MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL2

Total Repeats: 10065

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008270	TAC	2	6	65318	65323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026130
1502	NC_008270	CTG	2	6	65357	65362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026130
1503	NC_008270	GTG	2	6	65384	65389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026130
1504	NC_008270	GCC	2	6	65425	65430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026130
1505	NC_008270	GTC	2	6	65444	65449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026130
1506	NC_008270	CA	3	6	65524	65529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_008270	GACCT	2	10	65566	65575	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1508	NC_008270	GTG	2	6	65614	65619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_008270	ACG	2	6	65633	65638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_008270	AGG	2	6	65672	65677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_008270	GAC	2	6	65702	65707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_008270	AGAA	2	8	65730	65737	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_008270	TC	4	8	65906	65913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_008270	GCC	2	6	65971	65976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_008270	ATC	2	6	66015	66020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026131
1516	NC_008270	GCG	2	6	66058	66063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026131
1517	NC_008270	GTCG	2	8	66095	66102	0 %	25 %	50 %	25 %	111026131
1518	NC_008270	CCGC	2	8	66114	66121	0 %	0 %	25 %	75 %	111026131
1519	NC_008270	CGA	2	6	66158	66163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026131
1520	NC_008270	GCA	2	6	66179	66184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026131
1521	NC_008270	CCG	2	6	66202	66207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026131
1522	NC_008270	CCCG	2	8	66281	66288	0 %	0 %	25 %	75 %	111026131
1523	NC_008270	GGT	2	6	66311	66316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026131
1524	NC_008270	GCCC	2	8	66320	66327	0 %	0 %	25 %	75 %	111026131
1525	NC_008270	CGG	2	6	66350	66355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026131
1526	NC_008270	CACC	2	8	66359	66366	25 %	0 %	0 %	75 %	111026131
1527	NC_008270	GCA	2	6	66404	66409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026131
1528	NC_008270	CCT	2	6	66432	66437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026131
1529	NC_008270	GTC	2	6	66438	66443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026131
1530	NC_008270	CACC	2	8	66451	66458	25 %	0 %	0 %	75 %	111026131
1531	NC_008270	CGGC	2	8	66463	66470	0 %	0 %	50 %	50 %	111026131
1532	NC_008270	CCCT	2	8	66474	66481	0 %	25 %	0 %	75 %	111026131
1533	NC_008270	CG	3	6	66554	66559	0 %	0 %	50 %	50 %	111026131
1534	NC_008270	GCG	2	6	66573	66578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026131
1535	NC_008270	TGCG	2	8	66580	66587	0 %	25 %	50 %	25 %	111026131
1536	NC_008270	GCG	2	6	66610	66615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026131
1537	NC_008270	GGA	2	6	66651	66656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026131
1538	NC_008270	CCG	2	6	66661	66666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026131
1539	NC_008270	CTA	2	6	66698	66703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026131
1540	NC_008270	CGG	2	6	66713	66718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026131
1541	NC_008270	CAG	2	6	66765	66770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026131
1542	NC_008270	AGCCC	2	10	66785	66794	20 %	0 %	20 %	60 %	111026131
1543	NC_008270	CTG	2	6	66801	66806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026131
1544	NC_008270	GGCA	2	8	66817	66824	25 %	0 %	50 %	25 %	111026131
1545	NC_008270	CCGT	2	8	66910	66917	0 %	25 %	25 %	50 %	111026131
1546	NC_008270	GCCC	2	8	66929	66936	0 %	0 %	25 %	75 %	111026131
1547	NC_008270	AGA	2	6	67067	67072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_008270	CAG	2	6	67101	67106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026132
1549	NC_008270	AAG	2	6	67112	67117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026132
1550	NC_008270	GAA	2	6	67336	67341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026132
1551	NC_008270	CGTG	2	8	67366	67373	0 %	25 %	50 %	25 %	111026132
1552	NC_008270	GAC	2	6	67399	67404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026132
1553	NC_008270	TGC	3	9	67417	67425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026132
1554	NC_008270	GCC	2	6	67444	67449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026132
1555	NC_008270	AGCG	2	8	67472	67479	25 %	0 %	50 %	25 %	111026132
1556	NC_008270	GGT	2	6	67514	67519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_008270	GAT	2	6	67601	67606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_008270	AGG	2	6	67614	67619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_008270	GCA	2	6	67647	67652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026133
1560	NC_008270	CCGG	2	8	67676	67683	0 %	0 %	50 %	50 %	111026133
1561	NC_008270	GCA	2	6	67721	67726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026133
1562	NC_008270	CGC	2	6	67749	67754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026133
1563	NC_008270	CTGG	2	8	67862	67869	0 %	25 %	50 %	25 %	111026133
