MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 7993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008271	GCCA	2	8	68068	68075	25 %	0 %	25 %	50 %	111026898
1502	NC_008271	ACG	2	6	68156	68161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026898
1503	NC_008271	CG	4	8	68175	68182	0 %	0 %	50 %	50 %	111026898
1504	NC_008271	GCC	4	12	68185	68196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026898
1505	NC_008271	GCA	2	6	68243	68248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026898
1506	NC_008271	CTG	2	6	68251	68256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026898
1507	NC_008271	GA	3	6	68311	68316	50 %	0 %	50 %	0 %	111026898
1508	NC_008271	GCC	2	6	68396	68401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026898
1509	NC_008271	TCG	2	6	68444	68449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026898
1510	NC_008271	GGT	2	6	68451	68456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026898
1511	NC_008271	TGTCG	2	10	68481	68490	0 %	40 %	40 %	20 %	111026898
1512	NC_008271	TGG	2	6	68507	68512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026898
1513	NC_008271	GAT	2	6	68634	68639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026898
1514	NC_008271	CGT	2	6	68646	68651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026898
1515	NC_008271	CAG	2	6	68655	68660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026898
1516	NC_008271	GGC	2	6	68676	68681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026898
1517	NC_008271	CGG	2	6	68709	68714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026898
1518	NC_008271	CGAG	2	8	68780	68787	25 %	0 %	50 %	25 %	111026898
1519	NC_008271	GGAC	2	8	68805	68812	25 %	0 %	50 %	25 %	111026898
1520	NC_008271	CA	3	6	68848	68853	50 %	0 %	0 %	50 %	111026898
1521	NC_008271	CGA	2	6	68856	68861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026898
1522	NC_008271	GCG	2	6	68905	68910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026898
1523	NC_008271	CGCC	2	8	68918	68925	0 %	0 %	25 %	75 %	111026898
1524	NC_008271	ACC	2	6	68931	68936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_008271	CG	3	6	68938	68943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_008271	CGG	2	6	69045	69050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_008271	GTCG	2	8	69090	69097	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_008271	GCC	2	6	69128	69133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026899
1529	NC_008271	GGT	2	6	69141	69146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026899
1530	NC_008271	CGG	2	6	69245	69250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026899
1531	NC_008271	CCGC	2	8	69302	69309	0 %	0 %	25 %	75 %	111026899
1532	NC_008271	CG	3	6	69392	69397	0 %	0 %	50 %	50 %	111026899
1533	NC_008271	TCT	2	6	69416	69421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026899
1534	NC_008271	CT	3	6	69424	69429	0 %	50 %	0 %	50 %	111026899
1535	NC_008271	GTC	2	6	69460	69465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_008271	GAT	2	6	69509	69514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_008271	CGG	3	9	69542	69550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_008271	GGCC	2	8	69551	69558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_008271	CAC	2	6	69565	69570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1540	NC_008271	ACC	2	6	69577	69582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_008271	GGC	2	6	69587	69592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_008271	GGT	2	6	69595	69600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_008271	GCG	2	6	69619	69624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_008271	CCG	2	6	69642	69647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_008271	GCG	2	6	69681	69686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_008271	GGT	2	6	69695	69700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_008271	CGT	2	6	69704	69709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_008271	TCG	2	6	69732	69737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_008271	CCCG	2	8	69767	69774	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1550	NC_008271	AGT	2	6	69795	69800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_008271	CG	3	6	69919	69924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_008271	TCGGAG	2	12	69944	69955	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1553	NC_008271	CCA	2	6	69966	69971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_008271	GAC	3	9	69985	69993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_008271	GAA	2	6	70066	70071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026900
1556	NC_008271	GTTC	2	8	70110	70117	0 %	50 %	25 %	25 %	111026900
1557	NC_008271	CCAT	2	8	70126	70133	25 %	25 %	0 %	50 %	111026900
1558	NC_008271	GTG	3	9	70163	70171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026900
1559	NC_008271	CCG	2	6	70172	70177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026900
1560	NC_008271	TCG	2	6	70192	70197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026900
1561	NC_008271	CGC	3	9	70202	70210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026900
1562	NC_008271	CG	3	6	70398	70403	0 %	0 %	50 %	50 %	111026901
