MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 7993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008271	GCG	2	6	249161	249166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027083
6002	NC_008271	CCCGT	2	10	249191	249200	0 %	20 %	20 %	60 %	111027083
6003	NC_008271	CGG	2	6	249237	249242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027083
6004	NC_008271	CGG	2	6	249259	249264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027083
6005	NC_008271	GTG	2	6	249293	249298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027083
6006	NC_008271	CGA	2	6	249345	249350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027083
6007	NC_008271	GC	3	6	249364	249369	0 %	0 %	50 %	50 %	111027083
6008	NC_008271	TGC	2	6	249436	249441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027083
6009	NC_008271	GTC	3	9	249448	249456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027083
6010	NC_008271	TACG	2	8	249547	249554	25 %	25 %	25 %	25 %	111027083
6011	NC_008271	CAC	2	6	249562	249567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027083
6012	NC_008271	CAC	2	6	249610	249615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027083
6013	NC_008271	CGC	2	6	249627	249632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027083
6014	NC_008271	CAG	2	6	249652	249657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027083
6015	NC_008271	GGA	2	6	249675	249680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027083
6016	NC_008271	GCG	2	6	249698	249703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027083
6017	NC_008271	GTC	2	6	249724	249729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027083
6018	NC_008271	CGT	2	6	249732	249737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027083
6019	NC_008271	GAT	2	6	249754	249759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027083
6020	NC_008271	AGC	2	6	249767	249772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027083
6021	NC_008271	CGA	2	6	249789	249794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027083
6022	NC_008271	CCCG	2	8	249888	249895	0 %	0 %	25 %	75 %	111027083
6023	NC_008271	GT	3	6	249900	249905	0 %	50 %	50 %	0 %	111027083
6024	NC_008271	CCGG	2	8	249953	249960	0 %	0 %	50 %	50 %	111027083
6025	NC_008271	CGG	2	6	249976	249981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027083
6026	NC_008271	TCG	2	6	249995	250000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027083
6027	NC_008271	GCCG	2	8	250003	250010	0 %	0 %	50 %	50 %	111027083
6028	NC_008271	CGT	3	9	250011	250019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027083
6029	NC_008271	TCG	2	6	250025	250030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027083
6030	NC_008271	CGG	2	6	250063	250068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027083
6031	NC_008271	CGT	2	6	250077	250082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027083
6032	NC_008271	CGG	2	6	250089	250094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027083
6033	NC_008271	GCT	2	6	250101	250106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027083
6034	NC_008271	TGC	2	6	250123	250128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027083
6035	NC_008271	GGCT	2	8	250132	250139	0 %	25 %	50 %	25 %	111027083
6036	NC_008271	CGA	2	6	250161	250166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027083
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6042	NC_008271	TCG	2	6	250463	250468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027083
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6046	NC_008271	CCGT	2	8	250659	250666	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6047	NC_008271	CAC	2	6	250692	250697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_008271	TGCA	2	8	250731	250738	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6049	NC_008271	CGC	2	6	250781	250786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_008271	CGA	2	6	250790	250795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_008271	AC	3	6	250805	250810	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6052	NC_008271	CGT	2	6	250837	250842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_008271	ACC	2	6	250849	250854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6054	NC_008271	CCA	2	6	250869	250874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027084
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6061	NC_008271	GTCATC	2	12	251110	251121	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	111027084
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6080	NC_008271	CGGG	2	8	251719	251726	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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6113	NC_008271	GATC	2	8	252786	252793	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6117	NC_008271	TAGC	2	8	252996	253003	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6118	NC_008271	GGTCGC	2	12	253019	253030	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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6122	NC_008271	ACC	2	6	253252	253257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027087
6123	NC_008271	GACG	2	8	253467	253474	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6124	NC_008271	GTC	2	6	253549	253554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_008271	TCG	2	6	253730	253735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_008271	GCGTT	4	20	253802	253821	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6127	NC_008271	GCGTT	2	10	253840	253849	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6128	NC_008271	TGGT	2	8	253881	253888	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_008271	GTCT	2	8	253896	253903	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6130	NC_008271	GGT	2	6	253980	253985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_008271	CGC	2	6	254021	254026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6132	NC_008271	CGTC	2	8	254090	254097	0 %	25 %	25 %	50 %	111027088
6133	NC_008271	CGC	2	6	254098	254103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027088
6134	NC_008271	GCTG	2	8	254188	254195	0 %	25 %	50 %	25 %	111027088
6135	NC_008271	GCTGT	2	10	254230	254239	0 %	40 %	40 %	20 %	111027088
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6151	NC_008271	CCAAGA	2	12	254943	254954	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	111027088
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6161	NC_008271	CCG	2	6	255429	255434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6163	NC_008271	CCT	2	6	255451	255456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6165	NC_008271	GCTA	2	8	255522	255529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6492	NC_008271	CAA	2	6	270658	270663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111027105
6493	NC_008271	GCCC	2	8	270708	270715	0 %	0 %	25 %	75 %	111027105
6494	NC_008271	TGG	2	6	270740	270745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027105
6495	NC_008271	CG	3	6	270762	270767	0 %	0 %	50 %	50 %	111027105
6496	NC_008271	CGC	2	6	270778	270783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027105
6497	NC_008271	ACA	2	6	270809	270814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6498	NC_008271	GCA	2	6	270856	270861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6499	NC_008271	GTC	2	6	271063	271068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027106
6500	NC_008271	TGG	2	6	271083	271088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027106

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