MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 19681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_008378	GCC	2	6	709275	709280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249321
16002	NC_008378	GCA	2	6	709295	709300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249321
16003	NC_008378	GTC	2	6	709335	709340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249321
16004	NC_008378	CGGG	2	8	709378	709385	0 %	0 %	75 %	25 %	116249321
16005	NC_008378	AT	3	6	709389	709394	50 %	50 %	0 %	0 %	116249321
16006	NC_008378	GGC	2	6	709583	709588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249322
16007	NC_008378	CAT	2	6	709693	709698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249322
16008	NC_008378	TGA	2	6	709768	709773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249322
16009	NC_008378	CGA	2	6	709936	709941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249322
16010	NC_008378	GCA	2	6	709957	709962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249322
16011	NC_008378	GAA	2	6	709979	709984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249322
16012	NC_008378	AAT	2	6	709993	709998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116249322
16013	NC_008378	GT	3	6	709999	710004	0 %	50 %	50 %	0 %	116249322
16014	NC_008378	AGG	2	6	710026	710031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249322
16015	NC_008378	CAA	2	6	710101	710106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249322
16016	NC_008378	GT	3	6	710109	710114	0 %	50 %	50 %	0 %	116249322
16017	NC_008378	GC	3	6	710167	710172	0 %	0 %	50 %	50 %	116249322
16018	NC_008378	TTG	2	6	710181	710186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249322
16019	NC_008378	GCC	2	6	710195	710200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249322
16020	NC_008378	CGG	2	6	710212	710217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249322
16021	NC_008378	TCG	2	6	710220	710225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249322
16022	NC_008378	GTCAT	2	10	710238	710247	20 %	40 %	20 %	20 %	116249322
16023	NC_008378	TGG	2	6	710248	710253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249322
16024	NC_008378	AT	3	6	710278	710283	50 %	50 %	0 %	0 %	116249322
16025	NC_008378	TTG	2	6	710286	710291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249322
16026	NC_008378	GAC	2	6	710297	710302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249322
16027	NC_008378	GCC	2	6	710366	710371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249322
16028	NC_008378	TCT	2	6	710389	710394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249322
16029	NC_008378	GC	3	6	710433	710438	0 %	0 %	50 %	50 %	116249322
16030	NC_008378	CGATGT	2	12	710476	710487	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116249322
16031	NC_008378	GCC	2	6	710495	710500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249322
16032	NC_008378	ATC	2	6	710517	710522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249322
16033	NC_008378	GTC	2	6	710679	710684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249322
16034	NC_008378	CGC	2	6	710687	710692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249322
16035	NC_008378	C	6	6	710726	710731	0 %	0 %	0 %	100 %	116249322
16036	NC_008378	ATC	2	6	710769	710774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249322
16037	NC_008378	CGTCT	2	10	710798	710807	0 %	40 %	20 %	40 %	116249323
16038	NC_008378	CCG	2	6	710858	710863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249323
16039	NC_008378	AGA	2	6	710942	710947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249323
16040	NC_008378	GCCA	2	8	710956	710963	25 %	0 %	25 %	50 %	116249323
16041	NC_008378	TGC	2	6	710985	710990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249323
16042	NC_008378	CGGA	2	8	711003	711010	25 %	0 %	50 %	25 %	116249323
16043	NC_008378	GCA	2	6	711035	711040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249323
16044	NC_008378	CGA	2	6	711101	711106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249323
16045	NC_008378	CGA	2	6	711116	711121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249323
16046	NC_008378	CG	3	6	711160	711165	0 %	0 %	50 %	50 %	116249323
16047	NC_008378	CGCCAG	2	12	711213	711224	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116249323
16048	NC_008378	GC	3	6	711238	711243	0 %	0 %	50 %	50 %	116249323
16049	NC_008378	GCA	2	6	711278	711283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249323
16050	NC_008378	GGC	2	6	711330	711335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249323
16051	NC_008378	ACG	2	6	711355	711360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249323
16052	NC_008378	GGCC	2	8	711365	711372	0 %	0 %	50 %	50 %	116249323
16053	NC_008378	CAC	2	6	711406	711411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249323
16054	NC_008378	TCCC	2	8	711480	711487	0 %	25 %	0 %	75 %	116249323
16055	NC_008378	GCG	2	6	711634	711639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249324
16056	NC_008378	CCA	2	6	711670	711675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249324
16057	NC_008378	CGGC	2	8	711757	711764	0 %	0 %	50 %	50 %	116249324
16058	NC_008378	CGGA	2	8	711785	711792	25 %	0 %	50 %	25 %	116249324
16059	NC_008378	GCAG	2	8	711849	711856	25 %	0 %	50 %	25 %	116249324
16060	NC_008378	GCA	2	6	711919	711924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249324
16061	NC_008378	GCG	2	6	711934	711939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249324
16062	NC_008378	CGA	2	6	711955	711960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249324
16063	NC_008378	GCG	2	6	711991	711996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249324
16064	NC_008378	CTG	2	6	712004	712009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249324
16065	NC_008378	GAC	2	6	712028	712033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249324
16066	NC_008378	TCG	2	6	712170	712175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249324
