MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 26508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_008269	CGC	3	9	897739	897747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025710
21502	NC_008269	GTC	2	6	897764	897769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025710
21503	NC_008269	GCTG	2	8	897778	897785	0 %	25 %	50 %	25 %	111025710
21504	NC_008269	CGC	3	9	897847	897855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025710
21505	NC_008269	GT	3	6	897913	897918	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21506	NC_008269	AAG	2	6	897941	897946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21507	NC_008269	TCG	2	6	898011	898016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21508	NC_008269	ACC	2	6	898030	898035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21509	NC_008269	ACA	2	6	898037	898042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21510	NC_008269	ACA	2	6	898189	898194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21511	NC_008269	CGA	2	6	898253	898258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21512	NC_008269	GGGGT	2	10	898267	898276	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
21513	NC_008269	CAG	2	6	898293	898298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21514	NC_008269	CAC	2	6	898313	898318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21515	NC_008269	CCA	2	6	898358	898363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21516	NC_008269	GTT	2	6	898404	898409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21517	NC_008269	CGGC	2	8	898516	898523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21518	NC_008269	GT	3	6	898646	898651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21519	NC_008269	GTG	2	6	898676	898681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21520	NC_008269	GCT	2	6	898737	898742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21521	NC_008269	TGGG	2	8	898776	898783	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
21522	NC_008269	CTTT	2	8	898836	898843	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21523	NC_008269	CAG	2	6	898878	898883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21524	NC_008269	CGA	2	6	898939	898944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21525	NC_008269	CCG	2	6	898996	899001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21526	NC_008269	CAC	2	6	899008	899013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21527	NC_008269	CAG	2	6	899028	899033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21528	NC_008269	GGA	2	6	899190	899195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21529	NC_008269	CGA	2	6	899199	899204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21530	NC_008269	TTGG	2	8	899244	899251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21531	NC_008269	GAG	2	6	899303	899308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21532	NC_008269	CCA	2	6	899332	899337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025711
21533	NC_008269	TGG	2	6	899348	899353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025711
21534	NC_008269	CCCG	2	8	899492	899499	0 %	0 %	25 %	75 %	111025711
21535	NC_008269	AT	3	6	899520	899525	50 %	50 %	0 %	0 %	111025711
21536	NC_008269	ATC	2	6	899573	899578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025711
21537	NC_008269	TCC	2	6	899585	899590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21538	NC_008269	CGG	2	6	899629	899634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21539	NC_008269	CTC	2	6	899697	899702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21540	NC_008269	TTGTCA	2	12	899738	899749	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	111025712
21541	NC_008269	CAA	2	6	899765	899770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025712
21542	NC_008269	CGAG	2	8	899806	899813	25 %	0 %	50 %	25 %	111025712
21543	NC_008269	CAG	2	6	899825	899830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025712
21544	NC_008269	CTG	2	6	899887	899892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025712
21545	NC_008269	GAT	2	6	899939	899944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025712
21546	NC_008269	CGA	2	6	899947	899952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025712
21547	NC_008269	TG	3	6	899997	900002	0 %	50 %	50 %	0 %	111025712
21548	NC_008269	CGG	2	6	900092	900097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025712
21549	NC_008269	CGT	2	6	900121	900126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025712
21550	NC_008269	GGT	2	6	900128	900133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025712
21551	NC_008269	CA	3	6	900217	900222	50 %	0 %	0 %	50 %	111025712
21552	NC_008269	CGG	2	6	900381	900386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025713
21553	NC_008269	CGA	2	6	900561	900566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025713
21554	NC_008269	TTGG	2	8	900591	900598	0 %	50 %	50 %	0 %	111025713
21555	NC_008269	GCG	2	6	900632	900637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025713
21556	NC_008269	ACC	2	6	900654	900659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025713
21557	NC_008269	GGA	2	6	900663	900668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025713
