MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 7993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008271	GGC	2	6	21337	21342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026853
502	NC_008271	CGG	2	6	21417	21422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026853
503	NC_008271	CCG	2	6	21432	21437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026853
504	NC_008271	GCG	2	6	21554	21559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026853
505	NC_008271	GCC	4	12	21569	21580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026853
506	NC_008271	CGCAT	2	10	21581	21590	20 %	20 %	20 %	40 %	111026853
507	NC_008271	ACC	2	6	21627	21632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026853
508	NC_008271	TCACCG	2	12	21683	21694	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	111026853
509	NC_008271	AGGT	2	8	21701	21708	25 %	25 %	50 %	0 %	111026853
510	NC_008271	CCG	2	6	21754	21759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026853
511	NC_008271	GGT	2	6	21799	21804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026853
512	NC_008271	CGA	2	6	21831	21836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026853
513	NC_008271	CTC	2	6	21973	21978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026853
514	NC_008271	GGC	2	6	21994	21999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026853
515	NC_008271	GTC	2	6	22093	22098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026853
516	NC_008271	GCT	2	6	22202	22207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026854
517	NC_008271	TCC	2	6	22216	22221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026854
518	NC_008271	GCCG	2	8	22258	22265	0 %	0 %	50 %	50 %	111026854
519	NC_008271	TGCGTT	2	12	22307	22318	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	111026854
520	NC_008271	CCG	2	6	22433	22438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026854
521	NC_008271	CTCA	2	8	22508	22515	25 %	25 %	0 %	50 %	111026855
522	NC_008271	G	6	6	22516	22521	0 %	0 %	100 %	0 %	111026855
523	NC_008271	TGG	2	6	22553	22558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026855
524	NC_008271	TTCGC	2	10	22568	22577	0 %	40 %	20 %	40 %	111026855
525	NC_008271	GAG	2	6	22655	22660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026855
526	NC_008271	CTG	2	6	22757	22762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026855
527	NC_008271	GGTG	2	8	22789	22796	0 %	25 %	75 %	0 %	111026855
528	NC_008271	GCG	2	6	22799	22804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026855
529	NC_008271	ACG	2	6	22817	22822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026855
530	NC_008271	CGCGG	2	10	22867	22876	0 %	0 %	60 %	40 %	111026855
531	NC_008271	GCG	2	6	22897	22902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026855
532	NC_008271	CCCGA	2	10	22924	22933	20 %	0 %	20 %	60 %	111026855
533	NC_008271	GC	3	6	23072	23077	0 %	0 %	50 %	50 %	111026855
534	NC_008271	GCC	2	6	23090	23095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026855
535	NC_008271	TCG	2	6	23126	23131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026855
536	NC_008271	TGCC	2	8	23173	23180	0 %	25 %	25 %	50 %	111026855
537	NC_008271	TC	3	6	23317	23322	0 %	50 %	0 %	50 %	111026855
538	NC_008271	CGC	2	6	23367	23372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026855
539	NC_008271	GTC	2	6	23399	23404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026855
540	NC_008271	GCT	2	6	23546	23551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026855
541	NC_008271	GAT	2	6	23671	23676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026856
542	NC_008271	GCCC	2	8	23713	23720	0 %	0 %	25 %	75 %	111026856
543	NC_008271	ACC	2	6	23738	23743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026856
544	NC_008271	GCC	2	6	23851	23856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026856
545	NC_008271	GGC	2	6	23899	23904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026856
546	NC_008271	TGG	2	6	23918	23923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026856
547	NC_008271	GC	3	6	23927	23932	0 %	0 %	50 %	50 %	111026856
548	NC_008271	GAT	2	6	24022	24027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026856
549	NC_008271	GACCTC	2	12	24175	24186	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	111026856
550	NC_008271	GGT	2	6	24208	24213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026856
551	NC_008271	CTG	2	6	24223	24228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026856
552	NC_008271	GCG	2	6	24347	24352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026856
553	NC_008271	CGA	2	6	24386	24391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026856
554	NC_008271	TCG	2	6	24454	24459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026856
555	NC_008271	GCC	2	6	24503	24508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026856
556	NC_008271	CGG	2	6	24520	24525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026856
557	NC_008271	TTCCG	2	10	24559	24568	0 %	40 %	20 %	40 %	111026856
558	NC_008271	G	6	6	24575	24580	0 %	0 %	100 %	0 %	111026856
559	NC_008271	GT	4	8	24586	24593	0 %	50 %	50 %	0 %	111026856
560	NC_008271	TTCC	2	8	24619	24626	0 %	50 %	0 %	50 %	111026856
