MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 19681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_008378	GATC	2	8	619937	619944	25 %	25 %	25 %	25 %	116249232
14002	NC_008378	CGG	2	6	619979	619984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249232
14003	NC_008378	TGCCGG	2	12	620046	620057	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116249232
14004	NC_008378	GGC	2	6	620073	620078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249232
14005	NC_008378	GGC	2	6	620139	620144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249232
14006	NC_008378	GGC	2	6	620260	620265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249232
14007	NC_008378	GTC	2	6	620276	620281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249232
14008	NC_008378	TCG	2	6	620294	620299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249232
14009	NC_008378	CGACG	2	10	620629	620638	20 %	0 %	40 %	40 %	116249232
14010	NC_008378	CAA	2	6	620748	620753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249232
14011	NC_008378	ACG	2	6	620965	620970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249232
14012	NC_008378	CGA	3	9	621020	621028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249232
14013	NC_008378	GAG	2	6	621070	621075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249232
14014	NC_008378	GAC	2	6	621156	621161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249232
14015	NC_008378	GGA	2	6	621201	621206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249232
14016	NC_008378	CGG	2	6	621278	621283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249232
14017	NC_008378	GCC	2	6	621309	621314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249232
14018	NC_008378	GCA	2	6	621332	621337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249232
14019	NC_008378	GGC	2	6	621346	621351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249232
14020	NC_008378	CGC	2	6	621382	621387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249232
14021	NC_008378	AGC	2	6	621485	621490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249232
14022	NC_008378	ACG	2	6	621509	621514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249232
14023	NC_008378	GCG	2	6	621746	621751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249232
14024	NC_008378	GCC	2	6	621803	621808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249232
14025	NC_008378	GCT	2	6	621819	621824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249232
14026	NC_008378	GAT	2	6	621835	621840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249232
14027	NC_008378	TCG	2	6	621866	621871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249232
14028	NC_008378	CG	3	6	621901	621906	0 %	0 %	50 %	50 %	116249232
14029	NC_008378	AGC	2	6	621980	621985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249232
14030	NC_008378	CAG	2	6	622078	622083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249232
14031	NC_008378	GAG	2	6	622163	622168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_008378	GCCCT	2	10	622187	622196	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14033	NC_008378	CGC	2	6	622204	622209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14034	NC_008378	GA	3	6	622246	622251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_008378	GCC	2	6	622269	622274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14036	NC_008378	GC	3	6	622290	622295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14037	NC_008378	CT	3	6	622333	622338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14038	NC_008378	GA	3	6	622468	622473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_008378	CAT	2	6	622579	622584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14040	NC_008378	TGC	2	6	622602	622607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14041	NC_008378	AGA	2	6	622639	622644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_008378	TCC	2	6	622759	622764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14043	NC_008378	CAT	2	6	622766	622771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14044	NC_008378	CCT	2	6	622810	622815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14045	NC_008378	CGAT	2	8	622844	622851	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14046	NC_008378	CCGT	2	8	622945	622952	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14047	NC_008378	AGG	2	6	622970	622975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_008378	ATC	2	6	623038	623043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14049	NC_008378	TTG	2	6	623057	623062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_008378	CGGC	3	12	623128	623139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14051	NC_008378	TGG	2	6	623162	623167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_008378	CGA	2	6	623274	623279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14053	NC_008378	CCA	2	6	623338	623343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249233
14054	NC_008378	CGACAG	2	12	623476	623487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249233
14055	NC_008378	CGTTG	2	10	623557	623566	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14056	NC_008378	GTT	2	6	623601	623606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249234
14057	NC_008378	CAT	2	6	623608	623613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249234
14058	NC_008378	GAA	2	6	623618	623623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249234
14059	NC_008378	TGGTG	2	10	623634	623643	0 %	40 %	60 %	0 %	116249234
14060	NC_008378	GGC	2	6	623675	623680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249234
14061	NC_008378	TCA	2	6	623682	623687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249234
14062	NC_008378	GGT	2	6	623701	623706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249234
14063	NC_008378	CAAG	2	8	623761	623768	50 %	0 %	25 %	25 %	116249234
14064	NC_008378	TG	3	6	623804	623809	0 %	50 %	50 %	0 %	116249234
14065	NC_008378	CGA	2	6	623834	623839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249234
14066	NC_008378	CGAT	2	8	623875	623882	25 %	25 %	25 %	25 %	116249234
14067	NC_008378	AGG	2	6	623898	623903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249234
14068	NC_008378	CTT	3	9	623918	623926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249234
14069	NC_008378	AGC	2	6	623931	623936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249234
14070	NC_008378	GAC	2	6	623951	623956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249234
14071	NC_008378	CAT	2	6	623993	623998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249234