21558	NC_008269	GCTGA	2	10	900837	900846	20 %	20 %	40 %	20 %	111025713
21559	NC_008269	CGT	2	6	900872	900877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025713
21560	NC_008269	GCT	2	6	900916	900921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025713
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21562	NC_008269	TCG	2	6	901033	901038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025714
21563	NC_008269	GTTG	2	8	901060	901067	0 %	50 %	50 %	0 %	111025714
21564	NC_008269	GCC	2	6	901080	901085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025714
21565	NC_008269	GTT	2	6	901094	901099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025714
21566	NC_008269	GCA	2	6	901218	901223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025714
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21568	NC_008269	GCC	2	6	901251	901256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025714
21569	NC_008269	GCT	2	6	901321	901326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025714
21570	NC_008269	GTTC	2	8	901356	901363	0 %	50 %	25 %	25 %	111025714
21571	NC_008269	ACG	2	6	901398	901403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025714
21572	NC_008269	GC	4	8	901406	901413	0 %	0 %	50 %	50 %	111025714
21573	NC_008269	CCA	2	6	901474	901479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025714
21574	NC_008269	CCAT	2	8	901495	901502	25 %	25 %	0 %	50 %	111025714
21575	NC_008269	GGCCA	2	10	901625	901634	20 %	0 %	40 %	40 %	111025714
21576	NC_008269	CTG	2	6	901670	901675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025714
21577	NC_008269	G	6	6	901696	901701	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21578	NC_008269	GTCG	2	8	901708	901715	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21579	NC_008269	GATC	2	8	901724	901731	25 %	25 %	25 %	25 %	111025715
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21582	NC_008269	CTG	2	6	902063	902068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025715
21583	NC_008269	CGA	2	6	902098	902103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025715
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21585	NC_008269	GTCGA	2	10	902150	902159	20 %	20 %	40 %	20 %	111025715
21586	NC_008269	ACG	2	6	902175	902180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025715
21587	NC_008269	CGA	2	6	902209	902214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025715
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21589	NC_008269	AGAT	2	8	902282	902289	50 %	25 %	25 %	0 %	111025716
21590	NC_008269	CCG	2	6	902305	902310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025716
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21592	NC_008269	GGT	2	6	902564	902569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025716
21593	NC_008269	CGA	2	6	902641	902646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025716
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21595	NC_008269	ACC	2	6	902772	902777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025716
21596	NC_008269	CCGT	2	8	902806	902813	0 %	25 %	25 %	50 %	111025716
21597	NC_008269	CGT	2	6	902839	902844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21598	NC_008269	TCG	2	6	902877	902882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21602	NC_008269	GAT	2	6	903100	903105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025717
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21605	NC_008269	GCAC	2	8	903193	903200	25 %	0 %	25 %	50 %	111025717
21606	NC_008269	CATA	2	8	903336	903343	50 %	25 %	0 %	25 %	111025717
21607	NC_008269	AAG	2	6	903393	903398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21608	NC_008269	GATC	2	8	903415	903422	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21609	NC_008269	GGA	2	6	903446	903451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21610	NC_008269	TAC	2	6	903477	903482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025718
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21613	NC_008269	CGG	3	9	903622	903630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025718
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21989	NC_008269	TCG	2	6	921251	921256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025739
21990	NC_008269	CA	3	6	921282	921287	50 %	0 %	0 %	50 %	111025739
21991	NC_008269	GCG	2	6	921310	921315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025739
21992	NC_008269	GCCTGC	2	12	921334	921345	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111025739
21993	NC_008269	GAC	2	6	921355	921360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025739
21994	NC_008269	TCGAG	2	10	921387	921396	20 %	20 %	40 %	20 %	111025739
21995	NC_008269	CGC	2	6	921492	921497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025739
21996	NC_008269	CGG	2	6	921532	921537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025739
21997	NC_008269	GGT	2	6	921538	921543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025739
21998	NC_008269	GACC	2	8	921615	921622	25 %	0 %	25 %	50 %	111025739
21999	NC_008269	CGC	2	6	921637	921642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025739
22000	NC_008269	GCC	2	6	921692	921697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025739

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