MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 26508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_008269	ACA	3	9	1014449	1014457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025833
24002	NC_008269	AGA	2	6	1014527	1014532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025833
24003	NC_008269	CCG	2	6	1014567	1014572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025833
24004	NC_008269	ACT	2	6	1014628	1014633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025833
24005	NC_008269	GGACG	2	10	1014719	1014728	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
24006	NC_008269	GCGG	2	8	1014810	1014817	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24007	NC_008269	CGT	2	6	1014830	1014835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025834
24008	NC_008269	GCA	2	6	1014846	1014851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025834
24009	NC_008269	GCA	2	6	1014880	1014885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025834
24010	NC_008269	TCG	2	6	1014905	1014910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025834
24011	NC_008269	TGG	2	6	1014913	1014918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025834
24012	NC_008269	AGG	2	6	1014953	1014958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025834
24013	NC_008269	GTC	2	6	1014997	1015002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025834
24014	NC_008269	CAGA	2	8	1015047	1015054	50 %	0 %	25 %	25 %	111025834
24015	NC_008269	GGA	2	6	1015101	1015106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025834
24016	NC_008269	CAT	2	6	1015107	1015112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025834
24017	NC_008269	GCG	2	6	1015132	1015137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025834
24018	NC_008269	GGT	2	6	1015141	1015146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025834
24019	NC_008269	CGA	2	6	1015155	1015160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025834
24020	NC_008269	TCG	2	6	1015196	1015201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025834
24021	NC_008269	TCG	2	6	1015418	1015423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24022	NC_008269	CGA	2	6	1015472	1015477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025835
24023	NC_008269	TGG	2	6	1015512	1015517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025835
24024	NC_008269	GCC	2	6	1015521	1015526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025835
24025	NC_008269	TTC	2	6	1015569	1015574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025835
24026	NC_008269	GCA	2	6	1015600	1015605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025835
24027	NC_008269	GAG	2	6	1015622	1015627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025835
24028	NC_008269	G	6	6	1015656	1015661	0 %	0 %	100 %	0 %	111025835
24029	NC_008269	CAG	2	6	1015754	1015759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24030	NC_008269	ACG	2	6	1015876	1015881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025836
24031	NC_008269	AC	3	6	1015923	1015928	50 %	0 %	0 %	50 %	111025836
24032	NC_008269	CGA	2	6	1015931	1015936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025836
24033	NC_008269	CGACG	2	10	1015995	1016004	20 %	0 %	40 %	40 %	111025836
24034	NC_008269	GTG	2	6	1016042	1016047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025836
24035	NC_008269	ACT	2	6	1016074	1016079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025836
24036	NC_008269	TGC	2	6	1016097	1016102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025836
24037	NC_008269	ACG	3	9	1016169	1016177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025836
24038	NC_008269	TAG	2	6	1016223	1016228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025836
24039	NC_008269	AAG	2	6	1016229	1016234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025837
24040	NC_008269	GTC	2	6	1016237	1016242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025837
24041	NC_008269	AGA	2	6	1016281	1016286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025837
24042	NC_008269	CGA	2	6	1016365	1016370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025837
24043	NC_008269	GCC	2	6	1016393	1016398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025837
24044	NC_008269	ACGA	2	8	1016403	1016410	50 %	0 %	25 %	25 %	111025837
24045	NC_008269	GC	3	6	1016413	1016418	0 %	0 %	50 %	50 %	111025837
24046	NC_008269	TCG	2	6	1016420	1016425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025837
24047	NC_008269	CCG	2	6	1016460	1016465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025837
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24049	NC_008269	GGT	2	6	1016533	1016538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025837
24050	NC_008269	GGT	2	6	1016642	1016647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025837
24051	NC_008269	CTCC	2	8	1016888	1016895	0 %	25 %	0 %	75 %	111025838
24052	NC_008269	GGT	3	9	1016990	1016998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025838
24053	NC_008269	GTA	2	6	1017003	1017008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025838
24054	NC_008269	CGG	2	6	1017139	1017144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025839
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24056	NC_008269	TCG	2	6	1017195	1017200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025839
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24060	NC_008269	GCG	3	9	1017308	1017316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025839
24061	NC_008269	TCG	2	6	1017339	1017344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025839
24062	NC_008269	CGA	2	6	1017358	1017363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025839
24063	NC_008269	GAG	2	6	1017416	1017421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025839
24064	NC_008269	CGA	2	6	1017427	1017432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025839
24065	NC_008269	GCC	2	6	1017467	1017472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025839
24066	NC_008269	GGA	2	6	1017520	1017525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025839
24067	NC_008269	TCGA	2	8	1017528	1017535	25 %	25 %	25 %	25 %	111025839
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24069	NC_008269	GTC	3	9	1017632	1017640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025839
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24074	NC_008269	CCGG	2	8	1017856	1017863	0 %	0 %	50 %	50 %	111025839
24075	NC_008269	C	6	6	1017886	1017891	0 %	0 %	0 %	100 %	111025839
24076	NC_008269	GCG	2	6	1017897	1017902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025839
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24079	NC_008269	GTC	2	6	1017941	1017946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025839
