MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 26508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008269	TC	3	6	124307	124312	0 %	50 %	0 %	50 %	111024910
3002	NC_008269	TG	3	6	124323	124328	0 %	50 %	50 %	0 %	111024910
3003	NC_008269	GAA	2	6	124345	124350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111024910
3004	NC_008269	TCG	2	6	124363	124368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024910
3005	NC_008269	CGG	2	6	124485	124490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_008269	CCAGG	2	10	124504	124513	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3007	NC_008269	CCACGA	2	12	124520	124531	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3008	NC_008269	CAG	2	6	124592	124597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_008269	GCC	2	6	124822	124827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_008269	AGG	2	6	124927	124932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_008269	CAT	2	6	124934	124939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024911
3012	NC_008269	GAC	2	6	124947	124952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024911
3013	NC_008269	ACG	2	6	124981	124986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024911
3014	NC_008269	CGA	2	6	125000	125005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024911
3015	NC_008269	CAC	2	6	125060	125065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024911
3016	NC_008269	CGA	2	6	125075	125080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024911
3017	NC_008269	GCC	3	9	125082	125090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024911
3018	NC_008269	GTC	2	6	125139	125144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024911
3019	NC_008269	CGA	2	6	125218	125223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024912
3020	NC_008269	GCA	2	6	125235	125240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024912
3021	NC_008269	CGA	2	6	125287	125292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024912
3022	NC_008269	AGG	2	6	125298	125303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024912
3023	NC_008269	TCG	2	6	125349	125354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024912
3024	NC_008269	CTG	2	6	125366	125371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024912
3025	NC_008269	CAG	2	6	125410	125415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024912
3026	NC_008269	GGT	2	6	125425	125430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024912
3027	NC_008269	TGG	2	6	125442	125447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024912
3028	NC_008269	CTA	2	6	125470	125475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024912
3029	NC_008269	CGT	2	6	125496	125501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024912
3030	NC_008269	AGC	2	6	125521	125526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024913
3031	NC_008269	GTCCC	2	10	125538	125547	0 %	20 %	20 %	60 %	111024913
3032	NC_008269	TCGATC	2	12	125550	125561	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	111024913
3033	NC_008269	C	6	6	125561	125566	0 %	0 %	0 %	100 %	111024913
3034	NC_008269	CCG	2	6	125627	125632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024913
3035	NC_008269	CCGA	2	8	125643	125650	25 %	0 %	25 %	50 %	111024913
3036	NC_008269	AC	3	6	125788	125793	50 %	0 %	0 %	50 %	111024913
3037	NC_008269	CGG	2	6	125799	125804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024913
3038	NC_008269	ACG	2	6	125836	125841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024913
3039	NC_008269	GCG	3	9	125981	125989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024914
3040	NC_008269	GCG	2	6	126008	126013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024914
3041	NC_008269	CGG	2	6	126023	126028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024914
3042	NC_008269	ACT	2	6	126060	126065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024914
3043	NC_008269	ACC	2	6	126102	126107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024914
3044	NC_008269	GCCG	2	8	126175	126182	0 %	0 %	50 %	50 %	111024914
3045	NC_008269	CGC	2	6	126190	126195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024914
3046	NC_008269	CCA	2	6	126252	126257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024914
3047	NC_008269	CGG	2	6	126384	126389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024914
3048	NC_008269	TAC	3	9	126392	126400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024914
3049	NC_008269	CCG	2	6	126417	126422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024914
3050	NC_008269	CCGC	2	8	126531	126538	0 %	0 %	25 %	75 %	111024914
3051	NC_008269	GAATG	2	10	126599	126608	40 %	20 %	40 %	0 %	111024914
3052	NC_008269	CGG	2	6	126640	126645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024914
3053	NC_008269	CCG	2	6	126656	126661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024914
3054	NC_008269	CCG	2	6	126665	126670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024914
3055	NC_008269	GTG	2	6	126671	126676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024914
3056	NC_008269	TCT	2	6	126747	126752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024914
3057	NC_008269	GTGC	2	8	126815	126822	0 %	25 %	50 %	25 %	111024914
3058	NC_008269	CGGC	2	8	126832	126839	0 %	0 %	50 %	50 %	111024914
3059	NC_008269	TTC	2	6	126845	126850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024914
3060	NC_008269	TTC	2	6	126863	126868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024914
3061	NC_008269	GGGC	2	8	126919	126926	0 %	0 %	75 %	25 %	111024914
3062	NC_008269	GTC	2	6	126941	126946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024914
3063	NC_008269	CGG	2	6	126993	126998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024914
3064	NC_008269	ACG	2	6	127005	127010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024914
3065	NC_008269	CGG	2	6	127016	127021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024914
3066	NC_008269	GCG	2	6	127042	127047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024914
3067	NC_008269	CCA	2	6	127100	127105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024914