1564	NC_008270	CCA	2	6	67878	67883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026133
1565	NC_008270	CAT	2	6	68019	68024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026133
1566	NC_008270	GCC	2	6	68104	68109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026133
1567	NC_008270	CGG	2	6	68144	68149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026133
1568	NC_008270	CCA	2	6	68153	68158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026133
1569	NC_008270	CT	3	6	68251	68256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_008270	GGT	2	6	68308	68313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_008270	TGA	2	6	68317	68322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026134
1572	NC_008270	GCA	2	6	68325	68330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026134
1573	NC_008270	CCGG	2	8	68336	68343	0 %	0 %	50 %	50 %	111026134
1574	NC_008270	GCC	2	6	68364	68369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026134
1575	NC_008270	GCT	2	6	68408	68413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026134
1576	NC_008270	GGC	2	6	68537	68542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026134
1577	NC_008270	CCGC	2	8	68554	68561	0 %	0 %	25 %	75 %	111026134
1578	NC_008270	CGG	2	6	68569	68574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026134
1579	NC_008270	CGA	2	6	68612	68617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026134
1580	NC_008270	TTG	2	6	68631	68636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026134
1581	NC_008270	CGC	2	6	68678	68683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026134
1582	NC_008270	CGC	2	6	68696	68701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026134
1583	NC_008270	TCG	2	6	68730	68735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026135
1584	NC_008270	TCGGG	2	10	68788	68797	0 %	20 %	60 %	20 %	111026135
1585	NC_008270	CGCCGT	2	12	68802	68813	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111026135
1586	NC_008270	CCGG	2	8	68856	68863	0 %	0 %	50 %	50 %	111026135
1587	NC_008270	GAC	2	6	68867	68872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026135
1588	NC_008270	GT	3	6	68880	68885	0 %	50 %	50 %	0 %	111026135
1589	NC_008270	GC	3	6	68955	68960	0 %	0 %	50 %	50 %	111026135
1590	NC_008270	TCG	3	9	68985	68993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026135
1591	NC_008270	ACG	2	6	68994	68999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026135
1592	NC_008270	GCC	2	6	69005	69010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026135
1593	NC_008270	CCGG	2	8	69030	69037	0 %	0 %	50 %	50 %	111026135
1594	NC_008270	GTG	2	6	69049	69054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026135
1595	NC_008270	GCC	2	6	69068	69073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026135
1596	NC_008270	GC	3	6	69078	69083	0 %	0 %	50 %	50 %	111026135
1597	NC_008270	GGT	2	6	69090	69095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026135
1598	NC_008270	TCGG	2	8	69145	69152	0 %	25 %	50 %	25 %	111026135
1599	NC_008270	GAT	2	6	69173	69178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026135
1600	NC_008270	GCC	2	6	69204	69209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026135
1601	NC_008270	CGGA	2	8	69261	69268	25 %	0 %	50 %	25 %	111026135
1602	NC_008270	GGT	2	6	69352	69357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026135
1603	NC_008270	CGA	2	6	69400	69405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026135
1604	NC_008270	GAC	2	6	69449	69454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026135
1605	NC_008270	CGG	2	6	69464	69469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_008270	CGG	2	6	69540	69545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_008270	TC	4	8	69577	69584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_008270	GGA	2	6	69638	69643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026136
1609	NC_008270	TTC	2	6	69654	69659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026136
1610	NC_008270	CGG	2	6	69679	69684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026136
1611	NC_008270	CGG	2	6	69766	69771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026136
1612	NC_008270	GT	3	6	69773	69778	0 %	50 %	50 %	0 %	111026136
1613	NC_008270	TGG	3	9	69802	69810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026136
1614	NC_008270	GCC	2	6	69891	69896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026136
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1617	NC_008270	GCA	2	6	69927	69932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026136
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1619	NC_008270	GTA	2	6	69972	69977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026136
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1621	NC_008270	GT	3	6	70044	70049	0 %	50 %	50 %	0 %	111026136
1622	NC_008270	CG	3	6	70059	70064	0 %	0 %	50 %	50 %	111026136
1623	NC_008270	TGG	2	6	70123	70128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026136
1624	NC_008270	CAG	2	6	70158	70163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026136
1625	NC_008270	TGG	2	6	70164	70169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026136
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1627	NC_008270	TGTAGG	2	12	70223	70234	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	111026136
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