MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 7993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_008271	CAC	2	6	193210	193215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027017
4503	NC_008271	CAT	2	6	193231	193236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027017
4504	NC_008271	CGG	2	6	193246	193251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027017
4505	NC_008271	CGT	2	6	193266	193271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027017
4506	NC_008271	CAC	2	6	193277	193282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027017
4507	NC_008271	GGCC	2	8	193300	193307	0 %	0 %	50 %	50 %	111027017
4508	NC_008271	CCG	2	6	193326	193331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027017
4509	NC_008271	GGT	2	6	193396	193401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027017
4510	NC_008271	CGA	2	6	193426	193431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027017
4511	NC_008271	ATC	2	6	193448	193453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027017
4512	NC_008271	CACC	2	8	193485	193492	25 %	0 %	0 %	75 %	111027017
4513	NC_008271	GACCT	2	10	193541	193550	20 %	20 %	20 %	40 %	111027017
4514	NC_008271	CTC	2	6	193559	193564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027017
4515	NC_008271	CGG	2	6	193621	193626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027017
4516	NC_008271	TCG	2	6	193641	193646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027017
4517	NC_008271	TGG	2	6	193652	193657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027017
4518	NC_008271	AGACCG	2	12	193659	193670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027017
4519	NC_008271	CAT	2	6	193675	193680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027017
4520	NC_008271	CCA	2	6	193707	193712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027017
4521	NC_008271	TCG	2	6	193758	193763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027017
4522	NC_008271	ACG	3	9	193764	193772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027017
4523	NC_008271	CGG	2	6	193789	193794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027017
4524	NC_008271	ACG	4	12	193932	193943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027017
4525	NC_008271	CGA	2	6	193969	193974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027017
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4529	NC_008271	GTC	2	6	194060	194065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027017
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4531	NC_008271	TCG	2	6	194097	194102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027017
4532	NC_008271	TCC	2	6	194112	194117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027017
4533	NC_008271	TCG	2	6	194313	194318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027017
4534	NC_008271	CTCG	2	8	194378	194385	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4535	NC_008271	TGT	2	6	194395	194400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_008271	CTCA	2	8	194534	194541	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4537	NC_008271	TGA	2	6	194599	194604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027018
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4539	NC_008271	CGCCGT	2	12	194694	194705	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111027018
4540	NC_008271	GCG	2	6	194729	194734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027018
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4546	NC_008271	ATG	2	6	194975	194980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027018
4547	NC_008271	CAG	2	6	195004	195009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_008271	GAT	2	6	195029	195034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_008271	TGT	2	6	195114	195119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_008271	CAA	2	6	195170	195175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_008271	TTG	2	6	195210	195215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_008271	TGG	2	6	195288	195293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027019
4553	NC_008271	TGT	2	6	195492	195497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111027019
4554	NC_008271	TCG	2	6	195525	195530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027019
4555	NC_008271	GTA	2	6	195692	195697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_008271	A	6	6	195705	195710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_008271	GTT	2	6	195756	195761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_008271	TCGG	2	8	195769	195776	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4559	NC_008271	GCG	2	6	195829	195834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_008271	TCA	2	6	195862	195867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_008271	CCA	2	6	195871	195876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4562	NC_008271	CGA	2	6	195916	195921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_008271	GTG	2	6	195959	195964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027020
4564	NC_008271	GACT	2	8	195994	196001	25 %	25 %	25 %	25 %	111027020
4565	NC_008271	GCC	2	6	196009	196014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027020
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4584	NC_008271	CAG	2	6	196708	196713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027020
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4588	NC_008271	CGGCG	2	10	196794	196803	0 %	0 %	60 %	40 %	111027020
4589	NC_008271	CCG	2	6	196947	196952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027021
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4592	NC_008271	CG	3	6	197129	197134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4593	NC_008271	CGGG	2	8	197292	197299	0 %	0 %	75 %	25 %	111027022