3068	NC_008269	CGA	2	6	127252	127257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024914
3069	NC_008269	C	6	6	127288	127293	0 %	0 %	0 %	100 %	111024914
3070	NC_008269	GCCCCC	2	12	127294	127305	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	111024914
3071	NC_008269	CGA	2	6	127333	127338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024914
3072	NC_008269	CGG	2	6	127439	127444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024915
3073	NC_008269	GACC	2	8	127445	127452	25 %	0 %	25 %	50 %	111024915
3074	NC_008269	GA	3	6	127480	127485	50 %	0 %	50 %	0 %	111024915
3075	NC_008269	CGG	2	6	127526	127531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024915
3076	NC_008269	CGC	2	6	127604	127609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024915
3077	NC_008269	CAA	2	6	127649	127654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024915
3078	NC_008269	CGA	2	6	127772	127777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024915
3079	NC_008269	CGG	2	6	127799	127804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024915
3080	NC_008269	CGG	2	6	127835	127840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024915
3081	NC_008269	CCG	2	6	127844	127849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024915
3082	NC_008269	CGG	2	6	127868	127873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024915
3083	NC_008269	ACC	2	6	127896	127901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024915
3084	NC_008269	GGC	2	6	127902	127907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024915
3085	NC_008269	TGC	2	6	127927	127932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024915
3086	NC_008269	GCT	2	6	127955	127960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024915
3087	NC_008269	CCAC	2	8	128019	128026	25 %	0 %	0 %	75 %	111024915
3088	NC_008269	AAC	2	6	128082	128087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024915
3089	NC_008269	ACA	2	6	128119	128124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024915
3090	NC_008269	CGT	2	6	128135	128140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024915
3091	NC_008269	CCGG	2	8	128180	128187	0 %	0 %	50 %	50 %	111024915
3092	NC_008269	GGC	2	6	128208	128213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024915
3093	NC_008269	CGT	2	6	128219	128224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024915
3094	NC_008269	CGG	2	6	128237	128242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024915
3095	NC_008269	CAT	2	6	128279	128284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024915
3096	NC_008269	GGTACA	2	12	128336	128347	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	111024915
3097	NC_008269	GAG	2	6	128364	128369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024915
3098	NC_008269	CGC	3	9	128396	128404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024915
3099	NC_008269	GAC	2	6	128412	128417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024915
3100	NC_008269	ACG	2	6	128434	128439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024915
3101	NC_008269	AGG	2	6	128491	128496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024915
3102	NC_008269	GCC	2	6	128518	128523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024915
3103	NC_008269	CGG	2	6	128530	128535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024915
3104	NC_008269	AAC	2	6	128592	128597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024915
3105	NC_008269	ACT	2	6	128600	128605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024915
3106	NC_008269	TG	3	6	128614	128619	0 %	50 %	50 %	0 %	111024915
3107	NC_008269	TCGACG	2	12	128632	128643	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111024915
3108	NC_008269	TGC	2	6	128686	128691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_008269	GGGC	2	8	128752	128759	0 %	0 %	75 %	25 %	111024916
3110	NC_008269	ACC	2	6	128808	128813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024916
3111	NC_008269	GGT	2	6	128816	128821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024916
3112	NC_008269	CGC	2	6	128867	128872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024916
3113	NC_008269	CGTGC	2	10	128927	128936	0 %	20 %	40 %	40 %	111024916
3114	NC_008269	CGC	2	6	129005	129010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024916
3115	NC_008269	CTC	2	6	129027	129032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024916
3116	NC_008269	CAG	2	6	129074	129079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024916
3117	NC_008269	CCG	2	6	129083	129088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024916
3118	NC_008269	CGC	3	9	129185	129193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024916
3119	NC_008269	CAC	2	6	129275	129280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024916
3120	NC_008269	CGC	2	6	129281	129286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024916
3121	NC_008269	GCC	3	9	129321	129329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024916
3122	NC_008269	GCC	2	6	129440	129445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024916
3123	NC_008269	GGC	2	6	129452	129457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024916
3124	NC_008269	GC	3	6	129574	129579	0 %	0 %	50 %	50 %	111024916
3125	NC_008269	CGG	2	6	129623	129628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024916
3126	NC_008269	GTG	2	6	129657	129662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024916
3127	NC_008269	GCCG	2	8	129680	129687	0 %	0 %	50 %	50 %	111024916
3128	NC_008269	TCG	2	6	129691	129696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024916
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3130	NC_008269	CAC	2	6	129761	129766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024916
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3132	NC_008269	CAT	2	6	129866	129871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024916
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3134	NC_008269	CGC	2	6	129921	129926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3135	NC_008269	CG	3	6	129978	129983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3136	NC_008269	GTG	2	6	130100	130105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_008269	ATC	2	6	130156	130161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024917
