MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL2

Total Repeats: 10065

< Previous12...9101112131415161718192021Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008270	TGC	2	6	439359	439364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_008270	TCT	2	6	439433	439438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026520
10003	NC_008270	CGA	2	6	439439	439444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026520
10004	NC_008270	GTG	3	9	439450	439458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026520
10005	NC_008270	AGA	2	6	439524	439529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026520
10006	NC_008270	GCA	2	6	439578	439583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026520
10007	NC_008270	CGC	3	9	439588	439596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026520
10008	NC_008270	CCG	2	6	439612	439617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026520
10009	NC_008270	CCA	2	6	439654	439659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026520
10010	NC_008270	GGT	2	6	439664	439669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026520
10011	NC_008270	TGG	2	6	439672	439677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026520
10012	NC_008270	GCC	2	6	439695	439700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026520
10013	NC_008270	CCG	2	6	439782	439787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026520
10014	NC_008270	CG	3	6	439793	439798	0 %	0 %	50 %	50 %	111026520
10015	NC_008270	ACC	2	6	439834	439839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026520
10016	NC_008270	GCC	2	6	439855	439860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026520
10017	NC_008270	CGA	2	6	439905	439910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026521
10018	NC_008270	CGAC	2	8	439917	439924	25 %	0 %	25 %	50 %	111026521
10019	NC_008270	GCG	2	6	439934	439939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026521
10020	NC_008270	GCC	2	6	439965	439970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026521
10021	NC_008270	GAC	2	6	439982	439987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026521
10022	NC_008270	GC	3	6	439998	440003	0 %	0 %	50 %	50 %	111026521
10023	NC_008270	GAC	2	6	440063	440068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026521
10024	NC_008270	GCG	2	6	440111	440116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026521
10025	NC_008270	CGA	2	6	440191	440196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026521
10026	NC_008270	GGT	2	6	440332	440337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026521
10027	NC_008270	CGA	2	6	440398	440403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026521
10028	NC_008270	CCG	2	6	440416	440421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026521
10029	NC_008270	GAG	2	6	440438	440443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026521
10030	NC_008270	GAG	2	6	440456	440461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026521
10031	NC_008270	TGGA	2	8	440495	440502	25 %	25 %	50 %	0 %	111026521
10032	NC_008270	AAT	2	6	440552	440557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_008270	CG	3	6	440569	440574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10034	NC_008270	GAC	2	6	440582	440587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_008270	GCATC	2	10	440663	440672	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10036	NC_008270	CCG	2	6	440804	440809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026522
10037	NC_008270	CGC	2	6	440820	440825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026522
10038	NC_008270	CA	3	6	440908	440913	50 %	0 %	0 %	50 %	111026522
10039	NC_008270	CAG	2	6	440920	440925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026522
10040	NC_008270	CTTCTG	2	12	441004	441015	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	111026522
10041	NC_008270	CACG	2	8	441022	441029	25 %	0 %	25 %	50 %	111026522
10042	NC_008270	GGGCTC	2	12	441068	441079	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111026522
10043	NC_008270	CAGT	2	8	441116	441123	25 %	25 %	25 %	25 %	111026522
10044	NC_008270	GAA	2	6	441132	441137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026522
10045	NC_008270	GAA	2	6	441258	441263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026522
10046	NC_008270	TGGC	2	8	441309	441316	0 %	25 %	50 %	25 %	111026522
10047	NC_008270	CGAGA	2	10	441379	441388	40 %	0 %	40 %	20 %	111026522
10048	NC_008270	GCA	2	6	441505	441510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026522
10049	NC_008270	TGC	2	6	441573	441578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026522
10050	NC_008270	ACG	2	6	441782	441787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_008270	AGC	2	6	441802	441807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_008270	CCA	2	6	441867	441872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10053	NC_008270	GAG	2	6	441877	441882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_008270	CGG	2	6	442048	442053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_008270	GC	3	6	442054	442059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10056	NC_008270	TTGA	2	8	442102	442109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_008270	GT	3	6	442149	442154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_008270	TGT	2	6	442189	442194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_008270	GT	3	6	442237	442242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_008270	GGGGT	2	10	442245	442254	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_008270	GCG	2	6	442300	442305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_008270	G	6	6	442341	442346	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_008270	AGCGA	2	10	442413	442422	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10064	NC_008270	TCGA	2	8	442424	442431	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10065	NC_008270	GAGCG	2	10	442482	442491	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding

< Previous12...9101112131415161718192021Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.