4594	NC_008271	GCG	3	9	197308	197316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027022
4595	NC_008271	GGCG	2	8	197382	197389	0 %	0 %	75 %	25 %	111027022
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4602	NC_008271	GAG	2	6	197488	197493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027022
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4606	NC_008271	ACGA	2	8	197578	197585	50 %	0 %	25 %	25 %	111027022
4607	NC_008271	GGC	2	6	197593	197598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027022
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4609	NC_008271	GCG	2	6	197738	197743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_008271	CGC	2	6	197791	197796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027023
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4622	NC_008271	CGGG	2	8	198450	198457	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4623	NC_008271	CGG	2	6	198475	198480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_008271	CGGG	2	8	198486	198493	0 %	0 %	75 %	25 %	111027024
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4744	NC_008271	CGC	2	6	202780	202785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027030
4745	NC_008271	CGA	3	9	202807	202815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027030
4746	NC_008271	GTC	2	6	202832	202837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027030
4747	NC_008271	GTCGCC	2	12	202868	202879	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111027030
4748	NC_008271	CTCGCC	2	12	202898	202909	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	111027030
4749	NC_008271	GTG	2	6	202928	202933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027030
4750	NC_008271	CCGC	2	8	203022	203029	0 %	0 %	25 %	75 %	111027030
4751	NC_008271	CAT	2	6	203047	203052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027030
4752	NC_008271	GTCG	2	8	203059	203066	0 %	25 %	50 %	25 %	111027030
4753	NC_008271	CGA	2	6	203071	203076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027030
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4763	NC_008271	GCTGGT	2	12	203592	203603	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	111027031
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4780	NC_008271	GCA	2	6	204199	204204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027031
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4794	NC_008271	GGT	2	6	204741	204746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027032
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4797	NC_008271	GCCGA	2	10	204915	204924	20 %	0 %	40 %	40 %	111027032
4798	NC_008271	GTCCTC	2	12	204929	204940	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	111027032
4799	NC_008271	GC	3	6	204975	204980	0 %	0 %	50 %	50 %	111027032
4800	NC_008271	GGTG	2	8	204994	205001	0 %	25 %	75 %	0 %	111027033
4801	NC_008271	TCG	2	6	205025	205030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027033
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4818	NC_008271	ATC	2	6	205834	205839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027034
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4820	NC_008271	ACGTC	2	10	205850	205859	20 %	20 %	20 %	40 %	111027034
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4822	NC_008271	CTGA	2	8	205925	205932	25 %	25 %	25 %	25 %	111027034
4823	NC_008271	TGC	2	6	205946	205951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027034
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4827	NC_008271	GGTCGC	2	12	206362	206373	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111027035
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4833	NC_008271	CTC	2	6	206618	206623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4834	NC_008271	ATG	2	6	206655	206660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4836	NC_008271	GGT	2	6	206712	206717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4839	NC_008271	GCCC	3	12	206760	206771	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4840	NC_008271	CGGCCG	2	12	206776	206787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4852	NC_008271	GGC	2	6	207433	207438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027037
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4862	NC_008271	CGGT	2	8	207824	207831	0 %	25 %	50 %	25 %	111027037
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4985	NC_008271	CAC	2	6	212115	212120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027040
4986	NC_008271	TGC	2	6	212177	212182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027040
4987	NC_008271	GGCG	2	8	212187	212194	0 %	0 %	75 %	25 %	111027040
4988	NC_008271	CGC	2	6	212235	212240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027040
4989	NC_008271	CGC	2	6	212244	212249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027040
4990	NC_008271	AGGC	2	8	212252	212259	25 %	0 %	50 %	25 %	111027040
4991	NC_008271	CGG	2	6	212292	212297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027040
4992	NC_008271	GTC	2	6	212314	212319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027040
4993	NC_008271	GCCG	2	8	212338	212345	0 %	0 %	50 %	50 %	111027040
4994	NC_008271	GCTG	2	8	212351	212358	0 %	25 %	50 %	25 %	111027040
4995	NC_008271	TCG	3	9	212399	212407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027040
4996	NC_008271	ACG	2	6	212408	212413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027040
4997	NC_008271	CG	3	6	212464	212469	0 %	0 %	50 %	50 %	111027040
4998	NC_008271	CGG	2	6	212507	212512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027040
4999	NC_008271	TGC	2	6	212549	212554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027040
5000	NC_008271	CCGCG	2	10	212571	212580	0 %	0 %	40 %	60 %	111027040

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