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24084	NC_008269	GTG	2	6	1018172	1018177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025839
24085	NC_008269	AGC	2	6	1018191	1018196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025839
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24087	NC_008269	GCC	2	6	1018283	1018288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025839
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24089	NC_008269	ATG	2	6	1018320	1018325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025839
24090	NC_008269	CTC	2	6	1018330	1018335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24091	NC_008269	TGC	2	6	1018490	1018495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025840
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24100	NC_008269	GTC	2	6	1018907	1018912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025840
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24103	NC_008269	CTG	2	6	1018971	1018976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025840
24104	NC_008269	GC	3	6	1018982	1018987	0 %	0 %	50 %	50 %	111025840
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24107	NC_008269	CCGG	2	8	1019116	1019123	0 %	0 %	50 %	50 %	111025840
24108	NC_008269	CGTC	2	8	1019136	1019143	0 %	25 %	25 %	50 %	111025840
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24116	NC_008269	CGG	2	6	1019465	1019470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025841
24117	NC_008269	GT	3	6	1019476	1019481	0 %	50 %	50 %	0 %	111025841
24118	NC_008269	CCA	2	6	1019657	1019662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025841
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24165	NC_008269	CGGG	2	8	1021715	1021722	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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24351	NC_008269	GCG	2	6	1030037	1030042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025854
24352	NC_008269	AGGA	2	8	1030134	1030141	50 %	0 %	50 %	0 %	111025854
24353	NC_008269	GCC	2	6	1030181	1030186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025854
24354	NC_008269	GCTG	2	8	1030198	1030205	0 %	25 %	50 %	25 %	111025854
24355	NC_008269	CCGT	2	8	1030208	1030215	0 %	25 %	25 %	50 %	111025854
24356	NC_008269	GCA	2	6	1030246	1030251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025854
24357	NC_008269	GCA	2	6	1030255	1030260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025854
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24363	NC_008269	GC	3	6	1030410	1030415	0 %	0 %	50 %	50 %	111025854
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24379	NC_008269	GCG	2	6	1031051	1031056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025855
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24381	NC_008269	CGG	2	6	1031084	1031089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025855
24382	NC_008269	CGG	2	6	1031108	1031113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025855
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24385	NC_008269	CGC	2	6	1031203	1031208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025855
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24387	NC_008269	CG	3	6	1031256	1031261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24388	NC_008269	GCG	2	6	1031278	1031283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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24391	NC_008269	CGCT	2	8	1031443	1031450	0 %	25 %	25 %	50 %	111025856
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24434	NC_008269	GTAG	2	8	1033275	1033282	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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24454	NC_008269	ACA	2	6	1034184	1034189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24457	NC_008269	GCG	2	6	1034242	1034247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025860
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24468	NC_008269	GT	3	6	1034736	1034741	0 %	50 %	50 %	0 %	111025860
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24471	NC_008269	GT	4	8	1034820	1034827	0 %	50 %	50 %	0 %	111025860
24472	NC_008269	CTG	2	6	1034856	1034861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025860
24473	NC_008269	GAT	2	6	1034868	1034873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025860
24474	NC_008269	CTGG	2	8	1034891	1034898	0 %	25 %	50 %	25 %	111025860
24475	NC_008269	CGC	2	6	1034931	1034936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025860
24476	NC_008269	CCG	2	6	1034939	1034944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025860
24477	NC_008269	GGC	2	6	1034962	1034967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025860
24478	NC_008269	GCGG	2	8	1034972	1034979	0 %	0 %	75 %	25 %	111025860
24479	NC_008269	TCGGC	2	10	1035033	1035042	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24480	NC_008269	CGA	2	6	1035079	1035084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025861
24481	NC_008269	ACGC	2	8	1035091	1035098	25 %	0 %	25 %	50 %	111025861
24482	NC_008269	TGA	2	6	1035145	1035150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025861
24483	NC_008269	CG	3	6	1035168	1035173	0 %	0 %	50 %	50 %	111025861
24484	NC_008269	CGA	2	6	1035193	1035198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025861
24485	NC_008269	GC	3	6	1035360	1035365	0 %	0 %	50 %	50 %	111025861
24486	NC_008269	CGCC	2	8	1035379	1035386	0 %	0 %	25 %	75 %	111025861
24487	NC_008269	GGT	2	6	1035401	1035406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025861
24488	NC_008269	CGA	2	6	1035437	1035442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025861
24489	NC_008269	TGC	2	6	1035454	1035459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025861
24490	NC_008269	CGC	2	6	1035460	1035465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025861
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24492	NC_008269	G	6	6	1035570	1035575	0 %	0 %	100 %	0 %	111025861
24493	NC_008269	CGG	2	6	1035604	1035609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025861
24494	NC_008269	GTT	2	6	1035611	1035616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025861
24495	NC_008269	GTC	2	6	1035631	1035636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025861
24496	NC_008269	ATC	2	6	1035660	1035665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025861
24497	NC_008269	TCG	3	9	1035846	1035854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025861
24498	NC_008269	GATC	2	8	1035901	1035908	25 %	25 %	25 %	25 %	111025861
24499	NC_008269	CGC	2	6	1035964	1035969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24500	NC_008269	GCTC	2	8	1036042	1036049	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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