16067	NC_008378	AGG	2	6	712176	712181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249324
16068	NC_008378	CCG	2	6	712186	712191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249324
16069	NC_008378	GCCC	2	8	712234	712241	0 %	0 %	25 %	75 %	116249324
16070	NC_008378	GA	3	6	712273	712278	50 %	0 %	50 %	0 %	116249324
16071	NC_008378	GCG	2	6	712293	712298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249324
16072	NC_008378	CG	3	6	712324	712329	0 %	0 %	50 %	50 %	116249324
16073	NC_008378	CGT	2	6	712438	712443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249324
16074	NC_008378	CGC	2	6	712453	712458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249324
16075	NC_008378	CTC	2	6	712471	712476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249324
16076	NC_008378	ATC	2	6	712500	712505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249324
16077	NC_008378	CGT	2	6	712511	712516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249324
16078	NC_008378	ATG	2	6	712548	712553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249324
16079	NC_008378	GAC	2	6	712589	712594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249324
16080	NC_008378	TAA	3	9	712710	712718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116249325
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16084	NC_008378	GCGCC	2	10	712862	712871	0 %	0 %	40 %	60 %	116249325
16085	NC_008378	CCGGTT	2	12	712891	712902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249325
16086	NC_008378	CGA	2	6	712903	712908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249325
16087	NC_008378	CGA	2	6	712949	712954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249325
16088	NC_008378	CG	3	6	712960	712965	0 %	0 %	50 %	50 %	116249325
16089	NC_008378	TCGCCG	2	12	712968	712979	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116249325
16090	NC_008378	AGC	2	6	713043	713048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249325
16091	NC_008378	CG	3	6	713128	713133	0 %	0 %	50 %	50 %	116249325
16092	NC_008378	GTC	2	6	713144	713149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249325
16093	NC_008378	TGG	2	6	713164	713169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249325
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16095	NC_008378	GTG	2	6	713253	713258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249325
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16097	NC_008378	GAT	2	6	713348	713353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249325
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16099	NC_008378	CCTTGC	2	12	713371	713382	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	116249325
16100	NC_008378	CGG	2	6	713437	713442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249325
16101	NC_008378	GGC	2	6	713450	713455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249325
16102	NC_008378	CGA	2	6	713476	713481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249325
16103	NC_008378	GGC	2	6	713489	713494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249325
16104	NC_008378	AGG	2	6	713500	713505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249325
16105	NC_008378	CGC	2	6	713611	713616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249325
16106	NC_008378	GACG	2	8	713813	713820	25 %	0 %	50 %	25 %	116249325
16107	NC_008378	CGA	2	6	713870	713875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249326
16108	NC_008378	GA	4	8	713886	713893	50 %	0 %	50 %	0 %	116249326
16109	NC_008378	GAC	2	6	713898	713903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249326
16110	NC_008378	CGA	2	6	713921	713926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249326
16111	NC_008378	GCC	2	6	713932	713937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249326
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16113	NC_008378	ATC	2	6	714025	714030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249326
16114	NC_008378	GGT	2	6	714051	714056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249326
16115	NC_008378	GCA	2	6	714104	714109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249326
16116	NC_008378	GC	3	6	714114	714119	0 %	0 %	50 %	50 %	116249326
16117	NC_008378	GCC	2	6	714154	714159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249326
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16119	NC_008378	GCAG	2	8	714230	714237	25 %	0 %	50 %	25 %	116249326
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16239	NC_008378	CGC	2	6	719117	719122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249330
16240	NC_008378	AGC	2	6	719141	719146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249330
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16243	NC_008378	CGA	3	9	719208	719216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249330
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16271	NC_008378	GAG	2	6	720790	720795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16272	NC_008378	TGC	3	9	720822	720830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249332
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16297	NC_008378	TCC	2	6	721692	721697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16298	NC_008378	TCGC	2	8	721709	721716	0 %	25 %	25 %	50 %	116249333
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16345	NC_008378	GA	3	6	723918	723923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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16480	NC_008378	GCA	2	6	729954	729959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249342
16481	NC_008378	ACCTG	2	10	729996	730005	20 %	20 %	20 %	40 %	116249342
16482	NC_008378	GCA	2	6	730045	730050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249342
16483	NC_008378	GAC	3	9	730099	730107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249342
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