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3142	NC_008269	ATC	2	6	130312	130317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024917
3143	NC_008269	TCG	2	6	130322	130327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024917
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3171	NC_008269	CTG	2	6	131429	131434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3172	NC_008269	AC	4	8	131439	131446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3173	NC_008269	AC	3	6	131471	131476	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3182	NC_008269	CGA	2	6	131894	131899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3183	NC_008269	AC	3	6	131918	131923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3184	NC_008269	CCAC	2	8	131924	131931	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3185	NC_008269	CGA	2	6	131938	131943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3188	NC_008269	CAC	2	6	132032	132037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3189	NC_008269	ACA	3	9	132064	132072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3190	NC_008269	CG	4	8	132243	132250	0 %	0 %	50 %	50 %	111024919
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3192	NC_008269	CA	3	6	132278	132283	50 %	0 %	0 %	50 %	111024919
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3202	NC_008269	CGT	2	6	132643	132648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3203	NC_008269	CCGTC	2	10	132678	132687	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3204	NC_008269	GAT	2	6	132688	132693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3222	NC_008269	CAC	2	6	133544	133549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3227	NC_008269	TCG	2	6	133779	133784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024921
3228	NC_008269	CGTC	2	8	133796	133803	0 %	25 %	25 %	50 %	111024921
3229	NC_008269	CGGC	2	8	133809	133816	0 %	0 %	50 %	50 %	111024921
3230	NC_008269	TCG	2	6	133919	133924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024921
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3235	NC_008269	AGT	2	6	134083	134088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024922
3236	NC_008269	TCG	2	6	134172	134177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024922
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3238	NC_008269	GGA	2	6	134251	134256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024922
3239	NC_008269	CGA	3	9	134260	134268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024922
3240	NC_008269	CGG	2	6	134284	134289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024922
3241	NC_008269	CAT	2	6	134339	134344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024922
3242	NC_008269	ATG	2	6	134445	134450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024922
3243	NC_008269	CCG	2	6	134451	134456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024922
3244	NC_008269	TGT	3	9	134458	134466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111024922
3245	NC_008269	CGT	2	6	134509	134514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024922
3246	NC_008269	GCA	2	6	134533	134538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024922
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3369	NC_008269	CGT	2	6	139333	139338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024924
3370	NC_008269	GTC	3	9	139358	139366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024924
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3372	NC_008269	GGT	2	6	139412	139417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024924
3373	NC_008269	TCG	2	6	139449	139454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024924
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3377	NC_008269	GCGG	2	8	139649	139656	0 %	0 %	75 %	25 %	111024924
3378	NC_008269	CGA	2	6	139705	139710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024924
3379	NC_008269	CGT	2	6	139730	139735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024924
3380	NC_008269	GCA	2	6	139741	139746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024924
3381	NC_008269	CGGC	2	8	139750	139757	0 %	0 %	50 %	50 %	111024924
3382	NC_008269	GCA	2	6	139795	139800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024924
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3480	NC_008269	GAT	2	6	143592	143597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3481	NC_008269	GCA	2	6	143631	143636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3484	NC_008269	GGC	2	6	143780	143785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3485	NC_008269	CG	3	6	143790	143795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3486	NC_008269	GGC	2	6	143850	143855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3487	NC_008269	GTGC	2	8	143892	143899	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3488	NC_008269	GCC	2	6	143925	143930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3489	NC_008269	GCC	3	9	143932	143940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3490	NC_008269	CAT	3	9	144011	144019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024928
3491	NC_008269	GAC	2	6	144027	144032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024928
3492	NC_008269	GAG	2	6	144049	144054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024928
3493	NC_008269	ACCG	2	8	144082	144089	25 %	0 %	25 %	50 %	111024928
3494	NC_008269	ACCG	2	8	144106	144113	25 %	0 %	25 %	50 %	111024928
3495	NC_008269	CGC	3	9	144117	144125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024928
3496	NC_008269	CCGC	2	8	144158	144165	0 %	0 %	25 %	75 %	111024928
3497	NC_008269	CTG	2	6	144247	144252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024928
3498	NC_008269	CGA	2	6	144295	144300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024928
3499	NC_008269	CGC	2	6	144302	144307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024928
3500	NC_008269	CAA	2	6	144320	144325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024928

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