561	NC_008271	GGCG	2	8	24648	24655	0 %	0 %	75 %	25 %	111026856
562	NC_008271	CCG	2	6	24681	24686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026856
563	NC_008271	GCA	2	6	24693	24698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026856
564	NC_008271	TCACC	2	10	24756	24765	20 %	20 %	0 %	60 %	111026856
565	NC_008271	CAG	2	6	24805	24810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026856
566	NC_008271	TCG	2	6	24861	24866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026856
567	NC_008271	GTA	2	6	24997	25002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026857
568	NC_008271	TCG	2	6	25010	25015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026857
569	NC_008271	CGC	2	6	25024	25029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026857
570	NC_008271	CGTGTC	2	12	25111	25122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026857
571	NC_008271	CGA	2	6	25146	25151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026857
572	NC_008271	CTTC	2	8	25167	25174	0 %	50 %	0 %	50 %	111026857
573	NC_008271	ACG	2	6	25199	25204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026857
574	NC_008271	CAC	2	6	25276	25281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026857
575	NC_008271	CGA	2	6	25335	25340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026857
576	NC_008271	GTC	2	6	25354	25359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026857
577	NC_008271	GGC	2	6	25366	25371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026857
578	NC_008271	GTG	2	6	25462	25467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026857
579	NC_008271	CAC	2	6	25504	25509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026857
580	NC_008271	GCA	2	6	25517	25522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026857
581	NC_008271	GTA	2	6	25540	25545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026857
582	NC_008271	GTCAAG	2	12	25580	25591	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	111026857
583	NC_008271	GGC	2	6	25636	25641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026857
584	NC_008271	CTC	2	6	25666	25671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026857
585	NC_008271	CCGC	2	8	25742	25749	0 %	0 %	25 %	75 %	111026857
586	NC_008271	GC	3	6	25748	25753	0 %	0 %	50 %	50 %	111026857
587	NC_008271	TGTCC	2	10	25758	25767	0 %	40 %	20 %	40 %	111026857
588	NC_008271	TCG	2	6	25802	25807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026857
589	NC_008271	TGC	2	6	25852	25857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026857
590	NC_008271	CCT	2	6	25876	25881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026858
591	NC_008271	GTC	2	6	25902	25907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026858
592	NC_008271	CCG	2	6	25913	25918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026858
593	NC_008271	TCG	2	6	25957	25962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026858
594	NC_008271	CGG	2	6	25976	25981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026858
595	NC_008271	GCT	2	6	25988	25993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026858
596	NC_008271	TGT	2	6	26008	26013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026858
597	NC_008271	GCA	2	6	26015	26020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026858
598	NC_008271	GC	4	8	26022	26029	0 %	0 %	50 %	50 %	111026858
599	NC_008271	CGC	2	6	26153	26158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026858
600	NC_008271	GC	3	6	26167	26172	0 %	0 %	50 %	50 %	111026858
601	NC_008271	GCG	2	6	26179	26184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026858
602	NC_008271	CGA	3	9	26222	26230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026858
603	NC_008271	CGG	2	6	26249	26254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026858
604	NC_008271	GCGCA	2	10	26272	26281	20 %	0 %	40 %	40 %	111026858
605	NC_008271	GAG	3	9	26293	26301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026858
606	NC_008271	GTT	2	6	26316	26321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026858
607	NC_008271	GGC	2	6	26355	26360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026858
608	NC_008271	TCG	2	6	26428	26433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026858
609	NC_008271	GCT	2	6	26441	26446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026858
610	NC_008271	GCA	2	6	26467	26472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026858
611	NC_008271	GTT	2	6	26500	26505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026858
612	NC_008271	CGGG	2	8	26515	26522	0 %	0 %	75 %	25 %	111026858
613	NC_008271	TC	3	6	26540	26545	0 %	50 %	0 %	50 %	111026858
614	NC_008271	GCC	2	6	26730	26735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026858
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624	NC_008271	CCG	2	6	27018	27023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026859
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626	NC_008271	GC	3	6	27268	27273	0 %	0 %	50 %	50 %	111026859
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653	NC_008271	CCG	2	6	28248	28253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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