1563	NC_008271	CCG	2	6	70434	70439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026901
1564	NC_008271	GCT	2	6	70445	70450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026901
1565	NC_008271	TCC	2	6	70459	70464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026901
1566	NC_008271	TCG	2	6	70477	70482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026901
1567	NC_008271	CGGA	2	8	70485	70492	25 %	0 %	50 %	25 %	111026901
1568	NC_008271	ACC	2	6	70525	70530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026901
1569	NC_008271	GTC	2	6	70548	70553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026901
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1571	NC_008271	GCCG	2	8	70617	70624	0 %	0 %	50 %	50 %	111026902
1572	NC_008271	ACC	2	6	70667	70672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026902
1573	NC_008271	GCA	2	6	70692	70697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026902
1574	NC_008271	GTC	2	6	70708	70713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026902
1575	NC_008271	ATAC	2	8	70735	70742	50 %	25 %	0 %	25 %	111026902
1576	NC_008271	GCG	2	6	70805	70810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026902
1577	NC_008271	GCC	2	6	70877	70882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026902
1578	NC_008271	CGG	2	6	70950	70955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026902
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1580	NC_008271	TGC	2	6	71009	71014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026902
1581	NC_008271	ACCG	2	8	71044	71051	25 %	0 %	25 %	50 %	111026902
1582	NC_008271	CGG	2	6	71088	71093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026902
1583	NC_008271	ACTGCG	2	12	71112	71123	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111026902
1584	NC_008271	ACCG	2	8	71138	71145	25 %	0 %	25 %	50 %	111026902
1585	NC_008271	CGAAT	2	10	71177	71186	40 %	20 %	20 %	20 %	111026902
1586	NC_008271	GTC	2	6	71338	71343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026902
1587	NC_008271	CGGC	2	8	71352	71359	0 %	0 %	50 %	50 %	111026902
1588	NC_008271	GCCG	2	8	71365	71372	0 %	0 %	50 %	50 %	111026902
1589	NC_008271	CGT	2	6	71386	71391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026902
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1592	NC_008271	GGCA	2	8	71503	71510	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_008271	GGGT	2	8	71557	71564	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_008271	CGG	2	6	71625	71630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_008271	CCG	2	6	71633	71638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_008271	ACC	2	6	71660	71665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1597	NC_008271	CCA	2	6	71857	71862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026903
1598	NC_008271	CCG	2	6	71907	71912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026903
1599	NC_008271	GAA	2	6	71971	71976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026903
1600	NC_008271	CGTCT	2	10	72010	72019	0 %	40 %	20 %	40 %	111026903
1601	NC_008271	CGG	2	6	72134	72139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026903
1602	NC_008271	GGGTT	2	10	72143	72152	0 %	40 %	60 %	0 %	111026903
1603	NC_008271	TCAGG	2	10	72333	72342	20 %	20 %	40 %	20 %	111026903
1604	NC_008271	CCCAT	2	10	72347	72356	20 %	20 %	0 %	60 %	111026903
1605	NC_008271	GCG	2	6	72358	72363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026903
1606	NC_008271	CTT	2	6	72385	72390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026903
1607	NC_008271	GCA	2	6	72527	72532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026903
1608	NC_008271	GT	3	6	72541	72546	0 %	50 %	50 %	0 %	111026903
1609	NC_008271	GGT	2	6	72547	72552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026903
1610	NC_008271	GGC	2	6	72558	72563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026903
1611	NC_008271	TGG	2	6	72613	72618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026903
1612	NC_008271	TTCG	2	8	72772	72779	0 %	50 %	25 %	25 %	111026903
1613	NC_008271	GTC	2	6	72883	72888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026903
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1617	NC_008271	GCTC	2	8	73188	73195	0 %	25 %	25 %	50 %	111026903
1618	NC_008271	TCG	2	6	73211	73216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026903
1619	NC_008271	GGT	2	6	73232	73237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026903
1620	NC_008271	GTG	2	6	73242	73247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026903
1621	NC_008271	GTCGG	2	10	73382	73391	0 %	20 %	60 %	20 %	111026903
1622	NC_008271	CAG	2	6	73426	73431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026903
1623	NC_008271	CGA	2	6	73458	73463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026903
1624	NC_008271	CA	3	6	73466	73471	50 %	0 %	0 %	50 %	111026903
1625	NC_008271	GTC	2	6	73483	73488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026903
1626	NC_008271	CGC	2	6	73489	73494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026903
1627	NC_008271	CGTC	2	8	73515	73522	0 %	25 %	25 %	50 %	111026903
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