MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 7993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008271	GTCCG	2	10	44770	44779	0 %	20 %	40 %	40 %	111026876
1002	NC_008271	CGA	2	6	44812	44817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026876
1003	NC_008271	TCT	2	6	44821	44826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026876
1004	NC_008271	CCATCG	2	12	44827	44838	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	111026876
1005	NC_008271	GC	3	6	44970	44975	0 %	0 %	50 %	50 %	111026877
1006	NC_008271	CGG	2	6	45069	45074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026877
1007	NC_008271	TCGGC	2	10	45140	45149	0 %	20 %	40 %	40 %	111026877
1008	NC_008271	CGG	2	6	45153	45158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026877
1009	NC_008271	GTC	2	6	45166	45171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026877
1010	NC_008271	CGG	2	6	45243	45248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026877
1011	NC_008271	TGGTT	2	10	45277	45286	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_008271	CCAG	2	8	45287	45294	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_008271	GCG	2	6	45355	45360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_008271	GGT	2	6	45488	45493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026878
1015	NC_008271	CCG	2	6	45497	45502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026878
1016	NC_008271	GCG	2	6	45520	45525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026878
1017	NC_008271	CAG	2	6	45618	45623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026878
1018	NC_008271	CAA	2	6	45660	45665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026878
1019	NC_008271	CAGG	2	8	45672	45679	25 %	0 %	50 %	25 %	111026878
1020	NC_008271	CTGT	2	8	45688	45695	0 %	50 %	25 %	25 %	111026878
1021	NC_008271	GCA	2	6	45720	45725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026878
1022	NC_008271	CGG	2	6	45855	45860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_008271	TGG	2	6	45866	45871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_008271	GTCGA	2	10	45884	45893	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1025	NC_008271	GCG	2	6	45947	45952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_008271	ACG	2	6	46019	46024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026879
1027	NC_008271	GC	3	6	46045	46050	0 %	0 %	50 %	50 %	111026879
1028	NC_008271	GGC	2	6	46057	46062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026879
1029	NC_008271	CCGCTC	2	12	46099	46110	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	111026879
1030	NC_008271	CTG	2	6	46114	46119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026879
1031	NC_008271	CCGT	2	8	46137	46144	0 %	25 %	25 %	50 %	111026879
1032	NC_008271	CGCA	2	8	46180	46187	25 %	0 %	25 %	50 %	111026879
1033	NC_008271	GT	3	6	46285	46290	0 %	50 %	50 %	0 %	111026879
1034	NC_008271	CAG	2	6	46318	46323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026879
1035	NC_008271	CCG	2	6	46361	46366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026879
1036	NC_008271	TCG	2	6	46601	46606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026880
1037	NC_008271	TCG	2	6	46658	46663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026880
1038	NC_008271	AGG	2	6	46676	46681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026880
1039	NC_008271	CTT	2	6	46690	46695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026880
1040	NC_008271	CG	3	6	46715	46720	0 %	0 %	50 %	50 %	111026880
1041	NC_008271	GT	4	8	46783	46790	0 %	50 %	50 %	0 %	111026880
1042	NC_008271	AGTCG	2	10	46833	46842	20 %	20 %	40 %	20 %	111026880
1043	NC_008271	AG	3	6	46846	46851	50 %	0 %	50 %	0 %	111026880
1044	NC_008271	CTT	2	6	46933	46938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026880
1045	NC_008271	TCG	2	6	46979	46984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026880
1046	NC_008271	TTG	2	6	47324	47329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026880
1047	NC_008271	GCGG	2	8	47462	47469	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_008271	ATT	2	6	47483	47488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_008271	GCTA	2	8	47510	47517	25 %	25 %	25 %	25 %	111026881
1050	NC_008271	GCCC	2	8	47558	47565	0 %	0 %	25 %	75 %	111026881
1051	NC_008271	CGG	2	6	47691	47696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026881
1052	NC_008271	ACA	2	6	47755	47760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026881
1053	NC_008271	GGC	2	6	47851	47856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026881
1054	NC_008271	AAT	2	6	47857	47862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111026881
1055	NC_008271	CGA	2	6	47868	47873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026881
1056	NC_008271	GCG	2	6	47904	47909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026881
1057	NC_008271	CGC	2	6	48004	48009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026881
1058	NC_008271	CGAT	2	8	48040	48047	25 %	25 %	25 %	25 %	111026881
1059	NC_008271	CCG	2	6	48061	48066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026881
1060	NC_008271	TGC	2	6	48081	48086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026881
1061	NC_008271	GCG	2	6	48095	48100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026881
1062	NC_008271	CGT	2	6	48105	48110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026881
1063	NC_008271	ACT	2	6	48116	48121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026881
1064	NC_008271	TCG	3	9	48128	48136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026881
1065	NC_008271	GCAG	2	8	48140	48147	25 %	0 %	50 %	25 %	111026881
1066	NC_008271	CTC	2	6	48168	48173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026881
1067	NC_008271	GCG	2	6	48188	48193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026881
1068	NC_008271	ACG	2	6	48233	48238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026881
1069	NC_008271	GCT	2	6	48254	48259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026881
1070	NC_008271	GACTC	2	10	48286	48295	20 %	20 %	20 %	40 %	111026881
1071	NC_008271	ACA	2	6	48318	48323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026881
1072	NC_008271	AAC	2	6	48364	48369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026881
1073	NC_008271	ACC	2	6	48440	48445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026881
1074	NC_008271	CTC	2	6	48475	48480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026881
1075	NC_008271	TCA	2	6	48540	48545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026881
1076	NC_008271	CTA	2	6	48567	48572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026881
