MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 19681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_008378	CGG	2	6	552709	552714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249172
12502	NC_008378	CGA	2	6	552776	552781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249172
12503	NC_008378	CCG	2	6	552799	552804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249172
12504	NC_008378	CCG	2	6	552889	552894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249172
12505	NC_008378	GTC	2	6	552912	552917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249172
12506	NC_008378	GCC	2	6	552943	552948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249172
12507	NC_008378	TCG	2	6	552958	552963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249172
12508	NC_008378	CGG	2	6	552971	552976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249172
12509	NC_008378	CTG	2	6	552993	552998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249172
12510	NC_008378	CG	3	6	553043	553048	0 %	0 %	50 %	50 %	116249172
12511	NC_008378	CCT	2	6	553160	553165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249172
12512	NC_008378	ACG	2	6	553189	553194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249172
12513	NC_008378	GAG	2	6	553236	553241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249172
12514	NC_008378	CG	3	6	553304	553309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12515	NC_008378	CGG	2	6	553379	553384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249173
12516	NC_008378	CGG	2	6	553389	553394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249173
12517	NC_008378	TGC	2	6	553427	553432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249173
12518	NC_008378	TCG	2	6	553534	553539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249173
12519	NC_008378	CGCC	2	8	553601	553608	0 %	0 %	25 %	75 %	116249173
12520	NC_008378	TTC	2	6	553609	553614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249173
12521	NC_008378	GCC	2	6	553673	553678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249173
12522	NC_008378	GCG	2	6	553702	553707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249173
12523	NC_008378	GGA	2	6	553734	553739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249173
12524	NC_008378	GCA	2	6	553757	553762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249173
12525	NC_008378	CGGGC	2	10	553808	553817	0 %	0 %	60 %	40 %	116249173
12526	NC_008378	GCC	2	6	553828	553833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249173
12527	NC_008378	CAA	2	6	553869	553874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249173
12528	NC_008378	GGA	2	6	553962	553967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249173
12529	NC_008378	ACCA	2	8	554014	554021	50 %	0 %	0 %	50 %	116249173
12530	NC_008378	GGC	2	6	554049	554054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249173
12531	NC_008378	GC	4	8	554063	554070	0 %	0 %	50 %	50 %	116249173
12532	NC_008378	GTC	3	9	554071	554079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249173
12533	NC_008378	TGC	2	6	554141	554146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249173
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12535	NC_008378	CGG	2	6	554193	554198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249173
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12540	NC_008378	GGC	2	6	554740	554745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249173
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12546	NC_008378	CGA	2	6	555078	555083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249173
12547	NC_008378	GC	3	6	555142	555147	0 %	0 %	50 %	50 %	116249173
12548	NC_008378	CG	3	6	555158	555163	0 %	0 %	50 %	50 %	116249173
12549	NC_008378	GGCA	2	8	555210	555217	25 %	0 %	50 %	25 %	116249173
12550	NC_008378	CAT	2	6	555221	555226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249173
12551	NC_008378	CGA	2	6	555246	555251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249173
12552	NC_008378	CAATA	2	10	555319	555328	60 %	20 %	0 %	20 %	116249173
12553	NC_008378	TTCA	2	8	555388	555395	25 %	50 %	0 %	25 %	116249173
12554	NC_008378	ATG	2	6	555458	555463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249173
12555	NC_008378	TTA	2	6	555534	555539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116249173
12556	NC_008378	AGC	2	6	555568	555573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249173
12557	NC_008378	CAT	2	6	555609	555614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249173
12558	NC_008378	TTCC	2	8	555618	555625	0 %	50 %	0 %	50 %	116249173
12559	NC_008378	TCG	2	6	555682	555687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249174
12560	NC_008378	GCG	2	6	555690	555695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249174
12561	NC_008378	CATC	2	8	555718	555725	25 %	25 %	0 %	50 %	116249174
12562	NC_008378	CGC	2	6	555743	555748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249174
12563	NC_008378	GC	3	6	555783	555788	0 %	0 %	50 %	50 %	116249174
12564	NC_008378	TC	3	6	555807	555812	0 %	50 %	0 %	50 %	116249174
12565	NC_008378	TGC	2	6	555853	555858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249174
12566	NC_008378	GCC	2	6	555905	555910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249174
12567	NC_008378	CGC	2	6	555936	555941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12568	NC_008378	GCG	2	6	555957	555962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249175
12569	NC_008378	AAG	2	6	556039	556044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249175
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12571	NC_008378	CAG	2	6	556128	556133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249175
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12573	NC_008378	GCCG	2	8	556197	556204	0 %	0 %	50 %	50 %	116249175
12574	NC_008378	CGG	2	6	556267	556272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249175
12575	NC_008378	GGGCC	2	10	556292	556301	0 %	0 %	60 %	40 %	116249175
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12579	NC_008378	GCA	2	6	556487	556492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249175
12580	NC_008378	TCG	2	6	556570	556575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249175
12581	NC_008378	CATG	2	8	556592	556599	25 %	25 %	25 %	25 %	116249175
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12588	NC_008378	TGT	2	6	556895	556900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249175
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12590	NC_008378	GC	3	6	557016	557021	0 %	0 %	50 %	50 %	116249176
12591	NC_008378	TCA	2	6	557028	557033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249176
12592	NC_008378	TTG	2	6	557070	557075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249176
12593	NC_008378	GCA	2	6	557084	557089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249176
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12595	NC_008378	CGCCA	2	10	557336	557345	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12596	NC_008378	GGCA	2	8	557462	557469	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12597	NC_008378	GATG	2	8	557536	557543	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_008378	GGCTT	2	10	557548	557557	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12599	NC_008378	CAT	2	6	557571	557576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12600	NC_008378	CTTG	2	8	557704	557711	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12601	NC_008378	ATG	2	6	557798	557803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12602	NC_008378	CCG	2	6	557804	557809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12603	NC_008378	TGAGT	2	10	557831	557840	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_008378	GC	3	6	557993	557998	0 %	0 %	50 %	50 %	116249177
12605	NC_008378	AATCCG	2	12	558006	558017	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116249177
12606	NC_008378	GAAA	2	8	558074	558081	75 %	0 %	25 %	0 %	116249177
12607	NC_008378	CGA	2	6	558135	558140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249177
12608	NC_008378	GCC	2	6	558166	558171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249177
12609	NC_008378	GGT	2	6	558211	558216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249177
12610	NC_008378	TCG	2	6	558230	558235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249177
12611	NC_008378	GCC	2	6	558272	558277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249177
12612	NC_008378	TCG	2	6	558306	558311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249177
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12615	NC_008378	AGCG	2	8	558361	558368	25 %	0 %	50 %	25 %	116249177
12616	NC_008378	GCC	3	9	558401	558409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249177
12617	NC_008378	GGC	3	9	558427	558435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249177
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12619	NC_008378	CG	3	6	558540	558545	0 %	0 %	50 %	50 %	116249177
12620	NC_008378	GTC	2	6	558553	558558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249177
12621	NC_008378	GCC	2	6	558589	558594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249177
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12853	NC_008378	GGGA	2	8	568382	568389	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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12978	NC_008378	CGA	2	6	573963	573968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249193
12979	NC_008378	GGC	2	6	573977	573982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249193
12980	NC_008378	CTC	2	6	574012	574017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249193
12981	NC_008378	GCT	2	6	574029	574034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249193
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12983	NC_008378	CGT	2	6	574230	574235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249193
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12985	NC_008378	TGC	2	6	574299	574304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249193
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