14072	NC_008378	GAT	2	6	624071	624076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249234
14073	NC_008378	CCG	2	6	624106	624111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249234
14074	NC_008378	CG	3	6	624110	624115	0 %	0 %	50 %	50 %	116249234
14075	NC_008378	TCC	2	6	624227	624232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249234
14076	NC_008378	GTC	2	6	624323	624328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14077	NC_008378	AGG	2	6	624329	624334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_008378	TTC	2	6	624509	624514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249235
14079	NC_008378	CGA	2	6	624577	624582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249235
14080	NC_008378	GCAC	2	8	624607	624614	25 %	0 %	25 %	50 %	116249235
14081	NC_008378	GCAT	2	8	624923	624930	25 %	25 %	25 %	25 %	116249235
14082	NC_008378	TC	3	6	624953	624958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14083	NC_008378	TGG	2	6	625059	625064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_008378	CAAAG	2	10	625198	625207	60 %	0 %	20 %	20 %	116249236
14085	NC_008378	CCCA	2	8	625231	625238	25 %	0 %	0 %	75 %	116249236
14086	NC_008378	AAG	2	6	625252	625257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249236
14087	NC_008378	CG	3	6	625264	625269	0 %	0 %	50 %	50 %	116249236
14088	NC_008378	AATAA	2	10	625290	625299	80 %	20 %	0 %	0 %	116249236
14089	NC_008378	ATC	2	6	625390	625395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249236
14090	NC_008378	CAT	2	6	625620	625625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249236
14091	NC_008378	AGG	2	6	625643	625648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249236
14092	NC_008378	CTG	2	6	625720	625725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249237
14093	NC_008378	CGT	2	6	625746	625751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249237
14094	NC_008378	CG	3	6	625761	625766	0 %	0 %	50 %	50 %	116249237
14095	NC_008378	TTG	2	6	625769	625774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249237
14096	NC_008378	TGT	2	6	625939	625944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249237
14097	NC_008378	GCG	2	6	626177	626182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249237
14098	NC_008378	CAG	2	6	626209	626214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249237
14099	NC_008378	GAG	2	6	626370	626375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249238
14100	NC_008378	GCG	2	6	626408	626413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249238
14101	NC_008378	GGC	2	6	626442	626447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249238
14102	NC_008378	CCA	2	6	626475	626480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249238
14103	NC_008378	TCT	2	6	626488	626493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249238
14104	NC_008378	GCC	2	6	626524	626529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249238
14105	NC_008378	AAC	2	6	626533	626538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249238
14106	NC_008378	GCG	2	6	626624	626629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249238
14107	NC_008378	GCG	2	6	626663	626668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249238
14108	NC_008378	CAT	2	6	626817	626822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249238
14109	NC_008378	GAAA	2	8	626895	626902	75 %	0 %	25 %	0 %	116249239
14110	NC_008378	CGAT	2	8	626973	626980	25 %	25 %	25 %	25 %	116249239
14111	NC_008378	GCG	2	6	627017	627022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249239
14112	NC_008378	CCATT	2	10	627044	627053	20 %	40 %	0 %	40 %	116249239
14113	NC_008378	ATG	2	6	627102	627107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249239
14114	NC_008378	CCG	2	6	627108	627113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249239
14115	NC_008378	GAA	2	6	627116	627121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249239
14116	NC_008378	GAC	2	6	627284	627289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249239
14117	NC_008378	CGG	2	6	627328	627333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249239
14118	NC_008378	TGA	2	6	627334	627339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249239
14119	NC_008378	GC	3	6	627387	627392	0 %	0 %	50 %	50 %	116249239
14120	NC_008378	CG	3	6	627421	627426	0 %	0 %	50 %	50 %	116249239
14121	NC_008378	GGC	2	6	627509	627514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249239
14122	NC_008378	CGT	2	6	627560	627565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249239
14123	NC_008378	GGC	2	6	627629	627634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249239
14124	NC_008378	CGC	2	6	627734	627739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249239
14125	NC_008378	GCTC	2	8	627807	627814	0 %	25 %	25 %	50 %	116249239
14126	NC_008378	CGC	2	6	627927	627932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249240
14127	NC_008378	GCA	2	6	627939	627944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249240
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14129	NC_008378	AGC	2	6	627983	627988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249240
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14131	NC_008378	CAGC	2	8	628018	628025	25 %	0 %	25 %	50 %	116249240
14132	NC_008378	AGA	2	6	628068	628073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249240
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14134	NC_008378	GC	3	6	628162	628167	0 %	0 %	50 %	50 %	116249240
14135	NC_008378	TCGCC	2	10	628185	628194	0 %	20 %	20 %	60 %	116249240
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14146	NC_008378	CCG	2	6	628511	628516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249240
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14151	NC_008378	CG	3	6	628709	628714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14152	NC_008378	A	6	6	628729	628734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14153	NC_008378	CAGC	2	8	628740	628747	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14154	NC_008378	CTC	2	6	628762	628767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14155	NC_008378	AAC	2	6	628787	628792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14156	NC_008378	TGG	2	6	628969	628974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249241
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14160	NC_008378	GAT	2	6	629221	629226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249241
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14163	NC_008378	ATG	2	6	629273	629278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249241