1077	NC_008271	CTGC	2	8	48573	48580	0 %	25 %	25 %	50 %	111026881
1078	NC_008271	TCG	2	6	48608	48613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026881
1079	NC_008271	GCCTC	2	10	48651	48660	0 %	20 %	20 %	60 %	111026881
1080	NC_008271	ACG	2	6	48676	48681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026881
1081	NC_008271	CAT	2	6	48691	48696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026881
1082	NC_008271	GTT	2	6	48703	48708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026881
1083	NC_008271	ACG	2	6	48734	48739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026881
1084	NC_008271	ATC	2	6	48830	48835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026881
1085	NC_008271	ACC	2	6	48949	48954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026881
1086	NC_008271	GTT	2	6	48982	48987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026881
1087	NC_008271	ACG	2	6	49149	49154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026881
1088	NC_008271	CCGG	2	8	49164	49171	0 %	0 %	50 %	50 %	111026881
1089	NC_008271	CAC	2	6	49191	49196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026881
1090	NC_008271	CG	3	6	49232	49237	0 %	0 %	50 %	50 %	111026881
1091	NC_008271	GCT	2	6	49261	49266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026881
1092	NC_008271	GAT	2	6	49305	49310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026881
1093	NC_008271	CTC	2	6	49344	49349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026881
1094	NC_008271	TA	3	6	49350	49355	50 %	50 %	0 %	0 %	111026881
1095	NC_008271	CGT	2	6	49367	49372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026881
1096	NC_008271	CCG	2	6	49454	49459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_008271	C	6	6	49479	49484	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1098	NC_008271	AACGA	2	10	49543	49552	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1099	NC_008271	GA	3	6	49584	49589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_008271	CGG	3	9	49590	49598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_008271	TCA	2	6	49601	49606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_008271	GCGT	2	8	49656	49663	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_008271	GAC	2	6	49717	49722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_008271	GCCC	2	8	49830	49837	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1105	NC_008271	GCCC	2	8	49842	49849	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1106	NC_008271	GCG	2	6	50111	50116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_008271	TCCC	2	8	50202	50209	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1108	NC_008271	GATCG	2	10	50235	50244	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1109	NC_008271	CGA	2	6	50254	50259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_008271	GAA	2	6	50266	50271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_008271	C	6	6	50289	50294	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1112	NC_008271	GC	3	6	50307	50312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_008271	CCA	2	6	50356	50361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_008271	CTA	2	6	50377	50382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_008271	GTTC	2	8	50407	50414	0 %	50 %	25 %	25 %	111026882
1116	NC_008271	CCG	2	6	50415	50420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026882
1117	NC_008271	CGA	2	6	50429	50434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026882
1118	NC_008271	TCG	2	6	50448	50453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026882
1119	NC_008271	GCG	2	6	50461	50466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026882
1120	NC_008271	CGGG	2	8	50471	50478	0 %	0 %	75 %	25 %	111026882
1121	NC_008271	CCGGG	2	10	50506	50515	0 %	0 %	60 %	40 %	111026882
1122	NC_008271	GAT	2	6	50516	50521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026882
1123	NC_008271	ACC	2	6	50549	50554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026882
1124	NC_008271	GTC	2	6	50633	50638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026882
1125	NC_008271	CAG	2	6	50768	50773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026883
1126	NC_008271	GCA	2	6	50959	50964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026883
1127	NC_008271	CGA	2	6	50985	50990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026883
1128	NC_008271	ATCG	2	8	50993	51000	25 %	25 %	25 %	25 %	111026883
1129	NC_008271	GAG	2	6	51029	51034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026883
1130	NC_008271	GC	3	6	51113	51118	0 %	0 %	50 %	50 %	111026883
1131	NC_008271	TCGA	2	8	51134	51141	25 %	25 %	25 %	25 %	111026883
1132	NC_008271	ATC	2	6	51149	51154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026883
1133	NC_008271	GAT	2	6	51158	51163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026883
1134	NC_008271	AGT	2	6	51202	51207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026883
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1143	NC_008271	CATCAA	2	12	51619	51630	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	111026883
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1145	NC_008271	GCA	2	6	51695	51700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026883
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1152	NC_008271	CCT	2	6	52059	52064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026883
1153	NC_008271	CAT	2	6	52153	52158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026883
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1156	NC_008271	CGG	2	6	52283	52288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1157	NC_008271	CAC	2	6	52352	52357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1158	NC_008271	C	7	7	52377	52383	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1159	NC_008271	GCA	2	6	52415	52420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1160	NC_008271	ACCG	2	8	52433	52440	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1161	NC_008271	GGC	2	6	52543	52548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1162	NC_008271	GCG	2	6	52633	52638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1163	NC_008271	CGG	3	9	52693	52701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026884
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1375	NC_008271	CCG	3	9	61276	61284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026890
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1500	NC_008271	CGA	2	6	67994	67999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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