890	350895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249764
8035	NC_008379	CCT	2	6	350929	350934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249764
8036	NC_008379	CCTCC	3	15	350975	350989	0 %	20 %	0 %	80 %	116249764
8037	NC_008379	CGG	3	9	350995	351003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249764
8038	NC_008379	CA	3	6	351033	351038	50 %	0 %	0 %	50 %	116249764
8039	NC_008379	GAAA	2	8	351132	351139	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_008379	GTGCG	2	10	351148	351157	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8041	NC_008379	GCG	2	6	351237	351242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_008379	CG	3	6	351305	351310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8043	NC_008379	CCG	2	6	351357	351362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249765
8044	NC_008379	TCT	2	6	351405	351410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249765
8045	NC_008379	GGC	2	6	351429	351434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249765
8046	NC_008379	TGC	2	6	351474	351479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249765
8047	NC_008379	CGT	2	6	351480	351485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249765
8048	NC_008379	TACCG	2	10	351529	351538	20 %	20 %	20 %	40 %	116249765
8049	NC_008379	ACG	2	6	351624	351629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_008379	CCG	2	6	351657	351662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8051	NC_008379	GGT	2	6	351672	351677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_008379	TGC	2	6	351694	351699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_008379	CGA	2	6	351816	351821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_008379	CCA	2	6	351835	351840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8055	NC_008379	TGA	2	6	351871	351876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_008379	ACGGC	2	10	351877	351886	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8057	NC_008379	CG	3	6	351946	351951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8058	NC_008379	TCT	2	6	352014	352019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_008379	TCG	2	6	352022	352027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_008379	CG	3	6	352072	352077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8061	NC_008379	CGA	2	6	352089	352094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_008379	TCAG	2	8	352097	352104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8063	NC_008379	CATCG	2	10	352136	352145	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8064	NC_008379	CGT	2	6	352175	352180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_008379	GCT	2	6	352193	352198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8066	NC_008379	GCCCA	2	10	352218	352227	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8067	NC_008379	GC	4	8	352245	352252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8068	NC_008379	CGG	2	6	352297	352302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_008379	AGC	2	6	352311	352316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8070	NC_008379	TCC	2	6	352425	352430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8071	NC_008379	GC	3	6	352461	352466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8072	NC_008379	GGT	2	6	352470	352475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_008379	TCG	3	9	352496	352504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_008379	AG	4	8	352528	352535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_008379	TGT	2	6	352568	352573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_008379	CCTTC	2	10	352629	352638	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8077	NC_008379	AG	3	6	352640	352645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_008379	CTG	2	6	352666	352671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous12...567891011121314151617Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.