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14181	NC_008378	CATC	2	8	630292	630299	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14182	NC_008378	GCC	2	6	630315	630320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14183	NC_008378	TTG	2	6	630329	630334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14184	NC_008378	GC	3	6	630492	630497	0 %	0 %	50 %	50 %	116249242
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14192	NC_008378	CGA	2	6	630941	630946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14199	NC_008378	TTTGC	2	10	631402	631411	0 %	60 %	20 %	20 %	116249243
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14201	NC_008378	TCG	2	6	631512	631517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249244
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14203	NC_008378	GGCT	2	8	631599	631606	0 %	25 %	50 %	25 %	116249244
14204	NC_008378	GCC	2	6	631709	631714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249244
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14207	NC_008378	GAT	2	6	631927	631932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14208	NC_008378	T	6	6	631962	631967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14209	NC_008378	GGA	2	6	632102	632107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249245
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14211	NC_008378	ATG	2	6	632286	632291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249245
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14215	NC_008378	TGC	2	6	632381	632386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249245
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14220	NC_008378	GAC	2	6	632693	632698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249246
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14224	NC_008378	CGAG	2	8	632879	632886	25 %	0 %	50 %	25 %	116249246
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14226	NC_008378	CA	3	6	632930	632935	50 %	0 %	0 %	50 %	116249246
14227	NC_008378	GCC	2	6	632936	632941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249246
14228	NC_008378	AAC	2	6	632942	632947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249246
14229	NC_008378	GCGCA	2	10	633018	633027	20 %	0 %	40 %	40 %	116249246
14230	NC_008378	GAT	2	6	633028	633033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249246
14231	NC_008378	ACCG	2	8	633037	633044	25 %	0 %	25 %	50 %	116249246
14232	NC_008378	ACG	2	6	633053	633058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249246
14233	NC_008378	CG	3	6	633172	633177	0 %	0 %	50 %	50 %	116249246
14234	NC_008378	GCTG	2	8	633297	633304	0 %	25 %	50 %	25 %	116249246
14235	NC_008378	TTG	2	6	633311	633316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249246
14236	NC_008378	ACG	2	6	633341	633346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14237	NC_008378	CA	3	6	633355	633360	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14238	NC_008378	TTC	2	6	633441	633446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249247
14239	NC_008378	CGG	2	6	633645	633650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14240	NC_008378	ATTTC	2	10	633810	633819	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14241	NC_008378	GCC	2	6	633823	633828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14242	NC_008378	GGA	2	6	633851	633856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14243	NC_008378	GAG	2	6	633863	633868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14244	NC_008378	TGA	2	6	633908	633913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14245	NC_008378	TCA	2	6	633932	633937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14246	NC_008378	GTCT	2	8	633953	633960	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14247	NC_008378	ACGATG	2	12	633961	633972	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14248	NC_008378	CTTGTT	2	12	634017	634028	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14249	NC_008378	GGC	2	6	634129	634134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14250	NC_008378	TTG	2	6	634140	634145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249248
14251	NC_008378	TTC	2	6	634222	634227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249248
14252	NC_008378	TGA	2	6	634289	634294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249248
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14254	NC_008378	TG	3	6	634323	634328	0 %	50 %	50 %	0 %	116249248
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14261	NC_008378	GCCC	2	8	634668	634675	0 %	0 %	25 %	75 %	116249248
14262	NC_008378	TC	3	6	634731	634736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14263	NC_008378	GCAG	2	8	634770	634777	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14264	NC_008378	GCC	2	6	634871	634876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249249
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14271	NC_008378	TGC	2	6	635305	635310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249249
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14277	NC_008378	GTC	2	6	635684	635689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249249
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14282	NC_008378	GGC	2	6	635982	635987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14283	NC_008378	GCC	2	6	636016	636021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14284	NC_008378	GGA	2	6	636054	636059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14345	NC_008378	CA	3	6	638914	638919	50 %	0 %	0 %	50 %	116249253
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14347	NC_008378	TCG	3	9	639027	639035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249253
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14351	NC_008378	CG	3	6	639236	639241	0 %	0 %	50 %	50 %	116249253
14352	NC_008378	GCG	2	6	639272	639277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249253
14353	NC_008378	GCCG	2	8	639311	639318	0 %	0 %	50 %	50 %	116249253
14354	NC_008378	CAT	2	6	639328	639333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249253
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14357	NC_008378	CTG	2	6	639490	639495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249253
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14360	NC_008378	CGA	2	6	639595	639600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249253
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14472	NC_008378	CTTC	2	8	644419	644426	0 %	50 %	0 %	50 %	116249258
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14484	NC_008378	CGA	2	6	644881	644886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249258
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